BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-051K19
Chromosome4 (Build37)
Map Location 85,223,999 - 85,352,453
singlet/doubletdoublet
Overlap geneA930009N24
Upstream geneLOC100040660, LOC624465, LOC100040284, D530005L17Rik, LOC622811, LOC100040303, Sh3gl2
Downstream geneLOC668052, Adamtsl1, 4930500O09Rik, Rraga, 6230416J20Rik, LOC100040388, Adfp
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-051K19.bB6Ng01-051K19.g
ACCDH875244DH875245
length1,0801,104
definitionDH875244|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-051K19, 5' end.DH875245|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-051K19, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(85,351,367 - 85,352,453)(85,223,999 - 85,225,097)
sequence
gaattcaattttgcaatcattaaagaagtaaaatccataacttgaaaggc
tgtgagaatatagactggccaataattgtgtgaagttctgaaaagctcta
gagatgtgtgtggctttgctctctctttccaggccattcttttaggatgc
cgtcaaaataattatggccaagtcatggttatccttagggatcaggtcct
atcacaaagacagcaaattagagctaagaggaaaccctgcaagtatgtag
tgcagtctggcttcagtgttcaggtgagacagtcagcattgaggagggga
atgcactaatccaaacgcctcacgagggatagaggctatcttagtaccat
aacccttctccctgttcattctctctttccacaagcagcttatttattta
tcttagcatacaagattgccctcttttaccacaaagtcaattttttatga
agtcaacactagtcatgctttaaaatttttgacatacatttttttgtgtg
tacattcttggtacaaaggcgcaggtaagtaataacggcaaacaggtgcg
ggggacataaaaaggcacgtagaatatgagtaattcaatataggatcccg
agagtctagccaactgtggtttggttcctaaaagagacaatttcatacct
gtaccatggccacctgcaggtcacagaaaatataggcagcaacagacagt
aggcaggagagagaaaatgctgacagagaacagagactgcaggcactgta
gcatcaagttcacggcttcctgtgcaggatgcagtggctccttggacttc
atctttctgtttggatgacaagtccaccagtgggaggacgtttacataac
cagcgagggaagaaatggcagtcccagcactgtctgtgggctagcatcta
tgagcacctgaaaagggattggagtggggaaagggagacagtccatacct
ctgtcggagtctgagcgagggcagagtactgaaccttctaggaaatgcca
tttcaattacttggagattccatctacccagtaagaatggctagatcatg
aaaaaaaaacacctggcttaggtggtgggg
gaattcacttggtgagtgccactggcttcaaacttatcctcctttctcca
tctggaacgctcagattataagcatgttctactaacataattgtatacag
gaatgtgtgggcatcctttttcataccatttatatataaagaaacatggg
tggtttgacatattaacttttgtatgtgcccccccccctgcatttctgtc
agtttctatgacagtagattggtcctttgtaaacatccatatgatcatga
catttgcaaacaccattttactcttattttatggtatagatgcctttaat
ttattttatttaaatggttatcttgtgtataaatttcaggtctatgttga
acaaaagtagcaagagaagccaagctcagtgcttcacccttggctgtgga
agctgtgggctcgccactagaaatccttattgtattgaagcatatccctt
ctacatcaaatttgttgcaagctcttaatcactgcaggatattccacact
gtcatgtgctttttgtttctcttaagatgattatatgattttaaacatat
ttctattattgtttctcttattatttgaaaccataatataattacatcat
ttccctttccctttctagccctgaaaacatgattactatcttttgttctt
caaatgtggtatatcgcatctattaattggcacatataaaaacatccttg
tatcccttggataaatatcacttgtcatggttacggtccctgtaatgcac
tattgagtttggttttaagtattttatggggctctttgtgtctgtgctta
tcaggaatatttagatctacaatttttcttagagtatctttatctggctt
tagtattagaggaatgccatcttctgtgcaatgagctgtggtgttctgcc
cactacacttttgataattgtgggagtatgtccccccacaatttcatgtg
cttcagtggtggtcagcatgttggtagatgcaggttagtaaagttacgca
cactgtaagtgaataggtctaggagggacattcttaaaaagttggaactt
ctccctaggtggcggaaagtcctcatacaaagaatggtttcagggtcctt
ccca
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_85351367_85352453
seq2: B6Ng01-051K19.b_41_1120 (reverse)

seq1  CCCCACCACCTAAGCAGTGTGTCTTTTTTCATTGATCTTAGCCATTCTTA  50
      |||||||||||||||   |||| ||||||   ||||| ||||||||||||
seq2  CCCCACCACCTAAGCCAGGTGTTTTTTTTTCATGATC-TAGCCATTCTTA  49

seq1  CTGGGGTAAGATGAAATCTCAAAGTAATTGAAATTGGCATTTCCTAGGAA  100
      |||||   ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||
seq2  CTGGG--TAGATGGAATCTCCAAGTAATTGAAA-TGGCATTTCCTA-GAA  95

seq1  GGTTCAGTAACTCTGCCCTCGCTCCGACTCCGACAGAGGTATGGACTGTC  150
      |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTTCAGT-ACTCTGCCCTCGCTCAGACTCCGACAGAGGTATGGACTGTC  144

seq1  TCCCTTTCCCCACTCCAATCCCCTTTTCAGGTGCTCATAGATGCTAGCCC  200
      ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCCTTTCCCCACTCCAAT-CCCTTTTCAGGTGCTCATAGATGCTAGCCC  193

seq1  ACAGACAGTGCTGGGACTGCCATTTCTTCCCTCGCTGGTTATGTAAACGT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGACAGTGCTGGGACTGCCATTTCTTCCCTCGCTGGTTATGTAAACGT  243

