BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-028B22
Chromosome4 (Build37)
Map Location 63,638,877 - 63,761,466
singlet/doubletdoublet
Overlap geneTnc
Upstream geneZfp618, Ambp, Kif12, Col27a1, Orm1, Orm-ps, Orm3, Orm2, Akna, Whrn, Atp6v1g1, 6330416G13Rik, LOC670833, 1700018C11Rik, LOC667451, Tnfsf15, Tnfsf8, Rpl17-ps
Downstream genenone
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-028B22.bB6Ng01-028B22.g
ACCDH858682DH858683
length9201,123
definitionDH858682|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-028B22, 5' end.DH858683|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-028B22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(63,760,547 - 63,761,466)(63,638,877 - 63,640,012)
sequence
gaattctgtcccacaacaataggataccatccatagtgagcaaacatatt
ccacatgccagaccctatgctacaatccttacatatattgtaacattgaa
catccccacccccatgaagatattctccttgtatccttagtttcaagatt
aaaagatttgcgaatcagacagttaacttgcctaagataacacagttgat
gagtcgaagagtctcctctgaaagtcaagtggttctcattccagatctga
agtttctttctccactggtgactcaagaagaatgaagaggttccatgtat
tagtatttccacatgattaaccaactggatatcctaatggttgttcagcc
tgcatggtgctaagataacaggtttaaaaggtgaggctccaatgacctgg
aaattaggaacagaggtaggattctaatgtaaggtccctgggaaatgttc
tccaaactcatgtcatctaaagacagaaatagtttatgtatcgaaaatac
tgttctgacatagtatttcagaaactgcactctgaaagatccaacaagca
gatgaaagagtcagatgcagagagttgcacccaacaaatggacagaagca
gctggcccctgttgttaaattagggaaaggctgaaagaagctgaggagga
gagtgacctgtagaagggccagcagtctcaaataatctggacccccaaga
actctcaaacactggaccaccaaacaggcagcatacaacagctgatatga
ggtccccaacacatatatacagcagaggactacagggtctgtgttcattc
agagataatgtacctaaccctcaagagactggaggccccagggagtttag
aggtcaggtggggtgggaagtggggacatccacgtgaagatagggggtaa
agaggaggtatgggatgtgg
gaattcactaggtgcaattgtcctctctagtttcttccttatgcgacctt
ttcctacacagtctaccctgaaccttaagacactcctcaggagagatcta
gatgagtctagctgagagtagatcctactgatgtacatgaactctgcctt
ggaatatttttctctgcttattcaattcactgacttgttctaactggaaa
ccttgctggctgatgtaggttatgctacatttcacaatctgtgtcttata
aacaaagctttcttcttcagatctcagttttctcatctagacaatgacag
taatatctacactgtcttatatgctgcagaacccgtggcctcatccatga
cttactcagggccatgtgtttggtaacacatagtaggaaagccaccaggc
atcatctgtagcaatgtcacaatcgtgatggaattccaggagcagtgggc
atgatatttttctactaaagagcttcctaggtgtttgttacttcagtgtg
tagctttctgctatggggtcctcaagtcctgagccctacaacagatagct
aagcacaaaacaccagagtcatacctattaaaaagctggagaggggctgg
agatatggcataacactaaaagactaactgcacaaatatgaaggtctgag
tttagatgtccagtatccacatacaagctggttagacacaatgacctgtc
tgtaactcaagttctcaggaagctgaggaaagagatctcttccccttcca
tgagcatcaggtagctagacccactgaattggcaagctctgggttttagt
gtgagatcttgcctcaatatataagataaaatatgatagaggaagacata
cagcctctataagcacaaacacacatgcacctgcatctttcagacatctt
tcacacatgtaccacagtgtgacacacacacacacacacacacacacaca
cacacacacacacacatgcagagttagagatacttatgcacgatgctttc
ttccaatagactcaataaaaataaaaaaaaaacttcagtagctaatgctt
gggcttgataaaaacccttaaaggcttgctatccataaaaccctgcttct
caatcataatgaatgccctctgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_63760547_63761466
seq2: B6Ng01-028B22.b_43_962 (reverse)

seq1  CCACATCCCATACCTCCTCTTTACCCCCTATCTTCACGTGGATGTCCCCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACATCCCATACCTCCTCTTTACCCCCTATCTTCACGTGGATGTCCCCA  50

seq1  CTTCCCACCCCACCTGACCTCTAAACTCCCTGGGGCCTCCAGTCTCTTGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCCACCCCACCTGACCTCTAAACTCCCTGGGGCCTCCAGTCTCTTGA  100

