BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-485G12.T7 (MSMg01no485_g12.b1) | MSMg01-485G12.TJ (MSMg01no485_g12.g1) |
ACC | AG564858 | AG564859 |
length | 724 | 1,513 |
length of high quality (start - end) | 585 (79 - 663) | --- |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no485_g12.b1 PHD_FILE: MSMg01no485_g12.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:07:20 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no485_g12.g1 PHD_FILE: MSMg01no485_g12.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 20:07:21 2005 |
singlet/doublet | singlet | --- |
---|
BLAST hit | unique | no hit data |
---|
sequence | GGGTTATCAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
CGCGGAATTCACGTATATCACACTTATTGATTCAACAAACTAGGGTTTAG
TGAATTCATTTCTTTGATTAGTCACTGGATTCTTATCTTGGATGATCATT
TTTTATGCTTGTCAACACAATATTAATGTCACAACATTTGAGGCCTGAAT
TGATACACTTCAGTAACAAAGATAGTTTGAAATGGTAGCATTATCTCTAC
TAGAGATCCATCATGCAGCTGAAGATAAGCTTTCTGAGGGTAGAATATCC
ATGAAGACAATCTTGATACATCTGTTCTTTCCCATGTGGCAAAGAATTGC
ATATCTACTTGCTTGAGTTGGTTTCATTGTCTGTGACAGGAGTGAAATGG
GTGAAAAAGCATTTCATATGGGCTATCCTGTCTAACTTTGAACTTTCTGG
TGGGGTAAGGTGGAGAATCACAAGACTGCTCTCATACTTTTTGAGATGTG
GAATAGCATACCTCCTTAATGAATTCTGTCTGTCACAACAGTATGAAGAC
CCTGTCAAATAATTGAAATATCATGGGATATATTACAGTCTTTGCAAGTA
GCACCTATGGCACAGTACCATAAACAGGCTGCAGTATCAATTATGTGGCC
CTTGTCTGGAAAATAAGACACCCAAGAGAGATTAATCTGTCAGCCTAGAA
AAAACTTGCTGATAAAAGGGAGAA
| TCTGTTATCTTTACTATATTATTTGTCTAGATATTGCTTTACAATAATCG
AGCAGCGTTTATGTCATATTCTCTCCACACACAAGATGGAGATTATGATC
AATAGAGTGTAGCGGATTGTTTATCTTCTCCTCGTAGATATCCTAGATAG
TGCGTTATAGAATGNAATACGCCTACATGGTGAGATGCACGTTATGCGTG
CACATCGCAGTGCCTACGGTGCGATGATGAGGCGGCACTTTATCACATAG
TTATTGATAGTTCAACTAGTAGATAGAAGCACATGTATATATGAGATGTA
CTCCCGGTCGTGCTATATGCAGGGTGAGGCAGGACGCGTGTGGTGTAGCA
TGATGTTACCNCATGCTGCGTATGCAGCGCGGTGCTAGATGATGTACACT
AGATTTATGTTAGTGTGAGTCGAGCTGTGCTCCGCAGAGCTAAGTATATC
TATCTCGTATCTATACTAAGTAGTGAGCGACGTAAATGACAGATACGCGT
AGTAACTAAGCATGTATTGACTAAAGAANCCACGTAAAGAATGACATTAG
ATGTAAAACGATGCCATGATGCCATATGAAGGCAACAGATATAGCAACTA
TGAGAGTACTATTACTATTCTGTATGTGCGCTCTGCTGTTAGTAAGTAAC
ATTCACTATATTCCTACGTCTGTTTANTGATGTAGGATATATATCTCTAT
ATGTAANTTGGAGAGGTGACGCTCGTCTGTGATATGCACTAGATTTGACA
CATGATGTATATGATGTATATATGTGACGTAGATGATAGTGGCATGAGAA
ATGTGTGTTAGATATATGTGTAGTTCACTTGTGTAGTTAGCGAATCACNC
AACGCATCAACATGCTAACTAATGATCTTATATATACTTTAATCTAATAT
CATACGTGTCACGAGCGATATACCGTCGTCCTCACTCTGAGACANCGCCT
AGATGTACGTATAATAGGTGAGATGNGTGCNTGTACTATGAGATAGTGAT
ATNAGGTAGTTATACATATAGTATAGCATATCAAGCGATAATAATTAGGT
GTGACTACGTATATATACAACATACGACGGTAGAACGTCAGATAGATGTA
AAGTTAACAGTACGTAGATGATAGTGCGTACTAATATGTACACTTCATCA
CAGATACATGTATCAGTGCGGTGTGGGAGTCATTTTAAGGTGAGTGATAC
TACTGTGTACAGAAATAGTAATATATATGANATGACTAACATGTGAGATT
ANAGCGATCAGCACCATGATGTATCGTGAATAGTTACACTGAAGAGTAAT
CGTAGACACTCGTGCTACATGTGAGATATGAAGACTAGTGTGAGCAGCTG
CTAATTGATGTAGACGCTACTNCGAGGTGCAGAAGAGAGGGATATAATAT
