BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-467E03.T7 (MSMg01no467_e03.b1) | MSMg01-467E03.TJ (MSMg01no467_e03.g1) |
ACC | AG551010 | AG551011 |
length | 747 | 753 |
length of high quality (start - end) | 395 (47 - 441) | 309 (80 - 388) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no467_e03.b1 PHD_FILE: MSMg01no467_e03.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:43:04 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no467_e03.g1 PHD_FILE: MSMg01no467_e03.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:43:04 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CCTAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGG
AATTCAGCACGTTTCTCCCTTCTGCCTTCCTGTGAACCTGTGCCCCAGTG
GGTATAGTCATTTAATTGCTTGGATGATAAACGAGAGTCCCTTTCCCCTC
TCATCTGCTACTCAGAGAGACAGTTCTCTAACAAAGCTTTTCAACACTTA
AATCTTTTGTTGAATATGTTCTTAAATAATGGTTTCTCTCTTTTAACCTA
TCCATTTAAAGTTGATAATCCAACTGATGGATTTGTGACAAGCTAGGCCT
CTTTTTCTGGATGCCTCTGTTAAGGCTATGTTTTAGAAGTTGATTAGAAA
GACAATCTAATGTCCCCTTCAAACCTCAGTAGATATATGCATGTGTTACA
TTTTTGGAGTTTCTCTATGTTGATGCTTTGTTGATAATAAATGCAAGACA
CTGTGCCCCATTGGAAAGCAGAAAGACCAGCCCTTACATCCTCTGGGATT
GTCTGCTTTAACATGTTCTAGGTATTTAATGTACTTTACTTGTATTATAA
TTTCTCAGTTACTAGAATGGTACTATAAAGTCTTTCTTCTTCTGCCCCAG
GTATAGTCCACTTTCTGCTTCTTGTTTCAGAAGATCCTTTTTCTTTCTTT
TTCTATGTTTAGATTGATCTTTTTATACTTGTCACTCCTCCGCCTACTTT
TGTTGAATATATCTTTTTCACCCTTTATCTGCCTTTTTTCCCCGTTT
| NCCTCAATGATAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCAGGTTCAGTGGGAGACCCTA
TCCTGGAATGGAAGATGAAGCGACTGCCCAAAATGTGAAGCATGAAGTCT
AGTCCAAATAGATACATCTACAAAATTACTACCCAACGCTCAGGGATCAC
TTCAGAAGAGGGACCAGAAGGACTGCAAGATCCAGAGGAATAAGAGTTTG
CTGTGAGATTATCTTTCCTCAATATGTCAGAAGCTACACTGACAAAATCT
CACCATCGTACCTGCCTAAATAGAGCAGGAGTAGAGCAAGAACGATACCA
TTAGACATGTTAATGTGGATGGATGGGGGAAGTGCCTGACAGTTCATCCC
TGTACTAAGAAGTCAGCCAACCCACCAATGCTCAGATCTCACGATTCCGC
GTGCTCTCATATAATATCTCCCTTCTATATTACTCATATATCAATTTATC
ATCTCTCGATCTTTTCGGCCTTTCCCCTCCATCTCTTTCTTCTTCCCGAT
TCTCTCCTGCTTCTCCTTTCATCTGCTCCCCCTTCTATCCCCATTTCCCA
TCCATTCTCCCTTCCCTCTACCCATCCCGTTATTTATCCTTTTTCCAACC
CCTCTCGCCCTTTTATTTCTTTTTAACTCTGTTTCCTCTCCTATTTTCTC
TCTCCTTTTTCCCACCCCTTTTACTCTTTCCCTTTTCCCTCCCCTTTCTC
TCT
|
quality values | Open.Hide. 9 9 16 12 15 13 22 22 31 31 35 37 37 32 20 13 12 9 9 9 19 19 41 41 59 31 30 29 21 17 6 6 6 6 9 8 8 12 14 11 10 10 13 10 10 14 15 30 31 31
36 31 31 31 31 29 21 13 9 9 9 9 9 10 10 11 11 23 23 37 39 34 36 37 48 59 59 59 57 57 57 57 57 50 53 53 50 50 53 57 57 57 57 43 43 48 48 48 48 57
59 57 68 68 68 54 50 48 48 50 53 53 57 57 57 57 57 57 48 46 46 37 37 46 48 50 50 50 50 51 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 50 50 50 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 59 59 57
57 57 57 57 57 68 59 59 59 59 59 68 57 68 68 57 57 57 57 68 68 59 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59
57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 54 54 57 54 54 54 54 54 54 54 57 57 57 57 59 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 48
48 57 59 59 59 59 59 48 48 48 44 41 31 15 15 12 10 10 8 8 8 8 22 26 37 59 59 59 59 48 47 43 39 39 35 35 35 39 39 43 48 48 48 43 43 37 37 30 41 40