seq1  GGGTTAGGTACATTATCTCTGAATGAACACAGACCCTGTAGTCCTCTGCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTAGGTACATTATCTCTGAATGAACACAGACCCTGTAGTCCTCTGCT  150

seq1  GTATATATGTGTTGGGGACCTCATATCAGCTGTTGTATGCTGCCTGTTTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATATATGTGTTGGGGACCTCATATCAGCTGTTGTATGCTGCCTGTTTG  200

seq1  GTGGTCCAGTGTTTGAGAGTTCTTGGGGGTCCAGATTATTTGAGACTGCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGTCCAGTGTTTGAGAGTTCTTGGGGGTCCAGATTATTTGAGACTGCT  250

seq1  GGCCCTTCTACAGGTCACTCTCCTCCTCAGCTTCTTTCAGCCTTTCCCTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCCTTCTACAGGTCACTCTCCTCCTCAGCTTCTTTCAGCCTTTCCCTA  300

seq1  ATTTAACAACAGGGGCCAGCTGCTTCTGTCCATTTGTTGGGTGCAACTCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAACAACAGGGGCCAGCTGCTTCTGTCCATTTGTTGGGTGCAACTCT  350

seq1  CTGCATCTGACTCTTTCATCTGCTTGTTGGATCTTTCAGAGTGCAGTTTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCATCTGACTCTTTCATCTGCTTGTTGGATCTTTCAGAGTGCAGTTTC  400

seq1  TGAAATACTATGTCAGAACAGTATTTTCGATACATAAACTATTTCTGTCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAATACTATGTCAGAACAGTATTTTCGATACATAAACTATTTCTGTCT  450

seq1  TTAGATGACATGAGTTTGGAGAACATTTCCCAGGGACCTTACATTAGAAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGATGACATGAGTTTGGAGAACATTTCCCAGGGACCTTACATTAGAAT  500

seq1  CCTACCTCTGTTCCTAATTTCCAGGTCATTGGAGCCTCACCTTTTAAACC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTACCTCTGTTCCTAATTTCCAGGTCATTGGAGCCTCACCTTTTAAACC  550

seq1  TGTTATCTTAGCACCATGCAGGCTGAACAACCATTAGGATATCCAGTTGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTATCTTAGCACCATGCAGGCTGAACAACCATTAGGATATCCAGTTGG  600

seq1  TTAATCATGTGGAAATACTAATACATGGAACCTCTTCATTCTTCTTGAGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAATCATGTGGAAATACTAATACATGGAACCTCTTCATTCTTCTTGAGT  650

seq1  CACCAGTGGAGAAAGAAACTTCAGATCTGGAATGAGAACCACTTGACTTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACCAGTGGAGAAAGAAACTTCAGATCTGGAATGAGAACCACTTGACTTT  700

seq1  CAGAGGAGACTCTTCGACTCATCAACTGTGTTATCTTAGGCAAGTTAACT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGGAGACTCTTCGACTCATCAACTGTGTTATCTTAGGCAAGTTAACT  750

seq1  GTCTGATTCGCAAATCTTTTAATCTTGAAACTAAGGATACAAGGAGAATA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTGATTCGCAAATCTTTTAATCTTGAAACTAAGGATACAAGGAGAATA  800

seq1  TCTTCATGGGGGTGGGGATGTTCAATGTTACAATATATGTAAGGATTGTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCATGGGGGTGGGGATGTTCAATGTTACAATATATGTAAGGATTGTA  850

seq1  GCATAGGGTCTGGCATGTGGAATATGTTTGCTCACTATGGATGGTATCCT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATAGGGTCTGGCATGTGGAATATGTTTGCTCACTATGGATGGTATCCT  900

seq1  ATTGTTGTGGGACAGAATTC  920
      ||||||||||||||||||||
seq2  ATTGTTGTGGGACAGAATTC  920

seq1: chr4_63638877_63640012
seq2: B6Ng01-028B22.g_64_1186

seq1  GAATTCACTAGGTGCAATTGTCCTCTCTAGTTTCTTCCTTATGCGACCTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTAGGTGCAATTGTCCTCTCTAGTTTCTTCCTTATGCGACCTT  50

seq1  TTCCTACACAGTCTACCCTGAACCTTAAGACACTCCTCAGGAGAGATCTA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTACACAGTCTACCCTGAACCTTAAGACACTCCTCAGGAGAGATCTA  100

seq1  GATGAGTCTAGCTGAGAGTAGATCCTACTGATGTACATGAACTCTGCCTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGAGTCTAGCTGAGAGTAGATCCTACTGATGTACATGAACTCTGCCTT  150

