| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-399M12.T7 (MSMg01no399_m12.b1) | MSMg01-399M12.TJ (MSMg01no399_m12.g1) |
|---|
| ACC | AG499561 | AG499562 |
|---|
| length | 722 | 875 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 188 (122 - 309) | --- |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no399_m12.b1 PHD_FILE: MSMg01no399_m12.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:12:53 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no399_m12.g1 PHD_FILE: MSMg01no399_m12.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:12:53 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | CCCTCATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTCTGAGCATCCGCG
GAATTCTGTTAATCCCAAAAAAAATGAGTCATGGTTCATGGTTCAGGCAG
CCCAGAGGGCAGGTCTAGGGACTCCTCTTCTGTGTTTTGGGAGGCAGTAA
ATGTTGCTGTGTATCTTGGCTATTTGGGGACTTCATTTGAGCCATGCTCT
GCATAGCTGATACTGACTAGTAAACAAGTCGAGGCCTTCGAAGTCCCTTT
CAATGCTCTGAGGACAGATAGCTTATCAGGTGTCACCACTAAACACGCCA
CACAAGATGAATGTTTATTTTTTTCTTGCCGGTCCATCCTCAGCACTACC
CTCTCTGCAGCCATCACCTGTTACCGATTTACAAGCACAGTTATTTGGCG
TGCAGCTCAGTGGCGAACCCACCCACCCATATGTGCCCAGCTCTGGATCC
CTATGCCCATTTCCCCAACCTTCAATGTTATTTACTAAGACCTTGTTTAT
GTTGCAACCTTATAGACCCACCACCAATCCCTAGTTCTGAGCATACCTGC
ATCTACTTGTACAGGTTCCCTCCACATAACATCATTGTCCTGCCCGTTTT
ATATTAACCAGTTACACTTTTGTTTTCCTCGCTATTCTCTTATCACCCGC
ATGCCTTATGTTAAGCTTTTGCTTTTTCCTATTATACTCCCTTTCAATGC
TATCTCCTTTCGTTATCCACTA
| CCCGATGCTAGTGTTTAGGCTGGNGGCCGTCTGTTCCAAAACATGGAGGN
NGAACTATAGAATTTTCCCCGATAACTCATACAAAGGACGCCCCTAGTAT
CCCCTAATATCCAAAGGCCTATAAGCCGCTGCGTTGAGACCTAGGGATAA
AGATCATAATTCTATTTCGTTACCACATGCTCAGTTGGAAATTCTTAACG
CCAGCAGTTCATGCGCGCCTATGCCACGTTAGGTTCTCGATGGTACGCTG
ACTCGCCCCCACTCTTAGAATGAAACTACTCACCCTACGGCGTGCGCAGA
CTATGTTAACGGCCATCCTGTCCCTAATTACAAATGTATTTTTATGCTCA
TGCCATCTTCTTGTCCTCTTGCCTGCATAACCCTGGCAACAACCCTCATT
CCATTTGCACTATGCGCATTTTTCTATCATTGCCATGAACCCCCCTGTTT
AGCCCACCAACTTATTTGTTATTATTGATATAATGCCACCACGCTAAGTG
TATACCTCGTACCCCGTTTAAAATAAATGATCTTATGTTATGTTATACTC
ATCATGCCTTGTATCGTCATTGCTCCGTTCTCGCCCGACACCTTCCTTTT
TTTCTCCTTTCCCCCCCCCCTTTACTTTACTCACTCCCTCACCCCCCTTT
CCTCCTTCCTTTCTAATATCACACCCCCTCTTTTCATTTCCTATATTTTT
TTTTCCTCCTTCTTTCCTCTTTCGTCATCTCCTTCTCGAGCCCATTTTGT
GACACCCACTCATTATATATCATCTTGTGTCCCTTCCCTCCACCCCGTTT
CCTCCTTACGCTCTCCTCTTACTTGTTCCTCCTCTCCCCTCTATCTCTTA
