Query= MSMg01no383_k14.b1 MSMg01no383_k14.b1 CHROMAT_FILE:
MSMg01no383_k14.b1 PHD_FILE: MSMg01no383_k14.b1.phd.1 CHEM: term DYE:
big TIME: Tue May 17 23:25:45 2005
(412 letters)
>mm_chr3_15299840_15300651
Length = 812
Score = 277 bits (143), Expect = 1e-78
Identities = 151/157 (96%), Gaps = 6/157 (3%)
Strand = Plus / Plus
Query: 262 aaaaaacctactgactcataaggtgattgaataaggaaagagattgcagctaaactaaaa 321
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 462 aaaaaacctactgactcataaggtgattgaataaggaaagagattgcagctaaactaaaa 521
Query: 322 ttttcatgtaataaaggtgcatcttggtttgctgtgtgtgtatgtgtgt------atata 375
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
Sbjct: 522 ttttcatgtaataaaggtgcatcttggtttgctgtgtgtgtatgtgtgtgtgtgtatata 581
Query: 376 tatatatatatatatatatatatatatatatatatat 412
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 582 tatatatatatatatatatatatatatatatatatat 618
Score = 99.3 bits (51), Expect = 4e-25
Identities = 57/59 (96%)
Strand = Plus / Minus
Query: 354 tgtgtgtgtatgtgtgtatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 412
||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 645 tgtgtatgtatgtatgtatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 587
Score = 87.7 bits (45), Expect = 1e-21
Identities = 51/53 (96%)
Strand = Plus / Minus
Query: 360 tgtatgtgtgtatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 412
||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 635 tgtatgtatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 583
Score = 83.9 bits (43), Expect = 2e-20
Identities = 43/43 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 370 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 412
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 619 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 577
Score = 83.9 bits (43), Expect = 2e-20
Identities = 43/43 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 370 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 412
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 621 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 579
Score = 83.9 bits (43), Expect = 2e-20
Identities = 43/43 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 370 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 412
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 623 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 581
Score = 81.9 bits (42), Expect = 7e-20
Identities = 42/42 (100%)
Strand = Plus / Minus
Query: 370 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 411
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 617 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 576
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.34 0.600 1.10
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 2, Extension: 1
Number of Sequences: 1
Number of Hits to DB: 78
Number of extensions: 50
Number of successful extensions: 36
Number of sequences better than 10.0: 1
Number of HSP's gapped: 24
Number of HSP's successfully gapped: 9
Length of query: 412
Length of database: 812
Length adjustment: 9
Effective length of query: 403
Effective length of database: 803
Effective search space: 323609
Effective search space used: 323609
X1: 8 (15.9 bits)
X2: 517 (999.5 bits)
X3: 517 (999.5 bits)
S1: 8 (16.4 bits)
S2: 8 (16.2 bits)
| |
