| Query= MSMg01no456_i23.g1 MSMg01no456_i23.g1 CHROMAT_FILE:
MSMg01no456_i23.g1 PHD_FILE: MSMg01no456_i23.g1.phd.1 CHEM: term DYE:
big TIME: Wed May 18 19:28:25 2005
(275 letters)
>mm_chr3_64275208_64275882
Length = 675
Score = 472 bits (244), Expect = e-137
Identities = 259/264 (98%)
Strand = Plus / Minus
Query: 1 tccttactgagtggtactgaggacaaagcttcatcaaaatctctgacaatgaaaggattc 60
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||
Sbjct: 393 tccttactgagtggtactgaggacaaagcttcatcaaaacctctgacaatgaaaggcttc 334
Query: 61 tgaaataaaatcagaagacatattcaaaccacaacacaaaacctatgagatggttctctg 120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 333 tgaaataaaatcagaagacatattcaaaccacaacacaaaacctatgagatggttctctg 274
Query: 121 gggagtggtatggaatgctgatttccaggctcaaagtagctaattagaccctttaattca 180
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 273 gggagtggtatggaatgctgatttccaggctcaaagtagctaattagaccctttaattca 214
Query: 181 catattatttgcactctctctctctctctctctctctctatatatatatatatatatata 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||
Sbjct: 213 catattatttgcactctctctctctctctctctctctctctctctatatatatatatata 154
Query: 241 tatatatatatatatatatatata 264
||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 153 tatatatatatatatatatatata 130
Score = 78.1 bits (40), Expect = 6e-19
Identities = 40/40 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 219 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 130 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 169
Score = 78.1 bits (40), Expect = 6e-19
Identities = 40/40 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 221 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 260
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 130 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 169
Score = 78.1 bits (40), Expect = 6e-19
Identities = 40/40 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 223 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 262
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 130 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 169
Score = 78.1 bits (40), Expect = 6e-19
Identities = 40/40 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 225 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 264
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 130 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 169
Score = 78.1 bits (40), Expect = 6e-19
Identities = 40/40 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 227 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 266
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 130 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 169
Score = 78.1 bits (40), Expect = 6e-19
Identities = 40/40 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 229 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 268
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 130 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 169
Score = 78.1 bits (40), Expect = 6e-19
Identities = 40/40 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 231 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 270
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 130 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 169
Score = 78.1 bits (40), Expect = 6e-19
Identities = 40/40 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 233 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 272
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 130 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 169
Score = 78.1 bits (40), Expect = 6e-19
Identities = 40/40 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 235 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 274
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 130 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatata 169
Score = 76.1 bits (39), Expect = 2e-18
Identities = 39/39 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 237 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 275
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 130 tatatatatatatatatatatatatatatatatatatat 168
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.34 0.600 1.10
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 2, Extension: 1
Number of Sequences: 1
Number of Hits to DB: 77
Number of extensions: 43
Number of successful extensions: 36
Number of sequences better than 10.0: 1
Number of HSP's gapped: 26
Number of HSP's successfully gapped: 14
Length of query: 275
Length of database: 675
Length adjustment: 9
Effective length of query: 266
Effective length of database: 666
Effective search space: 177156
Effective search space used: 177156
X1: 7 (13.9 bits)
X2: 517 (999.5 bits)
X3: 517 (999.5 bits)
S1: 7 (14.4 bits)
S2: 7 (14.3 bits)
|