BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-320P09.T7 (MSMg01no320_p09.b1) | MSMg01-320P09.TJ (MSMg01no320_p09.g1) |
ACC | AG440059 | AG440060 |
length | 735 | 735 |
length of high quality (start - end) | 650 (75 - 724) | 289 (112 - 400) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no320_p09.b1 PHD_FILE: MSMg01no320_p09.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:03:36 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no320_p09.g1 PHD_FILE: MSMg01no320_p09.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:03:36 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | CCAAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCG
GAATTCAGAGATATCACAACATTTCACAATAGCCACAAATAATATAAAAT
ATCTTGGGGTAACTCTAACCAACCAGGTGAGGGTACAAAAACTTCAAGTC
ATTGAAGAAAAAAATTGAAGGAGTTAGAAGATGGAGAGATCTCCCATGCT
CATGAATTGGTAGAATCAACGTAGTGAAAATGCCACTTAATATTGATCTT
AATATGATCTTACCAACATCAATCTACAGATTCAATGAAATTCTCATCAA
AATTTCAACACATTTTTTTACAGACCTTGAAAAGAACAATACTCAACTTC
ATATGGAAAAACAAAGCAAAACAAAAAAAAAAATCAGGATAGCTACAACA
ATCCTGTATAATAAAATAACTTCTGGATCTATTGCCATTACTGTTTCAAG
CTATACTACAGAGCAATAGTAATAAAAACCTCACGCTATTGGCATCAAAA
CAAATAAGCTAATTGTGGAGTCAATTGAGAACCCACAAGTCAATCCACAC
AGCTATGGACACTTGATTTCTGACAAAGAAGACAAAATTATACAATGAGA
AAAGAGAAAGCATCTTCAACAATTGGTGCTGGTCTAATAGATATCTGCAA
GTAGAAGAATGTATAAATAGATCCATATCTATCACTCTGCACAAAACTCA
AGTCCAAGTGGATCAAAGATCCCAACATTAAACGN
| XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTGACACAA
AAAATTCCACTATTAGAGAGATATTTCTGGGAGTTTAAGCACTATCTTCG
ATCATGAGAGATTTTTTTTTTAGATATATATTTTAGGACAGTACATAGTT
GTATTAAGCGGTTTTCTTAAAACCAATTTTGAGTTTATTTCTTTTAGTAA
GTGATCTTGCATATGTGTATAACTATAATCTATTCCTCATATTGTTATTC
TCTTAAAAGTTTTTGTTCACTTCCAATGCTTGACTCACACTCTAGGTTAC
TATATAATTTGAATTTTCATTATAGTCGTTGTGATTTTCTTTTTTTTTTC
CCCCCCCCCCCCCTTGGTTGGTTTTTCGAGACAGGGTTTCTCTGTATAGT
CTTGAAAAAAAAAAACTCACTTTGGAGACCAGGCTGGCCTCGAACTCATA
GATCCACCTGCCTCTGCCTCCCAAGTGCTGGGATTAAAGGCATGTGCCAC
CACCGCCCGGCGATTTTCTAAATTTTGATGAACCTTAATTTCCTATTTCA
AAAATTAACTCTACCCCTTTTTTTCTTTTTTTTTTTCGGTGCCTTCCCAA
AAGGACTTTCTCTCCCGCTTTTCTTCTTTTCACCGGCTACCCTCCTTAAT
CAAAACAACGGCGGTTTTACACCCTTTTTTTATCTTGGTTTATCTCTTGT
TCCTCCTCGTTCCATTAAATTTTTCTACACGTCGN
|
quality values | Open.Hide.11 11 11 11 10 12 23 26 32 37 47 33 32 32 28 28 37 37 37 37 37 34 25 22 28 34 25 22 19 11 6 6 6 6 6 7 7 9 9 9 9 9 10 9 10 10 19 29 39 44
31 31 31 28 30 29 21 15 9 9 9 9 9 9 9 7 9 10 8 8 8 10 10 12 19 23 33 33 33 33 59 53 53 53 53 53 50 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 50
50 50 50 50 53 57 57 57 57 57 57 53 53 31 33 19 15 13 13 13 15 13 13 14 15 15 30 30 40 41 39 41 48 48 50 57 57 57 57 57 57 47 47 47 42 42 47 57 59 59
57 57 57 57 57 57 57 68 57 57 57 42 43 43 43 43 43 57 54 54 54 57 57 57 59 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 57 57 57 68 68 68 68 59 59 59 54 54 57 57 57 50 50 50 50 50 50 57 57 59 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59
59 59 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 44 43 35 26 26 26 27 31 43 44 44 68 62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 52 43 43 39 43 43 62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 57 57
