BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-047I21
Chromosome4 (Build37)
Map Location 65,225,307 - 65,404,202
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAstn2, Trim32
Upstream genePappa
Downstream geneLOC667499
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-047I21.bB6Ng01-047I21.g
ACCDH872384DH872385
length8091,064
definitionDH872384|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-047I21, 5' end.DH872385|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-047I21, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(65,225,307 - 65,226,120)(65,403,076 - 65,404,202)
sequence
gaattcacagggtcactgagaaaaaaaaaatgtaaaaactgagtatggtt
aaacataggttccatgtctttaacaatatgtggtaggaagtatttcttaa
aacacagatgtcaggtgtgatggcacttgcttttaatgtcagcatctgga
aggcagaagctggtagatctctctgagttcaagatcagcctgatatttta
tatatatatatatatattgagagagagaatgagagagagagagagagaga
gttacgggacagctgttatcaccctactgagaatgaatggatgaataaat
aaataaataaataaataaataaataaataaataaataaaagattgggaga
tggctgagtgaataaaagtgcttgctgagaaagcaaagacctgagttcaa
atctccaggacccaggtacaagccaagcactgtagttcatggcagtcagt
aactacagcactggagggtgaagacaagagatcacaggagctcgctggcc
agccaaactagccaaacttcaggtcaaatgagagattttgtctcataaaa
gtaaaatgataggggaaaccgctgggcacccggacatcttcctctaagca
catacagaagctaaatggaaacaacatgaagggtgggtgttgccttcagg
ataagggaacctgagatggaaagcaccaccagaagacagacagggcctct
aaagatagatgaagcacagagtctgccagggatgtgaatgggagatgtag
aatagctgagtgatcaggatgaatgatacgaatgatactagcagactctg
ttcagtctt
gaattccaactgaggatgtgtggctccagttcaggcaagatagatcgact
atctttgccagcctctaaatatatccagctatgggatcttggtgaagtga
ttcaatctctttgagcctctgctctttaatgtaggctcagaagtgactgt
tcccaattgtggggattaagtgaaattatgcaagcagagcgactggcagg
tggaaagaagcattcagtaaactgtgtaattattagtttaataggtagaa
agctgtagcatttaagtgttcaatcaatgaagtttagattgtgctctcta
ctctgtgcccagtaccttgaacagagcctagtccatagtggtgctcagct
aataattatttattaaaaggtcttcacttaatgtaagtcaatgtaaggca
ttgctactctggccttctcagttaacatttccagcacatccctatcttta
tgctacgcccatggcctcagtcgatgggattttaacaacactgttctatc
tgcaactcctcttctccctgtcctcaactcatccagactgtcggtggtcc
tttaacctgaacatctctgttttactttctagacttaagacaggcatctt
cctctccagcaagttctcctgactatcatggaagtggtgaaagagatgta
cagttacctcaatgatggttgataataccaatgcctacagataaagactg
cttaaactgtggctcaatgtttgccaagtgggataggaaacatataggaa
aggatttttttctctttgtcattcttatgtatctgtgtctgatatattat
atataattattataaatggtatactgaataaagcattaaatagctataga
gttactatctaaatgttttattcactcatctttgataggagagatactta
attggctgtattattttatagggttgagaagatgagcagatcatgagtca
gctgatttgatgacatgtagcagaacttaactctatctttctgctcactt
caagtatgagaacgacacttactacatttagctaataattacttggattc
tgacatgatcctgg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_65225307_65226120
seq2: B6Ng01-047I21.b_44_852

seq1  GAATTCACAGGGTCACTGAGAAAAAAAAAATGTAAAAACTGAGTATGGTT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACAGGGTCACTGAGAAAAAAAAAATGTAAAAACTGAGTATGGTT  50

seq1  AAACATAGGTTCCATGTCTTTAACAATATGTGGTAGGAAGTATTTCTTAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACATAGGTTCCATGTCTTTAACAATATGTGGTAGGAAGTATTTCTTAA  100

seq1  AACACAGATGTCAGGTGTGATGGCACTTGCTTTTAATGTCAGCATCTGGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACAGATGTCAGGTGTGATGGCACTTGCTTTTAATGTCAGCATCTGGA  150

seq1  AGGCAGAAGCTGGTAGATCTCTCTGAGTTCAAGATCAGCCTGATATTTTA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCAGAAGCTGGTAGATCTCTCTGAGTTCAAGATCAGCCTGATATTTTA  200

