BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-305L16.T7 (MSMg01no305_l16.b1) | MSMg01-305L16.TJ (MSMg01no305_l16.g1) |
ACC | AG430603 | AG430604 |
length | 1,319 | 1,294 |
length of high quality (start - end) | 419 (47 - 465) | 784 (89 - 872) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no305_l16.b1 PHD_FILE: MSMg01no305_l16.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:46:02 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no305_l16.g1 PHD_FILE: MSMg01no305_l16.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:46:02 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NCCTATATNNNNNNNNCTCAGTGGGCGCTATAGACTCCTAAGGGAGAGGA
TCCGCGGAATTCTGTAAGTCAGAATCCTGCATTACTCTCAAAATTCTTCT
TGTGTACTTTCACATATACTCTTGAAAAATCTTAGCATTTTATTCAATGA
ATACATTAATGCAATATTGCTAGTTTATGCCATCAGTTTCATCTAATTAT
TAAAAAGAGCTACCTAGTGTGACCGATTGCCTTTCTACTGTTGTAGTCAT
CTTTCTATAATTTACTGATGAAAATTATTTTTAAATCCACTTTCATCAAG
CTATATTTAAGATAAAATCACAATGTTCCTGGATAAGACATTTTGATATT
CATTCCTTGGGAAGACAAATACTTGCTCTCTCCCTATTCCTTATTTTCCT
ATATTTCTTTGTTGTTAGGGAACTCCATTAGATTTCCCTTTAGACATTAG
AATGTATAATGATATTGTTTGTCCCCCCACCTATATTTTTGATGTTTCAC
AGACAAAGCTTCTTTGCTATATTAAGAGAAAAAAATCACAGTAGACTTTT
TATCCCCCTTTCTCTCCTCTCGTTCCTGTTTTTTGCTTGAGTCTTAGATG
CAGAAATACCACACAAAAAATTATTACATTTTGACGAATTTCTTAGTTTT
GATGGACTTTATTGTTATGGGGGTTACACTTATCTGTGCATATAAGTGTA
TATGTTATCATTCAGCTAAGAATTATGGTGATTTGTTAAGTGGAAGTCGG
AGGTCCCCTCTAAGATTCATGACTTCTTTATCGCTGGGTAGTTGGCTAAG
TTTCTAATACCAGGCATGATTTTCATTCTGTTGAATTGGCCTTAAACCCA
ATTAAAAATCTGTCAGTATTCTCCAAGATATGAGTTTGGCCATGAAACCC
TTTAGGACCAGTTTTTATGCTAGTTATGTTTGTAGTTCATAGATACATCT
GTGTAAAACTAATGGTTGCTTTATTCTTTAAAACCTGCGGAAAAATTCTC
ATACTATTAAAAAACCCCATCCTCTACTTCTGGGAGTTTTTCTGGCCAAT
CCAATTTGATTCCTCAACTCCAAAGCTAAAAGCATGGGGCTTCCACAATT
GGAAAAGCCTCCACCCCCTCATAAAAAGAAGGGGAATGTAAACCCCTCGT
TTTGATATTTATCTCTCTCAAAAAACACAAAAAAGAGTGTTTTTTAATAT
AACTAGATTTTTTATATTATATACATGTAAAAGTCTCTCATATACTATTG
TGTATTATTATATGTTTTTATTACATTTATCACATTCATACAATAAATCA
TATATATTCCTGTTATACC
| NCCCGTTTTTNNNNNNTCCGCATGGAGNCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCTCTTAATCTCAATCGAAATA
TCTACAGTGCAACTTCTATACCTATGTGAAGCTTAGGGATCATAGAAGAA
AGTTCAGAAAGACTGTACAAGAATGTCTGATGTCTGTATCTTCTAGATGT
AACAGGGAAGCTACATCTGTGAACTCTCAACAATAATGTCACCTAAATAA
GACCCACATAAAGACATCAGTTGACATGTCAACATGGATGGAGGAAAATT
TACAAGGTTCCATGTAAAGATAAAGACCTATGGTTATAGAGGAAGGAGAT
CAGTTTTCTCCTATGTACCAAGGGGGTTATTTATCCATATGGTAGAATCT
GCCCAATGAGACCCATTTAGTCAGCCATAAATACATTGTCTTAGTTCATC
