BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-018F22
Chromosome4 (Build37)
Map Location 124,467,012 - 124,692,552
singlet/doubletdoublet
Overlap geneInpp5b, LOC100039433, Mtf1, Yrdc, Gm50, Epha10, Cdca8, 9930104L06Rik, Rspo1
Upstream geneRhbdl2, LOC667064, Mycbp, Rragc, 1700057H15Rik, LOC100039332, Pou3f1, Utp11l, Fhl3, Sf3a3, LOC664991
Downstream geneGnl2, Dnali1, Snip1, 2310005N01Rik, Zc3h12a, LOC100039298, Grik3, Ftl2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-018F22.bB6Ng01-018F22.g
ACCDH851792DH851793
length6791,079
definitionDH851792|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-018F22, 5' end.DH851793|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-018F22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(124,691,874 - 124,692,552)(124,467,012 - 124,468,088)
sequence
gaattctctcccagtcctcttagaccaaacctaacaaaccagaagagagg
ggggaaatccccactttaaaaaaatccagaaacgcataacctcatcaccc
caaacaatgggatgggaaaatataccagagctggaggtgggaaagacagc
cagaaatgtgtcagtctgggttaagtgcgtgaccccatagaggagagcta
acattttccaaactatgcaggcaaataaagacgtagaactatgtgttttc
accatctaaccctggagcagggagaggcatcttgacacagatatatggcc
tcctcccgcacttgctcaatgccttccaaagcaccaagtacctcttcagg
accacccgtggttgtaggcttctctaggattccagccacaagtgggtgtt
ttaggactgtgagcagataacccatccctcacttttaaactcacatcacc
atccagctcagagacacaagaacaggcccagggctcattgtattcacaat
gtgttagggtggcatttgggcattcacaagatgccaggacaagaatgacc
cctgaccagtcaacctgcagatgcggaagcctctgcatactcaagacttc
ctggagccagagactccctccccgagttgctcagatcccagaggtggctt
ctagaagtgaggggatggaggaggtgtta
gaattcactctgtagaccaggctggcctcagactctgagatccccctgcc
tctgcctcctgagtgctgggattaaaggtgtgctctactctttttattgt
gaacaagagaggaaatatccagaggcatctggagtagcccagagcacaga
gaaagaagactgagcaatgtctgggtcaggaataaggaggagagcatcct
ggagacagtgagatagaaaggggtagagaacagagggaagcgagacagcg
agagacagacagggagacagggacagacagggagacagggacagacagag
aggcagggacagacagggaggcaggcagatcccgggaagcagatgatagt
gggttaatagaaggatgaatagctgggtcaaagaacaggccaacagcctg
ttgtggactttgaaatgtgtaacaggcacttgtgacactcagggtgcctg
gatgccaggctgggccttgatattctgataggcaccacaggtagccgtgt
gtaagggacactcctttaagtagaagggaactggtttcacgagttcctga
ggatgcttttctgtaccacaggaaaccctcctatagtcacagcctgagct
cattgctggatatgtggactacacctaagattcatttactagtgtctact
cccaacagctcttactagttttaaaagaagatttatctacttttaggtga
cagggctcactatgtagtcaggctagcctcaaactcagagattcggataa
aagctgataccaccacaccaggcaagatttatttttaatgtatgtgtatg
agagttttgccctgcatacataacatgtatgtgcactgcctagtgctccc
agagaccaggagaggacatgaatcccctgcaaatagagttatagacggtt
tgtaaccatcatgtgggtaaggaaaacaggttcctctttaagagagcctg
tgctcagaacccccgagccgtctctgcagccctagtttcttattatctta
ttctttccaccaactattgtggagcttatttttctatacccttgcccatg
atttttttcaaccttttaaatgagcaaaa
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_124691874_124692552
seq2: B6Ng01-018F22.b_46_724 (reverse)

seq1  TAACACCTCCTCCATCCCCTCACTTCTAGAAGCCACCTCTGGGATCTGAG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAACACCTCCTCCATCCCCTCACTTCTAGAAGCCACCTCTGGGATCTGAG  50

