BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-030G10
Chromosome4 (Build37)
Map Location 123,025,413 - 123,209,275
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMacf1, D830031N03Rik
Upstream geneLOC633269, LOC633279, 9530002B09Rik, Ppt1, Cap1, Mfsd2, Mycl1, Trit1, Bmp8b, Oxct2b, Ppie, Hpcal4, Nt5c1a, Heyl, LOC194197, LOC622334, Pabpc4, Bmp8a, Oxct2a
Downstream geneLOC100039110, Ndufs5, 6330407G11Rik, Rhbdl2, LOC667064, Mycbp, Rragc, 1700057H15Rik, LOC100039332
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-030G10.bB6Ng01-030G10.g
ACCDH860323DH860324
length639852
definitionDH860323|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-030G10, 5' end.DH860324|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-030G10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(123,208,637 - 123,209,275)(123,025,413 - 123,026,262)
sequence
gaattcttttcttttatgtctttagttatgaaaattccaaggactgggag
gtgtatgcagtccttgtacatatagtcgcttacagtgacacagaagttaa
tattttgttctttattcttctgaggcagttttcctcttctttttcttaaa
ggaagtaaaacatttcagatacgttgcttcttgctctttctgctctgtag
taaatgtccttttgaagttggcacatatcatttcttatgcaattttgtgc
attaacagcagatttggaatcataactatgtgctagcatttgtatgtttt
atatttccaacgtgcccactccagccttgttcatgtaaggcccatgctct
actcccaagctaaggcctgtgctctattcctaacccagccctaaggtttg
tggggtttgtcgtgatggcgaagagtagtgtggcttgttcatcttggcgt
gtatagagtgtgatgtgaatggtacacttcacagctgtgccacacttcct
tccttaattaactataagggctttgttgccttcacttgtgaataaagtgc
catttttgcagtgaacatctgtgtattgtgaccttgccattgaagaaaga
ggtttggggttagacacctggtctggaatcctttcccca
gaattccaggacagtcaaggctacatagtaagaccttgtctcaaaaccaa
aacaagtaggtgtgtgtccgtgagtgcagatgcctctagagactgtctga
taatggtgctgggaactaaatgtgggttctttggaagagtagcaagtgct
cttttctctgtgtggccctggctatcctggaactcactctgaagaccagg
actcagagatgtgcctgcctctgcctctctagtgctgagattaaaggtgt
gcaccatcaaccagtgcaaaggctcttaacacatctctagccccaaatat
ttatttttaattataaggatgtagcatgtgggtatgtgcatgtgtatact
ggtattacggaggccagaagagtccctggagctggagttacagggggttg
tagatcaccattggtgctgggaactgaaaagatcttctgcgagggcagca
agtactcttaactgccgagccaactctccagccccaagctcacagcttta
atctatacatttggccctatgcaacttaggcatttacagcttgccaattt
ctggaatttgagggccatgtggcctgaagagtgagaacatagatctgagt
tgggaccctttcttgagttctcattcagttggtatctggatgttctagtc
acatcagggccagctatggactagagaggtggagccagactagcacagga
gttcaagactcattccctctgcccttgtacactttggactataacaagtt
tatatatataaatatatattactattatttgtatggcaaacaggcaatga
tgggcttcttgaaatgtacaaactgcaagacacctgtcaggtaccagcag
gc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_123208637_123209275
seq2: B6Ng01-030G10.b_40_679 (reverse)

seq1  TGGGG-AAGGATTCCAGACCAGGTGTCTAACCCCAAACCTCTTTCTTCAA  49
      ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGGAAAGGATTCCAGACCAGGTGTCTAACCCCAAACCTCTTTCTTCAA  50

seq1  TGGCAAGGTCACAATACACAGATGTTCACTGCAAAAATGGCACTTTATTC  99
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCAAGGTCACAATACACAGATGTTCACTGCAAAAATGGCACTTTATTC  100

seq1  ACAAGTGAAGGCAACAAAGCCCTTATAGTTAATTAAGGAAGGAAGTGTGG  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGTGAAGGCAACAAAGCCCTTATAGTTAATTAAGGAAGGAAGTGTGG  150

seq1  CACAGCTGTGAAGTGTACCATTCACATCACACTCTATACACGCCAAGATG  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAGCTGTGAAGTGTACCATTCACATCACACTCTATACACGCCAAGATG  200

seq1  AACAAGCCACACTACTCTTCGCCATCACGACAAACCCCACAAACCTTAGG  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAGCCACACTACTCTTCGCCATCACGACAAACCCCACAAACCTTAGG  250

seq1  GCTGGGTTAGGAATAGAGCACAGGCCTTAGCTTGGGAGTAGAGCATGGGC  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGGTTAGGAATAGAGCACAGGCCTTAGCTTGGGAGTAGAGCATGGGC  300

seq1  CTTACATGAACAAGGCTGGAGTGGGCACGTTGGAAATATAAAACATACAA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTACATGAACAAGGCTGGAGTGGGCACGTTGGAAATATAAAACATACAA  350

seq1  ATGCTAGCACATAGTTATGATTCCAAATCTGCTGTTAATGCACAAAATTG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTAGCACATAGTTATGATTCCAAATCTGCTGTTAATGCACAAAATTG  400

