BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-004F07
Chromosome4 (Build37)
Map Location 102,040,766 - 102,191,355
singlet/doubletdoublet
Overlap genePde4b
Upstream geneAk3l1, LOC669460, Dnajc6, Leprot, Lepr, B020004J07Rik, LOC665362, C130073F10Rik, LOC384033, LOC381535, LOC332923, LOC100039834, LOC381536, LOC433739
Downstream geneSgip1, Tctex1d1, Insl5, Wdr78, Mier1, Slc35d1, 4921539E11Rik, 4930456L15Rik, Oma1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-004F07.bB6Ng01-004F07.g
ACCDH841773DH841774
length1,188936
definitionDH841773|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-004F07, 5' end.DH841774|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-004F07, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(102,040,766 - 102,041,977)(102,190,444 - 102,191,355)
sequence
gaattctccagccctgaagggtgcttttccctacgggtttggatccgatg
tgcgaatagtgaatagcgaatagcagcgtctgaaaaggttaatctgttta
cccaaccacaacagtttgctctggggaacaaaccaggagttgccttgcta
gcctgctccagatgtcctatgcttgaagcggctttatttgcatttggtat
ttcaaagctggtgattgatttacaattataattgccaacaggattctact
ttaactagctctttgtgaaggaaaacatcaatttacattatcccacagaa
ttggaaaatatctaatgatttataaaacaaaaatgggtttcaccaggaca
agtgagtacaaaattgctgcggctaccctatgttttaatcactttctgat
ccaagatcctgtgatttttatgcggcagtattcactgtggtagtccctaa
taagctaattctaggcactggattatctagcttctcagggggaaggaaga
gcgcacacatcagttgaaaatgaaactgctgattatgaaatatccacttt
agaggcatttgtaactggattaacagagagccccattccataagacagct
cttatttttcatatcttctttaatacataaaaatgagttagtttccatcc
gctgttaatagagctctactttaggttctagaggttcttaaaagatatta
gtttctttaaaatataagagaaagacaagaggggtcataaatatacactg
attatattgattactcataggtaataattagcattgattaagcactgtct
tggagctagattctgtgctgaatctattatgtatataattccatgtaata
tctgcaatgaccattggaaagcaagcacttcagttattatgaactgctgt
ggtctgaaggttcctgcccttccaatatacataacctaatcaccaagacc
atagcattaggagtgggacctttctggggtgattaaatcaagaggtcaga
cacataaatttgatgggcatcttttaaggagactcagagagtgcctttat
cttctacatcaggaaaaacacaaagagtacttttctgttagaaaacaggt
tcttaaactcatctttccaccttagctacagatacgcactctgtgttgtg
agcgactctgtgtgagagcattgtctaactgcctgaaa
gaattcaattttctgaattctgaagagaaggtatagaccttttgaaccct
accttgctgatctcggcaatgcacataaagaggaccttccaggcacacta
atctccctcaagacattcaaggcaaattaactttttaaagataatgaatc
tcaattgagtctttcagtaattggttctgagatctaggaagtgggttttt
gtaaagttgaaacccacaggtttctcttttgattggctgtgcaagaagag
tggttggtgagaacagtaacatttttgtgacactacagttaatgtacata
ctgtccaggggcatgcaaagacaaagctttgcacttctggccctgcgcac
acacaccctgtctgatttctagaacaatgccgtgaacttgaaattgaagc
aagatgtctggtgcatggagactttcattttccttgactttaaacatctt
acctctaacaagtaggcatcattcaagctgggctactctttgagacaggt
tatgtgctttggtgggcagttgttgcccacaataaaaccggcttgaggtg
tcaacttggcagggctgcgtggtaccctttacttaaccagtaacctgtag
ctaattgctttgcagctattttgtccctaaaggtggcatctacattgaga
aactgaaattaaataagtccctgtctgtgcagtctttgttgtgtaaactt
gagaacaagatctgggtctaatttgtgaaaacatcacttcttcttttcta
tgagatattttttaagttaatatgtgtccaactggacagatgggtgatag
gagaagggagggcatgcctgattttaggtaaaatgaactgagagcagcta
cccacagcaggaagcaggaacagattctgctatccgaactgcttgtttag
gaagtctataaaaaggagctggcagactatgggtcc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_102040766_102041977
seq2: B6Ng01-004F07.b_45_1232

seq1  GAATTCTCCAGCCCTGAAAGGTGCTTTTCCCTACGGGTTTGGATCCGATG  50
      |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCAGCCCTGAAGGGTGCTTTTCCCTACGGGTTTGGATCCGATG  50

seq1  TGCGAATAGTGAATAGCGAATAGCAGCGTCTGAAAAGGTTAATCTGTTTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCGAATAGTGAATAGCGAATAGCAGCGTCTGAAAAGGTTAATCTGTTTA  100

seq1  CCCAACCACAACAGTTTGCTCTGTGGAACAAACCAGGAGTTGCCTTGCTA  150
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAACCACAACAGTTTGCTCTGGGGAACAAACCAGGAGTTGCCTTGCTA  150

