BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-049F21
Chromosome4 (Build37)
Map Location 137,123,674 - 137,266,147
singlet/doubletdoublet
Overlap geneHspg2, Ldlrad2, Usp48, Rap1gap
Upstream geneAof2, LOC667080, LOC433770, 4930549C01Rik, BC029684, Ephb2, C1qb, C1qc, C1qa, Epha8, Zbtb40, Wnt4, Cdc42, LOC665533, LOC242711, Ela3, 1700013G24Rik
Downstream geneAkp2, Ece1, LOC100040558, Eif4g3, Hp1bp3, Kif17, Ddost, Pink1, Cda, LOC625638, LOC625646, 0610009K11Rik, Camk2n1, LOC100040618, 4931403E03Rik
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-049F21.bB6Ng01-049F21.g
ACCDH873652DH873653
length7411,019
definitionDH873652|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-049F21, 5' end.DH873653|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-049F21, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(137,265,407 - 137,266,147)(137,123,674 - 137,124,701)
sequence
gaattcacccatgccacatacaggccagggctgggaggcaggcttcctgg
ctcattaatacctcccggcacccatctgtcccctcctccactctgcatgg
ggttcctgcagaggagcctaccaggactctgatgagctgggtgggtatgt
acatgtggggatggcctgctgggggaccctgggagcccagaagagttcat
agttagagaggaggcaggtgcctaacaactagtccttcaaggctctgcag
aggggacatccacctttagactaggcagtttggttctggggctccctggc
ccatccttacctgcatcttttcaatcatctcaaacagatctgtgttctgc
aacagagacgggagagcaaggtcagacccgagggaagcacggctcactct
gtcgagcccggcacgggctctaaccaccccagcttgcctgatcctctcat
gaggtaccaagagggtgcaaccaagactctgtgggaggggctttgtacaa
ctgaccctccagagtttggccatttgcctactgatgtgagcccagagcct
ggatctctggcagatgccccaactcagtttgctttctggaaggaggaggc
tgttgttagtctaggggaagagataccttcctctcccccaatgcaatgat
atcagctctgagattggcatatagagccccccgagagcccaccagaccca
gccctagagccaagccctaccaggcatgtaggggggggggg
gaattcaatacatcctaggtggcgggaggaagagaaggaaagaggcgtgc
agcaagcccttcccccaccccttttaaagtaaaactgtgggtaatgaggt
ggcttagcatgtaagagcacttgctacatacaccagtgacctgaggttaa
tccctggaacccactgtagaaggagagaaacaacccccaaaagttgtcat
ctgatctacacatgaatttgcgcgtgcggcacgcgcgtacacacatacac
acacacacacaatatcatgagcattcccacactcacatgcccatcgtgta
cacaacacatggtaattagctacgatggacttagagagtcacactccctg
tctccctccctcctacagatgcccctgggcaatacggagcctacttttat
gacaatggcttcctaggcctccctggtaacagtttctcaaggaggtaaga
tgggtgttagttgactctctgggcctggcagggttaaccggagtgtgaga
cgcagatttccccacccactgcttcctgctccctcttcccagcctgcctg
aagtacccgagacaattgaattcgaggttcggaccagcacagccgatggc
ctcctgctctggcagggtgtggtgagtgggaatctctgagggtcctgggg
cttctggggtagaaactggcctacactggtcaggaaagtgtagagagagg
actgctgaggctgcagccctcagggtcttcagcgctccagtgagggacac
ctagagacccaattttccttggcaggtgagagaggccagccgcagcaagg
acttcattagccttggataacaggatggcatctagttgttcaggtgagtc
ccagcacctccatccccctcttccaaccctggcttctcccctgggaagct
gcagtccaggtgccccagctacacacccgggatcattctgccctttatac
atctgtctcaacgtcaatccacacatggtggatctatgtacttcagctac
aactggcagtggggaggcc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_137265407_137266147
seq2: B6Ng01-049F21.b_46_786 (reverse)

seq1  CCCCCCCCCCCTACATGCCTGGTAGGGCTTGGCTCTAGGGCTGGGTCTGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCCCCCCCCTACATGCCTGGTAGGGCTTGGCTCTAGGGCTGGGTCTGG  50

