BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-304B22.T7 (MSMg01no304_b22.b1) | MSMg01-304B22.TJ (MSMg01no304_b22.g1) |
ACC | AG429508 | AG429509 |
length | 1,025 | 1,253 |
length of high quality (start - end) | 37 (81 - 117) | 714 (81 - 794) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no304_b22.b1 PHD_FILE: MSMg01no304_b22.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:42:19 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no304_b22.g1 PHD_FILE: MSMg01no304_b22.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:42:20 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | NNCCAAATTNNNNNNNTACAGTGGGCGCATAGACTACTAAGGGAGAGGAT
CGCGGAATTAATCATTCTTGTAGTTCGTATATACACAGTATAATCTTTGT
ATTTTGCTCACTCAGGCTGTGTGTTGTGTAAGTATGCATACATTATATAC
ATAACCATTTATGCATATTTAAATAAATAAAAATNNNTTAANNNNNTTTT
TTAAAAATTTGAAATCNTAATTCTAATGTAAACATAGAATTCTCTGATAT
TCTGTGGNCATTTTATATACCTGAACCGTTTATCAATATTNNNNNNNTTA
AAAAAAAATTGNANNTCTGNNNNNNNNNNNAAGAAATAATTCAAACAAAA
ATTGTTTCCATAAAAAAATATAANNNNNGNNTANNNNNNNNNNNNNNNTT
TTTTTTAAANNNNNNNNTNGNNTNNNNNNNTTTNNNNNNNNNNCATANNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTANNNNNNNNNNNNAAAAAAAAAAAAA
AANNNNNNTTTTTTTTTAAAAAAAATTTTTTTTTTTTTTAAAAAGAAAAA
TATCCNTATTTAAAAATTTTTNAAAAATTAAAATTTTTTTTTTTTTTAAA
ATTTAAAAAAATTTTTTTTAANANTTTTTTTTAAAAAAAAAAAAAGGNNT
AAAAAAAAAAAAAATTTTTTTTTTTTNNNANAAAAAAAATTTTTTTTATA
NTTTTNNTTTTTTTNNTTTTTTAATTAATAAAATATTATTATATTTTTTT
TAATATTTTTATAATTTTANTTTTNAATTTTTATAAATTNTATTATTTAT
TTTATTTTATTTTTTNTTTTTTATTNTTAAATTTTTTTATTTTTATTTTA
ATATTTTTTTTAATTTTTATTTTTTAATTTTTTAATTTTTTAATATTTAT
AATTTTTTTATATTTATTTTTATTTTTTAATTTTTTTTTNTTATTTATTN
TTNATTTTAATTTAATAATTTAATTTNNTTTNTTATNAAAAAAATTTATT
GTATNTGTTNNNTTATATTANTNTG
| NNCCGATTTTNNNNNNNTATGATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTTTAAAGATATATCTAAAA
GAAACTGAACCCAGCAATTAACGAGCAGAGGTTAGATGGCCCAGCATGTT
ACATGAGGTTGTTTCAGTGGGATTTAACATCTATGTCTAATAATTTAAAA
ATACTTCTAATTCTGGCACAGGATGGAGCTACACAATGAAACTTCTCACA
ATTAAAGCAGTGCAGCAGCCAGGCTAAGATTAGGCTTTTTGTTTGGTGTG
TAGGTTGTATCCACATTTATGCAGAACAGCTAGGATAAAATCAGAAATTT
CTGAGAGGTATCCGATGGGGAGGAGTGACAGCTTTGTAGTTGCATTTATG
TTAAACATCCCTGATAGAAAACATATCTACAATAAGATAGGTATGCTATA
GTTTATTAAGGTTTCTTAAAGTCATATCTCATTTAACATACATGAAAGAT
GTCATGTGAATGTTCATTTACACAGAAACCATGGTCCCCATGAAGGTAAA
TCCTGTTTTGTTTTTTGTTTTTTGTTTCTTTCTGGAAGAGCAATGTGAAG
TGTGGTCACCTTTTTGGTGCTTGCACTATGGCGATTCTTTGTGATGGACT
TTACAGAGTTTTACTTTGCCCCCTAAATCATGTTCGCAAACTCTTTCCCT
TATGTCATTATTTTGTGTATCTATTTTCCCAAAGACCTAGATTCTGTTCA
AGCATAGCTCTCTTTAAATTCCTTCCCTGTTAGGCAAAGTTCACACAATA
GACTCGAGACCTCTCAGCTGGTGTTTATGACTACATCAAGTAAGTCATGG
CCATCAGAGTGAACTGTTTAATTTAAAGGAAGGAGATTTTTAATGGATTC
TTCCCTGGAGTAATTATTAATATGGGAAACGCTGGTTCTTAAAAACGTTA
AGCCCCCCAAATCTCCCTGGAAACTTGGTTTCCTTTTTCTCCTGAACCCC
CTAGTTTGAAAAATAACTTANCAGGTTTTTCCTCCATCAACGGTTAAAAC
CCCCGGCCTCCCACTTTATGGGGTCTTCTTCTCTTTAAAATCATACAGCA
TTTTTTCCTCTCACCCAATTTCCTTTTTTATCTAAAGGTATACCTTTTCA
TAGTCTTCTTATTTTTTTCCCCCCCTCTCAAAGGCCACATTTCAACTATA
