BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-050P15
Chromosome4 (Build37)
Map Location 104,501,644 - 104,646,888
singlet/doubletdoublet
Overlap geneC8a, 1700024P16Rik
Upstream geneLOC622315, Dab1, C8b
Downstream genePrkaa2, LOC100039513, Ppap2b, LOC433742, LOC665518, LOC434381, Ppia-ps4_954.1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-050P15.bB6Ng01-050P15.g
ACCDH874756DH874757
length1,120620
definitionDH874756|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-050P15, 5' end.DH874757|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-050P15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(104,645,763 - 104,646,888)(104,501,644 - 104,502,263)
sequence
gaattcaattgaaaggcttacaaagattcagcccagccctgcttgttaat
tcctagaaaactaaattagtctgtattaaaagtacctccataacaaaaga
atttattccacaatcacaagaatgtctcaactgtagagaatttatcctgc
caatcaatcacggttttaatggaaaaaaatcaaatgttaaatgcacaaaa
gcattttgtggggttaaattttcttaactagattgatctccagtaaataa
atgccatagttaatgacaaagtgcaaaaaaaaagtgctaatatctgtata
aattctatcagaaacttcatcaatagaaaagggctagctcatggaaagct
ggaccgacccattagtcaccacagaaaagtcaagcacacacaaaactggg
tctttaacctcacagtgagcagaaaaatggaaaggagagcaatttagttc
acgccctagggtctgcatgaatctcagcttgaggacggcaccgtgatcag
tgggaaaatgagaagtagtgaatccctacattgtttgggaaagacttggc
agcaccaatatgggagataatatgtcaaaatcttgcaaagccgaacttgt
ttaattgctattgatttgcaaatctctggtaattattattctttggtaaa
tgagtgactttggagaactcccttggatcaaccacatatgtgagattttc
aagcagcttagctgctccacagtgaggaacacataagcaaatggcatgtt
cgtttgataggctacagcacagcagtccaactccacacacctgccaacat
ctgcttagaaaaccattcttctaaacacaagctgtggaaaggtagagtaa
cctgctttttataaaaaaaaaaaaaaaaaaaccttgacgttctattttta
acaagcaagtggacttgtcactctaacataggaaaagtctgtctggacac
ccccctaaatccataagaggtgctggctctagaggtgagaagtacagctg
agtagggagcaaagaggcaccctcacgtcatttgtgaggagaatagaggg
acatccgcccaggcaatccttccaccttccacatacaggaagcctcaatt
tagaaggcatgtttctttcc
gaattcttcagcgaacagtggagtgctactgaactcttcagagcactgcc
tgatgcatccgggctgaagagcgctgcggagcaactgtgctcttaaacga
tctgcaggcccagtgccagaaagtgcttgcagaagagaattctagcttgg
tttgagccatgacacttgtctgcagtggctttgctttctgaggggcccaa
aataagatactagccagtaagggaggaccatgactcagagaatcatagat
tctgagagctgaagagccttcagacacccagcacacacttctaatttaca
gtcaggatgaatatggttcatagaggtgaattgtctcacctgaggccatg
aggctgaagtcagggaagctgagattcacgtgaatgactgtctgactcag
aagcctgcagcatcttccccatcctcagttattgtatcagactaaagcat
cctgtcctctgagagaaatagatgtagtaggcacctgctgtgtactatcc
tggcccatcatgtgctggcaatgtaactatcttgggttaaaactcttgtg
cgtcagatgtgactctgattaactagtccttataaggttagtgtgtgtgt
gtgtgtgtgtgtgtgtgtgt
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_104645763_104646888
seq2: B6Ng01-050P15.b_43_1162 (reverse)

seq1  GGAAAAGGAAACATGCATCCTAAAATGTGAGGCCCTCCTGTATGTGG-AG  49
      |||||  ||||||||| | |||||   ||||| | |||||||||||| ||
seq2  GGAAA--GAAACATGCCTTCTAAA--TTGAGG-CTTCCTGTATGTGGAAG  45

