BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-467K20.T7 (MSMg01no467_k20.b1) | MSMg01-467K20.TJ (MSMg01no467_k20.g1) |
ACC | AG551328 | AG551329 |
length | 745 | 769 |
length of high quality (start - end) | 540 (38 - 577) | 244 (66 - 309) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no467_k20.b1 PHD_FILE: MSMg01no467_k20.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:43:37 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no467_k20.g1 PHD_FILE: MSMg01no467_k20.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:43:37 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTGTGCAGAAATCCGCGGAATTCCTA
TGATTTTCCCTTTAAATATTTTTCATTGCACAGAAATATTTCAGTCATTA
TTTTTAATGTTCTATTTTATTCTCCTACTTCGCTCTTTTCTAAAGTTTTT
CCTTACATTTTTCTGTTTTTCTTTGTTCCTGTTTTTTTAATTATTTTCTT
TATTTACATTTCAAATGTTATCCCCTTTCCTAGTTTCCTCCATGAAAATC
CCCTATCTCCTCACCCCTCCCACTGCTCACCAACCCACCCACTCCTAGTT
GCAGGCCCTGGCTTTCCCCTATACTGGGGCATAGAGCCTTCACAGGACAA
AGGGCCTCTCTTCCCGTTAATGACCAACTAGGCCATCCTCTGCTACATAT
GCAGCTAGAGCCATGAACCCCACCATGTGATTTCTTTGATTGGTGGTCCC
AGGTAGTCCCAGGGAGCTATGGGGCTACTGGTTAGTTCATATTGTTGTTC
CTCCTATGGAGCTAAAAACCCCTTCAGTTCCTTGGGTCCTTTCTCTAGAG
ACTTAATAGGGGACCATGTGCTCCATTTAATGGATGGCTGTGAACATTTA
CTTCTGTATTTGTCAGACACTGGCAGAGCCTCTCCACAAACAGTTATTTC
AGGGTCCAAGTCCCAAAGCTCCTGTTGGCATCCACCATAGTGTCTCGTTT
AATCGAATTGTTTATTGTATGTAACCCCTTGTCATTCTTATCTCC
| TXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXATCAGAGATAAGTTATGCCAAACTCTCCCAAGAAC
AGCACAGGGAAGAGAAGCTACTTAAGAGTAGTTCAAGGGGGAGAGAGGGG
GGGGATATGAATCACTGAATTTGGAGTTAGTGGTCAGTGCAGTGCAGTAC
AGTGCAGTTGAGTTCATGCAGTTTAGTGTAGGTCAGCAGAAACTGTTGAA
ACCAGATACTAAGAAGGAACAGAAGATTAGAATAAATTTCCAGAGGTAGT
TTGAGGCCAATTGTTTTTTCTCAGTGAAAAATCAAGAAAAAACAAACTGA
ATCATTCAGCTTGAAGAGAAGTTTGACTTTGGTCAAACAGCTCAGTTGAA
CCAGTCAGCCAAAGTTCAGAAAGAACTAGAAAGTGAGAGCTTAGTACTGC
ATCTTAGAGGCTGAAATATCTTAGGCCTAGATTAGATTGTAAGAAGACTA
GAATCATTCTGGCCTACGCTTAGGGATAGAAAAGAGGTATACAGCTTCTG
GGTTTACCCAAAGACATTGTATACATAAGTTTGGTCCAAGCTTTTATCTC
CTACTCCTCCGCTTAGAATAAATTCCCAGTTTTTTCTTTTACTTCTGGGT
AACCTTGCCCTCTCGGCATTACCTCTTTTGTTGTTAACTCGATCAAACCC
CCCCTTTTTCTCTTTCCCTTCTTATACCCCTCTACCCTCTTTTTTCTACA
CTCTATTCCTTCTGTCTTN
|
quality values | Open.Hide.24 28 30 30 28 24 23 28 30 30 27 25 32 37 37 41 46 28 28 28 28 25 21 19 12 9 7 7 7 7 7 6 7 10 8 9 13 18 26 30 34 30 30 29 29 33 33 59 59 47
37 37 37 37 32 30 28 25 15 12 12 21 15 8 8 8 22 22 41 50 53 36 36 36 36 36 42 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 53 68 68 54 54 54 54 54 54 54 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 59 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 44 57 43 39 44 44 57 57
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59
59 59 59 59 59 59 31 29 23 11 10 10 10 12 16 20 20 28 32 59 59 59 59 59 59 59 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 54 46
43 39 35 35 41 47 59 59 68 68 68 68 59 59 59 59 59 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 68 68 59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 54 59 59
57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 59 59 59