seq1  GGAATATTTTTCTCTGCTTATTCAATTCACTGACTTGTTCTAACTGGAAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAATATTTTTCTCTGCTTATTCAATTCACTGACTTGTTCTAACTGGAAA  200

seq1  CCTTGCTGGCTGATGTAGGTTATGCTACATTTCACAATCTGTGTCTTATA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTGCTGGCTGATGTAGGTTATGCTACATTTCACAATCTGTGTCTTATA  250

seq1  AACAAAGCTTTCTTCTTCAGATCTCAGTTTTCTCATCTAGACAATGACAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAAGCTTTCTTCTTCAGATCTCAGTTTTCTCATCTAGACAATGACAG  300

seq1  TAATATCTACACTGTCTTATATGCTGCAGAACCCGTGGCCTCATCCATGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATATCTACACTGTCTTATATGCTGCAGAACCCGTGGCCTCATCCATGA  350

seq1  CTTACTCAGGGCCATGTGTTTGGTAACACATAGTAGGAAAGCCACCAGGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACTCAGGGCCATGTGTTTGGTAACACATAGTAGGAAAGCCACCAGGC  400

seq1  ATCATCTGTAGCAATGTCACAATCGTGATGGAATTCCAGGAGCAGTGGGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATCTGTAGCAATGTCACAATCGTGATGGAATTCCAGGAGCAGTGGGC  450

seq1  ATGATATTTTTCTACTAAAGAGCTTCCTAGGTGTTTGTTACTTCAGTGTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGATATTTTTCTACTAAAGAGCTTCCTAGGTGTTTGTTACTTCAGTGTG  500

seq1  TAGCTTTCTGCTATGGGGTCCTCAAGTCCTGAGCCCTACAACAGATAGCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGCTTTCTGCTATGGGGTCCTCAAGTCCTGAGCCCTACAACAGATAGCT  550

seq1  AAGCACAAAACACCAGAGTCATACCTATTAAAAAGCTGGAGAGGGGCTGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCACAAAACACCAGAGTCATACCTATTAAAAAGCTGGAGAGGGGCTGG  600

seq1  AGATATGGCATAACACTAAAAGACTAACTGCACAAATATGAAGGTCTGAG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATATGGCATAACACTAAAAGACTAACTGCACAAATATGAAGGTCTGAG  650

seq1  TTTAGATGTCCAGTATCCACATACAAGCTGGTTAGACACAATGACCTGTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGATGTCCAGTATCCACATACAAGCTGGTTAGACACAATGACCTGTC  700

seq1  TGTAACTCAAGTTCTCAGGAAGCTGAGGAAAGAGATCTCTTCCCCTTCCA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTAACTCAAGTTCTCAGGAAGCTGAGGAAAGAGATCTCTTCCCCTTCCA  750

seq1  TGAGCATCAGGTAGCTAGACCCACTGAATTGGCAAGCTCTGGGTTTTAGT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGCATCAGGTAGCTAGACCCACTGAATTGGCAAGCTCTGGGTTTTAGT  800

seq1  GTGAGATCTTGCCTCAATATATAAGATAAAATATGATAGAGGAAGACATA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGATCTTGCCTCAATATATAAGATAAAATATGATAGAGGAAGACATA  850

seq1  CAGCCTCTATAAGCACAAACACACATGCACCTGCATCTTTCAGACATCTT  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCCTCTATAAGCACAAACACACATGCACCTGCATCTTTCAGACATCTT  900

seq1  TCACACATGTACCACAGGTGTGAACACACACACACACACACACACACACA  950
      |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACACATGTACCACA-GTGTG-ACACACACACACACACACACACACACA  948

seq1  CACACACACACACACACATGCAAGAGTTAGAGATACCTATGCAACAATGC  1000
      ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||
seq2  CACACACACACACACACATGC-AGAGTTAGAGATACTTATGC-ACGATGC  996

seq1  TTTCCTTCCAATTAGACTCAATAATAATAAAAAAGAACTTCCAGTAGCTA  1050
      ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| ||  | |||||||| 
seq2  TTT-CTTCCAA-TAGACTCAATAAAAATAAAAAAAAAACTTCAGTAGCT-  1043

seq1  AATGCATGGGCTTGATAAAAACCCTTAAAGTGCTTGCTATCCATATAAAA  1100
      ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||
seq2  AATGCTTGGGCTTGATAAAAACCCTTAAAG-GCTTGCTATCC--ATAAAA  1090

seq1  CCTTGCTTCTCAAATTCTATAATGAATGCCTTCTGT  1136
      || ||||||||||  || |||||||||||| |||||
seq2  CCCTGCTTCTCAA--TC-ATAATGAATGCCCTCTGT  1123