seq1: chr4_8735930_8737032
seq2: B6Ng01-046E09.b_45_1105 (reverse)
seq1 TTGCACGTGGAAAGAAAAAGAAATTTGATATTTTCCTGTGGACTCTAGCT 50
||||||||| ||||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||
seq2 TTGCACGTG--AAGAAAAAGAA---TGA---TTTTCTGT-GACTCTAGCT 41
seq1 GTGCTTCCTCTTACTATGAATAATTTAAGAATTGTCTCCCAGGGAGAGCC 100
| ||| ||| |||||||| | ||| ||||||||| |||||||
seq2 G-GCT--CTC-TACTATGA-----TATAGA--TGTCTCCCA-GGAGAGC- 78
seq1 ACCTCAGCTTCACACACCATGACAGTGGGCGTGGCTTGGCATTTAAATAT 150
|||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||| ||||
seq2 -ACTCAGC-TCACACA-CATGACAGT-GGCGTGGCT--GCATTT-AATA- 120
seq1 TGTCCTAAACACAAGTTAATGTCCCCAAGACCCAGGAGAGGGGTCTTGTA 200
||| |||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||
seq2 TGT-CTAAACAC-AGT--ATGTCCC--AGACC--AGAGAGGGGTC-TGTA 161
seq1 TATGAACATTGAGGTATGTTTGAATGTGTGTGTAGATATTTAGAGTGCAT 250
|||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TATG-ACATTGA-GTATGTTTGAATGTGTGTGTAGATATTTAGAGTGCAT 209
seq1 AGGTGTTTTGTTTTCCATATTTAGTTATAGCACTTCCTATATGCCATCTA 300
||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGGTG-TTTGTTTTCCATATTTAGTTATAGCACTTCCTATATGCCATCTA 258
seq1 TCTATAGAAAATAATCCAAGCCCTTTTCCTTTTAGAATCATAAGGTCAGA 350
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TCTATAGAAAATAATCCAAGCCCTTTTCCTTTTAGAATCATAAGGTCAGA 308
seq1 AGTTATCTTAGAGTCAGAATCTGGGTGTACTATATACACAGGAGAGATAC 400
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AGTTATCTTAGAGTCAGAATCTGGGTGTACTATATACACAGGAGAGATAC 358
seq1 TATCCCCTAACATTTATTTTTCTTTATTTAACATATGTTTTCTCCATAAG 450
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TATCCCCTAACATTTATTTTTCTTTATTTAACATATGTTTTCTCCATAAG 408
seq1 GAGTTATATTAGATTCCAGGATAATTGAACATAACAATAAAAAATAGAAC 500
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GAGTTATATTAGATTCCAGGATAATTGAACATAACAATAAAAAATAGAAC 458
seq1 ATTTTATAAAGTTAAAGTCTTAACTATAGTCTCCAGAATATCTTTATTTT 550
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 ATTTTATAAAGTTAAAGTCTTAACTATAGTCTCCAGAATATCTTTATTTT 508
seq1 CTCACTCAGTACTCTGTAACTCACTATCTCTGTTTGAGTATGAAATATAT 600
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTCACTCAGTACTCTGTAACTCACTATCTCTGTTTGAGTATGAAATATAT 558
seq1 TAGACCAGAAGCAGTTTATTATTCTTCTCTGTATACTTTTTCATTTTTTG 650
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TAGACCAGAAGCAGTTTATTATTCTTCTCTGTATACTTTTTCATTTTTTG 608
seq1 TTCATTATTTGTATAGTTTTGAGTAGAAGAGCTGTCTAATTTAGCAAGGC 700
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTCATTATTTGTATAGTTTTGAGTAGAAGAGCTGTCTAATTTAGCAAGGC 658
seq1 TATTCTTTCCTTGAGGGTGCAGGTTATCATGTGCTAACGGCTGTTTCAGG 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TATTCTTTCCTTGAGGGTGCAGGTTATCATGTGCTAACGGCTGTTTCAGG 708
seq1 CCACGTTAGAGAACTAGGCTTGGCTCCTTGGTCACATGAACAGTGAGACA 800
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCACGTTAGAGAACTAGGCTTGGCTCCTTGGTCACATGAACAGTGAGACA 758
seq1 AATATGTTAATATAGCCAAAACATCAGGTTTCCTGTAACCTGTTATGATT 850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AATATGTTAATATAGCCAAAACATCAGGTTTCCTGTAACCTGTTATGATT 808
seq1 CCTTTACATTCATTCCTGGGGAAGGAAAAGAATACCCATTTTCAAATGTC 900
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CCTTTACATTCATTCCTGGGGAAGGAAAAGAATACCCATTTTCAAATGTC 858
seq1 TATTGAACTCATGAAAATACTCAGAGCACTGTCAGGTTAGACAGTAGCTG 950
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TATTGAACTCATGAAAATACTCAGAGCACTGTCAGGTTAGACAGTAGCTG 908
seq1 GCCAAGGAGTGATCTCAGTGTTTGTGTGTGTGCGTATGTGAAGCTGTGCG 1000
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 GCCAAGGAGTGATCTCAGTGTTTGTGTGTGTGCGTATGTGAAGCTGTGCG 958
seq1 TTATCACCCTATCATTCATTGAGTCTGCAGAGTATGGAAGTTTCTGCACA 1050
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 TTATCACCCTATCATTCATTGAGTCTGCAGAGTATGGAAGTTTCTGCACA 1008
seq1 CTGGTACTGTGGGCTGCTGGAGGATGGACAAAGGAGATGTCTTTAGTGAA 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 CTGGTACTGTGGGCTGCTGGAGGATGGACAAAGGAGATGTCTTTAGTGAA 1058
seq1 TTC 1103
|||
seq2 TTC 1061
| seq1: chr4_8615617_8616016
seq2: B6Ng01-046E09.g_71_161
seq1 AAATGATTCTCTTTGGGAAAACTTCAAGAAAGAAGCAAACGGAGAGAAGA 50
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2 AAATGATTCTCTTTGGGAAAACTTCAAGAAAGAAGCAAACGGAGAGAAGA 50
seq1 GTGTTCCAGGCTTAGGGTAGTGGGGGGTGGGTGGGAGCTGAGGCTTAGCC 100
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |
seq2 GTGTTCCAGGCTTAGGGTAGTGGGGGGTGGGTGGGATCATA--------- 91
seq1 GGTACAAAGCTGCCTAGGTCTGCGCCTGAGGGTCTTCGGGTTTTCAAGGC 150
seq2 -------------------------------------------------- 91
seq1 CCTTGGAGTTCTGCACCAGCAGAACCTCTGAAAGCCTGGACTTCTAACCC 200
seq2 -------------------------------------------------- 91
seq1 GGACTTCCCGGATAAGGAGGATATTAAGTCAGGGAGGGGAGATGTGGCTG 250
seq2 -------------------------------------------------- 91
seq1 ATATGTCCCACACTGACTGTGTTTATCTTTGGCACATTACAAAAGTTAGT 300
seq2 -------------------------------------------------- 91
seq1 GTCCCAACGTCCTAGTGAAATACACAAGGACACAACAGGAGACCTCCACA 350
seq2 -------------------------------------------------- 91
seq1 TAGTCACTTGGAGCCTAAACGTTATACTTTCATTAAATGTAGAGGTCATA 400
seq2 -------------------------------------------------- 91
|
