| BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
|---|
| end name | MSMg01-478A13.T7 (MSMg01no478_a13.b1) | MSMg01-478A13.TJ (MSMg01no478_a13.g1) |
|---|
| ACC | AG559245 | AG559246 |
|---|
| length | 729 | 741 |
|---|
length of high quality
(start - end) | 411 (310 - 720) | 232 (76 - 307) |
|---|
| definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no478_a13.b1 PHD_FILE: MSMg01no478_a13.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:57:39 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no478_a13.g1 PHD_FILE: MSMg01no478_a13.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 19:57:39 2005 |
|---|
| singlet/doublet | singlet | --- |
|---|
| BLAST hit | unique | no hit data |
|---|
| sequence | CGGCCGCTAAACGACTCACAATCAATACGAGAGGCGCGGAATCTTTGTTA
CAAAAAAACGCCATTTTTAATAGGGTTCTGGTTACTGAGTGCATACTATG
TATCAGGCTCAGTAGCAAGTGCGGAGGATACAACATCAAGAGAGCTTTGC
CCTCTTGGGAAGAACAGCCATTTGGAAGGCCAGGGCTGCAAAAGCCTGCC
TCTGGGATTGTAATCTCTGGATGCCCTTTCCCAGCCTCTTGGCCTGGCAC
CTCAGAAGAGTGATTTCTCTTGTGGACTTAAGGGCCTTCACTCAAGGAAC
ATCCTANTTTGGGGGGGGGGGTGCACTGTGTGTGCAGAGCTTACTGTATG
TGTGCAGAGACAAACAGCAGCAGAATGCCAAAAGGCTTCAGAGAGAGGCA
TAGAGCCCTGCTTAGCAGAAGGGAAGAAGTGTTATTTGGCCTCCCAAGAC
CATTTCGAGTCTGTTTTTCTATTTCACATCCTCTTACATTAGGTCATCCT
GCCTCCATTTCCAGCCTGGTTTGTCTGCCTATCTCTTATTCCCCATCCCT
ACCCCGTACATCCCTTTCCTCTGTCCCATTTGACAGTCACCTTCTGGAGG
ACAGTAAGAGGGAGGGGGATAGGGATTATACCTGACTCTGCCTAGCACAC
AGTGTGCTCTCATGCAGGGAGGCTGACCCACAGAGAAGGTGCACAGTCCT
CTGCTAAGACCCACCAGTGGGCAGGAAGG
| GGTAGGCCTGGGGGGCGCCTGGTACTAAAATATTGGGGTGAACGANAGAA
TGTCAGCAGCAGGCCTTCNTNANGNCCTCTACCGTCATCATGAGATATGC
TTTTAAATCCAGGTCTACCTTTTCAGGTGTGTTAGGGTGTCCTGGATTGG
GCGAAGTGGGCGTTCTGGGTTCTGATGATGGTGAGTGGTCCTGGCTTCTG
TTAGTAGGATTCTTACGTTTACCTTTCGCCATCTGGCAATCTCTGGAGTT
AGTTGTTATAGTTGTCTTTGTTAAAAGATTGTTCCTCTGTTGATTTTGTT
ACCCTTTTTTTTTTAGGCGTGGGAGACAAGCTCTCTTCTCTGAGTTTCAG
TGGTCAGAGCAGTCTCTGTAGGCAAGCCCTCCTCTCTCAGGGAAGGTGTA
CAGTTATCTGGTGTTTGGACCTCCTCCTGGCTGAAGGTGAAGGCCCTAAA
CAGGATCTTTCCCAGAAGCTGTGTTGCTTTTGCCATGAAGGTGGCCATTT
GTCTGGAGTCTAAGATGTCTCCGCCTCAGAAGCTCTGTGGCTCTTGCCGG
GAAGGTGGCTGGTTGTCTGGAGCTGAGGATGGTGTCGCCCCAGAATCTCT
GCGACTCTCTTCCCCGTCCTCTAAACACCTGGCACTCTGGTATTCCCATG
GTCACCCGTGCAGCCTGCCCTCTGCGGAGTCCCTGAACTCAAAAAGGTCC
CCCCTGGCCCTTGTGCCCCTAACCTCTTTTTGCCATGGCAG
|
|---|
| quality values | Open.Hide.11 11 21 15 25 15 19 16 10 9 12 20 18 34 25 27 19 15 6 6 6 6 7 10 9 9 6 6 6 9 7 7 8 8 13 19 34 34 28 20 12 15 19 19 27 9 9 9 9 9
7 10 9 10 9 9 11 10 10 9 11 11 16 17 22 27 37 53 57 38 42 47 42 43 43 50 43 47 57 57 57 53 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 53 59 59 59 41 34
19 15 11 13 11 10 11 15 15 12 23 23 37 47 48 48 53 53 57 59 57 57 53 53 53 42 47 40 40 40 50 50 53 47 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 48 48
48 48 48 48 48 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 50 51 50 50 50 51 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 44 32 19 12 11 11 15 18 15 34 34 68 68 57 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 53 53 50 50 50 50 41 34 23 18 10
10 9 9 9 9 3 0 3 12 15 18 19 36 41 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59 57 57 41 43 39 32 32 32 32 32 39 42 43
43 43 43 37 39 39 39 59 48 57 57 57 57 57 59 68 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 59 68 68 59 59 57 47 47 50 50 57 57 59 59 68 68 68 59
