BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-170C24.T7 (MSMg01no170_c24.b1) | MSMg01-170C24.TJ (MSMg01no170_c24.g1) |
ACC | AG366837 | AG366838 |
length | 1,743 | 774 |
length of high quality (start - end) | --- | 290 (79 - 368) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no170_c24.b1 PHD_FILE: MSMg01no170_c24.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:40:04 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no170_c24.g1 PHD_FILE: MSMg01no170_c24.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 19:40:04 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | plural |
---|
sequence | TAAGAATGTATCGAGCGTAGACAAGCACGCAACATAAGACACAACTGCGC
TGTAGACAGATGATAAATTTGCGTACGTTTCTACTGTACGTGTGACCATT
GATAAATACACGCGCTGAGCATGTTTATTCTTAGCGTCTGTATCATACTG
TGCCGATACGTGTGCGAGTATAGCTATTTAATATCGCCGCCCATATCCGC
TTATTATCCATGCACCTACTTGATAATACTAATAGTGCTGATGAGCAGCA
CATATATGTTTATAACACATTTGACGCGCTAACTCTGATCTTGACGCAGA
CCGCGTATCTACGCTGATCGCGCGTCCCGTTATCGTGATAATACATTTAA
CGGCGCGCTCTCTAGCCGCGATAATATTATGCCGCCCGGTAGAGTACATG
GATCATGTAAATCTCTGCAACAGAAGCAATGCGTCGCACGGACATAATTC
ACTAAACAATATATTAAATATATCATAANAACACTATACAGACCTACCGC
TAAACGACCACGCGCGCACGGTAAACAACACGGTGATGTCAGTAATCATT
TCAATGCGTACAACCGTTAAATAAATATAAACATGACACATTACACGACG
TCGACTAATAATGGTAACGTTAGCCGCGCGTATTCACTGTATTTGTCCGC
CGGTCGTTAATAACAGCGCAATCATAGATCTACCATAGGACTATATGCGC
GACTATCGTAAGACGCCACTACGATGAATATATGAGAACAATTAGGAGAG
TATGCTCTCGCCCATATTTGAATGTGACCGACCTCGTGTTAGACGCAACG
GGTAAGTGTAATCTGGAGATGTATCCGAGGGCCGCCGGGCTCAATGGGCG
GCGAGGGNNGGCGCGGGCGTTTTTTTATTGNTATTCTGAGCATTATACTA
TATTAACGCAGCTCTCATATACATCTCNATAAGTGATCGCGGCGATGTCT
CTCGCGAGACGCGTGAATTATGGTGCGCGCGATGTGCCTCGCGCTGCTGC
GCCGCACTATATAGCATGCTCGTCACTTCGCTACTCTCGAAGTACTGATG
ATCCACGTTAGAGCTATCCGCGTATGTGTAGCCGCTCCGATGGCGCATCT
TACGTTAATATCATCCGCTATCTACCACGTCATCTATATATCGCCTTATC
GCGCACGCGTATATATTCTGATTAGAACGCACGTCATATATTGTGCGCCG
ATATAGCACGCGCCGCTCTCGCCGATTCTCGACCCACTATTACGTATGTC
ACGAGATACCGCCGCCGCATATCTTAAATNCGCCCGTCTTATTCTCATAT
ACCNCGCATNTCGCTCTACGCGAATACGCATATGATTGACTCACTCTATT
TGTCGCTCTGTCTCTTATCGCTATATTGAATCAAGGCAGAGCAATCTGTC
CACCTATATANCGCCTGACTGTATCAGTGNTAGTNCTATAGAGTATAAAG
TGTCGTCGCTTGACGGCGTCATTTNTTATNTCTCACGAGCGCGATCGGCG
ACTGGCGTGAGACTGATACTTACATTTGTACACCGCGTGTATATGTGTAT
ATATANCTTACTACCCGCGCGCGTCTATCTGANTACACACGACNTNGCTC
ACTTGGTACCTACCACACCCGCACGAGCATGNGTATAACGTCTGCTTGAT
TAGATCAACCGAACTAACGTGAGTATACCACGCGCCGAGCACGCGACTAT
ATATGTACGCGAATATTAGTTGTCTGACTACTNCGAGCGCGTN
| NTCGAATGCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTAGAAAGGGAGGACGCCTGCG
