BAC end | BAC-end 1 | BAC-end 2 |
---|
end name | MSMg01-545B09.T7 (MSMg01no545_b09.b1) | MSMg01-545B09.TJ (MSMg01no545_b09.g1) |
ACC | AG610232 | AG610233 |
length | 740 | 728 |
length of high quality (start - end) | 669 (41 - 709) | 611 (70 - 680) |
definition | CHROMAT_FILE: MSMg01no545_b09.b1 PHD_FILE: MSMg01no545_b09.b1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 21:25:58 2005 | CHROMAT_FILE: MSMg01no545_b09.g1 PHD_FILE: MSMg01no545_b09.g1.phd.1 CHEM: term DYE: big TIME: Wed May 18 21:25:58 2005 |
singlet/doublet | --- | singlet |
---|
BLAST hit | no hit data | unique |
---|
sequence | ATTTGXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXCGCGGAATTC
CTCATTATGATGTTTTGGAATTGAATGTATACCCAATCACGTTGAAGTTA
TGTTATCTTGTGATCTGCTTTTTGATTTTATAAGAAATTATAGTTAAGTA
TTTAGAAGAATCTCAGAAGAGACTTTCAGTTTTGGACTTTTAAATATTGC
TAAGATTGTGATATACTATGGGGACATTTGAAATTCGACCAAGTATATTT
TGCATCATGCTATGACCAACTATGATTCCCATAGACTCCTTTCTTTGAAG
AAACCTGTGGAGATTAAGCACTGGAATGAGGTGGTTTGAATATGGTTCGT
CCACTGAGTGGCACTATTAAGACATATAGCATTGTTGTAGTAGGTGTGGT
CTTGTTGGACAAAGTGAGTCACTGTAAGAGTTGGCTTTAAGACACAAACA
TCATGACCAAGAAGCAAGTTGGGGAAGAAAGGGTTTATTCACCTTACATT
TCCACACTGCTGTTTTCACCAAAGAAAGTCAGGACAGGAAATCAAGCACA
TCTGGAAGCAGAAACTGATGAAGAGGCCATGGGGGGGGTCCTTACTGGCT
TGCTTCCCCTGGTTTGCTCAGCCTTCTCTCTTATATAACCAAGATTACCA
TCCCAAATATGGCATCACCTACAAGGGGACCTCCCACCTTGATCACTAAT
TGAAAAAATGCCTTACAACTAACTGTATTTCATGGAGGCN
| ATXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXXX
XXXXXXXXXXXXXXXXXXXTGTTACTGACTATGGACTTTGAGGTTTCAGA
AGGCTAAATCAGTAACACTGGCTCTCTCTTCATGCTGCCTGTGGATCTGT
GTTGTGGGAAACCTCTGGCTGTATTTTCAGGTTCTCCATGGAAGATAGCA
GATGGGGAAGGACATCAACAGGGGCAAGAATTAGTCTTGGGAGATACTTA
TTTTTTTTCTTTTTCTTCAGGAAAATATTTTCCTGTTTTTTTTTATTCTT
TCATTTATTTATATTCCAAATGTTGGAATATAAATATAAATTCCCCTTTC
CTGGTCCCACCTCCAAGAGTTCTATACACCATCCACCCTTGCCTTTGTAT
CTGAGAGGGTGCTCCCCACACCACCACCTCAGCTCAATCACCCCTTCAAC
CAATCCCCTGGCATCACTCACCCCCACATCCTCCCTCACTTGGACATCTA
AACTGGACAGGATTAGGCACATCCTCTCCAACTGAGGTGAGATTAGGCTG
TTCTCTGCTACATCTGTACTGGTGGCCATGTAGCAGCCCATGTATTCTTT
TTGGTTGGTGGCTTAGTCTCTTGGAGCTCCCAATGGTCTGGGTTGTTTGA
CATTATCGGTCTGGATTGGTTGATATTGTAGCATGCCATCCCTTAAGCTC
CTTAAGTCCTTCCATGTTTTCCTGTCTT
|
quality values | Open.Hide.15 15 15 19 15 8 8 8 12 12 13 13 17 10 10 11 25 28 41 46 27 24 22 22 22 23 33 18 20 20 20 32 32 53 50 37 37 34 34 34 37 43 57 57 51 51 42 42 48 48
48 48 42 47 50 50 54 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 48 48 46 46 48 48 51 47 47 47 50 50 57 57 57 57 47 47 57 47 47 47 57 57 59 68 68 68 68 68 57 57 57
57 57 57 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 51 51 51 51 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 52 57 57 68 68 57 57 57 68 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 57 57 57 57 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68
68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68
62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62
62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59
59 59 59 59 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 59 59 57 57 57
