BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-423B04.T7 (MSMg01no423_b04.b1) | MSMg01-423B04.TJ (MSMg01no423_b04.g1) |
ACC | AG517314 | AG517315 |
length | 733 | 729 |
length of high quality (start - end) | 522 (40 - 561) | 507 (69 - 575) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no423_b04.b1 PHD_FILE: MSMg01no423_b04.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:43:40 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no423_b04.g1 PHD_FILE: MSMg01no423_b04.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 18:43:40 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTCT
CTAAGGAGCAATAAGGAATGGCTGAGAAGCACCTGAAAAAATGTTCAACA
TCCTTAATCATCTGAGAAATGCAAATCAAAACAACCCTGAGATTCCACCT
CATACCAGTCAGAATGGCTAAGATCAAAAACTCAGGTGACAGCAGATGCT
GTTGAGGATGTGGGGAAAGATGAACACTCCTTCATTACTGGTGGGATTGC
AAGCTGGTACAAACACTCTGGAAATCATTTTGGCAGTTAATCAGAAAATT
GGACATAATACTACTGGAAGATCCAGCAATACATCATATACCCAGAAGAT
GTTCCAATTTGAAATAATTGACACATGCTCCACTATGTTCATAGCAGCCT
TATTTATAATAGCCAGAAGCTGGAATGAACCCAGATGTCTCTCAACAGAA
GAATGGATACAGAAAATATGGTACATTTACAAAATGGAGTACTATTCAGC
TATTAAAAACAATGACTTTATGAAATTCTTAGGCAAATGGATGGATCTGG
AGGAAATCATCCTGAATGGATTAACCCAATCACAAAAGAACGTACATGAT
ATGCACTCACTGATAAGTGTATATTAGCTCAGCAGCTTAGAATACCCAAG
ATACAATTTCTCAAACACATGAATTCCGGAAAAAAGATAAACCCGTGGAA
ACTTTTGCTCCCCTCTTTTGTCTGGGAAAAAAA
| XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXTAAGAAGTCTGAAGAGGCTCTATGGGTAGAAA
CAGACCACCACAACAAAAGGATTCAAGGAGGAGTTATTGAAAGGCAGGTA
CAATTTTGGATCCTGAGAAATAGATGAGAAATGGTTCAGGCTGAGGACAC
CTCTGCAGAGGCAAGAGCATCTGGGGACTGTCAGGAGGAACACCCAAGGA
ATGTACTTGTGGCCAAGCTGGTCTAGTTATTAAAGCTGTGTGCAGAGGAG
GAATGAGACATAAGACTGGAATGATGTCAGAGACTCAGGTGCAGAACCTG
AGATGACATGCAAGGAATTTGGATAACAACTTTGAAGCAGGGAGAATCAC
AATGTCTGTGGAAATAATGAACCATATAAGAATGGGAAATACTCTAAAGA
ACCTAATACATTTAGGCTATACTTTTGTTTAAAAGTAGGCTCCCTTTGCT
CCACCATAAGCCCCACAGTTCATGCCACCACAGGTATTTCCTTGGTCTCC
ACAACCACTTAGACCGTGTGATCCTGANNAGACATCACCAGATTCACAGC
TGCCATTACTCTCTTGCCTTTGGGTGAAGTTATATGAGCCACAGCGCGGG
GCCTTCGGTATTCAGGCGACATGTTTTAGATTCATGACAGCTTATTCCTT
GGCGGTAAGGTATTGTATTGCGACCTGAA
|
quality values | Open.Hide.25 25 25 25 22 12 12 12 23 25 15 19 12 16 23 28 29 28 24 22 16 24 19 19 11 10 8 8 8 8 9 23 25 47 33 29 29 25 25 28 32 32 39 36 36 29 29 37 33 37
37 26 25 12 12 8 8 8 8 8 12 21 22 28 59 33 31 31 35 32 31 43 39 39 39 57 43 32 24 28 23 23 31 34 34 40 57 57 68 68 68 54 43 42 28 28 28 33 29 32
31 36 43 43 48 44 42 28 28 28 24 28 29 32 30 48 48 48 30 37 30 25 35 44 44 36 28 23 44 44 42 42 42 42 35 35 39 30 32 28 50 28 34 28 43 35 35 32 32 32
30 30 42 43 43 36 32 44 32 33 33 38 38 50 50 50 37 52 43 44 44 38 38 36 32 37 59 50 57 43 43 32 24 17 38 38 44 44 37 35 39 36 38 33 44 44 44 43 43 43
44 44 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 57 57 43 43 35 43 43 43 52 43 43 35 35 44 44 43 43 43 44 44 62 62 62 62 62 43 43 52 52
52 62 52 52 43 44 44 44 26 35 35 44 43 43 39 43 39 34 34 41 41 62 44 44 39 35 35 62 62 62 62 62 45 45 52 62 62 68 41 41 24 24 11 33 33 62 62 68 68 68
44 44 35 43 43 62 62 62 62 45 43 43 52 43 43 43 43 57 57 43 43 43 38 35 26 38 38 52 44 59 43 35 35 31 35 35 59 59 59 52 43 34 24 17 38 38 57 52 43 57
38 43 33 39 29 28 44 44 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 50 43 38 38 38 50 43 43 35 37 32 35 43 43 57 57 44 44 35 42 36 44 44 44 44 27 38 13 20 27