CAGTCCGGAAGGCGGGGACGCGGGGGCGGGGCGGGGCGCGGCGGCGGGGG
CGGGGCGCCTAGTCGATTGGCGGGGTTACCCGGAATTGGTTGCTAGACTG
GGCGCGAAGCGGTCTTCAGGTTTGGTCTCAGTTGCGCGGAAGTGAAACGA
CGCGGAGATGGAGGTGAGCCAGGCGGCGTCTGGTACCGACGGTGTCCGGG
AACGGAGGGGCTCGTTCGAAGCTGGAAGGAGGAACCAAGATGAGGCACCT
CAGTCCGGGATGAACGGTTTTCTCNATTTACTCCTACTGCCTGGATCTCT
GGCTCTTCATCCTTTTCGACCTGGCCTTGTTCGACATCGAGAACCTCTTG
CCCTGGTGAGTATCCTGAGTTGCAGAGTTGAAGAGCTTAGGAAGCTGGCG
GTTGCTTCAGTCTTCTCGGAGAGGGAGGGAGGGACGGCAGCTAGAGATGG
TGGACTCGGAAGAGCGAAAATGCATTTCCTTTGACCCCCACTGTGCTGAG
GACTGTGCCACAAATTTGACTTCCCCCATTTGCCCGCCTCCTCACCACTT
ACCAACCGTTAAGTGTCCCAACCCCATCCCCCCCACTTTGATTTTACCCG
CCCCCTCTCCCCACACACCCTCCTATCACCCGCCATTCCCTCCCAGCTCC
CTCATCTTCCCCTCCTCTTTTTTN
|
quality values | Open.Hide. 8 8 10 8 8 8 8 8 10 12 12 8 8 7 6 6 6 8 6 6 8 6 6 6 6 6 6 8 6 8 8 6 6 6 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 7 7
6 8 8 8 8 8 9 9 10 10 8 6 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 8 8 9 8 8 6 6 6 6 11 11 10 10 10 10 10 10 9 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 11 8 12 8 8 6 7 7 10 6 6 6 6 9 6 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 12 12 11 11 9 12 16 15 10 10
10 11 8 11 13 6 6 6 6 8 12 10 9 9 8 10 8 8 8 8 10 6 7 8 8 10 10 10 11 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 13 9 8 8 8 8 8
9 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 9 12 12 9 9 9 9 6 6 6 6 6 6 8 10 10 8 8 8 8 8 10 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 6 6 6 6
8 7 7 10 8 8 8 8 8 8 11 10 8 8 6 6 6 6 9 10 9 12 12 10 10 12 11 17 13 9 9 9 10 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 7 6 6 8
8 8 6 6 8 8 17 8 8 9 9 9 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 10 18 11 17 12 12 8 8 9 10 9 8 8 6 6 6 7 6 7 8 8 9 6 7 6 9 10
7 8 6 6 6 6 6 6 9 9 9 9 11 8 8 8 10 11 18 18 16 6 6 6 6 7 6 8 8 8 8 8 8 8 6 7 7 6 7 8 10 8 6 6 8 8 8 6 6 6
6 7 10 8 8 6 6 6 6 10 10 6 6 6 8 8 6 7 10 8 6 6 6 6 8 8 8 10 9 10 15 19 13 8 8 8 6 6 6 6 8 6 8 8 8 8 6 6 8 6
6 8 6 6 10 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 12 12 10 10 8 8 8 8 3 0 3 6 6 8 6 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 9
10 9 10 10 10 10 9 9 12 10 10 11 8 10 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 6 6 6 8 12 8 8 6 6 6 6 8 10 10 6 6 8
8 13 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 7 7 9 10 7 6 6 6 8 8 6 6 7 10 10 10 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8
8 8 10 10 8 8 7 7 7 8 8 8 8 7 6 8 6 6 6 6 8 8 9 10 10 10 12 10 10 8 10 6 7 7 7 7 10 8 10 8 8 8 10 8 8 8 10 9 9 8
