BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-051G11
Chromosome4 (Build37)
Map Location 108,573,652 - 108,755,734
singlet/doubletdoublet
Overlap geneRab3b, Nrd1, Osbpl9
Upstream geneCpt2, Slc1a7, Podn, Scp2, Echdc2, Zyg11a, Zyg11b, LOC100040252, 2010305A19Rik, LOC545667, Gpx7, LOC665728, Zcchc11, LOC100040110, Prpf38a, Orc1l, Cc2d1b, Zfyve9, LOC100040326, 3110021N24Rik, Btf3l4, Txndc12, Kti12
Downstream geneCalr4, Eps15, LOC666144, 4922503N01Rik, Rnf11, 4930522H14Rik, Cdkn2c, LOC100040307, Faf1, Dmrta2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-051G11.bB6Ng01-051G11.g
ACCDH875055DH875056
length968990
definitionDH875055|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-051G11, 5' end.DH875056|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-051G11, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(108,754,765 - 108,755,734)(108,573,652 - 108,574,639)
sequence
gaattccatcaaagtggctcgtccccaaagcgcttaatagagtaagtatg
tgaataatgtacgtattcaaattttaaaggatgtggtcttcagaccgctg
ttagtgagacacttgcctcatgaaggcttattcagcagttagttctgtca
cagttttgacttgtactcctgacttaatagtacaaacttaataaatagca
tcaggtttggtaatgtgccggcaatgttagattagctctgtatgtttctg
tagtggccctgccatcagaaaagagtcacatctcatatgtttgtatagga
atatatctaacaactaaaaactggaattttattgggtggaggaatggcat
ggtgtcttagtcgttttgggtgattgtagactggaagcttataaataaaa
ggattttatttctcatagtgcagtccaaaatctggttgctggcagatttg
ttttgtgctaggaggcttgctttctgttgcacaggtaacaccatctggta
atgttctcttgtggtggaaggcacagcagagctctggagcttctaatctg
tgtcccagagttattatctcctgacctcttagtactgccccactggcaac
tcaaggttcagcgttagaatttagaagcaaggttggaaagggatctcggg
agttaaaagcactggctgctcttccagaggatctaggtttgattcccagc
acccacatggcagcttacatctgcctgtaacttcacttccagggaattca
gtgctgccttctgctcagtagggtaatgcatacatgtagacacacaagct
tacacagccatatataactacataaaatgttcacaccgtggcatgcatta
tggttatatataggaaaccatggggcacattcatgtgctgggctagggaa
ggcttcccagaggagagattgaatgtgatctgaggtgaagttagagagca
tactgggtatgagaagag
gaattctaggggggagggcataggggacttttggaatagcatttgaaatg
taaatgaagaaaatatctaataaaaaaatttaaaaaataagataaaaaag
aaaacttgaaaaagaaaaagaaagaattctatttattctgtagccactgt
ctatttgcaggggctttttctgcctttccccctgtgtaatcttgtgcatc
atgcataggaaagataaagaaacagaagggagttcaccaaattacacaga
aattaataaatgacacagctgcggttcaaagttagagctgtctattccca
aaacctgtggtcttttcacacccaactcttcattgtgtagtgagacctca
gggacctcacaggagactgagagacactgccacggctaaattatggaacc
tctaagaaaatgctcccaggagagggcacactgcccatcccatcttccca
tctgtcagcttttcagctcccctgtctactagcctcctgtgctcctacaa
cgtcacaggtgactctagtgcacaccactggctgagcaatctggtgtgta
ggtatatattaatcaagttagcacttgatacagtagccttaagacagtgg
ttcttgtgctgggtgtggtggtgcacgcctttaatcccagtactcgggga
ggcagaggcaggtggatttctgagtttgaagccagcctggataacagagt
gagttccaggacagagtggttctcaaccttcctaatgctgtgacccttta
atacagttcctcatgttgtggtgatcccccacccccaaccataaaattat
ttcattgcatacttcataactgtaatttttgctactgttatgaattgcaa
tgttaataatctgatttgtagttatacctgaatatgatacgcctgtgaaa
gggtatttcaacccccaagggttttgctatccacatgttgagaatgctac
tctaaaaattgctgaatgtttgccgtaagatgagcaatag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_108754765_108755734
seq2: B6Ng01-051G11.b_45_1012 (reverse)

seq1  CTCTTCTCATCCCAGGTCTGCTCTCTATACTTCACCTCAGAATCACATTC  50
      |||||||||| ||  || ||||||||| |||||||||||| |||||||||
seq2  CTCTTCTCATACCCAGTATGCTCTCTA-ACTTCACCTCAG-ATCACATTC  48

