BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-015F15
Chromosome4 (Build37)
Map Location 109,714,693 - 109,828,496
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneNrd1, Osbpl9, Calr4, Eps15, LOC666144, 4922503N01Rik, Rnf11, 4930522H14Rik, Cdkn2c, LOC100040307, Faf1, Dmrta2
Downstream geneElavl4
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-015F15.bB6Ng01-015F15.g
ACCDH849635DH849636
length1,0351,060
definitionDH849635|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-015F15, 5' end.DH849636|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-015F15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(109,714,693 - 109,715,735)(109,827,442 - 109,828,496)
sequence
gaattccagtcctgacttcctttggtgatgaacagcaatgtggaagagta
agctgaataaaccctttccactccaagtgcttcttggtcatgatgtttgt
tcaggaatagaaaccctgactaagacagcgaccttctacctgcctttatg
aggttatgccagtgccttgcaagtacagaagtggatgttcacagtcatct
ataagatggaacacagggcccccagtggagatgctagagaaagcacccaa
ggagctgaaggggtctgcaaccctataggtggaacaacaatatggactaa
ccagtacccccagagctcgtgtctctagctgcatatgtagcagaagatgg
cctagttgggcctagggaactttcgggatagcatttgaatgtatataaag
aaaatatctaattaaaaaaaaaagaaagtgatttccttctggtctactga
ctacaggctggtactggaccctggatatttacccatgcaagtctgcacag
ctggagaggtgactggcagtgttggaggaaactgagtagacatgcttggc
cttgttagggtcattgctgtgatgaaacaccatgaccaaagccacttggg
ggagaaaagggtttatttggcatatgcttccaaatcattgttcattgtgg
aaggaagttggggcaagaacttaaacaggccaggaacctggatgcaggaa
ctgatacagaggtcatggaggctgtcgcttactaggcttgcttccaaagg
cttgctcagcctgctttcttagagaacccagaaccatcagtccagggacg
gccccacccacaatgggcttcgccctctcctatcaaccacttgattaaga
aaaaagtcatataggcttgcccatagcctgatcttagggagacattttct
caattgatgctccctcctttcaagactctggcttgtgtgaagttgatgta
actagcagcatcatgctcgttgaaagagcagtggaatcgctcctgtctca
atgcgaatgaagaatatcaggtagggatgggtggg
gaattccaagacaaagatgaagcaacacacttgagcttttcaaaaatagc
cagcattttgtcccaggcagagcaagaagcagagggagaggagaggccca
aagacagatcctgaacatagactcatgtcaggcaaacaacagaaaacaat
gctacattcttactgcagctctaggtggaaggggaagattagtttgagac
ctcactaaatagttagcttgactgagcatttgctgagtattttacatgca
tggcctcatttaatctcctgaacaatcctgaggttgtaccattactattc
cttctttagcagtaaagaaaatgagggaaggtcaagtcagccaaggtcag
acaccagaagaaggcagagcagggattagatccctcgggccttcagtata
ttttcctaaactatacccatcaatcccaatacgctaccaggccccttcgt
ctctgattcatgcctctcagaagcaagaagatccaccttaggagagcatc
tatgttcaggactccagaaccaacacttgttgggtttgtgtctgtcaaga
cgtcactgggacatctagcccttcacaggtgccagagcacggaaggaaga
gaagatgtctagagatgcacagtccctaccctggggtgtgtaactgtgtc
tgtctttctgggcagctctgtgttgccacatttggactctgcatctataa
gcactttgggtggcacatcctcttcagaggccagagctcagaaagcccct
cagctgccaaaagctaagaacaccagcctccccagtccctgagagatacc
accctcctatctctaggtgggaagctagagtctcaatagtacccagtgtc
cttttcttatcccctgcacattgaaggatgggccatctcttcaattcacc
tttctcctggttttgcccttcagacagagccctaccaatgagtcatgagc
catgttcatcggcagttcttgttcttctgagatcaccagagctcttctct
atccttggagctttagtttgagggaccagccttgcctgaaagtgagtgtg
gtatggcttc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_109714693_109715735
seq2: B6Ng01-015F15.b_45_1079

seq1  GAATTCCAGTCCTGACTTCCTTTGGTGATGAACAGCAATGTGGAAGAGTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGTCCTGACTTCCTTTGGTGATGAACAGCAATGTGGAAGAGTA  50

seq1  AGCTGAATAAACCCTTTCCACTCCAAGTGCTTCTTGGTCATGATGTTTGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGAATAAACCCTTTCCACTCCAAGTGCTTCTTGGTCATGATGTTTGT  100

seq1  TCAGGAATAGAAACCCTGACTAAGACAGCGACCTTCTACCTGCCTTTATG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGAATAGAAACCCTGACTAAGACAGCGACCTTCTACCTGCCTTTATG  150

seq1  AGGTTATGCCAGTGCCTTGCAAGTACAGAAGTGGATGTTCACAGTCATCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTTATGCCAGTGCCTTGCAAGTACAGAAGTGGATGTTCACAGTCATCT  200