57 57 44 32 32 27 33 43 43 44 44 36 40 29 29 36 33 37 44 48 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 59 59 59 68 59 59 54 57 54 54 54 54 54 54 54 57
54 54 54 57 59 57 57 54 54 54 54 59 57 57 57 59 59 57 57 57 48 57 57 57 48 48 48 57 57 57 59 59 48 48 42 47 47 47 41 37 35 32 32 39 39 59 59 59 59 59
48 48 48 48 48 48 50 48 48 48 48 48 48 48 48 57 57 59 57 57 48 48 43 48 48 57 48 57 54 57 57 59 59 59 59 57 54 54 54 54 54 50 68 50 50 50 50 57 59 59
59 59 59 57 57 37 37 28 37 37 57 59 59 59 57 57 48 48 48 57 47 57 48 48 48 59 47 39 36 36 33 31 37 30 30 30 34 30 35 31 34 39 43 43 41 36 35 35 37 37
35 28 28 34 41 59 34 34 30 28 28 31 35 31 31 43 39 39 36 36 36 40 37 37 28 28 28 37 37 37 37 37 34 31 19 19 12 18 15 12 12 13 21 21 21 30 30 32 37 31
28 19 29 17 20 20 34 28 32 32 37 37 47 27 23 14 14 14 19 25 29 29 35 29 29 23 18 18 18 19 23 24 24 30 24 19 18 18 18 28 28 33 33 26 21 13 13 13 21 28
37 37 37 37 25 19 10 10 10 10 10 18 25 31 27 30 22 11 11 13 11 15 14 15 11 11 10 10 10 | Open.Hide. 8 8 8 8 8 8 18 12 15 21 26 28 32 32 28 29 27 10 10 9 9 9 9 6 6 8 8 8 8 11 10 10 10 10 9 12 14 23 23 29 23 21 8 6 3 0 3 10 6 7
6 6 6 6 7 9 8 8 8 8 8 8 9 10 11 12 12 3 0 3 0 3 0 3 0 3 23 25 41 39 17 14 9 6 8 15 16 37 37 40 41 43 43 48 48 48 48 43 39 39
40 37 43 25 25 25 33 29 29 20 17 17 22 40 43 54 54 54 54 59 59 50 50 50 54 50 50 54 48 48 48 43 43 37 35 32 38 25 35 37 42 32 44 35 35 35 38 32 21 27
27 27 23 36 36 36 32 32 32 33 42 42 59 59 57 50 44 43 44 50 59 59 57 57 57 54 54 50 57 50 50 37 37 35 37 43 43 43 22 22 28 44 43 52 52 52 59 59 59 59
44 43 31 31 43 43 37 37 50 50 50 50 59 57 50 43 43 59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 43 37 46 44 32 21 14 14 15 15 26 26 44 44 57 57 57 57 44 41
44 44 57 48 48 48 48 46 43 40 37 37 43 43 43 48 59 59 59 54 54 54 54 47 43 28 28 28 34 34 36 42 43 43 43 43 46 57 46 48 48 48 48 57 57 47 47 37 37 37
32 31 20 20 9 12 11 16 16 19 23 12 14 12 11 11 21 22 33 33 33 33 47 48 43 43 37 37 28 28 32 39 40 46 57 57 50 50 50 50 43 43 35 35 28 37 32 25 25 33
31 33 31 28 36 33 43 43 43 43 43 43 43 47 47 57 57 44 44 37 37 37 30 30 24 32 24 28 37 36 37 37 44 44 31 23 21 19 12 17 27 27 26 32 28 28 30 28 28 31
28 28 28 40 28 33 33 43 42 42 35 39 39 43 37 43 32 36 36 37 37 39 40 39 43 39 32 32 30 30 37 37 28 15 15 11 11 19 28 28 28 18 18 12 12 7 7 8 11 12
17 19 15 16 24 27 29 30 31 31 33 34 28 23 19 26 17 17 17 32 32 43 32 32 24 22 19 19 19 11 8 8 8 10 10 11 11 11 12 10 11 16 17 18 15 19 11 13 11 16
18 27 30 33 39 33 25 20 11 11 11 11 11 11 11 25 25 19 12 12 14 16 12 9 12 10 9 10 11 11 12 12 12 11 15 15 21 21 15 13 13 13 25 25 37 26 31 20 20 20
25 22 22 24 24 27 19 19 22 19 25 19 19 14 19 13 13 13 16 16 11 12 12 11 11 11 11 11 11 11 11 11 17 11 10 10 12 16 16 20 15 11 11 10 10 10 10 10 13 11
18 10 12 10 13 12 13 10 11 8 11 10 9 8 9 8 8 8 10 6 8 8 13 10 10 10 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 10 10 8 8 8 6 8 10 12 10 10 11 10 10
10 12 10 10 10 17 17 24 12 8 6 6 8 8 13 15 15 10 9 9 9 10 9 9 10 10 12 10 10 10 15 10 10 9 9 8 8 9 8 10 10 10 10 10 9 8 8 8 10 10
9 6 7 6 6 6 8 10 10 6 6 6 6 9 13 9 10 8 8 8 8 10 8 10 18 21 18 19 16 10 9 9 9 9 9 8 8 6 6 8 6 |
|---|
