BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-539B06.T7 (MSMg01no539_b06.b1) | MSMg01-539B06.TJ (MSMg01no539_b06.g1) |
ACC | AG605655 | AG605656 |
length | 733 | 754 |
length of high quality (start - end) | 668 (55 - 722) | 629 (82 - 710) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no539_b06.b1 PHD_FILE: MSMg01no539_b06.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 21:17:53 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no539_b06.g1 PHD_FILE: MSMg01no539_b06.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 21:17:53 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | TCAATCCTATCTATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXCGCGGAATTCAGTTTTTCGAGGCTATAGGACTAAGGTCCCTATACT
TTGGCTGGCTGTTGTTCAGGGGTTGTTCTCAGCCCCCAGAGGCTCCTCGG
TCCCCTCCACATGGACTTCCCCCAGACCCACTTCCAGCTTAGCAGCTGCC
TTCCTCAGGGCCAACTGGGGAGCTTTCTGACCTCAGGGAGCAGCTGGACT
GGTCTCTGGAAGATTTTCGGTTAATGAAGTCAGGCCTAGGCAAGATAATC
TTCCTGTTGATTAACTCAGAGTCAACTGGTTTGGGAAGTTAATTATATCT
GCAACATCCCTTCACCTTGCCTGTGTTCTATTGGCTAGAAGCAAGTCACA
AGTTCTGGCTGCCCTCAAGAGAGGGTGTCTACCAGAGCACGATTCAGCAG
GGTCACCACTGGGTGTGTCTACACCCTGGGGATGGGCAGACTCCTACAGG
AGCATAGTAAATCCAGGGACCAGCTGGGGCCACCAGTCTGTTAGGCACCC
TGCCGCTGATTGACACAGTGTACTTTCATGGCCACCACATGGCATCCTCC
ACTCCATAATTCACGGACTACCTCCTTTGGTGTCTGTCTACCCAATTGGA
ATACAAGTTCAGAGGAGGCACCGAAAATATCTGTCTTGGCCGTGTTCTAC
TGTTAGGCACAATGCTTTTTGTATGACCTGGAN
| NNNTTCGATGAXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXAAAGTTTGCTAAAAATAGA
CAGTACACAGTAGTAAGTGTCACTAAAACCAGAAGTACTGCAAAGAAAAG
ATCTATTTCAGAGTTAAACTCAAAGGTCTGTGTTGTAAAATATTTGGTCT
TTGTTATTCTCTCAACACTCAATTTGGAAAGAGAAACATGCTCCAGTTTG
GGTAATTAACCAGTAACATAAGTCAAATAATGAATTCTGCTACCTCCTAA
ATACATCTGAACAGATTACCAAGTCTTTCAAAGCAATTTCAAAGCGGCAC
TGCAGCCTTGCAGGAGCTGAGAGACAGGAAATGCATGTTGACACGTGCAG
CTCGGGCAGCTTCCAGGCGGCTGCATAGAGGAGCTCACAGAGGAGCTGCA
GCCAGTCCTTGGAGCAGGACTAGACAGCGCCCAAACCAAAATGTTTAAGG
CTGCTCAGAAACAAAGATGTGAGGAAGGAAATAGCAGAGAGGAGTTACAA
AAGCCTTGCTCTTTTGTCAAGTATGCAATTATAGAAAAAAAAAAAAAGTC
TTCCTGGAAGTCTACATATAAGAATGCCAGCCCTTTCCCTCTCTGCCGTT
TAAGAGTCCTACTCTACTCCTCCAATAACACCTCTGAAACAAGTCTGAAA
CACTCCTTAGATGCCGCCACCTCTGGGTTAGCAGGATGGCTCANCAGGGA
AGGG
|
quality values | Open.Hide. 8 8 8 10 13 9 9 8 7 7 8 10 9 11 11 12 12 13 30 27 33 32 32 28 28 37 22 24 25 26 26 30 41 59 31 30 29 17 13 7 7 7 8 9 12 24 24 28 28 24
28 28 22 22 28 59 57 53 35 31 31 28 28 28 30 21 21 10 10 9 9 9 10 15 17 28 37 40 47 48 48 47 47 47 47 47 48 48 53 53 53 57 57 59 59 59 59 59 59 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 54 54 54 54 68 53 68 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 59 57 57 57 57 57 57 68 57 59 57 59 59 68 57 57 57
57 57 59 59 59 57 57 57 57 57 57 50 50 50 50 50 50 68 59 59 57 57 57 57 52 52 52 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59
59 59 59 57 57 57 54 59 59 68 68 68 68 68 68 68 59 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 68 68 62
62 62 62 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62
62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 41 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 59 59 59 59 57 57 57 59 59 68 59 59 57 43 43 43 43 35 43 43 57 57 57 57 57 57 57 57 52 52 52 57 52 52 52 57 57 57 52 52 45 52 52