seq1  GCCTGCTCCAGATGTCCTATGCTTGAAGCGGCTTTATTTGCATTTGGTAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTGCTCCAGATGTCCTATGCTTGAAGCGGCTTTATTTGCATTTGGTAT  200

seq1  TTCAAAGCTGGTGATTGATTTACAATTATAATTGCCAACAGGATTCTACT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAAAGCTGGTGATTGATTTACAATTATAATTGCCAACAGGATTCTACT  250

seq1  TTAACTAGCTCTTTGTGAAGGAAAACATCAATTTACATTATCCCACAGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAACTAGCTCTTTGTGAAGGAAAACATCAATTTACATTATCCCACAGAA  300

seq1  TTGGAAAATATCTAATGATTTATAAAACAAAAATGGGTTTCACCAGGACA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGAAAATATCTAATGATTTATAAAACAAAAATGGGTTTCACCAGGACA  350

seq1  AGTGAGTACAAAATTGCTGCGGCTACCCTATGTTTTAATCACTTTCTGAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAGTACAAAATTGCTGCGGCTACCCTATGTTTTAATCACTTTCTGAT  400

seq1  CCAAGATCCTGTGATTTTTATGCAGCAGTATTCACTGTGGTAGTCCCTAA  450
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAGATCCTGTGATTTTTATGCGGCAGTATTCACTGTGGTAGTCCCTAA  450

seq1  TAAGCTAATTCTAGGCACTGGATTATCTAGCTTCTCAGGGGGAAGGAAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGCTAATTCTAGGCACTGGATTATCTAGCTTCTCAGGGGGAAGGAAGA  500

seq1  GCGCAGACATCAGTTAAAAATGAAACTGCTGATTATGAAATATCCACTTT  550
      ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCGCACACATCAGTTGAAAATGAAACTGCTGATTATGAAATATCCACTTT  550

seq1  AGAGGCATTTGTAACTGGATTAACAGAGAGCCCCATTCCATAAGACAGCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGCATTTGTAACTGGATTAACAGAGAGCCCCATTCCATAAGACAGCT  600

seq1  CTTATTTTTCATATCTTCTTTAATACATAAAAATGAGTTAGTTTCCATCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTATTTTTCATATCTTCTTTAATACATAAAAATGAGTTAGTTTCCATCC  650

seq1  GCTGTTAATAGAGCTCTACTTTAGGTTCTAGAGGTTCTTAAAAGATATTA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGTTAATAGAGCTCTACTTTAGGTTCTAGAGGTTCTTAAAAGATATTA  700

seq1  GTTTCTTTAAAATATAAGAGAAAGACAAGAGGGGTCATAAATATACACTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCTTTAAAATATAAGAGAAAGACAAGAGGGGTCATAAATATACACTG  750

seq1  ATTATATTGATTACTCATAGGTAATAATTAGCATTGATTAAGCACTGTCT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATATTGATTACTCATAGGTAATAATTAGCATTGATTAAGCACTGTCT  800

seq1  TGGAGCTAGATTCTGTGCTGAATCTATTATGTATATAATTCCATGTAATA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGCTAGATTCTGTGCTGAATCTATTATGTATATAATTCCATGTAATA  850

seq1  TCTGCAATGACCATTGGAAAGCAAGCACTTCAGTTATTATGAACTGCTGT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCAATGACCATTGGAAAGCAAGCACTTCAGTTATTATGAACTGCTGT  900

seq1  GGTCTGAAGGTTCCTGCCCTTCCAATATCACATAACCTAATCACCAAGAC  950
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  GGTCTGAAGGTTCCTGCCCTTCCAATAT-ACATAACCTAATCACCAAGAC  949

seq1  CATAGCATTAGGAGGTGGGACCTTTCTGGGGTGATTAAATCAAGAGGTCA  1000
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAGCATTAGGA-GTGGGACCTTTCTGGGGTGATTAAATCAAGAGGTCA  998

seq1  GGACACATAAATTTGATGGGCATCCTTTTAAAGGAGACTCCAGAGAGTTG  1050
       |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||  
seq2  -GACACATAAATTTGATGGGCATC--TTTTAAGGAGACT-CAGAGAGT--  1042

seq1  CCCTTTATCTTCTACCACAGAAAAAACACAAAAGAAGTTACTGTTTCTGG  1100
       ||||||||||||||  ||| |||||||| |||||   |||| ||||| |
seq2  GCCTTTATCTTCTACATCAGGAAAAACAC-AAAGA--GTACT-TTTCT-G  1087

seq1  TTAGAAAACAGGTCCTTAAACTCCATCTTCCAAACCTTTAGGCTACAGAT  1150
      ||||||||||||| |||||||| |||||| |  |||||   |||||||||
seq2  TTAGAAAACAGGTTCTTAAACT-CATCTTTC-CACCTT--AGCTACAGAT  1133

