BAC Information

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BAC

Clone NameMSMg01-298P05
Chromosome3 (Build37)
Map Location 28,904,799 - 28,905,358
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream genePld1, Tnik, Slc2a2, EG624446, Eif5a2, Rpl22l1, Gm1527
Downstream gene6130401L20Rik, LOC100040676, Evi1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameMSMg01-298P05.T7 (MSMg01no298_p05.b1)MSMg01-298P05.TJ (MSMg01no298_p05.g1)
ACCAG425859AG425860
length741748
length of high quality
(start - end)
697 (45 - 741)668 (77 - 744)
definitionCHROMAT_FILE: MSMg01no298_p05.b1 PHD_FILE: MSMg01no298_p05.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:35:44 2005CHROMAT_FILE: MSMg01no298_p05.g1 PHD_FILE: MSMg01no298_p05.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:35:44 2005
singlet/doublet---singlet
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sequence
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quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
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MSMg01no298_p05.g1 PHD_FILE: MSMg01no298_p05.g1.phd.1 CHEM: term DYE:
big TIME: Tue May 17 21:35:44 2005
         (668 letters)



>mm_chr3_28904291_28905358
          Length = 1068

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 Strand = Plus / Plus

                                                           
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 Strand = Plus / Plus

                                                          
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Sbjct: 960  tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 1005


Lambda     K      H
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Gapped
Lambda     K      H
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Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 2, Extension: 1
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Effective search space used:   696164
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