Query= MSMg01no525_o08.b1 MSMg01no525_o08.b1 CHROMAT_FILE:
MSMg01no525_o08.b1 PHD_FILE: MSMg01no525_o08.b1.phd.1 CHEM: term DYE:
big TIME: Wed May 18 21:00:39 2005
(598 letters)
>mm_chr3_42362160_42363157
Length = 998
Score = 953 bits (493), Expect = 0.0
Identities = 516/531 (97%), Gaps = 12/531 (2%)
Strand = Plus / Minus
Query: 5 gaattcagtgtatccttgccaatcaatccaatctcttcactatgggcataatggttctat 64
|||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 531 gaattcagtgtagccttgccaatcaatccaatctcttcactatgggcataatggttctat 472
Query: 65 aaagtttctaaaagttaaatgcgatcacatagtatttctagttaaaacaatgattttcat 124
|||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 471 aaagtttccaaaagttaaatgcgatcacatagtatttctagttaaaacaatgattttcat 412
Query: 125 tgtcctggcaaaagcatgcaacttttcagcctttaacatgaactacatcatgctaattga 184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 411 tgtcctggcaaaagcatgcaacttttcagcctttaacatgaactacatcatgctaattga 352
Query: 185 ttgatcttgcctgcctttcaacttatcaaaatacaaccctaagttctcagattccctaat 244
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 351 ttgatcttgcctgcctttcaacttatcaaaatacaaccctaagttctcagattccctaat 292
Query: 245 acataaaggcactaagtagatgttgaatggatcaatatataaacattaaaacttttttca 304
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 291 acataaaggcactaagtagatgttgaatggatcaatatataaacattaaaacttttttca 232
Query: 305 tatacaataatcaaccagaggaatata------------acacacacacacacacacaca 352
||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
Sbjct: 231 tatacaataatcaaccagaggaatataacacacacacacacacacacacacacacacaca 172
Query: 353 cacacacacacacacacacatattaatctgtacatatgaagccaataatattagatatgt 412
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 171 cacacacacacacacacacatattaatctgtacatatgaagccaataatattagatatgt 112
Query: 413 ctgtttttccactcctaatatcatgattaggtgcattatctattttcattcaattaatgt 472
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 111 ctgtttttccactcctaatatcatgattaggtgcattatctattttcattcaattaatgt 52
Query: 473 acaaaatatttctaaggaaaaactactccttaacaactcaaatggtccatt 523
|||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 51 acaaaatatttcaaaggaaaaactactccttaacaactcaaatggtccatt 1
Score = 80.0 bits (41), Expect = 5e-19
Identities = 41/41 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 332 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 372
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 713 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 753
Score = 80.0 bits (41), Expect = 5e-19
Identities = 41/41 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 332 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 372
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 715 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 755
Score = 80.0 bits (41), Expect = 5e-19
Identities = 41/41 (100%)
Strand = Plus / Plus
Query: 332 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 372
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 717 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 757
Score = 72.3 bits (37), Expect = 1e-16
Identities = 40/41 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 332 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 372
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 701 acacacacacatacacacacacacacacacacacacacaca 741
Score = 72.3 bits (37), Expect = 1e-16
Identities = 40/41 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 332 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 372
||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 703 acacacacatacacacacacacacacacacacacacacaca 743
Score = 72.3 bits (37), Expect = 1e-16
Identities = 40/41 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 332 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 372
||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 705 acacacatacacacacacacacacacacacacacacacaca 745
Score = 72.3 bits (37), Expect = 1e-16
Identities = 40/41 (97%)
Strand = Plus / Plus
Query: 332 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacaca 372
||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 707 acacatacacacacacacacacacacacacacacacacaca 747
Lambda K H
1.37 0.711 1.31
Gapped
Lambda K H
1.34 0.600 1.10
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 2, Extension: 1
Number of Sequences: 1
Number of Hits to DB: 94
Number of extensions: 34
Number of successful extensions: 34
Number of sequences better than 10.0: 1
Number of HSP's gapped: 19
Number of HSP's successfully gapped: 10
Length of query: 598
Length of database: 998
Length adjustment: 10
Effective length of query: 588
Effective length of database: 988
Effective search space: 580944
Effective search space used: 580944
X1: 8 (15.9 bits)
X2: 517 (999.5 bits)
X3: 517 (999.5 bits)
S1: 8 (16.4 bits)
S2: 8 (16.2 bits)
| |
