BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-011L19
Chromosome4 (Build37)
Map Location 76,825,055 - 76,826,096
singlet/doubletsinglet
Overlap genenone
Upstream genePtprd, LOC667858, LOC667862
Downstream geneLOC100039974
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-011L19.b
ACCDH847037
length1,019
definitionDH847037|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-011L19, 5' end.
singlet/doubletsinglet---
BLAST hituniqueno hit data
sequence
gaattcccctgttctggggcatataaagtttgcgtgtccagtgggcctct
ctttccagtgatggccaactaggccatcttttgatacatatgcaactaga
gtcaaaagctccggggtactggttagttcataatgttgttgcacctacag
ggttgcagatctctttagctccttggatactttctctagctcctccattg
ggggccctgtgatccattcaatagcgactgtgagcatccacttatgtgtt
ttctaggcccatgcatatctatgtcacccatcaaaacttcaactatccac
aagagaaaacctaaatagtactttacattaagttgtagttaatataagac
atgatacctgcctgtgataaggaatgtttgcacaatattacaaaaagcag
catgttaaaaaatcctaaatccatggaggtatgccttaaaaattaggtat
gagtaacatgattttcccactggcatagttgaacagatgacaaaactact
tagagttgaaaaagctagaagcatgtttctcatgttcaacagtattgact
catcacatatgatctactacatagagtgaatttattcaaacagaacataa
tattcttttttagatttagtttaatttttaatttatttttacaatccata
ttttattccttgccccccccatccaccctctgacttttccacatcccaca
cctcctccccaacctccctgtctccttgtgaatgtccccatcccccaccc
cacctgactgctaaactccatgtggtctccagtctcttgagggttagttt
catcatctctgaatgaacacagaccccgaagtcttctactgtatgtaggt
tgggtgtatgctgtttgtttgatgagccagtgtttgagagatcttggagg
tccagattaattgagactgctgcttctcctacaggtatcactcttctttc
cagcttgttgtggtgtgtgtgtgttctcttcttcttctcttcttaagatg
tttgtttttttgtttgttt
quality valuesOpen.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_76825055_76826096
seq2: B6Ng01-011L19.b_43_1061 (reverse)

seq1  AAACAAACAAAAAACAAAACAAAAAAACAAAAACATTTCTTAAAGAAGAA  50
                 |||| ||||||||||||||| |    |||| |||||| |
seq2  -----------AAAC-AAACAAAAAAACAAACA----TCTT-AAGAAG-A  32

seq1  GAAGAAGAAGAAGAACAACAACAACAACAACAACAACAAGCTGAAAAGAA  100
      |||||||||| ||||||      |||   || ||||||||||| ||||||
seq2  GAAGAAGAAG-AGAACA-----CACACACACCACAACAAGCTGGAAAGAA  76

seq1  GAGTGATA-CTGTAGGAGAAGCAGCAGTCTCAATTAATCTGGACCTCCAA  149
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTGATACCTGTAGGAGAAGCAGCAGTCTCAATTAATCTGGACCTCCAA  126

seq1  GATCTCTCAAACACTGGCTCATCAAACAAACAGCATACACCCAACCTACA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATCTCTCAAACACTGGCTCATCAAACAAACAGCATACACCCAACCTACA  176

seq1  TACAGTAGAAGACTTCGGGGTCTGTGTTCATTCAGAGATGATGAAACTAA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGTAGAAGACTTCGGGGTCTGTGTTCATTCAGAGATGATGAAACTAA  226

seq1  CCCTCAAGAGACTGGAGACCACATGGAGTTTAGCAGTCAGGTGGGGTGGG  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCAAGAGACTGGAGACCACATGGAGTTTAGCAGTCAGGTGGGGTGGG  276

seq1  GGATGGGGACATTCACAAGGAGACAGGGAGGTTGGGGAGGAGGTGTGGGA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGGGGACATTCACAAGGAGACAGGGAGGTTGGGGAGGAGGTGTGGGA  326

seq1  TGTGGAAAAGTCAGAGGGTGGATGGGGGGGGCAAGGAATAAAATATGGAT  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGAAAAGTCAGAGGGTGGATGGGGGGGGCAAGGAATAAAATATGGAT  376

seq1  TGTAAAAATAAATTAAAAATTAAACTAAATCTAAAAAAGAATATTATGTT  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAAAAATAAATTAAAAATTAAACTAAATCTAAAAAAGAATATTATGTT  426

seq1  CTGTTTGAATAAATTCACTCTATGTAGTAGATCATATGTGATGAGTCAAT  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGTTTGAATAAATTCACTCTATGTAGTAGATCATATGTGATGAGTCAAT  476

seq1  ACTGTTGAACATGAGAAACATGCTTCTAGCTTTTTCAACTCTAAGTAGTT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGTTGAACATGAGAAACATGCTTCTAGCTTTTTCAACTCTAAGTAGTT  526

seq1  TTGTCATCTGTTCAACTATGCCAGTGGGAAAATCATGTTACTCATACCTA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCATCTGTTCAACTATGCCAGTGGGAAAATCATGTTACTCATACCTA  576

seq1  ATTTTTAAGGCATACCTCCATGGATTTAGGATTTTTTAACATGCTGCTTT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTTAAGGCATACCTCCATGGATTTAGGATTTTTTAACATGCTGCTTT  626

seq1  TTGTAATATTGTGCAAACATTCCTTATCACAGGCAGGTATCATGTCTTAT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTAATATTGTGCAAACATTCCTTATCACAGGCAGGTATCATGTCTTAT  676

seq1  ATTAACTACAACTTAATGTAAAGTACTATTTAGGTTTTCTCTTGTGGATA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAACTACAACTTAATGTAAAGTACTATTTAGGTTTTCTCTTGTGGATA  726

seq1  GTTGAAGTTTTGATGGGTGACATAGATATGCATGGGCCTAGAAAACACAT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGAAGTTTTGATGGGTGACATAGATATGCATGGGCCTAGAAAACACAT  776

seq1  AAGTGGATGCTCACAGTCGCTATTGAATGGATCACAGGGCCCCCAATGGA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTGGATGCTCACAGTCGCTATTGAATGGATCACAGGGCCCCCAATGGA  826

seq1  GGAGCTAGAGAAAGTATCCAAGGAGCTAAAGAGATCTGCAACCCTGTAGG  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCTAGAGAAAGTATCCAAGGAGCTAAAGAGATCTGCAACCCTGTAGG  876

seq1  TGCAACAACATTATGAACTAACCAGTACCCCGGAGCTTTTGACTCTAGTT  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCAACAACATTATGAACTAACCAGTACCCCGGAGCTTTTGACTCTAGTT  926

seq1  GCATATGTATCAAAAGATGGCCTAGTTGGCCATCACTGGAAAGAGAGGCC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATATGTATCAAAAGATGGCCTAGTTGGCCATCACTGGAAAGAGAGGCC  976

seq1  CACTGGACACGCAAACTTTATATGCCCCAGAACAGGGGAATTC  1042
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGGACACGCAAACTTTATATGCCCCAGAACAGGGGAATTC  1019