BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-394E02.T7 (MSMg01no394_e02.b1) | MSMg01-394E02.TJ (MSMg01no394_e02.g1) |
ACC | AG495355 | AG495356 |
length | 724 | 740 |
length of high quality (start - end) | 430 (77 - 506) | 452 (87 - 538) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no394_e02.b1 PHD_FILE: MSMg01no394_e02.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:39:34 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no394_e02.g1 PHD_FILE: MSMg01no394_e02.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Tue May 17 23:39:35 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CCCCCCTTCGTCAACXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXCGCGGAATTCACAAATTTTCATTAATTTAGAAAAGCATAGTACCA
AAAGAATACTGAGACTACTGCTAATACTTATCAAGTAAGAGCCTTCTACC
AGCTATCTTTTCGATGTTGGGAATAGCTGACAACATGCATTTGGATATTA
GCTTATGTATTTTCTCATAAATCACTTTGCTATTATTCCAGCTCTTTCTT
GCTTCCTAGGGTGGACATTGTGTCTAACACATGCTGAGTAACTGCTCCAC
TACTGAAGAAAACATCCCCAGCTTTACCTAATGCACAACTATTTTCTTTA
ACAACTGCACTTATAAATAAATGATAGTTTCTCTGGATTGAATTTCAAAA
TAATAAAAAGAAAATTACAAAACTTTTAGTGGGAGAGAAGTCTGACATGT
TCAAACCGTTATTGATAGATTTTAAAATATAATGGAATATAAATACACTA
GACAAAAATCAAAACCAACGTTTTATATAGTATTAGGATTTAAAGACAAA
TTTGTTAATAAAAAACAATACATAGACTGAGTATAGTTTTGAATCTTCCC
CTAAGGAATGTAACAATATTTGCCAGCTTCATTTTTCTCGACCAAATTAA
CATACTAAGATCCTTTAAAATGGTACTAGACACTCAGTGCGGAACAATTC
CTGGCCCAGAGCTACCACTCGAAG
| TCTCCTTTTTCAATGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTGTTGCACACAGGG
AAACAGAAACCACAGTCCATAGGTCCTATGGAGAATAGCTTCACACAGGA
CAACAGCTTGACTGCTCTGAAGACTCAACAGTCTTAAGGCATCCCAGAAG
ATCTGCTGCAGCCAATGAAACAGATCAACCACTTCTCTGCCCCTCTGAAA
ACCCCACAGTTGGAAGGCCCCACAGGAGGTCTGATACAGCCAGGGCTGCA
GGACTACCAGGAGACCTGAAGCAACCCAGGACAAAAAAGTCAGACTCCAG
ACAGTCACCCAGACCAGCAAACACCAGGGCTAGCCAAACGGCAAAAGGCA
AGCACAAGACTATAAGCAACAGAAGCCAATATATGTGGGCATCATTGGTA
CCCAGTTCTCCCACCACAGCAAACCCTAAATACGCCAACACACCAGAAAG
CCAACCTAAAGTTCTATCTCATGAAGATAATAGAGTCCTTTAGGGAGGAT
ATAAATAACTGAAAGAAATATAGGAAAATGCCGGTAAACAAATAGAAACT
CTTAAAGGAGCAACTAAACAAACCCCCTTTAAAAAATCCAGGAAAAACAG
CCCCAACGGTGAACGGAGTTGAATAAAGGGGGTTCAAAATCTGAAAAACG
CGAAGTGAAAAGTCCTAACGGCAAACCTCCCGTTGGACGC
|
quality values | Open.Hide. 9 12 11 11 11 10 9 13 9 9 9 9 9 9 10 11 13 13 16 27 25 27 27 23 15 12 19 12 22 10 10 10 23 30 47 31 30 29 21 21 9 10 9 9 9 9 9 10 25 25
20 21 29 29 31 31 59 53 53 36 35 35 30 33 33 33 27 28 13 14 9 11 11 11 11 11 16 23 25 37 40 37 37 43 36 36 43 47 57 57 57 57 57 57 59 47 34 34 32 32
42 42 57 50 50 48 48 42 42 57 57 57 48 48 44 44 48 46 46 46 46 54 54 48 48 44 46 48 57 57 57 46 43 44 57 59 68 68 59 59 59 43 43 46 57 54 54 57 57 47
47 57 57 57 57 57 57 57 57 59 50 43 43 57 57 57 57 57 50 48 57 57 50 50 52 52 52 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 52 57 57 57 57 57
57 57 59 59 59 38 38 13 13 24 38 44 44 19 19 17 32 34 38 14 14 14 38 32 38 18 18 20 38 41 59 68 34 34 12 12 12 28 33 35 35 35 44 39 41 39 59 62 68 68
68 62 62 62 62 62 62 62 44 38 20 14 14 27 38 43 62 38 38 13 13 13 38 38 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 44 62 43 43 39 43 43
62 62 62 62 62 62 68 68 68 62 62 52 62 62 52 62 44 44 35 35 31 44 44 57 44 52 52 43 43 35 35 39 44 43 52 52 52 57 57 68 68 68 57 59 57 57 57 57 57 57