TGACGCGGACCGAGCGNATATATAGATATTCAATAGCATATTATTAAGAT
TTATGGCAATATGGTTCTGGCGCGGACTGTTAGACTCTATATCTATACTA
TAATGTAACGGTG
|
quality values | Open.Hide. 7 7 7 6 6 3 6 9 9 8 8 8 9 8 19 30 39 39 32 29 31 37 23 19 10 10 10 21 21 37 28 28 28 25 23 21 19 6 6 6 6 6 6 9 7 7 7 8 8 10
12 12 25 20 30 28 28 28 28 28 33 30 30 27 19 9 7 7 7 7 9 9 9 15 15 20 24 21 22 28 22 30 32 34 47 53 53 53 53 53 53 53 53 57 57 57 57 57 59 59
59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 50 50 42 44 37 44 34 44 44 37 37 37 42 48 57 68 68 68 68 68 68 68 50 51 50 48 48 47 47 47 50 57 68
68 68 68 51 50 50 50 51 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 59 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57
35 32 20 20 28 28 42 48 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 68 68 57 57 57 57 57 57 59 59
57 57 57 57 53 53 57 57 57 53 53 59 59 50 50 41 32 28 15 12 9 11 9 10 10 10 10 10 25 33 47 47 50 50 50 50 59 59 59 59 59 59 59 57 57 57 57 57 57 59
59 59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 54 54 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 57 57 54 54 54 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 59 68 68 59 59 59 59 57 57 48 57 48 48 57
44 44 39 47 35 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 59 44 41 41 44 44 39 37 39 39 39 47 59 59 59 59 59 59 50 50 50 50 48 42 46 47 47 44 44 43 37 21 27 15 20
20 29 34 37 37 37 30 36 32 32 37 37 37 37 37 41 41 41 43 41 41 39 39 39 32 32 37 36 37 39 47 47 59 59 47 47 41 41 41 41 37 37 39 39 38 37 37 41 59 34
34 23 32 28 37 41 37 37 37 37 37 37 37 30 30 37 34 31 28 32 32 31 32 41 41 41 32 37 41 44 47 47 43 47 35 31 34 34 31 31 35 34 41 41 41 35 31 31 31 28
32 32 25 23 23 32 34 37 34 34 21 21 12 10 10 11 21 13 19 19 22 36 15 15 12 22 12 12 12 21 21 24 25 27 29 32 37 37 28 25 19 14 14 18 15 15 11 11 8 15
15 15 12 13 14 11 10 10 20 22 25 12 15 15 17 23 15 10 9 11 9 9 9 9 | Open.Hide. 6 6 6 7 7 6 6 6 7 8 9 7 8 6 6 6 8 8 10 10 9 6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 10 8 9 9 7 7 6 8
6 8 8 8 8 8 6 6 6 8 10 9 8 6 6 6 6 6 6 7 7 6 6 6 8 6 6 6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 10 8 6
6 6 6 6 6 8 8 8 10 8 10 10 9 10 9 9 9 9 10 10 10 7 6 6 6 6 6 8 7 7 6 6 6 8 6 6 6 6 7 6 6 8 9 9 9 10 8 8 8 8
8 8 6 6 7 8 8 8 8 8 8 8 8 3 0 3 6 6 8 6 9 9 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 8 6 6 6 6 6 6 10 6
6 6 6 8 6 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 9 9 9 12 9 11 11 11 11 11 11 11 10 8 6 7 6 6 6 8 6 6 6 8 8 9 8 9 10 8 10 10 10 9 9
6 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 6 6 6 6 12 7 8 8 8 8 12 8 8 8 8 8 8 8 9 8 10 10 11 10 8 7 7 7 6 9 9 9 8
8 8 8 8 8 10 10 8 8 6 6 6 6 6 10 7 7 7 6 8 8 9 9 9 9 9 8 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6 6 8 6 10 8 11 10 8 11 11 9 11 6
6 7 6 8 8 8 8 8 8 3 0 3 9 9 12 9 10 8 8 6 6 6 6 6 8 8 8 6 6 6 6 6 6 10 8 8 8 8 7 7 7 8 8 8 8 8 6 6 6 6