seq1  GTGGAAGGATTGCCTGGGGCGATGTCCCCTCTAGTCTCCTCACATATGAC  99
      ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| |||||
seq2  GTGGAAGGATTGCCTGGGCGGATGT-CCCTCTATTCTCCTCACAAATGAC  94

seq1  GTGAGGGTGCCTCCTTTGGCTCCCTACTCAGCTGTACTTCTCACCTCTAG  149
      |||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGAGGGTGCCTC--TTTGCTCCCTACTCAGCTGTACTTCTCACCTCTAG  142

seq1  AGCCAGCACCTCTTATGGATTTAGGGGGGTGTCCAGACAGACTTTTCCTA  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCAGCACCTCTTATGGATTTAGGGGGGTGTCCAGACAGACTTTTCCTA  192

seq1  TGTTAGAGTGACAAGTCCACTTGCTTGTTAAAAATAGAACGTCAAGGTTT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTAGAGTGACAAGTCCACTTGCTTGTTAAAAATAGAACGTCAAGGTTT  242

seq1  TTTTTTTTTTTTTTTTATAAAAAGCAGGTTACTCTACC-TTCCACAGCTT  298
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||
seq2  TTTTTTTTTTTTTTTTATAAAAAGCAGGTTACTCTACCTTTCCACAGCTT  292

seq1  GTGTTTAGAAGAATGGTTTTCTAAGCAGATGTTGGCAGGTGTGTGGAGTT  348
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTTAGAAGAATGGTTTTCTAAGCAGATGTTGGCAGGTGTGTGGAGTT  342

seq1  GGACTGCTGTGCTGTAGCCTATCAAACGAACATGCCATTTGCTTATGTGT  398
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGACTGCTGTGCTGTAGCCTATCAAACGAACATGCCATTTGCTTATGTGT  392

seq1  TCCTCACTGTGGAGCAGCTAAGCTGCTTGAAAATCTCACATATGTGGTTG  448
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCACTGTGGAGCAGCTAAGCTGCTTGAAAATCTCACATATGTGGTTG  442

seq1  ATCCAAGGGAGTTCTCCAAAGTCACTCATTTACCAAAGAATAATAATTAC  498
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCCAAGGGAGTTCTCCAAAGTCACTCATTTACCAAAGAATAATAATTAC  492

seq1  CAGAGATTTGCAAATCAATAGCAATTAAACAAGTTCGGCTTTGCAAGATT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGATTTGCAAATCAATAGCAATTAAACAAGTTCGGCTTTGCAAGATT  542

seq1  TTGACATATTATCTCCCATATTGGTGCTGCCAAGTCTTTCCCAAACAATG  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGACATATTATCTCCCATATTGGTGCTGCCAAGTCTTTCCCAAACAATG  592

seq1  TAGGGATTCACTACTTCTCATTTTCCCACTGATCACGGTGCCGTCCTCAA  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGGATTCACTACTTCTCATTTTCCCACTGATCACGGTGCCGTCCTCAA  642

seq1  GCTGAGATTCATGCAGACCCTAGGGCGTGAACTAAATTGCTCTCCTTTCC  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAGATTCATGCAGACCCTAGGGCGTGAACTAAATTGCTCTCCTTTCC  692

seq1  ATTTTTCTGCTCACTGTGAGGTTAAAGACCCAGTTTTGTGTGTGCTTGAC  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTTTCTGCTCACTGTGAGGTTAAAGACCCAGTTTTGTGTGTGCTTGAC  742

seq1  TTTTCTGTGGTGACTAATGGGTCGGTCCAGCTTTCCATGAGCTAGCCCTT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTGTGGTGACTAATGGGTCGGTCCAGCTTTCCATGAGCTAGCCCTT  792

seq1  TTCTATTGATGAAGTTTCTGATAGAATTTATACAGATATTAGCACTTTTT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTATTGATGAAGTTTCTGATAGAATTTATACAGATATTAGCACTTTTT  842

seq1  TTTTGCACTTTGTCATTAACTATGGCATTTATTTACTGGAGATCAATCTA  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTGCACTTTGTCATTAACTATGGCATTTATTTACTGGAGATCAATCTA  892

