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MSMg01no548_p10.b1 PHD_FILE: MSMg01no548_p10.b1.phd.1 CHEM: term DYE:
big TIME: Wed May 18 21:31:02 2005
(432 letters)
>mm_chr3_53910112_53910941
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Sbjct: 815 gaattctgagatgaatcccactgatggcaggcaatgactgaccctcacctgtcctcatgc 756
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Sbjct: 755 cgcagataggactgggacaagtgatcaggcttgatggcttttgtcttcataagtacaccc 696
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Sbjct: 695 gttagaagtatgtgtgtt--------------------tacacacacacacacacacaca 656
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Sbjct: 655 cacaca------------------cacacacacacacacacaccatctgattgtactgaa 614
Query: 231 cttacaaatatttaaaaaaaaaacgcacacagctaggttcatgtggcccctaagctggtc 290
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Sbjct: 613 cttataaatattt--taaaaaaacgcacacagctaggttcatgtggcccctaagctggtc 556
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Sbjct: 555 cagtcgcaaagtctacctatgtatacatctgtcaactcccatacagcttgaacagctgtt 496
Query: 351 cttaagctttggagctttgcttacagttttacatttttacaatcagttacatttttatgc 410
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Sbjct: 495 cttaagctttgcagctttgcttacagttttacatttttacaatcagttacatctttatgc 436
Query: 411 acttatttatcacaaacatgga 432
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Strand = Plus / Plus
Query: 150 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacg 194
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Sbjct: 164 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacg 208
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Strand = Plus / Plus
Query: 165 cacacacacacacacacacacacacacacgcacacacacacacacacaccatct 218
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Sbjct: 161 cacacacacacacacacacacacacacac--acacacacacacacacacgatct 212
Score = 85.8 bits (44), Expect = 5e-21
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Strand = Plus / Plus
Query: 150 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 193
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Sbjct: 162 acacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 205
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Strand = Plus / Plus
Query: 131 cacacacacacacacacatacacacacacacacacacacacacacac 177
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Sbjct: 161 cacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 207
Score = 83.9 bits (43), Expect = 2e-20
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Strand = Plus / Plus
Query: 133 cacacacacacacacatacacacacacacacacacacacacacacac 179
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Strand = Plus / Plus
Query: 135 cacacacacacacatacacacacacacacacacacacacacacacac 181
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Sbjct: 161 cacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 207
Score = 83.9 bits (43), Expect = 2e-20
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Strand = Plus / Plus
Query: 137 cacacacacacatacacacacacacacacacacacacacacacacac 183
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Sbjct: 161 cacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 207
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Strand = Plus / Plus
Query: 139 cacacacacatacacacacacacacacacacacacacacacacacac 185
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Strand = Plus / Plus
Query: 143 cacacatacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 189
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Strand = Plus / Plus
Query: 145 cacatacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 191
|||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct: 161 cacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 207
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Query: 155 cacacacacacacacacacacacacacacacacacacacgcacacac 201
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Sbjct: 161 cacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 207
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Query: 157 cacacacacacacacacacacacacacacacacacacgcacacacac 203
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Strand = Plus / Plus
Query: 159 cacacacacacacacacacacacacacacacacacgcacacacacac 205
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Sbjct: 161 cacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 207
Score = 83.9 bits (43), Expect = 2e-20
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Query: 161 cacacacacacacacacacacacacacacacacgcacacacacacac 207
||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
Sbjct: 161 cacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 207
Score = 83.9 bits (43), Expect = 2e-20
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Strand = Plus / Plus
Query: 163 cacacacacacacacacacacacacacacacgcacacacacacacac 209
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct: 161 cacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 207
Score = 83.9 bits (43), Expect = 2e-20
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Strand = Plus / Plus
Query: 151 cacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 193
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Sbjct: 161 cacacacacacacacacacacacacacacacacacacacacac 203
Lambda K H
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Gapped
Lambda K H
1.34 0.600 1.10
Matrix: blastn matrix:1 -3
Gap Penalties: Existence: 2, Extension: 1
Number of Sequences: 1
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Number of extensions: 41
Number of successful extensions: 40
Number of sequences better than 10.0: 1
Number of HSP's gapped: 32
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Length adjustment: 9
Effective length of query: 423
Effective length of database: 821
Effective search space: 347283
Effective search space used: 347283
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X3: 517 (999.5 bits)
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| Query= MSMg01no548_p10.g1 MSMg01no548_p10.g1 CHROMAT_FILE:
MSMg01no548_p10.g1 PHD_FILE: MSMg01no548_p10.g1.phd.1 CHEM: term DYE:
big TIME: Wed May 18 21:31:02 2005
(584 letters)
>mm_chr3_53774720_53775703
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Query: 61 aagacagtctgatgtgctcagatgaccagagaaggaagcagcacttcttggtacacaaaa 120
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Query: 121 ccaaggtgatacaatgaaaggtggcttgtgtgacattggtgctcttaactcagcagcaac 180
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Sbjct: 321 ccaaggtgatacaatgaaaggtggcttgtgtgacattggtgctcttaactcagcagcaac 380
Query: 181 ttatttttggtcccctcacagttctctctggtgactgagatgtttgcattgtggtccctt 240
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Query: 241 aaagccaacaacgtctgcagacagggccaagaggagttctgaagcagaggaaaaggatca 300
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Query: 301 caagagcattctatgttaaggggatgtaagccaccatatactgtagaaggaaaagcaaga 360
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Query: 421 agacaggagtttttgttgtgtttgcatccaccacaggtgcactgtggtgaccccgtgccc 480
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Sbjct: 621 agacaggagtttttgttgtgtttgcatccaccacaggtgcactgtggtgaccccgtgccc 680
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Query: 541 agatggatgactctggcaagtgctttttatacttttccctctca 584
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|