54 54 54 57 57 57 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 59 59 59 59 68 68 59 59 59 54 54 57 57 68 68 68 68 68 57 57
57 57 54 48 48 57 48 50 57 59 59 48 48 48 57 57 48 48 48 48 48 48 48 59 59 59 59 47 47 41 41 37 37 41 41 44 47 47 50 41 44 43 40 40 43 43 57 48 48 57
48 48 48 59 57 57 57 57 59 48 48 57 57 48 48 48 48 47 47 59 59 59 59 32 29 29 29 29 32 43 43 43 47 59 59 59 48 48 48 40 41 41 47 44 39 39 36 32 38 37
59 37 40 40 40 40 41 59 39 39 36 32 32 21 30 25 35 28 34 28 31 31 31 39 37 43 41 46 46 46 46 41 41 41 41 41 37 31 31 24 24 18 27 24 25 25 30 34 36 36
36 37 37 30 25 25 31 39 41 37 37 30 30 30 34 28 30 25 30 34 37 32 29 29 29 27 31 32 27 25 25 30 23 25 20 24 20 29 29 32 35 37 37 30 35 30 39 39 38 31
31 35 31 31 43 35 26 17 21 13 12 14 19 10 14 9 9 9 16 28 31 31 31 28 23 22 18 18 19 16 15 14 15 18 18 21 12 14 3 0 | Open.Hide. 6 6 8 19 17 8 8 8 11 17 43 37 37 39 41 33 32 37 32 32 37 44 28 28 12 6 6 6 6 6 8 11 12 20 20 22 23 39 39 37 39 37 32 33 33 33 33 33 50 47
43 28 23 15 10 10 15 16 22 20 39 43 43 33 33 36 36 36 36 50 53 53 53 57 57 57 57 57 57 57 57 57 53 53 68 68 68 68 68 68 68 68 68 54 50 47 47 47 47 47
68 68 68 68 68 68 57 48 41 42 37 48 48 51 57 57 57 50 50 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 47 54 54 57 57 59 59 59 57 59 57 57 50 50 50 50 50 50 57 57
57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 57 50 50 50 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 57 57 57 54 54 57 57 59 57 59 57 57 52 52 57 57 57 68 57 57 57 57 57 57 57 57
57 57 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 52 45 45 57 57 57 57 57 68 68 68 68 68 57 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 52 52 52 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68
68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 68 62 62 62 62 68 68 68 62 62 62 62
62 62 62 62 62 68 68 62 62 62 62 62 62 52 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 68 68 68 68 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 68 68 68 68 68 68 68 62 62
62 62 62 62 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 52 62 62 52 62 52 62 52 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62 62
57 57 57 57 59 59 57 57 57 57 57 59 57 57 57 57 59 57 52 52 59 59 68 68 68 68 59 59 52 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 59 68 68 68 68 59 59 57 59 57 59
59 68 68 68 68 68 68 68 57 57 57 57 57 57 57 57 57 59 57 50 50 43 52 52 54 52 43 43 37 46 46 50 57 57 47 47 47 57 57 54 54 54 57 57 44 44 43 46 46 48
48 48 57 57 57 57 57 57 57 57 48 48 48 57 59 54 54 54 57 57 57 43 39 39 39 39 41 41 43 40 40 30 41 37 43 43 37 43 36 43 43 43 43 43 43 43 46 48 48 59
59 43 43 30 30 28 41 34 37 37 37 37 32 32 20 20 15 28 28 37 37 37 34 32 35 35 35 39 36 37 30 30 30 32 28 31 35 36 47 47 59 41 29 27 30 30 30 37 37 35
30 30 27 27 32 37 31 31 28 34 25 37 32 37 37 37 26 27 22 22 15 25 19 28 28 25 31 19 19 13 19 18 25 25 18 16 14 14 14 30 30 37 37 31 30 24 28 20 31 24
31 31 29 28 19 18 15 19 19 26 28 26 22 19 19 12 13 13 28 28 37 24 28 14 14 14 19 19 |