TTTTGTGATAAATCCTATGAGGAAGACCAACTTGAGAAAGAAGGGGTTTA
TTACATCTTACAAGTTAAAGTTCACCATGAAGGGAAGCTATGGCCAGGCA
CTCAGGGCAGGAATTTGGAAGCAGGAACTGATGGAGAACCATGGGAAAAT
ATTACTTACTGTTATTCCATGTCAGGTGTAGTCTGCTTTCTTGCACAGCC
TAGGACTACTTGCCAGGGGTGTCACCTCTCATAGTAGCCTGGGCTTTCCC
ACATCAATCAGTACTTAATAACTGCTCTACAGACTTGCTATTCTGACAGA
AGTAGTTCCTTAATTGATATTCCCTGTTTCTAGATGGTTCTAGTTTGTGC
CAAGCTGACAAAACCCAGCCACCATGAATATGTACAAATGAGCAACATGA
ACTCATACACATATGTATTTATTTGTGTGTGCATGTGTGTGTATCAGTAA
TAATTAGAGAAGAAAGGCCATGAACTCAAGAGGGAGTGGGGACACACAAA
GAGTTTTATAAGAAAATGGAGGGGGGAAAAAGGGATAATACCCCTGGGAG
AAATTCCCCCAAAATTTTTTATAAAAACAATCTGGAAAAGGAACCCTTTT
TCGTTTTTTATTTTTTTCACAAAGGGGAAACCTTTCCGCTTTTTTGATTT
AAAATTTCTCAAAAACCAAAAAAAAGTGGAGAGAATGGGGCTTTTCTTTA
ATTTTTTTTCCCTTTCTAAAAGGGCCATTGGAGGCTTATAGGGTTTTTTT
CTCAAAATTCTCTCCAGAGCGGAATCTAATTGACAGGGGTGTAATTCCCT
CCAAAAAACAACCTGATATCGTCTAGGCATCAAAGGTTTCTTTT
|
quality values | Open.Hide. 0 3 7 6 6 6 6 3 0 0 0 0 0 0 0 0 3 11 9 6 6 6 8 8 9 10 8 8 6 6 6 6 8 10 15 9 8 8 8 8 8 15 21 28 18 24 23 22 22 29
37 37 37 37 39 39 39 39 28 32 37 29 30 31 31 31 31 31 36 36 36 53 50 50 25 25 16 13 13 16 13 11 10 10 10 17 17 23 23 29 39 50 50 47 53 53 50 50 50 50
50 50 37 37 37 42 42 42 53 53 50 36 31 31 31 31 25 27 10 12 9 9 9 9 10 21 28 41 37 37 33 33 33 36 39 47 59 59 50 50 50 53 47 53 50 50 50 57 57 50
50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 51 50 50 47 51 50 50 50 50 50 50 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 57 57 32 28 16 16 13 13 24 32 48 57
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 57 57 68 57 57 54 54 54 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 59 59 39 32 28 20 12 10 11 12 23 25 41 41 41 41 48 48 59 59 59 57 57 57 57 57 44 59 59 59 59 59 57 53 50 53 53 50 48 44 59 43 43
59 59 59 59 59 59 59 59 47 47 32 32 23 19 19 12 12 13 23 22 12 11 11 10 9 8 8 8 8 8 19 28 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 30 30
12 12 11 12 12 29 15 18 18 28 30 43 43 46 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 48 48 48 57 59 59
59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 54 54 54 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 54 44 44 43 43 48 57 57
57 59 59 59 68 57 68 68 68 68 68 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 68 68 59 59 59 59 59 59 68 57 57 57 48 48 48 59 59 59 57 57 44 44 23 23 23 44 44 59
59 59 59 54 57 54 57 57 57 59 54 47 47 59 59 59 59 59 48 48 59 59 59 57 57 57 54 54 57 59 59 59 57 57 59 59 59 59 59 59 59 48 42 42 42 42 48 43 43 48