seq1  ACTCTCTCCTCTGGGAAGCCTTCCCTAGCCCAGCACCTGAATGTGCCCCA  100
      | |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  AATCTCTCCTCTGGGAAGCCTTCCCTAGCCCAGCACATGAATGTGCCCCA  98

seq1  TGGTTTCCTATATATAACCATAATGCATGCCACGGTGTGAACA-TTTATG  149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  TGGTTTCCTATATATAACCATAATGCATGCCACGGTGTGAACATTTTATG  148

seq1  TAGTTATATATGGCTGTGTAAGCTTGTGTGTCCTACATGTATGCATTACC  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  TAGTTATATATGGCTGTGTAAGCTTGTGTGT-CTACATGTATGCATTACC  197

seq1  CTACTGAGCAGAAGGCAGCACTGAATTCCCTGGAAGTGAAGTTACAGGCA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACTGAGCAGAAGGCAGCACTGAATTCCCTGGAAGTGAAGTTACAGGCA  247

seq1  GATGTAAGCTGCCATGTGGGTGCTGGGAATCAAACCTAGATCCTCTGGAA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTAAGCTGCCATGTGGGTGCTGGGAATCAAACCTAGATCCTCTGGAA  297

seq1  GAGCAGCCAGTGCTTTTAACTCCCGAGATCCCTTTCCAACCTTGCTTCTA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCAGCCAGTGCTTTTAACTCCCGAGATCCCTTTCCAACCTTGCTTCTA  347

seq1  AATTCTAACGCTGAACCTTGAGTTGCCAGTGGGGCAGTACTAAGAGGTCA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCTAACGCTGAACCTTGAGTTGCCAGTGGGGCAGTACTAAGAGGTCA  397

seq1  GGAGATAATAACTCTGGGACACAGATTAGAAGCTCCAGAGCTCTGCTGTG  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGATAATAACTCTGGGACACAGATTAGAAGCTCCAGAGCTCTGCTGTG  447

seq1  CCTTCCACCACAAGAGAACATTACCAGATGGTGTTACCTGTGCAACAGAA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTCCACCACAAGAGAACATTACCAGATGGTGTTACCTGTGCAACAGAA  497

seq1  AGCAAGCCTCCTAGCACAAAACAAATCTGCCAGCAACCAGATTTTGGACT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAGCCTCCTAGCACAAAACAAATCTGCCAGCAACCAGATTTTGGACT  547

seq1  GCACTATGAGAAATAAAATCCTTTTATTTATAAGCTTCCAGTCTACAATC  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTATGAGAAATAAAATCCTTTTATTTATAAGCTTCCAGTCTACAATC  597

seq1  ACCCAAAACGACTAAGACACCATGCCATTCCTCCACCCAATAAAATTCCA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCAAAACGACTAAGACACCATGCCATTCCTCCACCCAATAAAATTCCA  647

seq1  GTTTTTAGTTGTTAGATATATTCCTATACAAACATATGAGATGTGACTCT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTTTAGTTGTTAGATATATTCCTATACAAACATATGAGATGTGACTCT  697

seq1  TTTCTGATGGCAGGGCCACTACAGAAACATACAGAGCTAATCTAACATTG  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTGATGGCAGGGCCACTACAGAAACATACAGAGCTAATCTAACATTG  747

seq1  CCGGCACATTACCAAACCTGATGCTATTTATTAAGTTTGTACTATTAAGT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCGGCACATTACCAAACCTGATGCTATTTATTAAGTTTGTACTATTAAGT  797

seq1  CAGGAGTACAAGTCAAAACTGTGACAGAACTAACTGCTGAATAAGCCTTC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGAGTACAAGTCAAAACTGTGACAGAACTAACTGCTGAATAAGCCTTC  847

seq1  ATGAGGCAAGTGTCTCACTAACAGCGGTCTGAAGACCACATCCTTTAAAA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGGCAAGTGTCTCACTAACAGCGGTCTGAAGACCACATCCTTTAAAA  897

seq1  TTTGAATACGTACATTATTCACATACTTACTCTATTAAGCGCTTTGGGGA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGAATACGTACATTATTCACATACTTACTCTATTAAGCGCTTTGGGGA  947

seq1  CGAGCCACTTTGATGGAATTC  970
      |||||||||||||||||||||
seq2  CGAGCCACTTTGATGGAATTC  968

seq1: chr4_108573652_108574639
seq2: B6Ng01-051G11.g_67_1056

seq1  GAATTCTAGGGGGGAGGGCATAGGGGACTTTTGGAATAGCATTTGAAATG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTAGGGGGGAGGGCATAGGGGACTTTTGGAATAGCATTTGAAATG  50