seq1  CAACTCGGGGAGGGAGTCTCTGGCTCCAGGAAGTCTTGAGTATGCAGAGG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACTCGGGGAGGGAGTCTCTGGCTCCAGGAAGTCTTGAGTATGCAGAGG  100

seq1  CTTCCGCATCTGCAGGTTGACTGGTCAGGGGTCATTCTTGTCCTGGCATC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCGCATCTGCAGGTTGACTGGTCAGGGGTCATTCTTGTCCTGGCATC  150

seq1  TTGTGAATGCCCAAATGCCACCCTAACACATTGTGAATACAATGAGCCCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGAATGCCCAAATGCCACCCTAACACATTGTGAATACAATGAGCCCT  200

seq1  GGGCCTGTTCTTGTGTCTCTGAGCTGGATGGTGATGTGAGTTTAAAAGTG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGCCTGTTCTTGTGTCTCTGAGCTGGATGGTGATGTGAGTTTAAAAGTG  250

seq1  AGGGATGGGTTATCTGCTCACAGTCCTAAAACACCCACTTGTGGCTGGAA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGATGGGTTATCTGCTCACAGTCCTAAAACACCCACTTGTGGCTGGAA  300

seq1  TCCTAGAGAAGCCTACAACCACGGGTGGTCCTGAAGAGGTACTTGGTGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTAGAGAAGCCTACAACCACGGGTGGTCCTGAAGAGGTACTTGGTGCT  350

seq1  TTGGAAGGCATTGAGCAAGTGCGGGAGGAGGCCATATATCTGTGTCAAGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGAAGGCATTGAGCAAGTGCGGGAGGAGGCCATATATCTGTGTCAAGA  400

seq1  TGCCTCTCCCTGCTCCAGGGTTAGATGGTGAAAACACATAGTTCTACGTC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCTCTCCCTGCTCCAGGGTTAGATGGTGAAAACACATAGTTCTACGTC  450

seq1  TTTATTTGCCTGCATAGTTTGGAAAATGTTAGCTCTCCTCTATGGGGTCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTTGCCTGCATAGTTTGGAAAATGTTAGCTCTCCTCTATGGGGTCA  500

seq1  CGCACTTAACCCAGACTGACACATTTCTGGCTGTCTTTCCCACCTCCAGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCACTTAACCCAGACTGACACATTTCTGGCTGTCTTTCCCACCTCCAGC  550

seq1  TCTGGTATATTTTCCCATCCCATTGTTTGGGGTGATGAGGTTATGCGTTT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGTATATTTTCCCATCCCATTGTTTGGGGTGATGAGGTTATGCGTTT  600

seq1  CTGGATTTTTTTAAAGTGGGGATTTCCCCCCTCTCTTCTGGTTTGTTAGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGATTTTTTTAAAGTGGGGATTTCCCCCCTCTCTTCTGGTTTGTTAGG  650

seq1  TTTGGTCTAAGAGGACTGGGAGAGAATTC  679
      |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGTCTAAGAGGACTGGGAGAGAATTC  679

seq1: chr4_124467012_124468088
seq2: B6Ng01-018F22.g_69_1147

seq1  GAATTCACTCTGTAGACCAGGCTGGCCTCAGACTCTGAGATCCCCCTGCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTCTGTAGACCAGGCTGGCCTCAGACTCTGAGATCCCCCTGCC  50

seq1  TCTGCCTCCTGAGTGCTGGGATTAAAGGTGTGCTCTACTCTTTTTATTGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCCTCCTGAGTGCTGGGATTAAAGGTGTGCTCTACTCTTTTTATTGT  100

seq1  GAACAAGAGAGGAAATATCCAGAGGCATCTGGAGTAGCCCAGAGCACAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAACAAGAGAGGAAATATCCAGAGGCATCTGGAGTAGCCCAGAGCACAGA  150

seq1  GAAAGAAGACTGAGCAATGTCTGGGTCAGGAATAAGGAGGAGAGCATCCT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGAAGACTGAGCAATGTCTGGGTCAGGAATAAGGAGGAGAGCATCCT  200

seq1  GGAGACAGTGAGATAGAAAGGGGTAGAGAACAGAGGGAAGCGAGACAGCG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGACAGTGAGATAGAAAGGGGTAGAGAACAGAGGGAAGCGAGACAGCG  250