seq1  CATAAGAAATGATATGTGCCAACTTCAAAAGGACATTTACTACAGAGCAG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATAAGAAATGATATGTGCCAACTTCAAAAGGACATTTACTACAGAGCAG  450

seq1  AAAGAGCAAGAAGCAACGTATCTGAAATGTTTTACTTCCTTTAAGAAAAA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGAGCAAGAAGCAACGTATCTGAAATGTTTTACTTCCTTTAAGAAAAA  500

seq1  GAAGAGGAAAACTGCCTCAGAAGAATAAAGAACAAAATATTAACTTCTGT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAGAGGAAAACTGCCTCAGAAGAATAAAGAACAAAATATTAACTTCTGT  550

seq1  GTCACTGTAAGCGACTATATGTACAAGGACTGCATACACCTCCCAGTCCT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACTGTAAGCGACTATATGTACAAGGACTGCATACACCTCCCAGTCCT  600

seq1  TGGAATTTTCATAACTAAAGACATAAAAGAAAAGAATTCC  639
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAATTTTCATAACTAAAGACATAAAAGAAAAGAATTCC  640

seq1: chr4_123025413_123026262
seq2: B6Ng01-030G10.g_66_917

seq1  GAATTCCAGGACAGTCAAGGCTACATAGTAAGACCTTGTCTCAAAACCAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGGACAGTCAAGGCTACATAGTAAGACCTTGTCTCAAAACCAA  50

seq1  AACAAGTAGGTGTGTGTCCGTGAGTGCAGATGCCTCTAGAGACTGTCTGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACAAGTAGGTGTGTGTCCGTGAGTGCAGATGCCTCTAGAGACTGTCTGA  100

seq1  TAATGGTGCTGGGAACTAAATGTGGGTTCTTTGGAAGAGTAGCAAGTGCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATGGTGCTGGGAACTAAATGTGGGTTCTTTGGAAGAGTAGCAAGTGCT  150

seq1  CTTTTCTCTGTGTGGCCCTGGCTATCCTGGAACTCACTCTGAAGACCAGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTTCTCTGTGTGGCCCTGGCTATCCTGGAACTCACTCTGAAGACCAGG  200

seq1  ACTCAGAGATGTGCCTGCCTCTGCCTCTCTAGTGCTGAGATTAAAGGTGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCAGAGATGTGCCTGCCTCTGCCTCTCTAGTGCTGAGATTAAAGGTGT  250

seq1  GCACCATCAACCAGTGCAAAGGCTCTTAACACATCTCTAGCCCCAAATAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACCATCAACCAGTGCAAAGGCTCTTAACACATCTCTAGCCCCAAATAT  300

seq1  TTATTTTTAATTATAAGGATGTAGCATGTGGGTATGTGCATGTGTATACT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTTTAATTATAAGGATGTAGCATGTGGGTATGTGCATGTGTATACT  350

seq1  GGTATTACGGAGGCCAGAAGAGTCCCTGGAGCTGGAGTTACAGGGGGTTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTATTACGGAGGCCAGAAGAGTCCCTGGAGCTGGAGTTACAGGGGGTTG  400

seq1  TAGATCACCATTGGTGCTGGGAACTGAAAAGATCTTCTGCGAGGGCAGCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATCACCATTGGTGCTGGGAACTGAAAAGATCTTCTGCGAGGGCAGCA  450

seq1  AGTACTCTTAACTGCCGAGCCAACTCTCCAGCCCCAAGCTCACAGCTTTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTACTCTTAACTGCCGAGCCAACTCTCCAGCCCCAAGCTCACAGCTTTA  500

seq1  ATCTATACATTTGGCCCTATGCAACTTAGGCATTTACAGCTTGCCAATTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTATACATTTGGCCCTATGCAACTTAGGCATTTACAGCTTGCCAATTT  550

seq1  CTGGAATTTGAGGGCCATGTGGCCTGAAGAGTGAGAACATAGATCTGAGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAATTTGAGGGCCATGTGGCCTGAAGAGTGAGAACATAGATCTGAGT  600

seq1  TGGGACCCTTTCTTGAGTTCTCATTCAGTTGGTATCTGGATGTTCTAGTC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGACCCTTTCTTGAGTTCTCATTCAGTTGGTATCTGGATGTTCTAGTC  650

seq1  ACATCAGGGCCAGCTATGGACTAGAGAGGTGGAGCCAGACTAGCACAGGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCAGGGCCAGCTATGGACTAGAGAGGTGGAGCCAGACTAGCACAGGA  700

seq1  GTTCAAGACTCATTCCCTCTGCCCTTGTACACTTTGGACTATAACAAG-T  749
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  GTTCAAGACTCATTCCCTCTGCCCTTGTACACTTTGGACTATAACAAGTT  750

seq1  TATATATATAAATATATATAACTA-TATTTGTATGGCAAACAGGCAATGA  798
      ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATATATAAATATATATTACTATTATTTGTATGGCAAACAGGCAATGA  800

seq1  TGG--CTCCTGAAATGTACAAACTGCAAGACACCTGTCCAGGTAACCAGC  846
      |||   || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||
seq2  TGGGCTTCTTGAAATGTACAAACTGCAAGACACCTGT-CAGGT-ACCAGC  848

seq1  AGGC  850
      ||||
seq2  AGGC  852