BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-313G18.T7 (MSMg01no313_g18.b1) | MSMg01-313G18.TJ (MSMg01no313_g18.g1) |
ACC | AG435355 | AG435356 |
length | 1,306 | 1,331 |
length of high quality (start - end) | 366 (139 - 504) | 279 (508 - 786) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_g18.b1 PHD_FILE: MSMg01no313_g18.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:55:05 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no313_g18.g1 PHD_FILE: MSMg01no313_g18.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 21:55:06 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CGCCTATTNNNNNNNCCACTCTGCGCTATAGACTCCTATAGGGAGAGGAT
CCGCGCAATTCTTAGATAGGTCAACCCGCTTAAAAAGACAATTTAGAGTG
AGCCATTTTAAGAGATGACCTTCTCCAGTGTCTCACGTTTACAAAGCGGT
GACAAATATCATTAAAAGCAAAGCAAAGCAAAGCAAACCACACTCAAACT
GAACAGCTTGACTCCTGGGATGATTTAGTTGGCTTTTCTTTTTCTTTTTT
TTTTTTTAAGATTTATTTATTTATTATATGTAAGTACACTGTAGCTGTCT
TCAGACACTCCAGAAGAGGGCGTCAGATCTTGTTACAGATGGTTGTGAGC
CTCCATGTGGTTGCTGGGATTTGAACTCCGGACCTTTGGAAGAGCAGTCG
GGTACTCTTACCCACTGAGCCATCTCACCAGCCCTTAGTTGGCTTTTCAT
CCCCAGCGTTAGGGAAGGGAATAGATGTCAACTAGGGAGCTAGGATTGGC
AAGGCAGAGTAAGTGCTTTTAGTTTATCAGCGGGGGAACATTGGTGTTTG
GTCTACATAGATTAACCTTTTATATAGTTCAAGAGTGTTTTTACCTCCCA
AACCTTAATGATCTTCCTTCTCAATTACGAAATAGTATTTTGCAATCTGT
GCTTATATTAATGTTGAATCCACCTGTGGCTTATTACCAACCATGGGTTT
ATAAGAAATCTGGAAACACAGGAACTGATTTCATCTTTGGGAACCTGTGA
TTTTTGCCTAAGCCTCATGCACTTTCCTACACAACTTTAAAACCATTTTA
ATTCCATTTGAGTTCAGGATCTAAGTTTGAGCTTAATATAAACATCTTGG
TAAAACAATGTCCTTTAAATACTTTAGATTCAAGGCAGCACTCAGATGCA
ATCCTTAATTAACATACTTATTACTTGTAACCTACCAAGACTAAAATACC
CTGTGAGCCCATGAAAAGAGTAACACACGGAATAGTCGCATTCTTGCCGA
CCCTCGGCTTCCCCTTAAACCGGATCCCGGGGATAACCCTCCTAAACTCT
GTTCCTCAAATGGTTAAAGATATATACTCCAAATATTATTCATTTCCATA
TTTTCCAAACCTTTTTATATTTTAATCTCCTCTAACTCAGGTAACATCTA
CTCCTTATTCTCTCTTCACATTCTCCCTTCATAATAAATCATTTTTATTC
ATTTCCTTCTCCCACTATCCTTCTTCCATACTCCCTCTCATCTAATCTTT
CATTATTCATCACCTACTCTATCTCATTTATCCTACATCCCAATATCATT
ATATAA
| NNNTTATTTCACGGTAGACTGTGGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCATAAAAGCGTATTAAAGGTCATCAA
ATGTGTTAGCGCGGATCCCCCAGGACCCTGTACAGCACTCCACGAGGACT
GCCTTCTGTAGCTAACAAGCCTGATCAGATATGATCTTTACAGACTAAAT
GTAGAAAATATTTATAATGTGTATATAAAGCAAAAGGATTATTTGACAGG
TTTTAAGCAATAATTTTAAATGCATTTAAAAGACCAAATACCTAACATAC
ATTAAAAACAAGTAGGAGCTATTCTTAAAAGTCAGTAAAAATGACACTCA
TCTGGCTTGTATGCCATTTAAGACCCTCCATTTCATTTGTAACCAGAATA
CTTGTCAAAAATGGTTAAAAATTATAACCCGTTCGTATTAAGGAACACTA
TAGATTTTTTTTTCCCCCCCCCTACAAATGTAGGAAAGGTACCCAAAAAA
GAGGAGGCGGAAAGTCACACAATCCCATTTATGCCTAAAACTCTCTATCT
GTTCTTGTGCACATACACACACTCCCAATGTGTGGGCAAGATTCTGAAAG
AGTAACTCTCATATTGTTAACTGTTCACTCCACACAGGAGGATAAAGAAG
GTGGCTTGGAGACAAAGGAGCCCCACCATTTGCTTTACCTAATGCACATG
GTCCTTTTTATCTTTGTAAAACTATATTCCTGTATTCTTATATTTTGGAG
AACAACAAAGTCAGACAATAGAGAGATTACTGTAGCCATGGTTGTTCTTA
AGCCAAGCTGAGAAGAATTATCTAAATCTTTTTTTTTAATCTGAGATAAA
