BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-192F15.T7 (MSMg01no192_f15.b1) | MSMg01-192F15.TJ (MSMg01no192_f15.g1) |
ACC | AG382057 | AG382058 |
length | 1,289 | 1,215 |
length of high quality (start - end) | 406 (42 - 447) | 325 (69 - 393) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no192_f15.b1 PHD_FILE: MSMg01no192_f15.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:09:35 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no192_f15.g1 PHD_FILE: MSMg01no192_f15.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 20:09:35 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NNNTTACATTGGCGCTATAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATT
CTTTTATCTGTTCTTCTTCCCAGATGAATAAATCTTCTTTATCTGACTCC
ATTTCCTCACCCTTTTAATAGGCATTTTGGCAACTGTTGCCCAGGGTTCC
AGCTGCTATATTACAATTTGGTAACACTGTCAGTTTATCTCTGTACATTT
TTTGAGAGAAGAAGAGTGATTTCTCTTTCCTTTATGATGTCAGCTGACCC
TATTCAGGGTTCCCATATTTTTAGCCCAACAGAGTCTCATTATGGAACTC
TGGCTGGCCTGAAACTTGCTGTGAAGACTAGACTTGGTTTTAACTCACAA
AGATCCTCTTGCCTCTGCCTGTTGAAATTCCTACTGAAATTCTAAGCCCT
GCCCTGTTGTTCTTCCTCCTAATGACTATTTTTGAGTTCCTCTGCATATC
TGTTTTTCCCCCCCCTTTAACTAGAAGAGCAAGAACCAAAAAACAGGTAC
TGCATCTTTTATGAAAAAGAGAATAAGCAAATGAGTTGTTAAGCCAATTG
CTAGTCTAACAATGGCTTCAAAATGTCATACCACCACCGGGTGGTGGTGG
CGCATGCCTCTAATCCCAGCACTCAGGAGGCAGAGGCAGGCGGATTTCTG
AGTTCGAGGCCAGCCTGGTTTACAAAGTGAGTTCCAGGACAGCCAGGGCT
AAACAGAGAAAACCTGTCTCGAAAAACTAAACAAAACCTAACAAAACCAA
ACAAAAACAAAAACCAAAAAACAAAAACAAAACAACAAAAACTAAAACAA
CAAAAAAACCACAAAATATCATACCACTCTGTGATACAATAGACTTGGTT
GTCAACTATCATACTCATGTAAAAAAAGGTTGACTTCATAAAACTGACAT
TATTTAGGGAATTACTAACCAAATTTGCTTAGGACACATTTAATCCCACC
AATGTGAATTTACTTAATGTATCATGTTCCTGCATCTACCCCAAAAATAA
TTATATTCTCTACTCGGCCTTTATTAGAATACCCATATTTTTCATTCTTG
CATTGAATTTCTTTACCCCCTACATTCATCACACTTTATTTCCCTTTTTT
AAATAAGTCTCCCAGTATCTGTCTTTCTTACATATCCTTCGACTTCACAA
TTTTTCCTTATCGACTTTCTTATCGTCCTTCACTTATCTCTTTCTCTCCT
TCATTCTTCATTCTCTCTATCTTCTTTCTAGTTATTCCTCTTTCTACATT
TTATCNTCTCTCTCGTAACTTTTTCTCCTCATCCTCACT
| NNCCGTTGATTGGAGGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTATATATGCTACTAAATGCTGCAGGATTTT
TCTGTCCCCTTACATGAGTGCAGAGGAGGACTGTGTTTGGACAGAGAAGG
GAGGCAGAGCTAAGAGTTGAAAGACATACTGCATCTGGGGGACTAGGGGG
AAATCCAAGATGGATTCAGACATGAACCCATGTGGCATTTACCAGCCACA
AGTAGCTATGATTTCACAAGTTAGAAATATTGGGATAAAGTGTTTATCAT
TATCAATTGGCTCTGAAATTATTTTTTTAGCATATTGTTAATTGTTATAT
TTTGATACATAAATAGGTTTTGTTAATTAAGCTTTAAGAGGCATGTTTTT
TTTTNGGGAACGGGGNCAANGACAAGNAACTGGGAGGAAGGAAGCTTTTT
TTANTTCCCGCCGNCCGGAANAANNCCCCCTCCCCACAACAGGAGAGGGG
GGGGTNNNNTNGNGNNTNTNGNNNNNNGNNTGTCTTTGNTGGGNNNNCTG
TTGGGTTGCTGTNGTGGGTGGGGGTGGGGTGNNNTTTTTNTTTGTTTTTG
TTTGGGGTTTTGTGTGGTCGGTTCTTTGTTCCGGGCGGTTTGTCCTTGCC