TTATTTTTTTAATTTATTCCCTCTTCTCCCTATCAATTTATATTTTTATT
TTT
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 7 6 8 8 6 3 0 0 0 0 0 0 0 3 6 6 6 6 6 7 6 7 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 19 15 9 10 12 11 10 10 10
10 21 21 30 37 21 21 16 22 19 27 27 37 39 50 50 53 35 31 28 28 19 15 9 9 9 9 9 9 9 15 21 26 30 34 24 13 12 13 19 28 38 36 38 53 38 42 42 37 37
35 35 42 53 36 35 35 31 31 31 30 31 23 22 10 10 9 9 9 9 9 13 11 12 19 25 29 31 29 29 24 22 22 22 31 28 39 37 39 47 47 53 50 47 47 44 44 39 37 37
37 37 37 32 26 24 28 23 20 22 25 30 28 37 21 19 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 10 8 8 3 0 0 0 3 7 6 3 0 0 0 0 0 3 13 13 22
24 22 22 23 26 26 26 41 41 41 44 41 32 14 21 3 0 3 9 9 9 10 15 22 22 19 19 22 14 12 12 9 9 11 14 9 9 9 9 9 9 11 15 19 16 20 11 11 10 15
12 12 15 10 9 9 3 0 3 9 10 10 13 14 11 10 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 13 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 9 3 0 0 0 0 0 0 0 3 9 9
9 9 9 15 15 15 8 7 8 9 3 0 3 0 0 3 6 6 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 10 10 10 10 9 9 9 7 10 6 8 6 6 6 9 10 11 11 12
10 10 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 17 12 7 6 8 8 6 6 3 0 0 0 0 0 3 0 0 3 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 6
6 8 11 7 6 8 6 6 3 0 0 0 0 0 0 0 0 3 0 3 0 0 3 0 0 0 0 0 0 0 3 7 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 6 8 3 0 0 0
0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 6 3 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 3 10 8 10 10 10 11 10 8 8 8 10 10
9 3 0 0 0 0 0 0 3 8 8 8 10 9 15 10 8 8 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 11 8 8 6 6 7 8 8 10 8 8 6 6 8 6 6 6 8 8 7 6 6
6 6 6 6 3 0 3 7 8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 9 9 3 0 3 8 10 8 8 8 10 10 8 8 8 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 9 9 9 12
11 11 10 8 8 8 6 6 6 9 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 8 17 17 10 10 8 11 12 6 6 6 3 0 0 3
6 8 8 10 10 10 26 22 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 9 3 0 0 0 3 0 3 8 10 8 8 8 8 8 10 9 10 8 8 8 8 8 8 10 3
0 3 8 8 3 0 0 3 8 8 21 8 8 3 0 0 3 17 19 15 15 10 9 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 12 14 15 10 8 8 8 8
8 9 8 8 7 6 8 8 8 8 10 8 11 8 8 8 8 8 3 0 3 15 13 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 3 0 3 8 10 8 10 10 8 8 15 15
13 13 8 8 8 10 10 10 8 12 12 10 8 8 3 0 3 9 8 6 6 6 6 8 3 0 3 8 10 10 9 8 8 8 8 8 8 12 8 8 8 8 8 8 7 7 8 6 6 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 12 11 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 12 21 8 8 8 8 8 13 15 34 24 24 19 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 9 9 10 10 9 9 8 8 6 6 8 8 8 10 8 10 9 9 9 9 10 10 9 7 7 6 8 8 9 9 10 8 8 8 8 8 3 0 3 9 15 8 8 8 8 8 3 0
3 3 0 3 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 12 8 8 6 7 3 0 0 3 7 3 0 3 8 8 3 0 3 6 6 6 8 7 8 8 6 6 8 8 8
