BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-305M17.T7 (MSMg01no305_m17.b1) | MSMg01-305M17.TJ (MSMg01no305_m17.g1) |
ACC | AG430648 | AG430649 |
length | 1,280 | 1,278 |
length of high quality (start - end) | 410 (45 - 454) | 389 (82 - 470) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no305_m17.b1 PHD_FILE: MSMg01no305_m17.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:46:10 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no305_m17.g1 PHD_FILE: MSMg01no305_m17.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:46:10 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | NNGGCCAGCACTGGGCGCTATAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGA
ATTCTGCAACGCTGAGAACCCATCCAGAGTACTAAATTCAACTCAAAGTG
CCAGGTTTGCTCTGGCAAGCACAGACCATGATGCCTGGCAAAGTAACCAA
CTCAAGAGGAGGGAGCAATCCTTACATGTGTGACGAACTCTGGGGGGGTG
GTTCTGTACTTTCTGAGATTCTAAGCAAGGAGAGCCTGGGTGAACATTAA
ATTGAACCCATTATTAGTAACTACCTCAGATGGCCTGGAGTGAGGGGCCA
GTTCTTAGTAGTTAGTGCATGTTGTGCAACTTCGCACACCTGCCTGAGAC
TGGACTCCAGAAGACACCTAAGAAGCCAGAGCAAACCTGTGCATGTCTGT
AATCCCTGCACTGGGGACAATGGACACAAGAGACTGTATGTAGCCAAGGG
TAGTTTTGTTTTTCCCCCCCCTCCTGCCTTAGCCTGATGAGTCAAAAAAA
AGCGGGCCCAATTCTGAAGTAATTGTTACTACACTATCATGACTTGACTC
TTGTAATTTAAAAAGTAAAGGCATGTAGACAGAGGAAGTAAGAAGCTAGA
GACTTCTGTACAAGAAACAGAAGAGATACATCCATGTAACAGCAACAACA
TAGTTACTGTGTCTTGATGTGCAACCTGCTAAACTATAATGCTATGGATG
GGGAGAAGTTATATAATTTATGCAAATATACAATATTATAAATATATTAT
TATTATTGAGGCAAACAGAAATTAAGGTTATGTAAATTAGAAAGAAACTT
GGGAGAGTTTTACATATTAAAGACATAAATTATTTCTTCATATAGCTGTA
TATAGGAAGTGGTATAAAAAAGAACCTTTTATTTCATTACTATTTTTACT
CTCTAATGTTCAGTGTTGATCATGTATAAAATCTGAGGTGTGTAAATGGC
GTCCTTTCCACCATGCCCTAATTCCCAAATAAGGACTCAGGGGCTTATTA
TTTTTTTTAAATGCCCCTGTGCCACTAGCCCGGAACCCTGTTACTTTAAA
CTTAAATATACCCCTTCTACTTTTTTTATATTTGGTGGGCCCAGGGGAAC
TCCCTTTTGTTTTATTATAAAATTTTTCCCTCTCCAAGGAAAAATTTCCC
CCCCCTAAATATTTTTAAAATATCTCCCCGCTTTAATCGCCCCCTTTTCT
CCCGCCCCTTAATGGTCCCCAATTTTATTTGTAGAGAGGTCTCTCTAAAC
ATCAAAATATTCTATTCACATCGGTATCTT
| NNNAACTTNNNNNNGCCTGATGTGATGCTGGGGCGCCXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAAATACAGAATAAATATTT
CCGTTTTTATTGAAAATATTCCTTTCTTGTACACTATATCCTGATTATAG
TTTTCCCTCCTTCTATCTCTCCTAATTCCTTCTGACCTCTATTTCCCTCC
ATATCCACTCCCTTTCTGTCTTTCATTAGAAAAGAACAGATTTCTAAGAG
ATAACAATAAAAATAATAAAATAAAATATAAAATGAGTAGTTGTACCAGG
TTGCAATCCCATCAACAACGGAGAAGTGTTCTTCTTTCTCCACATCCCCA
CCAGCATCTTCTGTCACCTGAGTTTTTGATCTTAGCCATTCTGACTGGTA
TGAGGTGGATTTTTAGGGTTGTTTTGATTTGCATTTCCCTAATGACTAAG
GATGTTGAATATTTTTTTTTTTCCCCCCCGGNNATACAATATTCCTCAAT
AAAAAAAAGGGGGTTTAACTCTTTACCCCACTTTTAATAGGGTTATTTGA
TTGTCTGGAGTCTAGCTTCTTGAGTTCTTTGCATATATTGGATATTAGCC
CTCTATTGGATGTAGGACTGGTAATGATTCCATTCTGTTGGTTGCCGTTT
TATCTTATTGACAGTGTCCTTTGCCTTACAGAAGCTTTACAATTTTATGA
GGTCCCATTTGTCTATTGTTGATCTTAGAGCATAAGCCATTGGTGTTTTG
TTCAGGAAAATTTCCCCTGTGCCCATGTGTCCAAGGCTTTTCCCCACTTT
CTCTTCTATTAGATTCAGTGTATCTGGTTTTATGTGGAGGTCCTTGATCC
AGTTGGATTTGAACTTTGTACAAAGAGATAAGAATGGATCAATTTGCCTT
CTTCTACACACAGAACCCCGGTTGAATCAGCACCTTTTTATTGAAATGCT
GTCTTTTTTCCATTGGATGGTTTTAGCTCCTTTTGTCAAGATCAAATGAC
CCATGGTGGGGAGGTTCATTTTCTAAACTTCACATTTATTCCCTGGAAAA
ACCGCCCGGCTCTGTACAAAAACAATAAAGTTTTTGGGGGTTGTTTTTGA
GTGGGGGGGAAAATTTTATAAACAAATGGGCCGAAAAAAAACTGTAGCAA
GGGGAGATAAATTTCCTCCACATACTTTTTGTTATAAAATATGGACAGAC
CTTATATATCTCTTGTTATACCACAAAAATCTTACAAAAAATAGCTCTTA