AATGAGTTCATTGTAAAATTATCAGGAAAGCTTCATCTCTTTTTTTACAT
TTTTTAAAAAAATTATTAGTTATTTTAATTATTTACATTTCTTTTTTTAC
TATAATAAAACCAGTTTTTATTAGATATTTTCCTTTAATTGCATTTCAAA
AGGTATTCCCCTTTCCTCCTTTCCCCCCCAGAAAACCCCCCCATCCAATC
CCCCTCCCCCCTGGTTAATAAACCACCCCATTCCTGTTTTCCTGGTCCTG
GGATTTCCCCTACAATTGGGGCACCTAACCCTTCCACAGACCCAGGACCC
CTCTCCTCTCCTGGAGTCCCACTAAAGACTTCTCTCTTTTCCTATATAGC
TGGGTAAAACATGTCCCCCTCCTCGAGACCCTTTTATTGTGTGGCTTATA
CCCCTAAAACACTCTCAGCTGGTGTGTGTTCTTATCGTCTTCCCACTTCG
GCGGTTAATCCACTCTCTCTACTGTACCCTT
|
quality values | Open.Hide. 6 6 6 6 6 6 6 3 0 0 0 0 0 0 0 3 6 6 6 9 9 11 11 13 10 10 7 6 6 6 8 7 8 8 8 8 8 8 12 10 10 18 18 13 17 10 9 9 9 15
15 19 15 17 10 10 10 14 19 28 33 23 23 15 8 8 13 12 12 11 19 19 27 12 10 8 6 6 6 6 8 9 9 11 14 13 15 11 11 13 28 30 37 26 15 8 8 8 10 12
24 32 39 43 39 39 32 32 33 30 29 28 28 24 15 13 8 8 8 9 15 18 16 18 16 15 26 21 22 20 18 15 10 10 10 10 17 15 19 19 33 29 29 28 28 30 28 24 22 32
32 32 32 36 39 39 39 39 42 39 37 37 33 42 37 39 43 43 39 43 43 43 33 32 28 28 30 37 41 43 47 43 48 48 48 48 47 47 47 48 39 39 33 36 25 33 36 37 39 39
42 39 43 57 59 59 54 48 57 57 57 57 57 57 57 57 43 43 44 44 57 59 54 54 43 44 43 23 23 27 38 35 38 38 43 50 52 47 47 35 37 37 43 43 52 52 52 52 52 52
52 52 54 52 52 52 43 43 32 32 38 38 23 32 32 42 42 57 57 52 52 52 52 43 52 45 45 43 44 52 52 42 42 29 44 44 44 38 43 43 18 18 27 38 17 34 28 43 35 43
43 43 27 22 22 22 22 31 44 38 32 14 14 14 20 20 20 35 23 43 35 35 35 47 47 62 62 52 43 43 43 35 35 43 43 52 43 43 31 32 23 34 32 35 35 39 39 43 39 39
43 62 62 62 52 52 45 43 43 35 35 24 39 24 24 18 15 15 34 43 38 52 52 52 52 62 62 43 43 31 31 31 43 43 43 43 43 29 29 29 19 32 32 38 39 13 12 12 26 39
14 17 17 39 39 39 39 39 39 14 14 20 27 27 43 39 62 52 52 43 44 43 52 52 62 62 62 62 62 45 45 45 62 44 44 39 26 19 19 26 34 39 39 43 62 43 52 52 52 52
62 62 62 43 18 16 12 12 10 17 13 16 26 13 14 23 29 20 26 27 43 43 26 26 26 43 43 43 62 62 62 62 62 52 52 43 44 35 43 43 57 57 57 57 57 57 42 33 33 24
24 22 22 16 24 18 28 12 11 11 21 26 24 19 10 10 10 13 22 38 18 20 20 38 38 38 38 28 14 14 14 15 14 14 14 38 38 38 38 35 24 26 38 38 52 43 38 30 24 18
14 14 14 30 14 13 13 26 15 20 20 27 27 38 32 43 43 38 38 27 27 23 36 24 32 32 28 23 23 36 30 37 27 24 13 13 13 19 32 35 39 39 43 43 43 43 42 42 42 37
41 43 43 43 43 39 28 26 13 13 15 34 30 37 37 42 39 32 32 30 32 32 39 59 40 40 28 28 28 25 33 29 35 30 31 23 32 34 43 48 48 59 57 57 43 43 26 28 14 14
14 30 28 40 40 39 39 30 26 17 12 12 12 12 13 28 28 41 37 37 30 30 30 34 34 28 34 28 23 20 20 21 21 18 18 24 32 27 28 22 17 17 19 16 12 19 19 13 21 21
28 16 22 9 8 8 8 8 10 16 15 18 12 12 12 26 28 30 20 19 19 24 24 30 30 39 37 37 27 26 20 22 22 28 22 21 11 10 10 11 8 8 8 8 8 17 10 10 10 10
17 12 11 11 11 13 13 19 18 17 16 22 20 25 23 30 19 19 12 15 10 10 13 17 15 12 12 13 13 10 11 11 10 10 12 10 10 17 8 10 10 9 9 9 10 10 23 26 37 43