seq1  ATAAGATGGAACACAGGGCCCCCAGTGGAGATGCTAGAGAAAGCACCCAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGATGGAACACAGGGCCCCCAGTGGAGATGCTAGAGAAAGCACCCAA  250

seq1  GGAGCTGAAGGGGTCTGCAACCCTATAGGTGGAACAACAATATGGACTAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCTGAAGGGGTCTGCAACCCTATAGGTGGAACAACAATATGGACTAA  300

seq1  CCAGTACCCCCAGAGCTCGTGTCTCTAGCTGCATATGTAGCAGAAGATGG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTACCCCCAGAGCTCGTGTCTCTAGCTGCATATGTAGCAGAAGATGG  350

seq1  CCTAGTTGGGCCTAGGGAACTTTCGGGATAGCATTTGAATGTATATAAAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGTTGGGCCTAGGGAACTTTCGGGATAGCATTTGAATGTATATAAAG  400

seq1  AAAATATCTAATTAAAAAAAAAAGAAAGTGATTTCCTTCTGGTCTACTGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATATCTAATTAAAAAAAAAAGAAAGTGATTTCCTTCTGGTCTACTGA  450

seq1  CTACAGGCTGGTACTGGACCCTGGATATTTACCCATGCAAGTCTGCACAG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACAGGCTGGTACTGGACCCTGGATATTTACCCATGCAAGTCTGCACAG  500

seq1  CTGGAGAGGTGACTGGCAGTGTTGGAGGAAACTGAGTAGACATGCTTGGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAGAGGTGACTGGCAGTGTTGGAGGAAACTGAGTAGACATGCTTGGC  550

seq1  CTTGTTAGGGTCATTGCTGTGATGAAACACCATGACCAAAGCCACTTGGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGTTAGGGTCATTGCTGTGATGAAACACCATGACCAAAGCCACTTGGG  600

seq1  GGAGAAAAGGGTTTATTTGGCATATGCTTCCAAATCATTGTTCATTGTGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGAAAAGGGTTTATTTGGCATATGCTTCCAAATCATTGTTCATTGTGG  650

seq1  AAGGAAGTTGGGGCAAGAACTTAAACAGGCCAGGAACCTGGATGCAGGAA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAAGTTGGGGCAAGAACTTAAACAGGCCAGGAACCTGGATGCAGGAA  700

seq1  CTGATACAGAGGTCATGGAGGCTGTCGCTTACTAGGCTTGCTTCCAAAGG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATACAGAGGTCATGGAGGCTGTCGCTTACTAGGCTTGCTTCCAAAGG  750

seq1  CTTGCTCAGCCTGCTTTCTTAGAGAACCCAGAACCATCAGTCCAGGGACG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCTCAGCCTGCTTTCTTAGAGAACCCAGAACCATCAGTCCAGGGACG  800

seq1  GCCCCACCCACAATGGGCTTCGCCCTCTCCTATCAACCAC-TGATTAAG-  848
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| 
seq2  GCCCCACCCACAATGGGCTTCGCCCTCTCCTATCAACCACTTGATTAAGA  850

seq1  AAAAAGTCATATAGGCTTGCCCATAGCCTGATCTTAGGGAGACATTTTCT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAGTCATATAGGCTTGCCCATAGCCTGATCTTAGGGAGACATTTTCT  900

seq1  CAATTGATGCTCCCTCCTTTTCAAGGACTCTGGCTTGTGTGAAGTTGATG  948
      ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATTGATGCTCCCTCC-TTTCAA-GACTCTGGCTTGTGTGAAGTTGATG  948

seq1  TAAACTAGCCAGCATCATGCTCGTTGAAAGGAGCCAGGGTGGAATCGCTC  998
      | |||||| |||||||||||||||||||| ||||    ||||||||||||
seq2  T-AACTAG-CAGCATCATGCTCGTTGAAA-GAGC---AGTGGAATCGCTC  992

seq1  CTGTCTCAGATGCGGATGAGAGAGAATCAGGGTAGGG-TGGGTGGG  1043
      |||||||| ||||| |||| |||  |||| ||||||| ||||||||
seq2  CTGTCTCA-ATGCGAATGA-AGAATATCA-GGTAGGGATGGGTGGG  1035

seq1: chr4_109827442_109828496
seq2: B6Ng01-015F15.g_70_1129 (reverse)

seq1  GAAGCCAT-CAACACTCACTCTCA-GCAAGGCTGGTCCCTCAAACTAAAG  48
      |||||||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGCCATACCACACTCACTTTCAGGCAAGGCTGGTCCCTCAAACTAAAG  50

seq1  CT-CAAGGATAGAGAAGAGCTCTGGGTGTCTCAG-AGAAC-AGGACTGCC  95
      || ||||||||||||||||||||||   |||||| ||||| || ||||||
seq2  CTCCAAGGATAGAGAAGAGCTCTGGTGATCTCAGAAGAACAAGAACTGCC  100