TTCNGTGCCCCCTCTCTCCCCTGGGGCGTTCCGGTTTTTCGGGCGGGTGC
CTTTTGCGTGCGGGTTTTCTGGGCGGTGCGTCCCCTTGTGGGGTCCGTGC
TGCGCGCGCCNCGCCTTTTTTTTTTTTTTTTTCCCGTGCCCGTCGCGGCC
CCGCGCTCTCGTTGGCCGTTCTGGTGCGTCTGGGCGCGTCCGCGGGTTGC
TTTTTGGTGGCGCTGCGTCCGTGCCTGGCGGGTGCGTCCGGGTCTCCGCG
CGGCGTGCTCTGCCCGGGCTGGCTGGTCTCTCTGGCCGGCTGCTGCCGTT
TTGGGTGTGCTGCTCGCGTGCCTGTCCGTCTGCGGTTCGCTCTGTCCGCT
CCTCGGTGTCCCTTCTCTCTCTGTTCCTCGCCCGCGCTCTGTGGGTCGGC
TCTTCCTCTCCTTCTTCTCCTCCGTCGGCCGTCCCTCGCTCCCTCCCTCG
GTTCTTTCTGTGGTNGCTCCCTGCGTGTCCTTCCTGTCGTTTCGGTTTTG
GTTTCTCCTCCCGTCCCCGGCTNCTGGTGCTCCTGGTTGTCCTCTTGCTC
TTCTTTGCTTCTTTT
|
quality values | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 6 9 8 8 8 13 13 8 8 8 8 8 8 11 15 21 28 24 23 17 14 14 19 21 36 36 33 36 33 33 33 33 33 33 37 37 43 41 32 32 32 37 37
37 59 33 33 33 33 33 30 43 39 39 47 47 43 48 48 48 48 43 37 34 37 37 37 43 43 42 48 43 39 39 39 46 46 57 57 68 50 50 50 50 42 41 48 48 48 57 48 57 57
57 48 57 57 57 57 57 54 57 48 57 57 57 38 38 40 38 20 20 28 33 33 42 42 44 57 48 57 57 57 57 50 47 50 57 43 43 43 43 37 42 43 43 43 52 47 50 50 50 57
57 52 52 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 52 41 52 57 50 57 50 52 52 52 57 42 57 43 43 35 43 43 57 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 52 57 52 52 52 57 57 59
59 59 57 57 52 57 59 43 42 35 35 43 44 39 39 43 43 52 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 54 52 62 62 62 39 39 39 43 43 35 43 43 43 43 52 62
62 52 52 43 62 43 43 41 39 39 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 43 43 35 31 31 43 44 44 43 39 35 35 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 35 35 35 59 59 59 59
57 52 52 57 57 52 52 52 57 57 52 52 52 59 59 57 47 47 32 32 23 43 32 43 33 33 33 43 44 43 57 43 50 50 52 42 42 38 43 50 52 52 52 52 52 59 59 68 68 59
57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 57 59 59 50 50 50 48 48 47 57 48 48 48 59 59 59 48 48 48 57 59 59 59 68 59 59 59 59 59 54 57 54 59 32 23 11 11 15 18 23
23 24 37 32 42 35 37 39 43 47 59 59 47 48 54 57 57 59 59 59 47 43 43 43 48 44 48 57 57 59 48 48 43 47 43 44 36 39 43 43 43 59 59 40 25 25 12 18 9 11
11 25 25 23 17 11 11 11 16 17 20 20 16 20 10 13 12 21 27 36 41 41 41 36 32 28 24 13 21 15 18 14 12 12 16 12 11 11 11 14 14 23 13 17 18 25 25 25 31 37
37 59 43 43 40 43 43 48 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 59 48 47 59 40 41 21 18 14 15 15 31 34 44 43 37 37 43 47 57 59 47 43 43 43 41 34 32 37 41 42
28 28 20 20 20 23 37 34 39 35 35 35 42 41 43 43 43 59 43 43 43 43 43 43 43 43 39 39 35 43 43 43 43 48 59 59 59 34 28 24 24 24 23 22 32 28 28 28 28 28