31 34 19 25 17 17 15 18 15 17 18 13 10 9 13 12 10 10 10 8 8 8 8 8 9 8 9 9 9 8 8 10 12 10 10 10 10 10 15 14 14 11 11 14 18 15 19 13 10 9
10 9 10 14 12 10 10 10 10 12 14 14 12 10 15 11 10 8 9 8 8 6 7 6 8 10 10 10 11 11 24 22 12 9 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 9 10 10 17 10 10
10 10 10 10 15 15 26 26 34 24 14 10 10 11 10 12 8 8 8 8 9 9 11 13 15 19 13 10 8 8 9 9 10 9 12 13 17 9 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 10
8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 12 8 8 8 8 9 9 10 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 8 7 6 8 8 10 10 11 10 15 15 8 8 8 10
10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10 12 8 8 8 13 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 12 15 12 10 10 9 7 10 10
10 8 11 10 9 8 8 8 8 10 8 9 12 12 10 12 12 9 8 6 6 10 8 8 8 10 10 10 8 8 15 9 9 9 12 9 9 9 10 10 10 10 10 10 11 9 10 8 6 6
13 15 12 8 8 6 6 8 8 11 11 11 13 13 8 10 10 13 13 14 16 14 9 9 8 8 8 10 10 10 9 9 9 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 12 8 8 8 8 10 8
8 9 10 9 9 10 10 10 10 11 11 11 11 11 16 10 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 11 11 10 8 10 10 8 8 6 6 8 8 10 7 9 12 12 12 13 10 10 8 10 8
8 8 8 17 19 11 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 9 8 13 9 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 16 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 11 11 8 10 11 8 8 8
8 8 8 8 8 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 12 8 8 8 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 12 10 10 9 8 8 8 8 12 10 8
8 8 11 8 8 8 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 9 9 9 7 7 6 8 6 6 6 7 7 7 6 8 6 8 10 15 9 10 18 12 10 10 10 19 19 19 12 10 16 13 21 20 21 9 9 9 23 26 34 42
34 36 37 32 32 22 21 24 31 31 36 42 42 48 48 39 37 44 37 37 29 23 24 17 11 11 11 11 26 26 39 44 39 37 37 42 34 42 32 28 28 32 26 29 28 29 29 40 28 35
35 43 40 42 42 34 34 33 32 32 39 47 37 24 24 29 29 37 37 34 47 37 21 21 13 11 11 10 10 10 11 17 18 34 41 37 41 43 43 43 37 39 43 43 48 42 42 47 47 47
47 57 43 48 43 43 42 31 31 33 42 42 36 36 33 39 36 43 44 48 54 57 57 54 48 54 54 54 40 44 32 30 30 14 14 14 14 24 32 36 43 43 43 46 37 37 28 28 28 28
25 32 24 32 35 44 48 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 42 42 37 43 37 50 50 52 52 57 52 52 52 52 52 52 59 59 59 54 57 57 57 57 57 59 57 57 57 54 54 54
57 57 52 57 43 37 37 39 43 43 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 59 59 52 52 52 57 57 57 59 59 59 52 52 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 45
45 43 57 57 57 68 59 59 52 52 52 59 59 39 39 39 57 43 52 57 57 57 68 68 57 68 57 57 52 52 52 59 57 54 54 54 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57 54 59 54 57