seq1  TGGGCTCTCGGGGGGCTCTATATGCCAATCTCAGAGCTGATATCATTGCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGCTCTCGGGGGGCTCTATATGCCAATCTCAGAGCTGATATCATTGCA  100

seq1  TTGGGGGAGAGGAAGGTATCTCTTCCCCTAGACTAACAACAGCCTCCTCC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGGGGAGAGGAAGGTATCTCTTCCCCTAGACTAACAACAGCCTCCTCC  150

seq1  TTCCAGAAAGCAAACTGAGTTGGGGCATCTGCCAGAGATCCAGGCTCTGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGAAAGCAAACTGAGTTGGGGCATCTGCCAGAGATCCAGGCTCTGG  200

seq1  GCTCACATCAGTAGGCAAATGGCCAAACTCTGGAGGGTCAGTTGTACAAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTCACATCAGTAGGCAAATGGCCAAACTCTGGAGGGTCAGTTGTACAAA  250

seq1  GCCCCTCCCACAGAGTCTTGGTTGCACCCTCTTGGTACCTCATGAGAGGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCCCTCCCACAGAGTCTTGGTTGCACCCTCTTGGTACCTCATGAGAGGA  300

seq1  TCAGGCAAGCTGGGGTGGTTAGAGCCCGTGCCGGGCTCGACAGAGTGAGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGGCAAGCTGGGGTGGTTAGAGCCCGTGCCGGGCTCGACAGAGTGAGC  350

seq1  CGTGCTTCCCTCGGGTCTGACCTTGCTCTCCCGTCTCTGTTGCAGAACAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTGCTTCCCTCGGGTCTGACCTTGCTCTCCCGTCTCTGTTGCAGAACAC  400

seq1  AGATCTGTTTGAGATGATTGAAAAGATGCAGGTAAGGATGGGCCAGGGAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATCTGTTTGAGATGATTGAAAAGATGCAGGTAAGGATGGGCCAGGGAG  450

seq1  CCCCAGAACCAAACTGCCTAGTCTAAAGGTGGATGTCCCCTCTGCAGAGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCCAGAACCAAACTGCCTAGTCTAAAGGTGGATGTCCCCTCTGCAGAGC  500

seq1  CTTGAAGGACTAGTTGTTAGGCACCTGCCTCCTCTCTAACTATGAACTCT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGAAGGACTAGTTGTTAGGCACCTGCCTCCTCTCTAACTATGAACTCT  550

seq1  TCTGGGCTCCCAGGGTCCCCCAGCAGGCCATCCCCACATGTACATACCCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGGCTCCCAGGGTCCCCCAGCAGGCCATCCCCACATGTACATACCCA  600

seq1  CCCAGCTCATCAGAGTCCTGGTAGGCTCCTCTGCAGGAACCCCATGCAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGCTCATCAGAGTCCTGGTAGGCTCCTCTGCAGGAACCCCATGCAGA  650

seq1  GTGGAGGAGGGGACAGATGGGTGCCGGGAGGTATTAATGAGCCAGGAAGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGGAGGAGGGGACAGATGGGTGCCGGGAGGTATTAATGAGCCAGGAAGC  700

seq1  CTGCCTCCCAGCCCTGGCCTGTATGTGGCATGGGTGAATTC  741
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCTCCCAGCCCTGGCCTGTATGTGGCATGGGTGAATTC  741

seq1: chr4_137123674_137124701
seq2: B6Ng01-049F21.g_67_1085

seq1  GAATTCAATACATCCTAGGTGGCGGGAGGAAGAGAAGGAAAGAGGCGTGC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATACATCCTAGGTGGCGGGAGGAAGAGAAGGAAAGAGGCGTGC  50

seq1  AGCAAGCCCTTCCCCCACCCCTTTTAAAGTAAAACTGTGGGTAATGAGGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAGCCCTTCCCCCACCCCTTTTAAAGTAAAACTGTGGGTAATGAGGT  100

seq1  GGCTTAGCATGTAAGAGCACTTGCTACATACACCAGTGACCTGAGGTTAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTAGCATGTAAGAGCACTTGCTACATACACCAGTGACCTGAGGTTAA  150

seq1  TCCCTGGAACCCACTGTAGAAGGAGAGAAACAACCCCCAAAAGTTGTCAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTGGAACCCACTGTAGAAGGAGAGAAACAACCCCCAAAAGTTGTCAT  200