37 37 39 43 47 43 36 36 39 43 43 48 48 43 43 30 24 17 17 24 32 42 34 34 23 23 23 34 34 37 37 24 24 20 23 23 28 28 30 28 37 30 30 22 30 30 37 39 30 27
12 11 11 13 20 20 12 13 13 26 24 25 25 22 24 34 31 31 27 17 21 10 10 11 17 23 32 30 23 22 22 25 20 30 26 19 19 24 27 30 28 32 28 27 28 23 23 23 23 24
30 33 19 19 13 21 16 22 20 25 24 37 33 33 37 31 35 32 34 17 13 9 8 8 7 6 6 6 8 15 15 23 25 30 21 22 16 10 10 10 10 10 12 20 17 9 9 9 9 9
14 19 14 10 10 10 10 10 9 9 14 23 23 18 15 18 12 12 12 12 12 14 13 12 9 9 10 10 10 22 21 12 12 12 23 18 20 20 15 20 11 11 9 11 10 15 13 14 11 11
11 14 14 15 10 8 8 10 12 10 14 14 15 15 30 30 24 24 25 18 20 22 10 9 12 17 19 17 18 20 23 23 30 30 28 28 28 30 21 20 9 9 9 8 8 8 10 11 10 17
8 8 8 8 9 19 18 19 19 21 17 17 19 21 19 10 10 10 19 12 10 10 10 11 10 13 13 9 9 9 10 12 14 14 9 9 9 9 10 11 11 15 13 12 14 18 15 10 10 8
8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 10 10 9 9 9 11 19 11 11 9 9 8 9 9 8 8 8 9 9 9 10 10 8 8 8 10 10 9 9 11 8 10 8 10 8 8 6 6 7
10 12 15 11 9 9 12 15 15 14 7 6 6 6 8 8 11 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 11 8 8 9 9 12 10 8 8 8 8
10 12 8 10 10 8 8 8 8 7 7 8 6 7 10 8 8 8 8 8 10 8 8 8 6 8 6 6 8 10 10 9 9 8 8 8 8 8 14 12 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 10 10 10 10 7 7 8 10 6 6 8 8 12 12 12 12 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 10 21 20 12 12 12 12 15 15 13 13 9 10 8 8
10 8 8 6 6 6 6 9 9 9 9 9 8 8 7 7 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 7 10 8 10 10 9 9 9 9 9 9 8 8 8 7 7 8 9 10 15 15 12 12 8
10 10 9 8 8 10 11 8 6 6 8 7 7 7 11 16 11 11 11 8 9 9 10 8 8 8 8 8 10 10 8 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 6 6 8 10 8 15 8 8 8
8 8 10 10 9 8 8 6 7 7 10 7 7 8 8 6 6 6 8 8 10 12 15 19 12 13 6 6 8 8 6 6 8 8 10 6 6 8 6 7 15 8 9 9 8 8 9 9 8 10
10 10 10 10 3 0 3 11 8 8 8 12 9 9 9 9 8 8 7 7 15 19 15 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 10 11 11 9 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 9 9 6 6 6 7 7 9 7 7 8 6 6 6 7 10 13 17 12 9 9 9 16 15 28 21 21 10 10 10 23 23 31 30 35 28 27 22 12 11 12 24 23 36
36 38 47 48 48 50 50 50 41 47 47 27 27 12 11 11 11 12 21 16 22 16 27 30 36 36 33 30 29 35 35 34 34 39 43 39 39 32 31 23 24 19 26 23 37 37 48 48 48 40
40 37 33 30 25 17 12 10 10 10 18 15 22 22 28 29 28 28 25 31 31 57 59 57 57 57 57 50 37 37 28 28 17 17 17 24 24 48 48 48 48 43 43 35 35 35 43 43 57 54
48 47 59 35 35 35 59 47 47 43 43 43 42 42 47 35 33 25 25 25 32 21 28 21 39 25 19 11 6 6 6 6 8 19 30 34 37 36 28 23 28 28 28 28 23 34 32 59 59 59