57 57 59 48 48 48 59 59 57 50 48 48 48 46 47 59 59 59 43 30 28 28 30 41 37 34 31 36 29 29 29 29 33 31 47 44 44 41 37 44 39 37 37 39 39 40 39 36 30 30
24 19 22 30 34 37 37 41 41 39 29 27 12 12 11 15 16 32 32 37 37 33 36 36 43 43 43 43 41 41 39 39 35 43 30 28 15 14 14 14 23 18 27 27 25 32 41 32 31 37
31 32 37 39 39 39 32 37 37 28 24 21 17 12 21 12 15 19 23 24 20 28 20 17 28 30 31 18 18 13 27 21 41 37 37 31 24 19 20 17 15 18 20 23 23 24 22 22 25 31
32 30 30 35 30 31 30 30 32 34 34 34 28 25 24 11 10 8 10 10 17 28 31 25 34 28 28 14 18 18 23 18 12 9 9 11 11 22 20 25 18 30 18 14 11 11 11 11 11 11
15 13 10 8 8 8 8 8 8 9 9 19 24 24 24 15 15 13 17 11 11 8 8 8 8 11 12 13 11 11 15 8 11 10 16 8 8 12 10 10 9 9 9 9 9 10 9 9 9 10
9 9 10 10 11 21 23 27 18 16 10 7 7 6 8 8 8 8 8 8 16 11 12 12 11 11 12 13 13 13 11 9 9 9 10 10 10 9 9 10 10 17 15 19 13 7 6 6 6 8
8 8 8 8 8 8 8 9 9 9 24 14 15 10 10 8 10 8 8 8 8 10 9 9 10 9 9 9 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 15 8 6 6 6 8 12 11 12 11 13 15
15 13 18 12 18 18 12 12 12 11 8 8 8 8 6 6 9 11 12 12 18 12 10 8 8 8 10 10 9 14 12 8 10 7 9 8 10 12 12 10 13 10 12 19 17 13 12 11 11 10
10 12 16 24 29 37 20 18 11 11 8 8 7 6 8 8 8 7 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 17 10 8 8 8 8 9 13 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6
8 8 8 8 8 8 8 10 14 12 9 9 10 10 6 6 6 6 8 8 8 8 8 11 9 9 9 14 9 15 15 28 10 10 9 8 8 8 8 8 10 12 7 9 9 9 9 9 10 7
6 8 8 9 8 8 8 8 8 17 22 13 6 6 8 8 10 11 8 8 12 8 9 9 15 15 9 9 18 14 10 12 10 8 8 8 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6
7 8 8 9 10 10 11 11 11 8 8 6 6 6 6 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 12 12 10 10 9 10 13 8 8 8 8 8 9 9 10 18 21 10 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 11 10 7 7 7 8 8 6 6 6 8 10 8 | Open.Hide. 0 3 11 8 7 7 10 11 9 3 0 0 0 0 0 0 3 6 6 6 6 6 6 6 6 8 3 0 3 6 6 6 6 8 10 13 8 7 9 9 12 10 16 19 15 15 8 10 10 22
19 20 20 28 28 35 35 36 37 37 37 34 34 35 36 38 36 36 41 41 50 50 47 47 28 27 12 9 9 9 11 11 12 12 16 16 22 19 17 19 22 37 37 44 53 50 50 50 53 36
38 42 42 42 37 37 35 38 38 35 36 47 36 31 31 30 26 24 14 12 12 10 9 9 9 9 13 18 30 33 39 30 29 31 36 47 47 57 57 57 50 50 50 50 53 53 59 59 59 59
59 57 50 54 54 54 54 54 59 59 57 57 54 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 38 36 24 24 24 44 44 57
68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 57 57 68 68 57 57 57 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 57 68