CTTTTTATCTCACCACCACTCTCTN
|
|---|
| quality values | Open.Hide. 8 13 8 8 11 8 10 10 11 11 11 27 27 37 37 32 31 34 28 19 17 10 10 8 16 22 43 30 28 24 19 19 8 10 8 7 7 6 6 6 6 6 6 6 8 11 21 20 23 30
30 33 33 33 37 37 44 25 25 9 9 9 9 12 9 9 9 9 11 9 10 10 10 17 19 25 22 11 11 11 21 23 34 47 39 42 47 47 47 50 59 36 31 31 18 18 18 23 28 26
14 14 24 15 21 16 22 18 22 22 24 18 17 13 18 28 18 18 12 11 11 21 22 28 37 44 57 57 57 44 43 37 37 43 47 44 36 41 18 18 14 14 28 28 33 42 42 43 42 47
47 38 38 35 35 35 32 34 42 42 37 35 35 50 50 44 50 32 32 23 28 38 43 43 38 24 15 12 12 15 30 38 57 52 52 52 52 43 43 38 44 43 50 50 52 52 52 57 59 59
59 59 59 52 43 32 23 19 30 32 50 37 37 36 38 20 20 20 23 16 16 15 15 20 20 20 17 18 18 28 28 31 42 35 37 37 44 44 31 21 21 13 13 14 24 24 35 42 38 38
28 23 23 25 28 30 35 42 34 34 20 20 20 20 23 25 37 37 36 28 28 28 21 15 8 8 8 10 13 15 15 15 21 21 25 33 28 28 15 16 12 11 12 12 28 28 30 30 18 18
15 28 26 33 23 24 12 22 16 13 11 18 13 9 8 8 10 8 8 8 9 8 8 8 8 8 10 16 12 11 10 10 10 10 13 12 14 23 21 21 25 11 11 11 16 12 12 12 12 12
15 15 32 32 32 32 15 13 9 9 9 9 12 10 11 11 17 12 12 11 11 10 8 8 10 10 8 11 18 21 19 16 19 11 11 11 11 10 10 9 10 9 9 10 17 22 9 9 9 9
9 9 12 11 11 12 12 12 9 11 11 11 11 11 10 10 12 6 6 6 6 6 7 8 10 10 21 15 14 10 10 10 12 15 16 8 9 10 8 8 8 8 8 11 11 9 9 9 9 9
13 21 21 32 24 19 16 19 22 28 25 20 17 10 10 10 10 10 18 11 10 10 10 10 14 17 12 10 11 10 10 12 12 10 10 9 9 9 9 10 11 8 9 10 15 13 13 14 10 10
11 11 15 12 12 12 11 10 8 8 10 10 8 8 8 10 13 11 15 13 10 8 8 8 8 10 15 13 10 8 8 10 8 8 9 11 13 11 12 9 9 11 9 9 13 10 12 10 16 11
10 8 10 10 11 10 14 10 9 8 8 8 8 8 11 12 18 15 15 15 10 10 11 11 11 10 11 11 12 11 11 11 9 9 8 8 10 8 8 8 8 10 10 9 9 8 8 8 8 8
8 8 8 8 9 10 11 8 8 8 8 11 8 8 9 12 15 28 28 15 8 8 8 8 11 10 12 12 12 11 11 10 10 10 9 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 17 10 9 9
7 8 10 8 10 7 8 6 6 6 10 10 10 9 9 10 12 17 9 9 9 13 16 19 16 17 12 12 8 8 8 8 8 10 17 8 10 10 8 8 8 12 8 10 10 8 8 8 8 10
9 10 9 11 10 14 13 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 6 6 | Open.Hide. 6 6 6 7 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 8 8 9 16 19 15 3 0 3 12 18 16 10 16 12 15 10 8 7 8 8 9 9 8 8 7 8 6 6 6 8 13 3 0