seq1  TATATATATATATATATTGAGAGAGAGAATGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATATATATATATATATTGAGAGAGAGAATGAGAGAGAGAGAGAGAGAGA  250

seq1  GTTACGGGACAGCTGTTATCACCCTACTGAGAATGAATGGATGAATAAAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTACGGGACAGCTGTTATCACCCTACTGAGAATGAATGGATGAATAAAT  300

seq1  AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAGATTGGGAGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAATAAAAGATTGGGAGA  350

seq1  TGGCTGAGTGAATAAAAGTGCTTGCTGAGAAAGCAAAGACCTGAGTTCAA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCTGAGTGAATAAAAGTGCTTGCTGAGAAAGCAAAGACCTGAGTTCAA  400

seq1  ATCTCCAGGACCCAGGTACAAGCCAAGCACTGTAGTTCATGGCAGTCAGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTCCAGGACCCAGGTACAAGCCAAGCACTGTAGTTCATGGCAGTCAGT  450

seq1  AACTACAGCACTGGAGGGTGAAGACAAGAGATCACAGGAGCTCGCTGGCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTACAGCACTGGAGGGTGAAGACAAGAGATCACAGGAGCTCGCTGGCC  500

seq1  AGCCAAACTAGCCAAACTTCAGGTCAAATGAGAGATTTTGTCTCATAAAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAAACTAGCCAAACTTCAGGTCAAATGAGAGATTTTGTCTCATAAAA  550

seq1  GTAAAATGATAGGGGAAACCGCTGGGCACCCGGACATCTTCCTCTAAGCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAAAATGATAGGGGAAACCGCTGGGCACCCGGACATCTTCCTCTAAGCA  600

seq1  CATACAGAAGCTAAATGGAAACAACATGAAGGGTGGGTGTTGCCTTCAGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATACAGAAGCTAAATGGAAACAACATGAAGGGTGGGTGTTGCCTTCAGG  650

seq1  ATAAGGGAACCTGAGATGGAAAGCACCACCAGAAGACAGACAGGGCCTCT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGGGAACCTGAGATGGAAAGCACCACCAGAAGACAGACAGGGCCTCT  700

seq1  AAAGATAGATGAAGCACAGAAGTCTGCCAGGGATGTGAATGGGAGAAGTA  750
      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  AAAGATAGATGAAGCACAG-AGTCTGCCAGGGATGTGAATGGGAGATGTA  749

seq1  GAATAGCTGGAGTGAGCCAGGATGAAGGATAACGAAATGATACAGGCAGA  800
      |||||||| ||||||  ||||||||| ||| ||| ||||||||  |||||
seq2  GAATAGCT-GAGTGA-TCAGGATGAATGAT-ACG-AATGATACTAGCAGA  795

seq1  CACTGTTCAGTCTT  814
      | ||||||||||||
seq2  CTCTGTTCAGTCTT  809

seq1: chr4_65403076_65404202
seq2: B6Ng01-047I21.g_69_1132 (reverse)

seq1  CCAGAGATCATGTCTATAAGATATCACAAGTAAAATTAGATTAGCTATAA  50
      |||| |||||||||    ||| ||| |||||  ||||  ||||||  |||
seq2  CCAG-GATCATGTC----AGA-ATC-CAAGT--AATT--ATTAGC--TAA  37

seq1  ATGGTAGGTATAGTGGTGCCTGTTTTCTCAATACTTTGGAGGTGGAGGCA  100
      || ||| ||| ||||  |      ||||| ||||||  || || |||   
seq2  AT-GTA-GTA-AGTGTCG------TTCTC-ATACTT--GAAGT-GAG--C  72

seq1  AGAAAGATAAGGAGTTTAAGGTTTCTGGCTACATGGTCAATCCAAAATCA  150
      |||||||||  ||| |||||  |||| ||||||| ||| |||  ||||||
seq2  AGAAAGATA--GAG-TTAAG--TTCT-GCTACAT-GTC-ATC--AAATCA  112

seq1  GCTTGGGCTCCATGATACCCTGCCTCAATCTTTCTCCAACCCCTATAAAA  200
      |||  | || ||||||   ||| ||| ||| |||||  | ||||||||||
seq2  GCT--GACT-CATGAT---CTG-CTC-ATC-TTCTC--AACCCTATAAAA  151