57 38 38 14 16 24 32 32 39 39 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 52 42 42 43 43 52 52 52 52 52 57 57 57 57 54 54 52 43 30 18 14 28 28 57
57 50 50 47 47 47 47 47 48 59 59 57 57 57 57 44 44 32 32 32 42 42 57 59 59 59 59 32 27 12 11 11 11 28 28 57 59 59 59 59 54 54 59 57 57 43 43 37 31 29
21 15 15 29 30 36 39 35 39 39 48 48 57 57 54 54 48 48 43 43 43 43 43 43 43 43 25 23 11 11 11 24 27 57 48 48 50 59 59 47 30 30 12 12 12 11 11 12 23 30
34 32 23 20 20 24 26 28 15 15 13 18 21 24 18 20 12 15 9 12 12 24 26 44 48 50 41 39 37 37 30 18 19 10 10 10 10 15 25 39 39 40 39 37 34 28 15 14 14 24
28 34 39 40 40 40 43 43 34 30 25 25 28 31 37 36 36 36 21 21 10 10 10 13 19 21 26 24 28 19 19 16 25 11 11 11 18 18 37 28 34 16 12 9 9 9 10 16 16 18
18 19 14 14 14 15 17 15 11 11 13 12 12 21 17 17 18 23 23 25 28 21 21 15 14 15 23 18 20 22 19 17 19 23 24 26 22 11 11 6 6 8 8 12 12 12 14 15 16 11
13 10 10 10 16 17 14 14 14 14 24 27 27 24 19 23 11 10 9 9 9 9 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 13 10 12 13 18 10 9 9 10 8 8 8 9 10 9 19 20
25 24 18 12 10 10 10 10 8 8 13 10 9 8 10 14 14 8 11 6 6 6 7 7 | Open.Hide. 7 7 10 6 9 9 9 12 9 8 8 8 9 11 10 8 8 8 8 8 9 9 9 15 14 16 11 27 18 39 37 37 37 37 37 32 32 37 27 25 19 12 10 10 10 10 11 18 19 30
31 31 33 33 44 47 53 53 36 36 36 36 37 50 57 59 59 59 34 21 15 10 10 14 19 24 30 30 42 39 42 42 42 42 47 47 54 54 54 54 54 54 54 54 54 54 57 48 48 68
57 48 46 48 48 48 50 57 57 47 47 47 57 57 57 37 37 42 42 48 48 59 59 42 41 42 42 57 57 68 68 68 50 50 50 50 50 50 50 57 57 52 52 52 52 52 50 50 50 50
50 50 54 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 54 54 52 57 57 57 57 57 57 57 52 43 57 57 57 57 45 45 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 57 57
57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 52 52 52 57 57 57 57 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 45 45 62 52 52 62 62 62 62 62 62 62 39 39 43 62 62 62 52 45 45 62 52 52 52 62 62 62 62 62 62 52 52
62 62 62 62 62 62 44 43 35 43 43 62 44 44 43 43 52 44 44 62 62 62 62 62 52 62 43 43 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 52 52 62 62 62 62 62 52 52 62
62 57 57 59 39 39 43 43 57 52 52 57 52 43 43 35 57 57 57 57 52 52 52 43 43 29 44 44 57 57 57 57 57 42 39 39 43 43 57 52 59 59 59 57 57 59 59 59 59 59
59 52 52 52 52 52 57 57 52 52 52 59 59 59 57 57 57 57 52 52 52 52 57 57 52 43 43 43 44 46 48 57 57 57 57 57 57 59 54 54 59 59 59 59 57 57 57 37 44 28
44 44 44 42 44 44 28 40 40 48 57 48 57 44 43 43 44 44 54 54 44 44 30 30 30 44 44 44 57 59 59 59 44 32 22 22 22 32 33 34 33 30 28 28 28 28 42 43 43 30
25 25 28 33 39 43 43 43 59 47 43 43 39 43 37 46 46 41 39 39 36 37 34 31 31 35 37 37 39 39 39 39 39 32 29 25 17 17 23 19 19 11 21 21 29 20 23 23 28 31
28 28 33 28 30 30 31 37 37 18 15 9 9 10 14 16 24 25 28 24 28 28 24 28 28 28 25 28 18 12 8 8 8 8 9 11 12 15 18 17 14 18 21 12 12 12 12 11 11 11
19 13 13 11 9 15 11 8 8 6 6 6 8 8 8 10 10 10 10 10 10 13 16 14 17 10 9 8 8 8 12 11 21 13 13 8 8 7 8 8 9 12 8 10 9 9 13 7 6 6
7 12 8 10 8 8 8 10 11 11 12 10 8 8 8 8 8 8 12 10 10 10 10 10 9 9 15 11 11 11 14 12 21 31 23 23 16 13 8 8 8 10 8 8 13 9 9 9 6 6
6 6 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 10 10 10 9 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 11 10 10 9 9 9 9 9 |