8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 9 8 10 10 13 13 15 12 12 11 11 11 8 9 6 6 6 6 8 6 8 8 9 13 8 8 8 6 6 6
6 6 8 8 11 8 8 8 8 8 9 9 13 13 13 8 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 7 6 6 10 8 8 6 6 6 6 7 8 8 11
11 11 12 21 13 12 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8
8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 10 16 12 12 12 11 8 6 6 6 6 10 10 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 10 8 8 6 6 6 6 6 6
7 6 8 7 8 8 3 0 0 3 8 8 6 8 6 6 6 6 6 6 6 7 8 8 6 6 6 6 6 3 0 3 9 9 7 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 10 8 6
8 6 6 6 6 8 10 6 6 6 6 8 8 9 9 8 8 8 8 8 10 8 8 11 10 10 3 0 3 8 8 10 8 10 8 8 9 9 9 9 9 9 9 10 10 15 14 14 8 8
6 6 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 10 6 6 6 6 10 7 10 13 12 11 10 10 10 10 10 8 8 8 6 6 13 10 12 11 10 10 10 10 8 8 8 10 8 8
6 6 6 6 9 8 8 8 10 10 8 8 8 10 9 14 12 12 8 9 8 8 8 8 8 10 10 8 6 6 6 6 6 8 8 10 13 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8
8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 7 8 8 10 8 6 6 6 6 6 11 10 11 9 8 8 6 6 6 6 8 7 9 10 8 10 10 10 9
6 6 6 8 8 8 8 13 10 10 8 8 6 9 9 7 7 8 8 10 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 8 8 6 6 6 6 8 11 10 9 9 9 10 10 11 10 13 9
8 8 8 8 8 10 13 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 8 9 10 10 9 9 10 8 10 10 6 6 8 7 8 8 10 8 9 10 10 10
10 10 10 8 8 10 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 9 10 9 9 9 10 11 6 6 8 6 9 6 8 6 6 10 8 10 10 9 6 7 6 6 6 9
7 8 8 8 8 10 8 7 8 7 6 8 6 8 8 8 8 8 8 7 8 8 10 8 8 6 6 6 3 0 3 8 8 10 9 9 9 10 10 8 8 8 8 10 10 10 8 11 9 9
8 10 3 0 3 7 7 8 3 0 3 9 10 11 12 12 11 11 11 11 11 9 9 12 11 11 8 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 7 10 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10
8 8 10 10 10 10 10 8 6 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 8 6
8 9 9 9 14 24 22 16 18 3 0 3 8 8 8 8 10 8 8 10 8 8 8 6 6 6 6 8 3 0 3 8 8 3 0 3 6 6 6 6 7 7 8 6 8 6 6 6 6 8
8 7 7 7 7 7 8 12 8 8 6 6 6 6 6 8 11 13 10 8 8 6 8 3 0 3 8 8 3 0 3 8 8 8 8 8 9 13 8 8 8 6 6 6 8 6 6 8 8 8
6 6 6 6 8 8 11 11 10 10 10 9 9 9 10 8 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 12 12 14 14
12 12 10 9 3 0 3 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 10 13 11 10 10 10 10 13 13 8 8 8 7 3 0 3 8 6 6 6 6 6 6 6 3 0 3 0 3 6 8 8
13 8 8 8 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 7 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 10 8 9 7 9 3 0 3 6 6 6 6 6 6 6 8 10 6 6 6 6 8 8 6 6