6 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 8 8 10 9 9 6 6 6 6 8 8 10 8 6 6 8 8 10 10 10 8 8 9 6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 6 8 8 6
6 8 8 9 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 6 6 10 8 8 8 6 6 8 6 6 6 8 10 7 6 6 8 8 6 6 8 6 6 6 8 8 8 6 6
6 6 6 8 8 8 6 6 6 7 10 8 10 8 8 8 8 8 8 10 10 10 10 10 10 10 10 3 0 3 10 9 9 9 8 8 9 11 12 12 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8
8 8 11 8 8 8 6 8 6 6 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 7 8 8 10 7 9 10 10 10 7 6 8 6 6 6 6 6 6 12 6 6 6 8 8 8 10 10
8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 11 11 7 6 6 6 6 8 8 8 8 11 10 10 11 11 10 8 8 8 8 8 6 8 9 7 10 6 8 8 8 8 8 8 8
6 8 6 6 6 8 8 12 13 10 10 8 6 6 6 6 6 6 6 7 7 8 8 8 12 3 0 3 10 10 8 10 10 8 8 8 9 10 10 9 10 9 9 8 10 13 9 10 10 6
6 8 6 6 8 3 0 3 6 6 8 8 8 6 6 7 8 8 8 8 8 8 8 10 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 6 6 8 8 8 6 6 7 8 6 6 6 8 8
6 6 6 6 6 8 8 10 10 10 12 9 9 9 6 9 8 8 8 8 10 10 11 9 8 6 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 8 6 6 6 8 8 10 12 10 10 13 10 8
8 8 8 8 12 8 8 8 8 8 7 7 6 8 8 8 6 6 8 12 18 12 11 10 8 8 8 8 8 8 9 10 10 10 8 8 9 8 8 7 6 6 6 10 8 8 8 3 0 3
12 12 9 9 7 8 11 8 9 8 10 8 8 8 8 10 10 12 9 9 6 8 6 6 8 7 6 8 6 6 6 7 12 13 12 10 8 8 8 8 8 9 6 8 6 6 6 6 8 6
6 8 10 10 8 8 8 8 8 13 12 12 10 13 9 9 9 11 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 8 8 6 8 8 8 8 8 3 0 3 9 9 9 9
6 6 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 8 10 8 6 6 12 12 8 9 8 8 8 3 0 3 7 7 3 0 3 9 9 9 8 8 8 8 6 8 6 6 6 6 8 9 10 10 15
12 3 0 3 6 6 6 7 10 8 6 6 6 6 8 6 6 6 6 8 6 7 7 10 10 11 9 14 15 10 8 10 10 7 6 6 8 6 8 8 8 7 7 7 8 9 8 8 6 6
8 8 6 6 8 6 6 8 6 8 8 10 15 12 10 10 8 8 8 8 8 11 8 8 8 8 8 8 8 6 6 6 7 10 8 6 6 8 6 8 8 10 12 10 10 8 8 6 6 7
7 7 6 6 7 8 8 8 8 8 8 8 6 6 10 8 8 10 10 10 9 9 9 8 8 6 8 6 6 8 8 8 8 8 8 15 8 8 8 6 6 9 7 6 8 6 6 8 6 8
6 6 6 6 8 8 6 6 6 6 10 11 8 8 8 10 13 15 12 12 15 10 8 7 7 7 8 9 6 6 6 6 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 8 8 6 7 8 6 6
8 10 10 9 7 6 6 6 8 6 6 6 8 12 12 8 8 6 6 10 13 15 10 9 9 9 9 8 6 3 0 3 10 8 10 8 8 10 8 8 10 12 11 13 10 8 8 6 6 8
3 0 3 6 6 7 8 8 6 6 6 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8 8 8 6 6 8 6 6 8 8 10 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 8 8
8 8 8 8 8 8 6 6 6 6 8 8 10 10 10 10 10 9 9 9 9 6 6 6 6 8 8 6 8 6 6 6 6 6 10 8 8 8 6 6 6 6 6 6 6 6 10 6 6 8
8 6 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 8 10 10 10 9 9 3 0 3 6 8 10 10 10 8 8 8 8 12 8 8 6 6 6 10 8 8 11 9 9 9 9 12 12 13 10
10 10 9 9 9 10 9 10 10 10 10 10 10 9 9 3 0 3 6 6 6 8 8 8 8 10 11 11 7 6 6 6 8 8 8 6 6 8 8 10 10 8 8 10 8 8 6 6 6 7
9 8 9 8 6 8 6 8 8 8 9 8 8 6 6 8 6 6 8 8 9 8 8 8 8 7 7 8 6 6 8 8 8 8 6 6 6 6 6 6 8 8 6 6 6 8 6 9 10 9
7 8 8 8 10 8 8 7 7 7 8 8 7 |