seq1  CTGATCTACACATGAATTTGCGCGTGCGGCACGCGCGTACACACATACAC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATCTACACATGAATTTGCGCGTGCGGCACGCGCGTACACACATACAC  250

seq1  ACACACACACAATATCATGAGCATTCCCACACTCACATGCCCATCGTGTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACAATATCATGAGCATTCCCACACTCACATGCCCATCGTGTA  300

seq1  CACAACACATGGTAATTAGCTACGATGGACTTAGAGAGTCACACTCCCTG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACAACACATGGTAATTAGCTACGATGGACTTAGAGAGTCACACTCCCTG  350

seq1  TCTCCCTCCCTCCTACAGATGCCCCTGGGCAATACGGAGCCTACTTTTAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCCTCCCTCCTACAGATGCCCCTGGGCAATACGGAGCCTACTTTTAT  400

seq1  GACAATGGCTTCCTAGGCCTCCCTGGTAACAGTTTCTCAAGGAGGTAAGA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACAATGGCTTCCTAGGCCTCCCTGGTAACAGTTTCTCAAGGAGGTAAGA  450

seq1  TGGGTGTTAGTTGACTCTCTGGGCCTGGCAGGGTTAACCGGAGTGTGAGA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGGTGTTAGTTGACTCTCTGGGCCTGGCAGGGTTAACCGGAGTGTGAGA  500

seq1  CGCAGATTTCCCCACCCACTGCTTCCTGCTCCCTCTTCCCAGCCTGCCTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGCAGATTTCCCCACCCACTGCTTCCTGCTCCCTCTTCCCAGCCTGCCTG  550

seq1  AAGTACCCGAGACAATTGAATTCGAGGTTCGGACCAGCACAGCCGATGGC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTACCCGAGACAATTGAATTCGAGGTTCGGACCAGCACAGCCGATGGC  600

seq1  CTCCTGCTCTGGCAGGGTGTGGTGAGTGGGAATCTCTGAGGGTCCTGGGG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCCTGCTCTGGCAGGGTGTGGTGAGTGGGAATCTCTGAGGGTCCTGGGG  650

seq1  CTTCTGGGGTTAGAAACTGGCCTACACTGGTCAGGAAAGTGTAGAGAGAG  700
      ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTGGGG-TAGAAACTGGCCTACACTGGTCAGGAAAGTGTAGAGAGAG  699

seq1  GACTGCTGAGGCTGCAGCCCTCAGGGTC-TCAGCGCTCCAGTGAGGGACA  749
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||
seq2  GACTGCTGAGGCTGCAGCCCTCAGGGTCTTCAGCGCTCCAGTGAGGGACA  749

seq1  CCTAGAGACCCCATGTTTCCTTGGCAGGTGAGAGAGGCCAGCCGCAGCAA  799
      ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGAGACCCAAT-TTTCCTTGGCAGGTGAGAGAGGCCAGCCGCAGCAA  798

seq1  GGACTTCATTAGCCTTGGACTACAGGATGGCCATCTAG-TGTTCAGGTGA  848
      |||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||
seq2  GGACTTCATTAGCCTTGGATAACAGGATGG-CATCTAGTTGTTCAGGTGA  847

seq1  GTCCCAGCACCTCCATCCCCCTCTTCCAACCCTGGCTTCTCCCCTGGGAA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCCCAGCACCTCCATCCCCCTCTTCCAACCCTGGCTTCTCCCCTGGGAA  897

seq1  GCTGCAGGTCCAGGTGCCCCAGCTACACACCCCGGTATCA-TCTGCACCT  947
      |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| |||
seq2  GCTGCA-GTCCAGGTGCCCCAGCTACACA-CCCGGGATCATTCTGC-CCT  944

seq1  TTATACATCCTGTCTCACCGTCAAATTCACACCATTGTGGATCTATGTTA  997
      |||||||| |||||||| |||| ||| |||| ||| ||||||||||| ||
seq2  TTATACAT-CTGTCTCAACGTC-AATCCACA-CATGGTGGATCTATG-TA  990

seq1  CTCCAGCTACCAACTGGGCAGTGGGGAGGCC  1028
      || |||||| ||||| |||||||||||||||
seq2  CTTCAGCTA-CAACT-GGCAGTGGGGAGGCC  1019