| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-341D19.T7 (MSMg01no341_d19.b1) | MSMg01-341D19.TJ (MSMg01no341_d19.g1) |
|---|
| ACC | AG455082 | AG455083 |
|---|
| length | 765 | 772 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 492 (40 - 531) | 381 (68 - 448) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no341_d19.b1 PHD_FILE: MSMg01no341_d19.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:30:26 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no341_d19.g1 PHD_FILE: MSMg01no341_d19.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 22:30:26 2005 |
|---|
| singlet/doublet | --- | singlet |
|---|
| BLAST hit | no hit data | unique |
|---|
| sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTCGAGAGGATCCGCGGAATT
CAAGGCTCATACATAAACATAGTAAAAGCAATATACAGGAAACTAGTAGC
CAACATCAAACTAAATGGAGAGAAACTTGGAGCAATTCCACTCAAATCAG
GGACTAGATGTTGGGCACCGGGTGTGGGTAAATAAATGGGGTAGGAGAGA
ACCTGTGTCTCTCCAGAGTTCCAGTGCTCTGGGTTGGCAGACACAGCAGA
CTGCTGCACACTCTCCACACAGCTCTGACTGTGGAAACCCACAGAATAAC
AGTCTGAGGGGAATGGAGAGGAAACAGTCTGATGTCTTTGGGCCTCGTGG
AGGCCAGATATGACAGGTTCTCACTCTTGGACACCTTAGATGCTGCTGTA
TTTTGTGGAAGAGCTGAGAACGAAGTGGGGGGCCCCCAGGGGCAGCTCAC
TCAGCCCGGGGACAAAGGAGAAGGAGGCAGGGAGAGGGGTTCGCTAGGTG
ATTTCCATGTGGCAAGAGTCCTTGGTCCGGAGCTCAGGAAGGCCTTCCAG
TGGATGGTTAGATGTGGCTCTTTATAGGAAAATTTGCTCTGCTGCCCCAA
CATGGTGACCCCTGCTGTACCAATATCGCCCCTGGTTTTTCAACTTTATT
GGTCTAACGCTCCTATAAATAAATAATGTTCCAAAATCCCCTTCCCTTTT
TTCCTTTTTACCCACTTTTTTCCTACATTTTTTTTTCCCTTTTCCACTCC
CCTTTTTTTCCTTTT
| XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXCAAAGGAATAGGTTGTAGCTCCAGGGAAGGGTG
GATTTAATAACATCTTTACTGGATTGTAAAAGAATCTCCATCCTTCAGTT
AAAGCTGATTGTTTGAATACCATTTCAGTTATTGTGGACAGGTTAGAATG
ATACAGGCCTGAGTTTGAGTTGCTGTTGTTGTTTTGAGACAGGGTTTTTC
TGTATAGCCCTGGCTGTTCGGAAACTCACTCTGTAGACCAGGCTGGCCTT
GAACTCAGAAATCTACTGCCTCTGCCTCCCAAGTGCTGGGATTAAAGATG
TGTGCCACCACTGCCTGGCTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTATTTA
TTTATTTATTTATTTATTGGCCTGAGTTCTTTTTATCATTATTCCTGCAC
TAAAAATACATTGTTTTTTCTGACTCTATGTTTCCCTTCTACAATTTCTG
TCATATTCTTCCTATCTTTTCTTCCCTCCCCTTGACCTCCTTTCCCCTCT
ACTCCCCCCTTTCGAAACACTTCACCATCTTTACTATACTTAATATTTTC
TTCTTTATCCCCACTTTTTTCCACCGCCATCCCCTACGTATTTTTCTCTC
TCCCCCGCTTTATTTTTTTTCCTACAATATCCCCTCTCCCTTATTTTTTT
TTCTCCCCAAAATCTATTTTTCTATCTTCTCCTTACCTCCTTCCCCTCTT
TTTTATCCTTTATCCTTTTCCC
|
|---|
| quality values | Open.Hide.20 20 26 26 30 32 37 30 25 25 30 32 29 26 25 27 28 31 31 41 33 33 33 33 30 22 27 18 21 12 12 10 10 10 19 23 20 20 17 17 17 26 41 53 57 36 36 36 36 38
36 36 33 33 28 23 12 15 15 15 21 12 15 19 34 35 37 37 37 37 41 50 59 50 57 57 53 53 53 53 53 53 57 57 50 50 48 48 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 50 50
50 50 68 50 50 47 47 47 47 54 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 50
48 48 48 48 48 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 50 50 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 68 68 68 57 57 59 59 57 57 68 57 57 57 59 59 59 59 68 59 59 59 59 59 59 59 52 52 52
57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 68 59 59 57 57 57
68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 54 54 46 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 59 57 43 43 48 47 46 43 46 48 57 57 48 48 43 43 39 43 43 47
