BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-482J01.T7 (MSMg01no482_j01.b1) | MSMg01-482J01.TJ (MSMg01no482_j01.g1) |
ACC | AG562701 | AG562702 |
length | 704 | 704 |
length of high quality (start - end) | 225 (52 - 276) | 615 (74 - 688) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no482_j01.b1 PHD_FILE: MSMg01no482_j01.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:03:30 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no482_j01.g1 PHD_FILE: MSMg01no482_j01.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:03:30 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | CTCACTAATAGTCATTGAGGCGCGGAANTCACCAAATACCTACACAAGGA
GTTTATCCCTGAAGCTAATGCTGCTATCAATCCCCAGGGTTTCAGCTCTC
TGTTCCATTTGAGGATGCACATAGATGACACGTATGTGCCCATGTGATTG
TATTTGGGCCAATCAATGTAAACATGTCTCCCTGGCCAACCCCCACAAGC
ACTTTTCTGGGCTTAGGATCCTGGGTATCCGTAGGTTGGGTCTTCAAGGG
CTCTAAAGAGGAGTGCTCCTGTGATCTCATGACCACCGATTTTTTTTTTT
GAGCAAATCCTGACTCCCTTGAGGTCCAGAAGCTAGTTTGAACAGCTTGC
ACTGTGCTACGTGACACCCTTTGACTTTTCAAACTGTAAAGTGCCTCACT
AGAGCAAAAGTCATCAACGGCTCCCAGAAGCACCCCCCTCCTACCCTGAA
AAAGACTGCCTCTGCCTCCCCCATGTTGTTAGCGCGCCAATCCCACCGCT
TGGGCTATTGCCTTAACCTCTGCCACCCCTTCCCCTGTGCATACTTCCCC
ATCCCCTCCCAGCCCCCACTTATATCCCCTTTAACCATGCTTAGCACTCT
ACCTCCCAACCCCCTACACATTCTTCGCTCTACACATACCTGTCCTACCC
TTAGTATTTTTCTCTCCTCCCACTGCCTCTATCTCCCCCCAGCCCACCTC
TGTT
| CGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXTTTGTTTAGCTCTGTATCACATTTTTT
AATATGATTATTTGATTCTCTAGAATCTAACTTTTTAAAAAATAATTATT
TATTTTATGTATATGAGTACACTGTTCCTGTTTTCAGACACACCAGAAGA
GGGCATAAAATCCCCTTACAGATAGTTGTGAGACACAATGCAGTTGCTGG
GAATGGAACTAAGGCACTCTGGAAGAGCAGTCAGTGCTCTTAACTGCTGA
GCCAGCTCTCTAGCCCAGAATCTAACTTTTGAGTTCTTTATATATATTGG
ATATTGGCCCTCTATCCGATGTAGGGTTGGTAAAGATCTTTCCCCAATCT
GTTGGTTGCTGTTTTGTCCTATTGACAGTGTCCTTTGCCTTACAGAAGCT
TTGCAATTTTATGAGGCCCATTTGTCAATTGTTGATCTTAGAGCATTAGC
CATTGGTGTTCTGTTCAGTAATTTTTCCTCTGTGCCCATAACTTTGAAAC
TCTTCCCCACTTTCTCCTTTGTAAGGTTCAGTGTATCTGGCTTTATGTGG
AGGTCCTTGATCCACTTGAACTTGAGCTTTGTACAGGAGATTGATTTACA
TTCTTCTGCATGCTAACTACCAGTTGAGTCAGCACCATTTGTTGTAAAGG
CAGC
|
quality values | Open.Hide. 9 9 9 12 8 6 6 6 6 6 6 6 8 8 8 9 8 8 8 8 8 8 12 23 21 21 3 0 3 8 6 6 7 6 6 6 9 7 7 7 7 7 10 10 11 11 15 15 16 12
15 16 22 24 37 37 48 43 47 48 39 39 28 28 28 32 37 39 43 43 43 43 43 36 36 36 40 29 29 29 36 46 42 32 27 20 20 24 34 44 48 36 21 12 10 10 10 19 21 25
28 25 40 38 42 35 35 35 37 41 37 23 18 14 23 23 27 14 10 10 14 19 16 28 37 42 38 50 43 43 32 37 43 50 50 50 50 43 43 35 35 35 35 43 43 35 35 32 43 43
50 52 57 57 57 57 38 38 17 32 32 43 43 43 43 52 57 57 52 52 52 52 52 52 52 52 52 57 52 52 52 50 44 52 32 32 12 15 15 28 28 43 32 35 32 32 33 41 41 41
37 43 43 59 59 57 57 50 43 37 37 37 36 44 33 37 37 42 42 42 37 42 31 31 31 35 44 36 32 25 18 32 24 37 35 42 42 48 46 47 43 43 40 44 25 25 25 32 30 24
24 17 28 28 41 37 20 20 20 32 31 41 33 30 37 32 39 43 33 33 32 23 23 21 21 13 13 13 19 18 21 15 8 8 8 10 8 9 10 13 12 11 14 14 11 11 10 9 13 9