57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 45 45 45 59 59 59 52 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 59 57 52 52 57 59 57 57 57 57 57
68 68 68 68 59 59 57 59 59 57 57 57 57 52 52 52 52 43 52 43 52 52 52 43 50 43 43 33 32 32 43 43 48 44 44 43 43 43 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 57
57 48 48 48 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 47 47 57 57 57 57 54 46 46 43 43 37 32 39 32 39 39 43 43 39 43 40 43 43 43 37 40 33 30 30 39 42 39 43 39
40 39 39 39 43 43 48 48 48 48 48 48 48 46 37 33 33 33 27 27 15 16 19 24 18 22 34 34 34 34 39 39 37 37 28 25 23 28 24 28 30 37 39 47 39 39 43 37 37 43
32 36 21 21 14 21 21 17 20 26 34 34 41 40 40 40 43 43 48 48 48 48 57 48 48 48 57 37 57 43 33 33 34 31 31 22 33 34 32 32 39 39 36 43 43 43 41 41 41 37
37 28 28 22 20 17 10 9 9 9 13 18 37 37 35 28 32 36 32 35 18 22 16 16 15 18 10 8 6 6 14 9 10 3 0 | Open.Hide.12 12 27 27 36 36 36 39 59 59 59 37 23 19 12 18 15 10 9 9 9 9 9 12 15 13 21 16 26 34 26 26 12 12 12 25 25 21 11 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9
9 10 11 10 12 21 22 22 30 33 33 50 50 53 53 53 53 59 36 38 37 37 37 42 53 50 53 53 53 50 50 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 27 23 10 9 6 6 6 6
6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 15 24 37 37 47 59 59 59 59 59 57 57 50 53 50 53 53 53 57 57 59 59 59 59 59 50 50 50 50 48 48 48 48 48 54 57 57 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 54 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 59 57 57 57 68 68 68 68 68 59 59 59 54 54 57 59 59
59 57 57 57 57 68 57 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 59 59 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 59 59 57 59 59 59 57 57 57
57 57 57 59 59 59 59 68 68 68 59 59 57 59 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 34 34 15 21 21
15 21 14 15 15 32 32 48 48 57 68 68 57 59 59 57 57 57 57 57 57 53 53 53 50 50 57 59 47 30 25 17 17 26 30 24 27 16 21 10 9 10 12 20 28 34 30 25 12 12
12 10 14 24 26 25 25 28 28 24 16 15 10 10 12 11 12 23 28 39 39 39 39 39 43 43 43 43 43 43 35 35 35 35 36 39 43 37 37 32 35 25 27 23 28 28 24 26 18 16
11 13 8 8 10 8 8 10 10 10 10 8 8 13 10 10 15 14 26 28 35 32 32 23 23 23 23 23 25 25 21 24 21 11 11 12 25 26 25 25 12 12 12 18 21 26 20 20 20 21
28 30 24 28 15 20 15 28 25 28 21 21 21 23 23 20 20 20 28 32 37 34 34 18 18 12 11 11 19 23 24 23 15 15 15 14 18 19 24 15 13 13 15 13 13 13 21 19 21 12
12 12 12 15 14 15 26 19 18 12 15 15 23 28 28 28 28 30 24 17 14 15 9 10 10 12 12 11 11 11 11 13 12 12 16 18 24 25 25 26 21 14 18 15 15 17 17 15 10 10
8 9 10 9 11 11 30 19 19 8 8 6 6 8 8 10 11 10 8 9 8 6 8 8 8 8 13 12 14 21 24 30 28 23 14 9 9 9 9 10 10 10 11 12 17 10 8 8 8 8
8 8 8 6 6 6 6 10 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 8 8 8 10 12 8 11 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 9 11 16 18 13 10 10 10
9 9 12 10 10 8 8 6 6 6 8 9 10 11 12 12 11 8 8 8 8 8 8 11 11 19 16 14 11 14 19 16 14 9 9 10 10 10 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 6 6
8 8 9 9 15 15 19 15 19 11 12 12 14 10 10 10 10 10 11 11 11 9 10 10 9 9 9 9 10 9 9 11 11 3 0 |