seq1  TAAATGAAGAAAATATCTAATAAAAAAATTTAAAAAATAAGATAAAAAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAATGAAGAAAATATCTAATAAAAAAATTTAAAAAATAAGATAAAAAAG  100

seq1  AAAACTTGAAAAAGAAAAAGAAAGAATTCTATTTATTCTGTAGCCACTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAACTTGAAAAAGAAAAAGAAAGAATTCTATTTATTCTGTAGCCACTGT  150

seq1  CTATTTGCAGGGGCTTTTTCTGCCTTTCCCCCTGTGTAATCTTGTGCATC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTTGCAGGGGCTTTTTCTGCCTTTCCCCCTGTGTAATCTTGTGCATC  200

seq1  ATGCATAGGAAAGATAAAGAAACAGAAGGGAGTTCACCAAATTACACAGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCATAGGAAAGATAAAGAAACAGAAGGGAGTTCACCAAATTACACAGA  250

seq1  AATTAATAAATGACACAGCTGCGGTTCAAAGTTAGAGCTGTCTATTCCCA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTAATAAATGACACAGCTGCGGTTCAAAGTTAGAGCTGTCTATTCCCA  300

seq1  AAACCTGTGGTCTTTTCACACCCAACTCTTCATTGTGTAGTGAGACCTCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACCTGTGGTCTTTTCACACCCAACTCTTCATTGTGTAGTGAGACCTCA  350

seq1  GGGACCTCACAGGAGACTGAGAGACACTGCCACGGCTAAATTATGGAACC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACCTCACAGGAGACTGAGAGACACTGCCACGGCTAAATTATGGAACC  400

seq1  TCTAAGAAAATGCTCCCAGGAGAGGGCACACTGCCCATCCCATCTTCCCA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAAGAAAATGCTCCCAGGAGAGGGCACACTGCCCATCCCATCTTCCCA  450

seq1  TCTGTCAGCTTTTCAGCTCCCCTGTCTACTAGCCTCCTGTGCTCCTACAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTCAGCTTTTCAGCTCCCCTGTCTACTAGCCTCCTGTGCTCCTACAA  500

seq1  CGTCACAGGTGACTCTAGTGCACACCACTGGCTGAGCAATCTGGTGTGTA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTCACAGGTGACTCTAGTGCACACCACTGGCTGAGCAATCTGGTGTGTA  550

seq1  GGTATATATTAATCAAGTTAGCACTTGATACAGTAGCCTTAAGACAGTGG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTATATATTAATCAAGTTAGCACTTGATACAGTAGCCTTAAGACAGTGG  600

seq1  TTCTTGTGCTGGGTGTGGTGGTGCACGCCTTTAATCCCAGTACTC-GGGA  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  TTCTTGTGCTGGGTGTGGTGGTGCACGCCTTTAATCCCAGTACTCGGGGA  650

seq1  GGCAGAGGCAGGTGGATTTCTGAGTTTGAAGCCAGCCTGGATAACAGAGT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAGAGGCAGGTGGATTTCTGAGTTTGAAGCCAGCCTGGATAACAGAGT  700

seq1  GAGTTCCAGGACAGAGTGGTTCTCAACCTTCCTAATGCTGTGACCCTTTA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTCCAGGACAGAGTGGTTCTCAACCTTCCTAATGCTGTGACCCTTTA  750

seq1  ATACAGTTCCTCATGTTGTGGTGATCCCCCACCCCCAACCATAAAATTAT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  ATACAGTTCCTCATGTTGTGGTGATCCCCCACCCCCAACCATAAAATTA-  799

seq1  TTTCATTGCATACTTCATAACTGTAA-TTTTGCTACTGTTATGAATTGCA  848
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCATTGCATACTTCATAACTGTAATTTTTGCTACTGTTATGAATTGCA  849

seq1  ATGTTAAT-ATCTGATTTGTAG-TATACCTG-ATATGATACGCCTGTGAA  895
      |||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||
seq2  ATGTTAATAATCTGATTTGTAGTTATACCTGAATATGATACGCCTGTGAA  899

seq1  AGGGTAATTCAACCCCCAAAGGGTTTGCAATCCACATGTTGAGAAATGCT  945
      |||||| |||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||
seq2  AGGGTATTTCAACCCCCAAGGGTTTTGCTATCCACATGTTGAG-AATGCT  948

seq1  ACTCTAAGAAATTGCTGAATGTTTGGCGTAAGATGAGCAAGAG  988
      ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||
seq2  ACTCTAA-AAATTGCTGAATGTTTGCCGTAAGATGAGCAATAG  990