6 6 8 3 0 3 9 9 3 0 0 0 3 8 8 8 10 12 10 3 0 3 0 3 3 | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 11 12 11 3 0 0 0 0 0 0 0 3 6 6 6 6 7 6 3 0 3 8 6 15 6 6 6 7 11 8 9 11 6 6 9 8 8 8 14 15 19 8 9 9
22 19 20 15 18 24 33 36 36 36 37 37 37 37 37 42 42 38 50 50 53 53 53 53 50 44 30 27 12 11 15 12 16 11 11 11 23 21 30 33 33 36 30 30 36 35 36 36 53 57
57 53 53 53 50 50 53 53 53 53 53 53 44 44 39 50 31 28 21 15 10 10 11 11 12 24 25 36 39 47 33 33 33 28 24 23 32 28 35 35 43 43 57 57 53 53 53 47 47 47
47 43 43 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 50 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 53 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 47 32 37 22 23 11 11 11 25 27 41 47 50 50 50 50 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 59 59 54 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 59 59 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 52 57 57 59 59 59 57 57 57 59 59 59
59 57 57 57 59 57 52 57 57 57 57 68 68 59 59 59 59 59 57 59 59 59 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 52 54 54 57 59 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57
57 59 59 57 57 57 50 48 48 59 59 59 57 57 57 57 57 54 54 54 57 57 68 68 68 57 59 59 59 59 59 54 48 48 48 48 54 59 34 34 20 20 28 44 44 68 68 68 68 57
57 57 57 54 57 57 59 57 57 57 57 57 43 59 41 41 41 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 47 47 47 47 48 59 59 48 48 37 41 28 30 28 37 36 41 41 43 23 22 13 13
13 22 34 37 39 36 39 39 47 47 47 48 57 59 57 57 57 50 47 47 41 41 37 42 42 41 39 41 41 26 26 28 22 22 34 31 32 32 30 27 27 27 23 16 14 14 11 10 17 8
14 14 26 26 25 25 11 11 11 25 25 37 39 32 32 24 24 30 23 22 16 16 16 25 27 32 38 41 41 41 37 19 17 11 11 12 16 19 20 15 15 9 9 9 14 19 12 8 8 8
10 12 24 18 13 10 10 7 8 8 8 15 8 10 11 12 13 19 16 14 14 9 9 10 10 11 12 11 20 11 11 12 14 12 14 12 14 10 11 10 11 13 11 11 10 12 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 8 8 8 8 15 10 13 6 7 6 7 7 7 9 9 10 10 10 10 10 11 11 11 11 8 11 9 9 8 10 12 23 15 13 11 8 8 14
8 8 8 25 24 16 12 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8 6 6 10 8 10 9 8 8 8 8 8 8 10 10 10 25 25 21 13 8 6 6 7 6 10 10 10 10 8 8 8
11 8 8 6 6 8 10 11 13 11 17 8 6 6 6 8 8 10 12 3 0 3 13 10 16 15 19 10 10 6 6 6 6 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 9 9 10 9 9 9
11 17 19 16 12 8 8 8 8 8 10 8 13 13 20 17 13 8 8 8 8 10 9 9 9 8 11 11 10 10 10 10 10 13 18 11 25 16 18 8 8 8 12 13 10 8 8 6 6 6
8 10 10 12 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 15 22 27 14 7 7 7 6 8 11 18 16 12 12 8 9 9 8 8 8 8 8 8 10 10 13 11 10 10 8 13 9 8 9 8 8
6 6 8 8 12 12 8 6 6 6 6 8 8 8 9 15 12 22 12 19 15 15 19 12 12 6 7 6 6 8 8 19 13 8 8 6 6 8 8 7 8 8 6 6 8 10 9 10 9 10
10 10 10 19 19 32 23 29 23 12 12 11 10 19 9 9 9 9 9 9 9 11 11 8 8 6 6 8 8 9 8 8 6 6 6 8 8 9 9 8 8 12 12 16 15 14 11 15 10 9
9 9 9 |