TCGTTCTATCGCTTAGTTATAAACGCCA
|
quality values | Open.Hide. 0 0 3 6 6 6 7 8 7 7 7 7 8 8 14 15 16 14 10 10 8 8 8 12 15 22 23 23 23 23 21 18 26 26 42 37 28 33 30 36 37 48 48 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 51 50 50 50 51 51 68 68 68 68 68 50 50 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 48 47 47 50 50 50
50 57 57 57 54 57 57 57 57 51 50 50 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 50 50 50 50 50 68 68 68 57 57 54 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57
57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62
62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 44 32
18 18 11 12 12 12 18 26 26 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 48 48 48 48 48 57 59 59 59 59 59 59 59 59 50 50 50 50 47 34
30 18 12 9 11 10 9 9 9 12 15 20 12 10 16 13 17 15 15 16 11 11 11 27 29 59 59 59 59 59 47 30 24 25 23 37 39 29 23 15 11 9 9 12 12 12 15 15 11 9
9 9 9 9 12 12 29 29 47 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 35 42 42 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 57 68 59 59 57 57 57 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 54 57 57 57 57 57 57 43 59 47 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59
68 68 68 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 50 53 48 48 48 53 59 50 50 50 50 50 50 59 59 53 53 57 57 57 50 59 34 34 23 23 23 34 34 44 44 36 36 30 29 25
26 28 31 37 30 37 30 30 25 31 37 43 59 59 59 44 41 41 44 59 36 34 28 22 22 36 36 59 36 36 28 28 28 37 37 50 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59
59 59 39 33 33 33 33 32 32 31 31 39 41 47 37 31 30 30 37 30 30 28 22 17 21 26 25 30 24 34 33 26 26 14 14 14 17 25 28 28 28 35 34 39 19 15 15 17 16 16
24 20 27 19 21 15 10 10 11 14 11 14 16 18 23 22 22 21 21 21 21 27 24 17 9 8 8 8 10 12 17 41 41 37 37 39 31 20 22 25 30 26 24 20 24 24 34 20 19 18
32 27 34 16 14 12 16 16 17 21 16 14 14 13 17 11 12 12 21 17 18 12 8 8 8 8 11 14 16 19 19 24 26 28 19 19 29 24 28 23 32 28 25 20 29 23 22 24 32 35
28 24 14 16 14 16 17 22 19 21 13 8 7 7 7 13 17 25 16 20 20 18 18 12 8 8 10 8 12 14 16 21 18 18 22 13 15 10 9 9 9 9 12 15 16 13 10 8 8 8
8 9 10 13 16 30 18 25 18 13 12 12 12 19 22 21 19 12 15 11 14 17 13 12 10 11 9 9 9 9 8 8 8 11 9 9 9 9 10 9 9 8 8 15 15 10 9 16 16 10
10 10 8 8 8 10 12 9 9 9 13 13 9 19 16 15 7 8 6 6 6 8 13 13 11 11 13 12 12 12 10 11 12 12 12 11 12 11 11 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 11
13 13 11 10 8 7 8 7 7 10 11 9 9 9 9 9 9 11 15 15 15 25 27 20 10 10 8 8 9 9 9 9 9 8 10 10 9 10 10 10 10 12 16 11 9 8 10 9 9 9
9 8 8 8 8 8 11 10 12 12 8 13 8 9 9 12 12 8 8 8 8 12 15 12 10 8 8 8 9 8 8 9 9 10 8 8 6 6 6 6 13 14 10 10 8 11 7 6 6 6
10 10 11 9 17 10 8 10 8 8 8 8 9 11 10 15 14 19 10 8 8 8 8 8 8 8 17 13 7 7 7 10 8 11 11 8 8 6 6 6 7 10 9 9 9 19 11 8 6 6
8 6 6 6 6 10 13 7 6 8 8 8 8 8 6 8 9 8 6 6 8 8 8 8 11 8 8 8 11 11 10 10 8 8 6 6 8 8 12 15 10 10 15 8 8 8 8 8 11 10
7 6 8 8 12 11 8 8 8 10 10 6 6 6 6 8 8 8 8 9 9 6 6 6 6 8 6 10 10 10 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 8 3 0 0 0 0 0 0 3 9 9 6 6 6 6 7 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 8 10 13 8 6 9 3 0 3 3 0 3 9 9 9 21 19 19
