BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-278A05.T7 (MSMg01no278_a05.b1) | MSMg01-278A05.TJ (MSMg01no278_a05.g1) |
ACC | AG415752 | AG415753 |
length | 712 | 721 |
length of high quality (start - end) | 484 (45 - 528) | 297 (77 - 373) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no278_a05.b1 PHD_FILE: MSMg01no278_a05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:18:14 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no278_a05.g1 PHD_FILE: MSMg01no278_a05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:18:14 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGA
ATTCTTAATTATCACCGCAGCAGCCTTATAGGATCCTTAATAGGATGTTA
AAACTTTACTTTGAAGTGAACAAAGATGATTTTTACATTCATGTTTTTCT
TGCCAAAGAACGGCTATGGACACATTTAATAACAATAACTACAATAAGTA
GCTAATATTTGATTACCACCAATTACAATCGATACCAAAAGATTACAGAA
GTTTCCTCTACTTTCTGTTAAAGCCTTTTAGTTTCTCAGCAGTTAATTTG
AATCTCACTTGATAGCACCTAACAAAGGCTTAAGTTCTCCTGTGGTGAGT
TTAAGGTGAGGTCTTAGCCAATTAATATTTCCTGGAAGCTTTCGAAAATA
ATTTGAAGTAAGCAAATCATCAATTTTTTAAAATTTTCTTATACCACAAC
TTTTCTAGGATAACTAAAATCCTAAATATTAAAAAAGATATTGCCCCTGA
ANCNTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGGAATTCAAGACAAGGTATCT
CTGTATAGCCCTTCTGGCTGTCCTGAAACTCACTTTGTATATCAGTCTGG
CCTCGAACTCATAAATCTGCCTGCCTCTGCCTCCCAAGTGCTGGGATCAA
AGGCATGTGCAAACAGCGCCCTCCCAGCTCACCTCTGAATCTTATGGAGC
AACAACTACTCC
| CGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTTTCTCAGTTTACATTCTTCCAA
TTGACTAGCATCTCCCAAGATAAGTGCCAGCTGGGATGAAAAGATGGACT
AATAATTGTAGTGCCCTGCAGATGCTGCCTGTCTTTCATCTTCATCCTTC
TACTGAGAGTATCAATGGTTCCATCACCAATTTGGATATCATGATAATAG
TTGACTCAAGGAGTTTACGTGGCTAGAGGACTAAGCTAATCTCTTTTCTA
GCATCTCAAAAGAAATGATTATATTTTCTCAGAATAAAAAATAATTCTAA
AACATCATTTTTAAAGATAAAATATCTATGTTTTGCTCATAATTTTAGAA
GCTCCTCTCTTTGATCAGTTAGTATTTCTACTTTAGCCTGTAACAAGTAA
ATACTAACAACAAAACTCTTCATAAATAGACCAATAAGTATCAGAGAGAA
GTAGTGTGTGTGCTGGGGGTGGTGGTTGTATGTATAGGATTCTATAGTAT
GCTTTATCTGCATGCTCCTAAGAACCTAACAATCACAGAGTAGGCCTCAG
TCTTTACTGTCCAACACTGTCCCAAAGTACCTTATCACGACTTTATCACT
TTGTGCCTATGGGGCACAGTCTTGATTCCAACAAATCCAGTTATGATGAC
ATAAATCTCCATCCTAGTATT
|
quality values | Open.Hide. 8 10 8 8 8 9 9 21 34 30 29 27 28 22 22 32 25 21 10 10 10 21 21 41 27 28 26 25 22 21 21 10 10 9 9 9 9 9 12 10 12 15 23 25 31 37 41 47 36 36
35 35 36 31 50 39 37 25 25 10 10 10 9 9 9 19 23 34 28 28 28 37 37 43 59 59 59 59 59 57 36 42 37 37 47 47 59 53 53 53 53 53 47 51 47 47 47 51 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 54 44 32 18 23 18 20 24 31 36 42 41 41 41 48 50 50 51 68 68 68 68 68 68 57 57 48 48 48 57 59 68 68 68 57 57
57 50 50 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 68 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 43 35 35 43 43 52 52 62 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68