48 48 48 48 48 57 59 59 48 48 48 59 48 54 57 57 57 57 57 48 48 59 59 59 57 57 46 44 39 44 57 57 43 47 47 57 57 57 57 43 42 42 42 41 35 35 42 59 59 59
59 57 47 43 33 27 27 36 43 44 48 50 50 54 57 57 32 32 15 16 14 14 18 24 28 35 32 44 28 23 23 37 37 42 42 35 28 27 18 18 15 16 21 12 16 16 23 15 20 20
22 19 21 19 15 10 12 15 15 26 21 28 18 15 12 15 15 12 11 11 10 12 16 22 32 30 16 16 16 16 15 17 19 19 19 22 14 12 12 14 18 13 10 10 9 9 9 10 12 12
8 8 8 8 12 14 19 11 11 11 11 11 15 15 12 12 12 12 19 12 11 11 11 12 14 14 13 10 10 12 11 10 12 11 11 18 24 24 15 15 15 15 14 14 16 18 14 13 12 8
8 8 8 10 8 12 12 11 11 11 15 11 11 11 11 11 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 8 10 10 10 14 14 9 8 8 8 10 10
9 8 10 8 6 6 6 10 8 10 10 10 8 10 10 11 12 10 8 6 6 8 8 9 10 9 10 11 11 10 10 10 11 10 11 15 10 8 8 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 10
11 11 11 15 10 10 8 8 10 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 9 10 17 24 11 9 9 9 8 10 8 8 8 8 10 10 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8
6 6 8 8 10 11 12 12 12 11 14 9 9 8 11 12 10 10 10 10 9 12 14 16 10 7 9 7 12 10 8 8 6 6 8 10 13 22 19 15 10 8 8 6 6 10 7 | Open.Hide. 0 3 9 9 9 9 9 13 8 8 8 8 6 9 9 9 16 17 37 41 39 36 39 37 37 37 37 39 39 39 44 23 21 12 6 6 6 6 6 6 6 6 11 11 14 19 18 32 20 28
34 37 44 47 37 37 39 37 59 27 27 9 9 11 8 8 8 8 10 16 20 25 17 14 15 27 29 36 36 36 36 36 38 53 53 53 53 53 53 57 57 57 48 50 48 57 57 57 57 68
68 68 59 59 54 48 48 50 53 53 68 68 50 50 47 50 47 47 47 47 47 47 59 46 46 43 46 48 57 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68
59 59 57 57 57 57 57 68 68 50 50 50 50 50 50 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 68 68
68 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68
68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68
68 68 68 57 57 57 57 43 57 57 68 57 68 68 44 44 27 24 9 9 9 9 9 13 15 20 27 36 44 57 57 47 47 44 44 44 44 48 59 59 59 59 57 59 57 59 59 59 57 57
44 44 43 43 43 59 59 68 59 59 48 48 48 48 42 39 35 35 35 37 37 43 48 43 43 43 39 39 39 34 34 28 28 22 22 31 20 20 11 11 11 15 13 10 10 10 10 10 15 15
28 12 10 13 17 8 8 8 9 9 9 9 9 9 9 9 11 11 9 12 11 10 9 9 9 9 11 12 9 9 8 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 11 9 8 8 6 6 6 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 12 15 10 10 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 13 8 10 9 11
11 10 10 13 15 13 13 8 10 10 10 10 10 8 9 6 8 8 8 8 8 15 10 12 10 10 10 11 9 9 9 9 9 9 9 9 9 9 10 10 10 10 10 12 14 9 8 8 6 6
10 8 10 8 9 9 9 9 9 9 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 6 8 8 8 9 9 9 9 12 21 24 21 16 10 10 8 8 10 8 8 8 8 13 8 10 10 10 10 8 8
8 12 8 9 9 9 9 10 9 9 8 8 10 8 8 8 10 10 9 9 10 22 16 22 11 11 10 12 8 8 7 7 8 13 6 6 8 8 8 10 12 10 20 17 20 12 8 8 8 10
12 16 14 8 8 6 6 8 8 15 11 10 10 8 8 8 10 11 9 7 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 15 12 14 18 12 10 10 15 13 8 8 6 6 8 12 11 12 10 11
7 7 10 8 9 13 11 11 11 13 13 10 8 8 9 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 8 9 9 13 19 12 8 8 8 8 10 6 6 8 8 8 9 9 10 10 9 10
8 8 8 |