14 11 16 11 12 12 11 17 9 9 9 17 23 33 32 32 32 35 35 28 30 18 18 14 15 15 15 11 11 15 18 12 12 12 12 12 21 29 34 34 30 18 18 12 19 11 11 15 12 12
19 22 31 28 20 18 18 15 12 11 11 12 22 15 15 8 8 8 8 8 10 10 17 17 30 26 24 22 22 23 23 22 25 25 28 28 28 28 24 22 25 24 16 16 12 12 12 12 16 18
21 15 19 19 24 23 21 21 15 12 12 11 11 11 17 23 31 31 31 22 22 22 27 25 12 11 11 11 12 11 10 10 10 18 13 13 13 12 10 12 10 10 10 12 15 22 28 30 30 25
19 19 13 13 11 18 19 16 14 10 10 10 10 12 14 14 16 16 13 11 8 8 7 6 8 8 10 12 12 12 11 12 12 12 11 11 13 11 10 10 16 17 13 11 12 12 12 15 15 28
22 14 12 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 16 16 21 23 10 10 10 10 10 13 11 9 11 10 9 9 9 10 17 20 12 12 12 11 8 8 10 8 8 10 8 12 12 13 10 12
12 12 21 13 16 10 10 10 10 11 11 11 11 16 17 15 12 9 14 15 8 8 8 8 8 8 8 8 9 8 9 9 9 9 10 10 10 10 10 9 9 9 9 9 10 13 17 17 22 22
28 28 22 23 12 11 8 6 6 6 12 13 9 8 8 10 8 8 8 8 9 10 13 11 8 8 8 11 8 8 8 8 7 6 8 8 8 8 8 10 7 7 8 8 10 9 9 13 15 13
8 10 8 8 8 8 8 8 10 10 13 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 13 8 8 8 8 8 8 10 12 9 10 9 9 9 9 13 10 8 8 8 8 8
8 8 8 8 | Open.Hide. 6 6 8 10 9 10 9 10 18 23 28 28 32 41 37 37 43 43 39 33 33 33 33 33 37 50 47 47 30 25 12 9 9 9 11 12 10 10 10 10 15 8 8 8 8 18 23 24 11 11
11 26 29 50 47 43 27 23 9 9 9 9 9 9 9 12 23 18 30 30 30 33 33 48 48 59 59 57 57 57 57 53 53 53 53 50 50 50 47 47 47 47 42 42 42 51 68 68 68 68
68 68 68 68 51 51 50 50 50 51 68 68 68 68 48 57 47 47 48 44 44 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 50 50 50 51 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 54 52 57 52 54 54 57 57 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 68 68 68
59 59 57 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62
68 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 38 38 29 39 35 35 35 35 35 44 44 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 62 62 52 52 62 62 62 57 59 57 57 52 52 57 59 59 59 59 57 57 59 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59 59
59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 52 52 57 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 59 59 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59 59 59
59 57 57 57 57 57 57 59 59 59 57 57 57 54 48 57 48 48 48 48 54 59 59 57 57 57 57 57 57 59 48 48 48 57 48 54 54 47 59 59 59 57 59 48 54 47 59 43 39 39
39 39 48 59 59 59 59 43 43 43 47 47 48 48 48 43 43 43 43 43 43 43 48 44 59 43 43 40 47 30 59 36 36 35 28 28 32 36 36 37 37 37 50 59 50 50 50 57 57 57
48 48 48 48 48 48 57 48 48 48 48 57 57 48 46 46 46 59 41 59 36 35 35 23 18 11 11 11 23 23 37 39 36 39 39 43 43 39 39 30 30 28 34 28 30 32 37 37 39 39
37 37 31 30 25 24 27 28 30 28 24 24 30 30 30 33 37 28 24 24 25 30 21 24 20 32 32 34 26 22 14 14 22 26 27 25 25 32 37 37 39 37 37 32 29 25 25 25 27 30
25 23 22 18 18 27 30 31 28 28 37 33 37 35 31 32 41 28 19 11 11 9 12 13 18 26 30 32 28 28 23 23 23 28 14 13 13 13 16 17 20 8 8 8 8 8 15 11 18 16
15 15 11 11 |