57 59 59 59 59 57 57 59 57 59 57 50 44 47 59 59 59 57 57 43 50 50 54 59 59 59 59 57 48 48 59 59 59 57 59 59 59 59 54 54 59 59 59 57 54 54 32 41 31 39
30 30 28 21 18 12 11 15 21 41 39 59 59 59 59 59 48 48 48 46 48 43 54 54 57 59 59 59 59 59 59 57 57 59 59 57 57 59 59 44 44 37 40 43 44 59 59 59 59 59
27 29 9 9 9 9 11 16 31 43 43 30 30 18 17 17 18 20 18 17 15 16 15 16 15 33 41 59 59 59 33 28 12 11 15 12 13 15 16 16 12 12 12 12 12 27 29 25 14 12
11 10 8 8 8 8 8 17 18 34 34 50 42 59 59 48 48 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 59 59
59 59 54 57 57 59 59 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 54 47 47 50 50 54 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57
57 59 59 68 68 68 59 59 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 59 59 59 59 59 59 68 59 59 48 57 57 59 59 59 59 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 44 43 43 43
43 44 57 57 57 57 57 42 42 32 37 32 43 43 57 54 54 54 54 54 48 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 50 50 47 47 47 47 59 59 59 41 41 41 41 39 39 31
34 43 36 47 47 59 59 59 59 59 39 35 35 27 34 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 39 47 35 39 37 37 37 37 40 30 30 18 18 22 31 21 31 28 32 36 41
31 36 39 31 28 31 30 30 19 16 16 12 19 24 39 25 22 22 28 28 27 30 39 34 39 37 47 41 42 40 37 25 24 13 11 12 12 16 14 16 11 11 12 13 25 15 22 19 15 10
10 21 12 16 28 37 37 41 23 21 11 10 10 11 11 18 25 32 37 37 37 33 27 25 14 14 14 23 22 25 33 33 33 30 37 37 25 20 11 11 11 11 15 8 8 8 17 15 25 25
24 34 24 22 12 11 10 10 13 12 10 11 11 11 14 24 10 10 10 11 11 13 15 10 10 10 11 12 12 13 13 22 22 14 12 12 19 19 25 34 30 32 31 28 22 23 24 18 18 10
9 9 19 9 14 12 27 32 39 23 17 15 9 9 12 10 10 10 19 10 16 18 30 29 27 25 21 19 14 14 15 21 34 19 19 11 11 9 9 9 10 14 14 22 10 9 9 10 10 10
15 11 10 8 8 8 8 15 15 14 11 8 8 8 7 8 9 12 12 15 10 10 9 10 9 10 11 16 17 30 12 9 8 12 6 6 6 6 6 9 10 10 14 18 11 11 10 10 8 8
7 8 6 6 8 6 8 11 15 19 11 12 9 8 10 9 8 8 8 9 13 14 9 9 9 7 6 6 8 8 8 8 9 9 18 20 29 32 39 22 18 10 10 8 8 8 8 9 13 24
29 15 11 8 8 8 8 10 20 10 10 8 8 9 8 8 8 8 8 8 10 10 10 11 11 11 12 9 12 8 8 8 10 8 8 10 12 10 12 10 10 9 10 12 14 10 10 8 8 8
9 11 10 10 11 17 19 13 16 11 12 10 10 11 11 10 11 11 15 12 12 10 9 9 9 10 15 11 11 11 8 8 6 7 8 6 6 8 8 9 9 9 9 8 7 6 6 8 10 11
11 13 10 8 8 6 6 6 6 10 10 13 10 6 6 6 7 9 9 7 6 6 8 8 8 6 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 13 12 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10
10 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 11 12 9 7 7 6 6 6 8 9 8 8 9 9 9 8 8 6 7 10 10 8 8 8 8 6 6 8 8 10 10 12 10 11 6 6 6
8 10 11 8 8 8 8 8 13 8 8 7 7 10 8 8 6 6 8 8 10 12 12 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 8
6 6 8 6 7 8 8 6 7 8 8 11 11 13 12 9 9 9 10 8 6 6 8 8 8 11 13 11 13 10 9 |