68 68 59 59 43 43 43 57 57 57 48 47 47 57 54 54 54 59 59 59 46 48 48 54 44 44 47 48 47 42 39 48 48 48 48 43 43 43 43 48 48 43 57 48 48 48 48 48 43 44
43 48 48 48 48 47 47 39 47 43 41 41 41 41 37 28 31 27 25 22 28 39 39 39 33 28 27 24 22 28 30 37 30 23 20 31 28 29 30 39 41 47 47 47 32 32 28 30 21 26
21 34 34 21 18 16 19 18 19 25 16 21 12 14 14 32 32 39 39 46 46 37 39 30 30 19 19 12 10 10 16 14 19 23 22 17 20 30 28 32 32 31 32 37 30 30 32 32 34 23
23 23 32 24 23 18 12 12 12 11 11 25 19 19 12 16 11 11 11 16 15 9 9 10 9 9 9 11 11 12 16 14 12 8 9 12 12 14 14 10 10 8 8 8 8 10 8 8 8 13
10 13 11 11 12 11 7 8 6 7 8 8 10 13 19 12 8 8 8 15 22 26 28 28 21 15 11 9 10 10 11 13 6 6 6 8 8 9 6 8 8 8 10 10 9 8 8 8 9 9
8 8 8 9 10 10 7 12 9 9 10 19 13 11 11 10 8 10 8 6 8 6 6 7 13 8 8 8 6 8 8 8 8 8 8 9 8 8 8 10 8 11 12 10 10 | Open.Hide.11 11 8 8 10 9 16 39 39 39 39 39 39 39 39 39 39 44 41 41 35 27 14 9 9 10 12 9 9 9 13 13 22 19 32 28 37 39 34 26 22 22 22 30 27 50 50 47 33 27
12 11 12 11 13 15 12 11 18 12 20 20 28 28 28 37 33 36 39 39 36 36 50 50 50 50 53 53 47 47 50 50 50 50 57 57 54 57 68 68 68 42 42 42 42 42 50 54 68 68
68 50 50 47 47 48 50 50 57 68 68 57 59 47 47 54 54 59 59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 54 59 59 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68
68 68 48 48 41 42 42 48 50 50 50 50 50 46 57 57 50 47 47 50 57 68 68 68 68 68 68 59 59 54 48 48 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 59 59 59 43 43 43 43 59
59 59 59 59 57 54 54 54 54 54 54 54 54 57 43 48 43 43 43 43 39 43 37 43 39 43 47 53 53 50 57 50 50 50 48 41 34 30 30 24 13 10 8 8 8 15 23 30 37 37
36 37 37 37 43 48 43 43 37 37 30 39 39 30 39 39 47 47 48 48 48 57 59 42 54 54 43 43 39 39 29 32 32 36 36 47 47 57 57 59 48 47 59 43 43 43 59 59 59 59
59 59 59 59 59 32 28 15 11 11 11 9 12 12 12 10 9 9 9 9 22 25 41 41 47 59 59 59 53 50 57 39 39 35 35 35 37 35 59 47 57 57 43 43 43 43 46 57 48 34
30 18 14 14 13 15 19 21 30 31 44 47 37 36 23 23 41 44 37 39 39 46 57 57 54 54 57 57 57 59 48 44 43 43 37 37 37 37 37 46 59 59 59 68 68 46 44 42 36 35
35 39 39 43 43 43 40 39 39 33 28 25 28 30 30 32 28 20 20 20 23 32 33 43 47 34 28 19 13 12 12 11 11 12 23 25 37 36 37 37 32 34 28 28 14 24 28 32 31 20
20 20 32 29 30 28 28 30 30 30 37 43 37 25 25 39 28 28 23 28 20 24 18 23 28 28 24 34 25 25 19 25 23 11 11 16 22 25 20 16 12 21 22 29 31 41 37 32 32 20
19 24 27 22 15 12 12 20 20 21 18 14 23 19 27 15 11 11 15 27 27 22 18 17 21 21 15 12 12 11 12 12 15 15 14 12 12 15 13 13 9 9 9 10 10 10 15 19 22 14
8 8 8 8 12 8 8 8 8 10 10 10 10 10 11 8 8 7 10 8 8 8 8 6 6 8 10 8 8 9 13 9 9 7 10 6 6 8 8 8 14 15 8 8 9 9 9 9 10 9
9 9 6 6 6 6 8 8 10 8 8 7 7 8 8 8 8 9 10 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 10 11 10 12 12 10 10 11 13 13 11 11 13 17 11 11 9 9 9 11 8
8 8 10 10 9 11 11 11 11 11 11 15 12 12 12 12 12 12 12 18 15 15 18 12 12 14 20 17 18 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 6 6 8 8 8
13 12 11 15 15 21 10 9 9 8 6 6 6 11 10 10 11 11 12 20 10 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 8 8 8 8 11 13 13 15 15 10 10 9 9 9 9 9 10
10 10 10 9 9 9 11 11 10 10 9 10 8 8 8 9 8 3 0 |