10 17 22 35 36 36 35 35 35 35 42 37 42 47 42 42 34 47 48 48 50 57 54 57 57 57 48 48 42 57 48 42 47 47 50 47 47 47 57 50 51 51 68 68 68 68 57 68 68 57
48 37 35 35 42 42 42 50 47 47 47 48 48 57 57 68 57 57 57 47 57 57 57 57 57 68 68 50 50 51 51 50 50 50 50 50 50 50 68 68 68 68 57 50 50 50 52 50 37 50
50 57 57 68 51 51 50 50 50 51 68 51 50 50 50 51 50 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57
57 57 43 43 52 52 52 57 57 57 68 68 68 68 68 57 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 52 52 52 62 62 68 68 68 62 62 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 57 59 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 59 59 57
57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 68 59 59 68 59 59 59 59 59 59 48 44 42 47 43 59 59 59 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 59 59 59 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 54 54 54 54 54 54 68 59 59 68 68 68 68 68 57 59 48 59 59 59 59 59 59 57 50 50 50 50 50 57 57 53 50
50 50 50 59 41 27 13 10 10 10 10 11 12 11 9 9 11 24 29 59 59 59 59 59 50 50 50 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 50
50 50 50 47 47 47 59 27 27 11 12 12 27 27 41 41 39 24 15 12 10 10 10 17 16 19 14 12 9 9 3 0 0 3 29 27 47 34 28 22 16 18 24 21 20 19 8 8 8 8
8 10 27 36 31 9 9 8 6 6 6 8 8 14 16 34 41 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 59 59 59 59 54 54 54 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 48 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 54 54 54 54 54 54 57 57 57 57 59 57 57 54 59 59 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 57 57 57 57 59 59 59 59 48 48 48 48 48 48 47 47 59 59 59 59 41 37 37 43 59 47 39 36 32 28 31 35 39 39 41 39 39 38 37 37 43 59 44 41 41 32 32 18
18 20 32 28 36 39 41 41 43 46 46 46 47 47 43 47 47 39 39 41 41 39 41 41 21 21 12 12 12 21 21 37 30 28 26 32 28 34 34 37 43 32 32 37 35 31 31 39 39 39
32 18 20 11 11 11 21 24 37 41 37 37 32 29 29 37 28 28 14 15 15 28 28 31 35 37 33 33 36 25 23 19 18 16 18 22 39 31 31 28 21 14 10 10 10 22 22 30 23 23
14 14 14 19 19 32 30 28 18 18 11 11 10 12 12 17 17 20 28 28 34 32 39 37 32 12 17 17 17 16 9 21 19 16 15 9 9 9 11 13 19 17 20 22 31 32 15 12 8 8
8 8 13 9 10 10 10 11 15 12 12 9 9 12 15 23 20 20 20 16 15 8 8 8 8 10 10 14 20 16 12 12 12 17 18 16 11 11 11 17 12 18 9 9 9 15 10 11 10 10
12 16 16 24 22 16 14 14 16 16 16 8 8 6 6 6 7 7 8 7 8 19 12 13 14 14 15 12 11 13 9 9 9 10 9 12 17 12 11 14 10 10 12 11 22 10 10 10 14 16
15 12 14 15 21 35 26 21 10 8 8 10 8 18 10 10 8 8 8 12 14 14 8 10 9 9 9 10 10 8 9 9 11 8 8 9 9 9 6 6 6 6 6 6 6 8 9 9 10 11
17 16 11 8 8 6 6 6 8 9 12 9 9 8 8 8 11 11 11 14 11 8 8 8 10 10 10 10 10 8 10 6 6 8 8 8 8 13 13 15 15 9 9 6 6 8 8 8 8 10
10 10 17 10 9 9 11 9 11 13 10 10 10 10 10 11 10 10 10 15 19 10 10 8 6 6 7 15 9 9 8 8 8 8 9 8 17 15 8 9 9 13 16 24 30 32 27 9 8 8
6 6 7 7 8 8 10 10 11 16 8 8 6 9 7 7 6 6 6 6 8 8 10 11 10 10 11 11 10 11 11 15 12 12 11 8 6 7 7 6 6 6 6 8 8 11 11 8 8 6
7 8 8 6 6 8 6 10 8 8 8 8 8 8 10 11 11 11 8 11 7 6 8 8 10 12 14 16 15 8 8 8 11 8 9 9 9 10 11 11 10 9 7 8 8 9 9 9 9 9
9 9 9 9 8 9 7 8 8 8 8 8 10 8 8 10 8 8 8 10 10 8 8 6 7 13 7 11 9 9 10 12 8 7 6 8 8 14 21 16 13 11 9 8 8 6 6 8 8 10
18 8 8 6 7 10 8 9 8 8 6 6 8 8 8 6 6 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 6 |