57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 50 50 44 33 33 27 22 19 14 14 14 14 15 16 18 25 41 41 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 59 68 68
59 68 59 59 54 57 57 68 57 57 54 54 54 59 59 59 68 57 57 47 47 47 57 57 57 44 44 37 30 33 33 44 44 44 43 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 59 59 54 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 59 59 59 59 59
59 59 57 52 59 59 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 52 57 57 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 59 57 59 59 57 57 57 59 48 54 48 59 59 48 48 48 48 57 57 43
43 30 30 30 42 43 59 57 57 57 59 59 57 57 48 48 57 57 59 59 59 57 48 48 43 43 43 47 47 47 37 47 41 39 37 37 37 34 35 39 41 41 44 59 41 41 41 41 41 43
43 48 48 57 59 48 59 48 48 47 47 59 47 59 59 44 37 37 17 17 8 8 8 22 28 41 47 39 47 43 43 43 43 43 43 48 48 48 48 46 59 48 47 47 47 39 39 39 35 31
34 39 39 37 37 31 31 43 59 59 37 32 35 37 37 37 39 40 40 41 43 48 48 48 48 48 48 48 59 47 41 39 39 39 39 31 36 36 29 21 19 18 15 14 14 22 41 43 32 27
25 25 25 32 37 34 34 28 23 20 31 34 41 37 37 41 43 34 31 24 28 30 37 37 39 30 24 25 27 37 37 39 37 40 35 32 32 32 34 34 16 16 11 11 11 27 25 39 37 29
29 30 34 25 25 20 31 18 20 20 24 24 37 37 37 37 34 31 23 20 24 22 16 18 17 20 15 18 12 12 12 28 23 26 12 12 12 12 12 12 12 11 11 15 22 9 9 14 14 14
16 15 18 12 12 10 10 11 16 10 8 8 7 8 8 9 11 14 11 10 10 15 10 9 9 10 9 9 9 11 9 14 14 16 12 11 10 10 12 17 12 15 11 8 8 8 8 8 8 8
8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 9 11 10 11 8 8 8 8 9 9 9 9 9 11 13 17 21 16 12 12 12 10 8 8 8 10 6 6 6 6 6 10 10 10 12 11 11 10 10
10 13 12 12 8 8 8 8 8 16 19 25 24 24 22 20 28 18 16 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 6 6 6 6 8 13 8 8 6 7 6 6 8 10 8 10 9 8
8 8 9 9 10 13 19 8 8 8 8 8 9 10 9 9 10 10 6 8 8 13 8 10 9 8 8 8 8 8 8 13 11 8 8 8 8 8 11 9 8 9 9 10 8 8 8 8 9 8
9 12 9 18 12 7 8 6 6 10 6 10 8 10 8 8 8 8 11 16 30 24 10 10 10 8 8 8 8 8 6 8 8 8 8 8 12 17 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8
16 26 20 21 14 14 13 15 11 6 6 6 6 8 10 6 6 8 10 8 7 7 7 7 8 7 6 8 6 8 8 8 8 10 11 11 10 8 8 8 8 8 10 11 12 12 8 9 14 8
6 6 6 6 10 10 12 11 11 8 8 6 6 8 6 8 8 6 6 6 6 8 8 13 13 8 8 6 6 8 8 8 6 6 8 6 8 6 8 6 6 6 6 9 10 20 9 9 9 13
9 9 9 10 10 7 10 6 6 8 7 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 10 10 9 9 9 9 9 9 10 20 8 8 6 6 6 6 8 8 11 8 8 |