seq1  GTTAAGAAAATTTAACCCCACAAAATGCTTTTGTGCATTTAACATTTGAT  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAAGAAAATTTAACCCCACAAAATGCTTTTGTGCATTTAACATTTGAT  942

seq1  TTTTTTCCATTAAAACCGTGATTGATTGGCAGGATAAATTCTCTACAGTT  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTTCCATTAAAACCGTGATTGATTGGCAGGATAAATTCTCTACAGTT  992

seq1  GAGACATTCTTGTGATTGTGGAATAAATTCTTTTGTTATGGAGGTACTTT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGACATTCTTGTGATTGTGGAATAAATTCTTTTGTTATGGAGGTACTTT  1042

seq1  TAATACAGACTAATTTAGTTTTCTAGGAATTAACAAGCAGGGCTGGGCTG  1098
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATACAGACTAATTTAGTTTTCTAGGAATTAACAAGCAGGGCTGGGCTG  1092

seq1  AATCTTTGTAAGCCTTTCAATTGAATTC  1126
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCTTTGTAAGCCTTTCAATTGAATTC  1120

seq1: chr4_104501644_104502263
seq2: B6Ng01-050P15.g_66_685

seq1  GAATTCTTCAGCGAACAGTGGAGTGCTACTGAACTCTTCAGAGCACTGCC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTCAGCGAACAGTGGAGTGCTACTGAACTCTTCAGAGCACTGCC  50

seq1  TGATGCATCCGGGCTGAAGAGCGCTGCGGAGCAACTGTGCTCTTAAACGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGCATCCGGGCTGAAGAGCGCTGCGGAGCAACTGTGCTCTTAAACGA  100

seq1  TCTGCAGGCCCAGTGCCAGAAAGTGCTTGCAGAAGAGAATTCTAGCTTGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCAGGCCCAGTGCCAGAAAGTGCTTGCAGAAGAGAATTCTAGCTTGG  150

seq1  TTTGAGCCATGACACTTGTCTGCAGTGGCTTTGCTTTCTGAGGGGCCCAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAGCCATGACACTTGTCTGCAGTGGCTTTGCTTTCTGAGGGGCCCAA  200

seq1  AATAAGATACTAGCCAGTAAGGGAGGACCATGACTCAGAGAATCATAGAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAAGATACTAGCCAGTAAGGGAGGACCATGACTCAGAGAATCATAGAT  250

seq1  TCTGAGAGCTGAAGAGCCTTCAGACACCCAGCACACACTTCTAATTTACA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGAGAGCTGAAGAGCCTTCAGACACCCAGCACACACTTCTAATTTACA  300

seq1  GTCAGGATGAATATGGTTCATAGAGGTGAATTGTCTCACCTGAGGCCATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGGATGAATATGGTTCATAGAGGTGAATTGTCTCACCTGAGGCCATG  350

seq1  AGGCTGAAGTCAGGGAAGCTGAGATTCACGTGAATGACTGTCTGACTCAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGCTGAAGTCAGGGAAGCTGAGATTCACGTGAATGACTGTCTGACTCAG  400

seq1  AAGCCTGCAGCATCTTCCCCATCCTCAGTTATTGTATCAGACTAAAGCAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCTGCAGCATCTTCCCCATCCTCAGTTATTGTATCAGACTAAAGCAT  450

seq1  CCTGTCCTCTGAGAGAAATAGATGTAGTAGGCACCTGCTGTGTACTATCC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGTCCTCTGAGAGAAATAGATGTAGTAGGCACCTGCTGTGTACTATCC  500

seq1  TGGCCCATCATGTGCTGGCAATGTAACTATCTTGGGTTAAAACTCTTGTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGCCCATCATGTGCTGGCAATGTAACTATCTTGGGTTAAAACTCTTGTG  550

seq1  CGTCAGATGTGACTCTGATTAACTAGTCCTTATAAGGTTAGTGTGTGTGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTCAGATGTGACTCTGATTAACTAGTCCTTATAAGGTTAGTGTGTGTGT  600

seq1  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  620
      ||||||||||||||||||||
seq2  GTGTGTGTGTGTGTGTGTGT  620