seq1  ACAGCCACTTCTGTTGTTTGTGAGCGACTCTGTGT-AGAGCATTTTGTCA  1199
      ||   ||| |||||   |||||||||||||||||| ||||||  ||||| 
seq2  AC--GCAC-TCTGT--GTTGTGAGCGACTCTGTGTGAGAGCA--TTGTC-  1175

seq1  TAGCTGCCTGAAA  1212
      || ||||||||||
seq2  TAACTGCCTGAAA  1188

seq1: chr4_102190444_102191355
seq2: B6Ng01-004F07.g_67_976 (reverse)

seq1  TATAGACTTCCTAAAACAAGCAGTTCGGATTGCTGCTTCTGTTTCCTGCT  50
      |||||||||||| ||||||||||||||||| || |  |||| ||||||||
seq2  TATAGACTTCCT-AAACAAGCAGTTCGGATAGCAGAATCTG-TTCCTGCT  48

seq1  GCCTGCTGTGGGTAGCTGCTCTCAGTTCATTTTACCTGAAATCAGGCATG  100
       |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||
seq2  TCCTGCTGTGGGTAGCTGCTCTCAGTTCATTTTACCTAAAATCAGGCATG  98

seq1  CCCTCCCTTCTCCTATCACCCATCTGTCCAGTTGGACACATATTAACTTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCCCTTCTCCTATCACCCATCTGTCCAGTTGGACACATATTAACTTA  148

seq1  AAAAATATCTCATAGAAAAGAAGAAGTGATGTTTTCACAAATTAGACCCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAATATCTCATAGAAAAGAAGAAGTGATGTTTTCACAAATTAGACCCA  198

seq1  GATCCTGTTCTCAAGTTTACACAACAAAGACTGCACAGACAGGGACTTAT  250
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTTGTTCTCAAGTTTACACAACAAAGACTGCACAGACAGGGACTTAT  248

seq1  TTAATTTCAGTTTCTCAATGTAGATGCCACCCTTAGGGACAAAATAGCTG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TTAATTTCAGTTTCTCAATGTAGATGCCACCTTTAGGGACAAAATAGCTG  298

seq1  CAAAGCAATTAGCTACAGGTTACTGGTTAAGTAAAGGGTACCACGCAGCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGCAATTAGCTACAGGTTACTGGTTAAGTAAAGGGTACCACGCAGCC  348

seq1  CTGCCAAGTTGACACCTCAAGCCGGTTTTATTGTGGGCAACAACTGCCCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCAAGTTGACACCTCAAGCCGGTTTTATTGTGGGCAACAACTGCCCA  398

seq1  CCAAAGCACATAACCTGTCTCAAAGAGTAGCCCAGCTTGAATGATGCCTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAGCACATAACCTGTCTCAAAGAGTAGCCCAGCTTGAATGATGCCTA  448

seq1  CTTGTTAGAGGTAAGATGTTTAAAGTCAAGGAAAATGAAAGTCTCCATGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTTAGAGGTAAGATGTTTAAAGTCAAGGAAAATGAAAGTCTCCATGC  498

seq1  ACCAGACATCTTGCTTCAATTTCAAGTTCACGGCATTGTTCTAGAAATCA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGACATCTTGCTTCAATTTCAAGTTCACGGCATTGTTCTAGAAATCA  548

seq1  GACAGGGTGTGTGTGCGCAGGGCCAGAAGTGCAAAGCTTTGTCTTTGCAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAGGGTGTGTGTGCGCAGGGCCAGAAGTGCAAAGCTTTGTCTTTGCAT  598

seq1  GCCCCTGGACAGTATGTACATTAACTGTAGTGTCACAAAAATGTTACTGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCTGGACAGTATGTACATTAACTGTAGTGTCACAAAAATGTTACTGT  648

seq1  TCTCACCAACCACTCTTCTTGCACAGCCAATCAAAAGAGAAACCTGTGGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCACCAACCACTCTTCTTGCACAGCCAATCAAAAGAGAAACCTGTGGG  698

seq1  TTTCAACTTTACAAAAACCCACTTCCTAGATCTCAGAACCAATTACTGAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCAACTTTACAAAAACCCACTTCCTAGATCTCAGAACCAATTACTGAA  748

seq1  AGACTCAATTGAGATTCATTATCTTTAAAAAGTTAATTTGCCTTGAATGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGACTCAATTGAGATTCATTATCTTTAAAAAGTTAATTTGCCTTGAATGT  798

seq1  CTTGAGGGAGATTAGTGTGCCTGGAAGGTCCTCTTTATGTGCATTGCTGA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||
seq2  CTTGAGGGAGATTAGTGTGCCTGGAAGGTCCTCTTTATGTGCATTGCCGA  848

seq1  GATCAGCAAGGTAGGGTTCAAAAGGTCTATACCTTCTCTTCAGAATTCAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCAGCAAGGTAGGGTTCAAAAGGTCTATACCTTCTCTTCAGAATTCAG  898

seq1  AAAATTGAATTC  912
      ||||||||||||
seq2  AAAATTGAATTC  910