0 3 8 9 22 31 28 30 12 12 11 15 11 14 12 14 12 14 11 8 8 8 8 8 8 8 8 13 11 14 17 21 13 13 11 8 8 6 7 8 6 10 16 22 13 9 8 8 6 6
13 12 17 17 15 21 13 10 10 10 10 11 16 13 13 11 11 11 11 11 12 12 11 11 11 6 6 6 6 13 10 14 12 17 16 16 16 22 28 17 15 13 13 12 9 9 9 9 9 10
15 12 12 10 10 10 10 10 9 12 13 11 10 14 15 16 11 11 10 12 9 16 19 27 10 12 12 12 12 10 15 19 12 12 13 15 12 11 10 10 10 8 6 6 6 8 8 13 13 12
23 17 10 8 8 8 8 8 8 10 9 9 10 10 8 8 6 6 6 6 8 8 16 22 11 11 9 15 13 8 8 8 8 21 24 12 12 6 7 8 10 9 8 8 6 6 6 6 8 8
11 8 8 8 8 10 10 16 14 11 11 8 15 12 11 11 8 11 11 18 15 15 11 8 8 13 12 10 10 10 10 8 8 8 10 10 8 8 8 8 6 6 6 8 10 10 10 10 8 8
8 8 8 15 15 12 10 10 12 12 11 12 16 12 10 10 10 12 15 18 22 28 23 25 12 12 11 19 12 15 12 13 12 21 12 12 11 11 11 12 17 12 9 8 8 8 8 10 10 8
10 8 6 8 8 8 8 8 9 6 6 6 6 10 10 23 20 15 12 7 7 7 7 8 6 6 8 8 11 12 8 8 12 8 8 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 13
13 13 10 10 9 11 11 10 8 8 8 8 13 8 8 10 13 13 10 11 10 15 13 13 13 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 9 10 11 11 14 14 17 20 20 20 9 8 8 6 6
6 6 6 10 10 8 8 8 8 8 10 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 7 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 13 13 15 15 13 9 10 10 8 8 8 8 8 8 8 10
8 12 10 12 12 14 19 13 13 12 12 11 8 8 8 10 12 8 10 10 10 9 8 8 10 8 8 10 11 11 11 11 10 8 8 7 7 11 6 6 6 8 9 9 10 11 10 10 9 8
8 8 8 8 8 11 8 9 9 9 10 7 7 7 8 8 8 6 6 8 8 8 9 9 10 9 9 9 14 13 15 8 8 8 11 10 6 6 6 6 6 8 8 10 10 10 15 21 16 16
10 8 8 8 8 10 8 14 14 15 17 9 9 10 15 12 18 10 10 10 8 8 10 10 10 10 11 16 13 16 19 10 10 9 10 8 8 10 10 8 8 8 10 8 10 8 8 8 8 8
9 11 9 10 10 17 10 9 9 13 17 12 10 9 9 10 10 11 11 11 11 11 14 14 20 16 15 15 12 15 11 10 8 8 6 8 8 8 10 9 9 12 8 8 8 10 10 12 18 18
20 19 20 16 16 19 21 21 10 9 9 9 9 13 15 18 14 19 21 21 9 8 8 6 8 6 6 6 12 17 19 19 10 11 9 9 8 8 8 8 8 6 6 7 7 10 7 6 6 8
8 8 8 10 12 15 10 10 7 7 8 8 10 8 9 8 9 9 9 10 9 9 9 15 15 9 9 9 10 10 8 10 8 8 6 6 6 13 21 13 9 8 8 7 10 9 9 10 7 13
16 16 10 8 8 8 8 8 9 6 6 13 8 8 9 11 13 15 13 8 8 6 8 6 6 6 10 9 9 9 14 14 10 10 8 8 8 8 10 13 8 10 10 9 9 9 11 11 17 10
10 9 9 7 11 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 7 7 9 8 10 12 12 3 0 |
|---|