44 59 59 57 57 57 57 57 68 48 34 26 13 18 15 34 34 44 33 33 42 44 57 57 57 57 57 44 42 30 24 22 19 32 44 34 32 23 23 28 28 24 19 13 21 21 30 34 41 59
68 68 68 68 68 68 43 37 32 23 23 37 37 59 57 57 50 50 48 48 34 34 23 28 28 59 59 34 32 20 20 32 34 59 44 41 37 41 37 37 30 37 37 37 30 19 12 11 23 23
41 39 39 44 39 39 41 40 39 36 36 36 41 43 48 41 41 41 41 41 41 41 37 37 32 34 23 23 16 25 15 18 18 28 24 32 32 39 37 37 41 41 32 31 34 28 28 28 28 28
35 37 41 27 21 22 15 15 15 18 24 23 28 17 14 12 15 12 12 18 16 25 27 19 14 11 11 11 24 17 15 15 14 15 15 18 11 12 10 13 14 10 8 8 8 15 15 22 24 30
30 33 21 18 13 13 13 10 11 11 20 20 13 10 9 9 9 9 11 11 11 15 15 12 12 11 11 11 17 13 11 11 18 18 18 9 11 11 9 9 9 8 7 8 8 8 8 9 9 12
12 22 19 15 15 17 7 7 6 6 6 8 10 8 8 8 8 8 8 10 11 15 24 18 10 9 9 12 14 14 27 27 27 14 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 11 16
17 14 12 17 14 16 9 9 9 12 10 10 8 8 6 6 6 7 8 8 8 8 8 8 8 9 12 12 16 15 15 15 15 | Open.Hide. 7 7 7 7 6 6 8 12 17 24 31 39 39 37 34 30 27 32 30 34 32 25 19 10 8 8 8 8 17 20 30 33 28 28 33 33 53 53 53 50 39 39 37 37 30 30 40 43 43 53
40 27 25 13 14 19 24 29 36 33 40 37 42 42 36 36 33 33 36 44 44 59 54 43 43 32 32 37 44 44 57 59 59 59 32 36 26 36 36 44 44 57 68 68 68 68 68 59 48 35
35 39 43 39 37 35 32 30 25 25 25 24 28 30 35 42 42 59 50 50 38 36 30 14 15 36 36 57 57 57 50 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 59 52 52 52 59 59 44 35
29 29 44 44 57 68 68 57 57 57 39 39 41 38 38 38 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 43 44 31 43 35 44 43 57 57 57 57 44 44 43 39 35 35
43 43 43 43 43 43 39 62 62 62 52 52 52 62 44 44 52 43 43 43 52 43 44 44 43 43 43 43 43 43 35 35 35 44 44 68 68 62 62 52 43 43 39 43 35 31 44 44 68 68
68 68 62 62 39 43 43 62 59 62 44 43 26 26 26 44 43 52 43 44 44 31 31 43 44 44 68 68 68 68 68 68 62 62 43 43 52 62 62 62 62 43 43 39 62 62 68 68 68 68
68 68 68 68 68 44 44 31 41 39 44 44 44 44 35 43 43 62 62 68 68 68 68 68 44 44 35 31 31 44 44 62 35 43 43 23 20 43 43 59 43 43 39 44 38 38 32 35 32 38
38 57 57 41 41 43 29 29 44 43 35 35 44 44 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 43 39 39 35 42 43 59 59 68 59 59 42 42 35 44 44 68 68 68 38 38 32 21 21 32
32 59 44 44 35 35 43 44 44 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 44 43 29 27 27 44 44 68 68 68 68 57 57 57 57 54 59 57 57 44 57 36 42 35 27 24 34 34 68 57 35
36 28 25 32 44 44 59 37 35 35 44 44 57 57 57 54 57 57 59 59 48 48 48 59 59 59 54 54 54 57 54 54 53 50 48 48 43 43 28 34 23 39 39 46 46 59 59 37 37 24
28 20 20 23 28 31 30 31 32 24 18 22 32 31 31 28 30 30 30 17 26 26 39 34 25 24 28 28 28 31 37 32 39 39 48 48 28 28 32 32 30 28 24 27 12 12 12 21 16 18
20 24 22 25 25 25 30 37 23 30 14 12 12 16 16 20 21 21 28 23 32 24 25 28 19 19 3 0 0 3 23 20 28 24 15 14 14 15 17 22 30 28 18 18 13 13 13 21 21 31
31 18 17 17 24 19 29 24 28 25 24 20 22 15 17 18 24 24 31 17 7 7 6 6 6 9 21 17 15 14 16 20 18 23 19 19 10 11 8 8 8 11 15 11 18 13 24 14 14 9
9 9 9 9 12 9 11 10 10 8 8 8 8 8 8 17 18 13 10 9 8 8 7 7 7 8 21 12 11 9 10 10 10 10 11 16 13 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 9 8
8 8 8 8 8 8 7 6 8 8 8 13 12 6 8 8 8 8 10 6 6 6 8 6 8 10 8 8 8 |