68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 44 43 52 52 52 52 52 52 52 52 52 54 59 57 57 52 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 59 59 68 68 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 54
57 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 47 47 47 47 47 44 48 50 50 42 41 44 44 25 19
3 0 3 0 3 27 27 59 59 59 59 59 59 59 59 59 48 48 48 48 59 59 59 40 39 34 22 12 7 7 8 6 9 19 22 14 16 15 26 15 20 20 22 22 28 28 28 32 32 39
29 30 17 15 12 24 13 13 13 21 21 32 36 36 30 34 30 28 28 23 23 23 34 34 37 37 31 31 32 32 23 23 23 31 26 32 28 28 25 32 32 32 32 23 21 24 14 24 24 40
40 32 32 23 22 22 31 31 37 30 30 30 30 34 31 30 28 28 25 25 23 34 26 24 24 34 34 37 31 24 24 32 32 39 31 20 20 11 11 11 15 15 32 18 19 12 12 12 12 21
24 19 19 21 19 13 15 15 11 17 14 20 18 18 28 22 25 25 22 22 25 32 32 32 30 31 26 22 15 16 16 20 31 31 31 30 20 22 20 20 21 26 22 28 28 24 26 24 30 25
17 17 17 16 16 23 24 22 24 19 18 18 | Open.Hide. 6 6 6 14 15 8 8 8 8 19 21 30 27 27 23 20 22 34 34 37 39 41 41 50 50 50 50 41 41 39 34 28 18 14 13 12 12 12 19 16 24 24 31 29 37 39 57 50 53 53
50 50 50 50 53 53 53 43 34 26 16 12 10 15 15 20 29 30 47 43 42 42 47 50 50 50 68 68 68 68 43 43 43 43 42 42 54 68 68 68 68 68 68 68 57 42 42 42 42 47
47 59 59 59 57 57 53 53 53 53 53 53 59 33 33 33 33 33 23 22 12 12 11 11 12 23 28 41 42 50 50 59 50 35 35 35 35 35 38 57 57 53 42 40 47 40 47 53 53 53
53 53 68 68 51 51 51 47 53 53 54 57 57 48 57 57 57 43 48 48 48 32 42 42 57 59 57 59 54 59 54 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57
59 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 57 57 54 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 35 36 28 23 23 23 28 34 37 32 21 15 12 10 8 8 8 8 8 10 13 14 18 28 32 47 59 59 53 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 54 54 54 54 54 54 54 57 48 59 59 54 54 54 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 54 57 57 59
59 59 59 57 57 47 50 50 50 57 57 57 57 57 68 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 68 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 59 59 59 50 44 37 44 36 41 32 42 42 42
38 48 48 48 54 59 59 59 59 43 43 43 57 44 44 43 44 42 37 37 39 37 43 46 48 57 47 47 47 48 48 47 47 57 47 46 48 48 48 48 47 43 43 36 31 31 23 20 20 24
24 28 28 33 31 34 32 32 24 24 12 16 16 32 26 33 33 33 26 26 16 11 9 10 15 22 20 20 21 21 21 25 25 13 13 13 15 10 11 10 8 9 10 12 24 18 18 10 8 8
8 8 15 15 25 22 22 21 20 30 20 20 21 21 18 18 19 24 14 13 13 12 12 12 10 9 9 9 9 9 10 10 17 16 13 11 9 9 9 15 18 21 23 28 29 27 21 15 15 19
27 28 20 17 14 11 10 17 14 15 10 9 10 9 8 8 15 19 14 17 17 22 22 37 29 26 15 12 12 11 13 10 8 8 8 10 21 17 11 10 9 8 11 12 10 12 11 12 11 11
11 18 12 9 10 10 10 17 21 29 29 13 15 10 9 8 8 8 8 8 8 |