seq1  TAAATTACAGGCAAATTTAAGTAATCCTCTCCCTTATCAAAGGATGAGTT  250
      |||  ||||| |||  |||||||    |||| | ||||||| |||||| |
seq2  TAA--TACAGCCAA--TTAAGTA----TCTCTCCTATCAAA-GATGAG-T  191

seq1  GAATTAAAAACATTTTAGATAGTTAACTCTATAGCTTATTTAATGCTTTA  300
      ||||  |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||
seq2  GAAT--AAAACA-TTTAGATAG-TAACTCTATAGC-TATTTAATGCTTTA  236

seq1  TTCAGTATACCATTTATAATAATTATATATAATATATCAGACACAGATAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGTATACCATTTATAATAATTATATATAATATATCAGACACAGATAC  286

seq1  ATAAGAATGACAAAGAGAAAAAAATCC-TTCCTATATGTTTCCTATCCCA  399
      ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGAATGACAAAGAGAAAAAAATCCTTTCCTATATGTTTCCTATCCCA  336

seq1  CTTGGCAAACATTGAGCCACAGTTTAAGCAGTCTTTATCTGTAGGCATTG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGGCAAACATTGAGCCACAGTTTAAGCAGTCTTTATCTGTAGGCATTG  386

seq1  GTATTATCAACCATCATTGAGGTAACTGTACATCTCTTTCACCACTTCCA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATTATCAACCATCATTGAGGTAACTGTACATCTCTTTCACCACTTCCA  436

seq1  TGATAGTCAGGAGAACTTGCTGGAGAGGAAGATGCCTGTCTTAAGTCTAG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATAGTCAGGAGAACTTGCTGGAGAGGAAGATGCCTGTCTTAAGTCTAG  486

seq1  AAAGTAAAACAGAGATGTTCAGGTTAAAGGACCACCGACAGTCTGGATGA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTAAAACAGAGATGTTCAGGTTAAAGGACCACCGACAGTCTGGATGA  536

seq1  GTTGAGGACAGGGAGAAGAGGAGTTGCAGATAGAACAGTGTTGTTAAAAT  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGAGGACAGGGAGAAGAGGAGTTGCAGATAGAACAGTGTTGTTAAAAT  586

seq1  CCCATCGACTGAGGCCATGGGCGTAGCATAAAGATAGGGATGTGCTGGAA  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATCGACTGAGGCCATGGGCGTAGCATAAAGATAGGGATGTGCTGGAA  636

seq1  ATGTTAACTGAGAAGGCCAGAGTAGCAATGCCTTACATTGACTTACATTA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTAACTGAGAAGGCCAGAGTAGCAATGCCTTACATTGACTTACATTA  686

seq1  AGTGAAGACCTTTTAATAAATAATTATTAGCTGAGCACCACTATGGACTA  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGAAGACCTTTTAATAAATAATTATTAGCTGAGCACCACTATGGACTA  736

seq1  GGCTCTGTTCAAGGTACTGGGCACAGAGTAGAGAGCACAATCTAAACTTC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTCTGTTCAAGGTACTGGGCACAGAGTAGAGAGCACAATCTAAACTTC  786

seq1  ATTGATTGAACACTTAAATGCTACAGCTTTCTACCTATTAAACTAATAAT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGATTGAACACTTAAATGCTACAGCTTTCTACCTATTAAACTAATAAT  836

seq1  TACACAGTTTACTGAATGCTTCTTTCCACCTGCCAGTCGCTCTGCTTGCA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACAGTTTACTGAATGCTTCTTTCCACCTGCCAGTCGCTCTGCTTGCA  886

seq1  TAATTTCACTTAATCCCCACAATTGGGAACAGTCACTTCTGAGCCTACAT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTTCACTTAATCCCCACAATTGGGAACAGTCACTTCTGAGCCTACAT  936

seq1  TAAAGAGCAGAGGCTCAAAGAGATTGAATCACTTCACCAAGATCCCATAG  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAGAGCAGAGGCTCAAAGAGATTGAATCACTTCACCAAGATCCCATAG  986

seq1  CTGGATATATTTAGAGGCTGGCAAAGATAGTCGATCTATCTTGCCTGAAC  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGATATATTTAGAGGCTGGCAAAGATAGTCGATCTATCTTGCCTGAAC  1036

seq1  TGGAGCCACACATCCTCAGTTGGAATTC  1127
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGCCACACATCCTCAGTTGGAATTC  1064