6 6 6 8 8 6 6 6 8 8 8 10 8 8 8 10 7 7 6 6 8 8 9 10 12 9 8 8 8 8 8 8 7 8 8 7 7 6 6 6 6 6 8 10 10 10 10 13 12 15
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 10 8 8 8 6 3 0 3 8 7 8 6 8 6 6 3 0 | Open.Hide. 0 3 6 6 6 6 13 10 9 9 9 20 23 41 40 39 47 43 34 28 22 28 19 25 25 37 39 36 34 39 40 37 37 33 34 32 22 30 27 30 30 33 33 33 36 44 43 43 40 40
39 34 36 31 31 20 31 32 39 39 48 48 48 36 37 40 36 40 36 41 39 39 29 42 42 42 42 42 39 39 35 44 44 48 48 43 59 44 48 48 44 44 37 37 37 42 42 41 37 37
35 42 42 47 48 57 57 57 48 57 57 57 57 59 57 41 28 28 24 24 32 27 23 43 32 38 18 23 17 38 38 57 57 57 44 44 32 43 43 43 43 52 52 52 57 59 57 57 54 54
52 59 57 38 41 23 32 43 43 43 43 44 57 52 43 43 57 57 52 52 45 45 45 52 43 43 43 43 43 57 57 43 34 36 36 57 57 57 57 52 52 52 52 52 57 57 57 52 57 52
59 57 57 57 57 57 57 52 52 43 43 57 35 35 57 57 43 52 52 57 59 52 43 43 34 34 18 32 19 43 43 52 52 57 52 43 43 39 37 57 57 57 57 52 52 43 44 31 43 43
57 44 57 52 52 43 43 35 43 43 57 59 59 57 50 50 43 43 43 42 42 42 50 50 57 59 59 50 43 43 32 32 20 32 32 57 57 57 57 57 57 32 32 20 20 20 44 44 37 37
37 42 42 57 57 57 44 42 42 30 37 37 57 46 48 48 48 57 48 59 46 43 43 39 39 24 21 13 18 15 15 17 14 16 21 19 31 28 43 43 43 48 59 41 34 20 20 20 32 32
23 34 34 30 30 30 26 19 24 29 37 37 37 28 22 16 11 9 7 7 6 6 6 3 0 3 9 11 12 16 11 12 12 11 11 11 11 11 11 11 12 28 25 37 37 32 28 28 30 24
24 28 28 30 39 32 41 41 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 41 37 31 39 37 43 39 39 34 34 28 34 24 14 10 8 8 8 8 8 8 11 12 12 21 28 30 37 37 43 46 46
34 34 30 20 18 11 11 11 18 11 24 11 21 21 37 34 28 26 12 12 11 11 11 13 11 11 12 12 14 26 26 28 35 35 39 39 39 43 39 48 30 30 20 23 32 34 37 39 29 21
11 11 11 24 25 24 24 12 12 12 13 12 26 26 35 32 28 15 15 15 15 20 32 31 39 35 39 35 35 28 34 20 14 18 21 12 12 12 11 11 12 11 12 12 11 12 12 12 12 9
10 10 13 10 13 11 11 11 11 15 12 12 11 12 12 12 12 11 11 11 10 10 10 10 15 25 22 23 15 13 10 10 8 10 13 22 23 21 12 8 8 8 8 8 6 8 8 13 15 15
17 14 14 21 15 15 10 10 10 11 8 8 8 8 8 9 13 14 14 10 10 10 12 10 12 13 14 14 18 20 37 34 34 19 20 14 14 14 12 13 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8
8 10 8 8 8 8 8 8 12 10 10 10 10 9 9 11 12 12 13 11 10 8 12 12 8 9 8 8 11 11 15 8 8 6 6 8 15 10 8 8 10 10 19 20 14 13 12 11 13 14
12 9 9 14 10 10 9 9 10 12 12 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 11 14 15 15 8 8 6 6 8 10 11
15 19 10 9 10 8 8 8 8 10 8 9 7 7 8 8 7 7 10 10 15 10 3 0 |