seq1  AGAGACAGACAGGGAGACAGGGACAGACAGGGAGACAGGGACAGACAGAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACAGACAGGGAGACAGGGACAGACAGGGAGACAGGGACAGACAGAG  300

seq1  AGGCAGGGACAGACAGGGAGGCAGGCAGATCCCGGGAAGCAGATGATAGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAGGGACAGACAGGGAGGCAGGCAGATCCCGGGAAGCAGATGATAGT  350

seq1  GGGTTAATAGAAGGATGAATAGCTGGGTCAAAGAACAGGCCAACAGCCTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTAATAGAAGGATGAATAGCTGGGTCAAAGAACAGGCCAACAGCCTG  400

seq1  TTGTGGACTTTGAAATGTGTAACAGGCACTTGTGACACTCAGGGTGCCTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTGGACTTTGAAATGTGTAACAGGCACTTGTGACACTCAGGGTGCCTG  450

seq1  GATGCCAGGCTGGGCCTTGATATTCTGATAGGCACCACAGGTAGCCGTGT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGCCAGGCTGGGCCTTGATATTCTGATAGGCACCACAGGTAGCCGTGT  500

seq1  GTAAGGGACACTCCTTTAAGTAGAAGGGAACTGGTTTCACGAGTTCCTGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAGGGACACTCCTTTAAGTAGAAGGGAACTGGTTTCACGAGTTCCTGA  550

seq1  GGATGCTTTTCTGTACCACAGGAAACCCTCCTATAGTCACAGCCTGAGCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGATGCTTTTCTGTACCACAGGAAACCCTCCTATAGTCACAGCCTGAGCT  600

seq1  CATTGCTGGATATGTGGACTACACCTAAGATTCATTTACTAGTGTCTACT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTGCTGGATATGTGGACTACACCTAAGATTCATTTACTAGTGTCTACT  650

seq1  CCCAACAGCTCTTACTAGTTTTAAAAGAAGATTTATCTACTTTTAGGTGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAACAGCTCTTACTAGTTTTAAAAGAAGATTTATCTACTTTTAGGTGA  700

seq1  CAGGGCTCACTATGTAGTCAGGCTAGCCTCAAACTCAGAGATTCGGATAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGCTCACTATGTAGTCAGGCTAGCCTCAAACTCAGAGATTCGGATAA  750

seq1  AAGCTGATACCACCACACCAGGCAAGATTTATTTTTAATGTATGTGTATG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCTGATACCACCACACCAGGCAAGATTTATTTTTAATGTATGTGTATG  800

seq1  AGAGTTTTG-CCTGCATACAT-ACATGTATGTGCACTGCCTAGTGCTCCC  848
      ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGTTTTGCCCTGCATACATAACATGTATGTGCACTGCCTAGTGCTCCC  850

seq1  AGAGACCAGGAGAGGACATGAATCCCCTGCAAATAGAGTTATAGACGGTT  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGACCAGGAGAGGACATGAATCCCCTGCAAATAGAGTTATAGACGGTT  900

seq1  GTTAAGCCATCATGTGGGTAAGGAAAACCAGGTCCTCTATAAGAGAGCCT  948
        ||| ||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||
seq2  TGTAA-CCATCATGTGGGTAAGGAAAACAGGTTCCTCTTTAAGAGAGCCT  949

seq1  GTGCTCAGAACCACCGAGCCGTCTCTGCAGCCCTAG-TTCTTATCATCTT  997
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||
seq2  GTGCTCAGAACCCCCGAGCCGTCTCTGCAGCCCTAGTTTCTTATTATCTT  999

seq1  ATAC-TTCCACCAACTACTTGT-GAGCTTATTTTTCTATAACCTTGCCAA  1045
      || | |||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||| |
seq2  ATTCTTTCCACCAACTA-TTGTGGAGCTTATTTTTCTATACCCTTGCCCA  1048

seq1  TGATTTTTTTCAACCTTTTACAATGAGCAAAA  1077
      |||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  TGATTTTTTTCAACCTTTTA-AATGAGCAAAA  1079