57 59 59 59 59 59 57 57 34 34 11 12 11 27 27 57 59 59 59 59 59 52 52 52 52 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 54 57 57 57 57 48 47 47 57
57 47 47 48 46 42 42 35 35 42 59 57 43 43 43 57 57 57 48 57 57 54 54 54 59 59 57 57 48 48 48 57 57 48 48 48 57 48 43 43 43 48 42 42 36 39 39 43 43 44
43 43 43 48 48 48 48 48 48 48 48 43 43 43 43 43 43 48 48 48 48 48 41 41 41 59 41 41 32 36 32 41 41 41 41 41 41 41 41 36 34 31 39 43 39 39 46 40 40 48
48 48 47 47 47 47 47 47 48 59 59 57 48 32 32 25 19 23 28 28 30 39 37 48 42 37 37 37 37 26 25 14 14 14 31 24 35 31 37 37 37 37 37 37 37 36 32 41 43 47
32 30 30 30 30 30 35 32 37 37 37 37 30 37 37 37 30 32 41 41 41 41 19 18 11 11 14 15 25 37 33 37 32 37 37 43 32 30 27 27 22 28 23 23 26 30 23 23 23 32
32 22 19 14 12 12 12 19 19 27 25 27 27 24 32 24 31 34 32 21 16 16 18 21 26 21 15 12 16 11 11 3 0 | Open.Hide. 0 0 0 3 6 6 6 8 8 8 9 9 9 8 8 12 12 12 19 14 19 19 21 28 34 35 34 37 37 37 28 28 34 28 28 28 18 8 6 6 6 6 8 8 12 16 20 33 32 48
48 48 53 34 34 37 37 30 30 37 41 41 47 37 23 23 10 10 14 12 16 12 18 28 24 29 29 26 26 19 15 15 27 27 59 59 59 59 37 37 33 43 43 57 57 53 68 34 27 14
19 19 36 36 28 28 28 28 25 27 34 68 68 68 68 68 68 44 44 30 30 30 32 32 44 44 41 24 24 24 17 35 35 68 35 35 24 27 32 32 28 35 59 59 68 68 68 68 57 32
30 30 30 35 50 43 43 24 21 14 38 38 68 68 68 44 44 32 32 24 15 13 38 38 41 41 33 33 42 44 44 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 41 41 17 17 32
41 41 68 68 68 38 38 33 35 33 24 24 14 14 24 28 38 38 35 29 27 44 44 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 44 44 39 39 39 57 43 43 35 35 27 27 44 44 68 68 68
68 68 68 68 68 68 62 44 39 23 20 14 38 38 43 35 35 35 43 43 44 44 26 35 35 59 59 68 68 68 68 68 68 44 44 35 31 31 43 43 43 39 35 39 39 31 24 39 43 44
44 44 35 31 31 31 39 41 44 44 39 39 39 62 62 62 44 43 39 31 31 44 44 31 31 39 43 39 23 23 43 43 39 39 39 62 44 44 39 29 29 44 44 52 52 52 43 43 35 39
43 43 39 27 27 14 23 39 44 39 39 29 44 44 44 39 39 43 44 44 68 39 39 27 39 39 62 62 68 68 62 62 43 39 39 62 62 68 62 44 43 35 31 31 31 44 39 43 35 39
39 23 34 23 43 43 43 43 43 43 43 39 29 26 16 38 26 43 43 43 43 43 41 35 35 44 44 68 68 68 44 62 34 34 20 28 26 30 26 44 44 68 44 44 31 31 43 43 35 20
32 17 20 23 44 31 31 35 38 44 41 57 57 35 35 31 44 44 43 43 43 44 44 27 35 33 35 34 38 23 23 23 27 41 39 33 33 33 44 44 57 57 57 57 57 57 57 57 57 38
43 43 43 43 24 24 11 29 34 38 26 29 29 44 44 57 57 57 57 57 57 57 59 68 68 68 68 68 68 57 57 50 50 36 36 29 44 44 59 59 59 59 68 68 44 44 36 27 25 37
44 44 42 32 35 37 44 44 44 23 28 32 44 34 59 44 35 35 37 44 44 59 59 48 43 43 43 46 46 59 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 57 41 32 20 18
25 22 28 28 30 37 30 43 32 32 20 23 24 28 28 35 37 37 34 34 28 21 18 20 24 30 28 28 28 36 37 35 39 30 39 30 30 30 32 30 30 30 28 28 28 16 17 24 21 31
28 27 18 15 15 14 14 24 28 37 34 34 28 28 28 34 34 28 23 28 22 22 17 17 20 28 35 39 34 33 22 24 28 23 12 9 9 9 9 15 16 30 30 25 25 13 10 11 11 11
16 18 34 28 24 24 20 23 11 11 11 18 18 29 24 22 18 17 17 12 18 19 23 23 26 21 25 24 22 20 20 20 23 14 14 11 11 15 22 21 12 15 3 0 3 16 12 19 26 23
19 19 19 19 |