40 37 30 32 32 32 42 39 37 40 43 40 40 40 43 43 39 37 32 28 28 30 37 39 39 39 36 37 35 35 32 34 39 39 37 39 40 40 34 34 28 30 32 37 37 46 46 47 34 34
30 30 36 32 31 28 35 37 37 34 26 31 34 41 34 34 35 36 32 31 31 39 39 31 25 34 20 24 28 30 17 14 14 9 9 9 11 9 14 9 8 8 8 12 22 21 16 11 11 11
23 20 24 28 20 18 19 25 25 15 13 10 10 10 15 15 16 11 11 15 12 10 9 8 8 11 11 14 12 13 13 11 11 14 17 16 11 11 8 8 8 8 8 10 16 16 18 16 10 8
8 6 6 7 7 13 15 10 10 9 10 9 10 8 11 10 12 9 7 10 6 6 6 6 8 10 9 9 9 8 13 8 6 6 6 6 9 9 15 13 13 16 16 16 19 15 8 8 8 10
6 6 7 10 8 8 8 8 8 8 11 11 11 9 10 9 8 8 8 8 6 7 8 8 8 8 8 8 8 9 13 9 9 8 10 8 8 6 6 11 9 9 9 8 8 15 15 12 12 9
9 11 9 9 10 12 15 8 8 8 8 8 6 6 6 8 13 27 27 20 13 7 8 6 6 8 6 8 17 22 30 37 40 39 39 37 17 15 10 10 8 15 18 11 8 8 8 8 8 10
9 10 14 15 15 11 11 9 9 12 13 13 16 16 15 | Open.Hide. 9 9 9 9 9 9 12 14 13 29 25 30 36 37 30 32 32 29 29 34 25 21 15 8 8 8 8 8 13 18 21 11 11 10 21 23 37 31 31 26 23 30 28 28 33 33 46 46 43 37
28 28 12 14 21 24 27 30 36 47 59 29 29 28 28 29 33 28 28 28 37 59 42 40 37 37 36 42 48 53 50 50 54 54 54 54 54 54 54 54 41 42 50 51 51 50 57 54 54 47
50 50 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 47 50 50 50 50 47 57 57 57 68 68 50 48 48 48 48 48 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59
59 59 59 57 57 50 50 50 50 50 51 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 52 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 68
68 57 68 68 68 68 59 59 52 57 57 57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68
68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 57 57 57 57 59 59 59 59 68 59 43 43 35 43 43 57 57 57 57 59 59 59 59 59 68 68
68 68 68 68 57 57 57 52 45 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 57 57 68 68 68 68 68 68 68
59 59 59 57 43 43 44 50 50 57 59 57 48 48 44 57 47 48 54 59 59 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 68 68 59 59 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54
57 57 48 47 47 47 47 47 57 57 57 57 48 47 46 46 36 31 22 28 33 42 42 57 40 40 25 32 34 39 39 42 42 33 36 33 37 37 30 33 30 30 30 23 12 8 6 6 8 10
18 17 12 12 12 12 19 8 8 8 13 13 28 34 25 22 22 27 23 19 12 12 10 10 8 19 12 15 10 10 14 16 16 29 20 24 19 12 10 8 12 15 22 22 24 11 11 10 11 10
13 10 10 9 15 12 8 10 8 8 8 10 10 10 8 10 10 13 22 12 10 9 10 15 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 9 17 17 15 11 13 12 10 10 11 10 8
8 8 8 8 8 10 8 9 10 17 13 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 16 24 13 9 9 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 8 8 10 13 14 10 8
8 8 8 8 8 8 8 14 16 13 13 9 9 9 9 10 10 9 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 13 15 15 15 8 8 8 7 7 9 9 8 10 10 8 10 8 11 13 16
12 11 11 12 8 6 6 6 8 6 6 6 6 8 8 22 17 15 15 13 10 8 8 7 7 7 7 10 8 8 8 17 21 12 10 7 6 6 6 8 8 8 8 8 14 21 19 15 11 16
11 9 9 10 10 15 17 11 11 10 10 8 8 7 7 8 8 18 18 19 15 10 10 11 10 10 10 12 12 15 11 11 11 10 11 8 8 8 8 8 8 9 15 17 23 10 10 10 10 10
10 11 10 10 10 10 12 12 9 8 8 8 8 10 8 8 8 9 13 16 16 12 |
|---|