59 57 57 57 57 57 57 48 48 48 48 48 47 47 43 43 43 43 43 43 43 43 43 46 43 43 48 48 46 43 43 47 44 44 37 24 24 19 28 42 42 37 37 37 30 44 42 48 48 40
43 28 28 28 40 32 32 27 27 43 42 42 32 32 37 37 39 42 37 47 44 44 44 47 47 47 48 47 57 47 47 43 43 46 46 44 40 27 27 17 17 17 30 30 48 57 57 48 57 57
57 57 48 57 43 43 43 37 37 28 28 28 37 37 48 43 44 41 41 41 41 28 26 23 22 18 23 22 12 13 28 30 40 47 46 46 46 47 59 59 48 43 47 43 40 39 39 39 43 40
43 30 28 28 37 34 34 26 13 13 15 34 34 54 59 59 42 42 30 39 39 39 37 43 43 43 43 47 47 59 35 35 35 34 34 28 28 23 31 32 34 22 22 9 11 10 14 17 19 19
19 15 16 3 0 3 21 21 31 31 17 17 12 23 3 0 3 9 3 0 3 9 9 9 15 3 0 3 20 13 9 9 9 9 17 19 13 11 11 11 9 11 9 9 9 8 11 9 9 9
7 6 3 0 3 8 8 6 3 3 3 3 3 0 3 6 6 9 14 3 0 3 3 0 0 3 9 9 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 7 9 8 8 7 6 8 8 8 8 9
11 15 13 8 3 0 0 0 0 3 0 3 0 3 0 0 3 0 3 0 3 0 0 0 0 0 0 3 0 0 3 8 8 9 6 6 6 3 0 3 17 23 3 0 0 0 0 3 9 9
17 18 19 11 8 7 7 11 9 9 9 3 0 3 18 18 28 28 18 26 13 15 13 15 15 18 17 17 9 9 3 0 0 0 3 8 15 9 3 0 3 6 6 6 6 10 8 8 6 8
6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 9 8 10 8 8 6 6 6 8 8 6 6 8 8 8 8 19 15 10 11 9 9 8 6 6 6 8 6 9 8 13 9 9 9 10 9 11
11 12 3 0 3 9 6 6 7 7 6 8 8 6 6 6 6 6 9 10 9 9 9 10 10 8 8 6 6 6 7 8 8 9 9 9 9 10 12 9 9 8 13 8 6 6 7 8 8 10
13 14 8 8 8 8 6 6 8 8 9 9 9 7 8 7 8 8 10 10 8 7 9 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 10 8 8 8 10 10 9 8 8 6 7 8 8 8 8 8
6 6 6 6 8 8 9 9 9 3 0 3 9 11 11 9 11 11 9 9 9 8 14 8 6 6 6 6 10 8 15 11 8 11 8 8 8 6 7 9 8 8 8 10 8 8 8 8 8 12
13 9 8 9 9 9 9 9 10 9 6 8 8 8 8 8 9 7 7 7 9 7 8 8 8 7 7 11 16 11 13 11 8 8 6 6 8 8 6 7 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8
8 8 8 7 7 6 6 8 8 8 6 6 8 8 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 7 8 8 8 8 9 9 8 8 8 8 10 10 15 10 8 8 6 6 8 6 6 8 15 10 11
10 10 8 8 6 6 8 6 7 8 8 8 8 8 13 17 8 8 6 6 8 8 8 9 8 8 8 8 7 8 11 15 14 14 11 14 13 8 8 8 8 8 8 8 10 6 6 6 6 8
9 10 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 8 6 8 8 8 9 9 9 12 12 8 8 6 6 8 8 10 10 9 10 10 8 8 8 11 6 6 7 8 8 8 8 8 8 8 8
8 6 6 6 6 8 11 8 8 8 8 6 6 6 8 13 15 10 9 8 8 13 9 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 13 8 7 6 8 8 8 9 9 8 8 6 6 8 8 8 8
8 8 9 8 10 10 7 7 8 8 9 10 12 9 9 9 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 10 8 7 6 6 6 8 8 8 8 8 12 10 11 8 8 8 8 8 6 6 6 6
9 9 9 9 8 8 7 6 8 8 8 8 6 3 0 3 8 6 6 10 9 10 10 12 8 8 8 7 7 7 7 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 10 8 8 11 13 13 8 8
8 8 8 10 10 9 9 9 10 10 9 9 9 9 9 8 8 7 8 7 9 3 0 3 6 8 8 6 6 8 10 10 7 6 8 8 6 7 8 8 8 8 10 8 8 8 8 6 6 10
8 10 10 10 13 10 8 6 6 8 8 9 10 9 9 |