seq1  GATGAACATGGCCTCATGGCCTCATTGGTAGGGCTCTGTCTGAAGGGCAA  145
      ||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGAACATGG-CTCAT-GACTCATTGGTAGGGCTCTGTCTGAAGGGCAA  148

seq1  AACCAGGAGAAAGGTGAATGGAAGAGATGGCCCAT-CTTCAATGTGCAGG  194
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||
seq2  AACCAGGAGAAAGGTGAATTGAAGAGATGGCCCATCCTTCAATGTGCAGG  198

seq1  GGATAAG-AAAGGACACTGGGTACTATTTGAGACTCTAGCTT-CCACCTA  242
      ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||
seq2  GGATAAGAAAAGGACACTGGGTACTA-TTGAGACTCTAGCTTCCCACCTA  247

seq1  GAGATAGGAGGGTGGTATCTCTCAGGGACTGGGGAGGCTGGTGTTCTTAG  292
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATAGGAGGGTGGTATCTCTCAGGGACTGGGGAGGCTGGTGTTCTTAG  297

seq1  CTTTTGGCAGCTGAGGGGCTTTCTGAGCTCTGGCCTCTGAAGAGGATGTG  342
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTGGCAGCTGAGGGGCTTTCTGAGCTCTGGCCTCTGAAGAGGATGTG  347

seq1  CCACCCAAAGTGCTTATAGATGCAGAGTCCAAATGTGGCAACACAGAGCT  392
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACCCAAAGTGCTTATAGATGCAGAGTCCAAATGTGGCAACACAGAGCT  397

seq1  GCCCAGAAAGACAGACACAGTTACACACCCCAGGGTAGGGACTGTGCATC  442
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCAGAAAGACAGACACAGTTACACACCCCAGGGTAGGGACTGTGCATC  447

seq1  TCTAGACATCTTCTCTTCCTTCCGTGCTCTGGCACCTGTGAAGGGCTAGA  492
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAGACATCTTCTCTTCCTTCCGTGCTCTGGCACCTGTGAAGGGCTAGA  497

seq1  TGTCCCAGTGACGTCTTGACAGACACAAACCCAACAAGTGTTGGTTCTGG  542
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTCCCAGTGACGTCTTGACAGACACAAACCCAACAAGTGTTGGTTCTGG  547

seq1  AGTCCTGAACATAGATGCTCTCCTAAGGTGGATCTTCTTGCTTCTGAGAG  592
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCTGAACATAGATGCTCTCCTAAGGTGGATCTTCTTGCTTCTGAGAG  597

seq1  GCATGAATCAGAGACGAAGGGGCCTGGTAGCGTATTGGGATTGATGGGTA  642
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGAATCAGAGACGAAGGGGCCTGGTAGCGTATTGGGATTGATGGGTA  647

seq1  TAGTTTAGGAAAATATACTGAAGGCCCGAGGGATCTAATCCCTGCTCTGC  692
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTTTAGGAAAATATACTGAAGGCCCGAGGGATCTAATCCCTGCTCTGC  697

seq1  CTTCTTCTGGTGTCTGACCTTGGCTGACTTGACCTTCCCTCATTTTCTTT  742
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTTCTGGTGTCTGACCTTGGCTGACTTGACCTTCCCTCATTTTCTTT  747

seq1  ACTGCTAAAGAAGGAATAGTAATGGTACAACCTCAGGATTGTTCAGGAGA  792
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGCTAAAGAAGGAATAGTAATGGTACAACCTCAGGATTGTTCAGGAGA  797

seq1  TTAAATGAGGCCATGCATGTAAAATACTCAGCAAATGCTCAGTCAAGCTA  842
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAATGAGGCCATGCATGTAAAATACTCAGCAAATGCTCAGTCAAGCTA  847

seq1  ACTATTTAGTGAGGTCTCAAACTAATCTTCCCCTTCCACCTAGAGCTGCA  892
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTATTTAGTGAGGTCTCAAACTAATCTTCCCCTTCCACCTAGAGCTGCA  897

seq1  GTAAGAATGTAGCATTGTTTTCTGTTGTTTGCCTGACATGAGTCTATGTT  942
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAGAATGTAGCATTGTTTTCTGTTGTTTGCCTGACATGAGTCTATGTT  947

seq1  CAGGATCTGTCTTTGGGCCTCTCCTCTCCCTCTGCTTCTTGCTCTGCCTG  992
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGATCTGTCTTTGGGCCTCTCCTCTCCCTCTGCTTCTTGCTCTGCCTG  997

seq1  GGACAAAATGCTGGCTATTTTTGAAAAGCTCAAGTGTGTTGCTTCATCTT  1042
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACAAAATGCTGGCTATTTTTGAAAAGCTCAAGTGTGTTGCTTCATCTT  1047

seq1  TGTCTTGGAATTC  1055
      |||||||||||||
seq2  TGTCTTGGAATTC  1060