seq1  CCTCCCACTGGTGGACTTGTCATCCAAACAGAAAGATGAAGTCCAAGGAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCCACTGGTGGACTTGTCATCCAAACAGAAAGATGAAGTCCAAGGAG  293

seq1  CCACTGCATCCTGCACAGGAAGCCGTGAACTTGATGCTACAGTGCCTGCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTGCATCCTGCACAGGAAGCCGTGAACTTGATGCTACAGTGCCTGCA  343

seq1  GTCTCTGTTCTCTGTCAGCATTTTCTCTCTCCTGCCTACTGTCTGTTGCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCTGTTCTCTGTCAGCATTTTCTCTCTCCTGCCTACTGTCTGTTGCT  393

seq1  GCCTATATTTTCTGTGACCTGCAGGTGGCCATGGTACAGGTATGAAATTG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCTATATTTTCTGTGACCTGCAGGTGGCCATGGTACAGGTATGAAATTG  443

seq1  TCTCTTTTAGGAACCAAACCACAGTTGGCTAGACTCTCGGGATCCTATAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTTTTAGGAACCAAACCACAGTTGGCTAGACTCTCGGGATCCTATAT  493

seq1  TGAATTACTCATATTCTACGTGCCTTTTTATGTCCCCCGCACCTGTTTGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATTACTCATATTCTACGTGCCTTTTTATGTCCCCCGCACCTGTTTGC  543

seq1  CGTTATTACTTACCTGCGCCTTTGTACCAAGAATGTACACACAAAAAAAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTTATTACTTACCTGCGCCTTTGTACCAAGAATGTACACACAAAAAAAT  593

seq1  GTATGTCAAAAATTTTAAAGCATGACTAGTGTTGACTTCATAAAAAATTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGTCAAAAATTTTAAAGCATGACTAGTGTTGACTTCATAAAAAATTG  643

seq1  ACTTTGTGGTAAAAGAGGGCAATCTTGTATGCTAAGATAAATAAATAAGC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTTGTGGTAAAAGAGGGCAATCTTGTATGCTAAGATAAATAAATAAGC  693

seq1  TGCTTGTGGAAAGAGAGAATGAACAGGGAGAAGGGTTATGGTACTAAGAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTGTGGAAAGAGAGAATGAACAGGGAGAAGGGTTATGGTACTAAGAT  743

seq1  AGCCTCTATCCCTCGTGAGGCGTTTGGATTAGTGCATTCCCCTCCTCAAT  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTCTATCCCTCGTGAGGCGTTTGGATTAGTGCATTCCCCTCCTCAAT  793

seq1  GCTGACTGTCTCACCTGAACACTGAAGCCAGACTGCACTACATACTTGCA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGACTGTCTCACCTGAACACTGAAGCCAGACTGCACTACATACTTGCA  843

seq1  GGGTTTCCTCTTAGCTCTAATTTGCTGTCTTTGTGATAGGACCTGATCCC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGTTTCCTCTTAGCTCTAATTTGCTGTCTTTGTGATAGGACCTGATCCC  893

seq1  TAAGGATAACCATGACTTGGCCATAATTATTTTGACGGCATCCTAAAAGA  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGGATAACCATGACTTGGCCATAATTATTTTGACGGCATCCTAAAAGA  943

seq1  ATGGCCTGGAAAGAGAGAGCAAAGCCACACACATCTCTAGAGCTTTTCAG  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGCCTGGAAAGAGAGAGCAAAGCCACACACATCTCTAGAGCTTTTCAG  993

seq1  AACTTCACACAATTATTGGCCAGTCTATATTCTCACAGCCTTTCAAGTTA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTTCACACAATTATTGGCCAGTCTATATTCTCACAGCCTTTCAAGTTA  1043

seq1  TGGATTTTACTTCTTTAATGATTGCAAAATTGAATTC  1087
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGATTTTACTTCTTTAATGATTGCAAAATTGAATTC  1080

seq1: chr4_85223999_85225097
seq2: B6Ng01-051K19.g_67_1170

seq1  GAATTCACTTGGTGAGTGCCACTGGCTTCAAACTTATCCTCCTTTCTCCA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCACTTGGTGAGTGCCACTGGCTTCAAACTTATCCTCCTTTCTCCA  50

seq1  TCTGGAACGCTCAGATTATAAGCATGTTCTACTAACATAATTGTATACAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGGAACGCTCAGATTATAAGCATGTTCTACTAACATAATTGTATACAG  100

seq1  GAATGTGTGGGCATCCTTTTTCATACCATTTATATATAAAGAAACATGGG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGTGTGGGCATCCTTTTTCATACCATTTATATATAAAGAAACATGGG  150

seq1  TGGTTTGACATATTAACTTTTGTATGTGCCCCCCCCCCTGCATTTCTGTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTTTGACATATTAACTTTTGTATGTGCCCCCCCCCCTGCATTTCTGTC  200

seq1  AGTTTCTATGACAGTAGATTGGTCCTTTGTAAACATCCATATGATCATGA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTTCTATGACAGTAGATTGGTCCTTTGTAAACATCCATATGATCATGA  250

seq1  CATTTGCAAACACCATTTTACTCTTATTTTATGGTATAGATGCCTTTAAT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTGCAAACACCATTTTACTCTTATTTTATGGTATAGATGCCTTTAAT  300

seq1  TTATTTTATTTAAATGGTTATCTTGTGTATAAATTTCAGGTCTATGTTGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATTTTATTTAAATGGTTATCTTGTGTATAAATTTCAGGTCTATGTTGA  350

seq1  ACAAAAGTAGCAAGAGAAGCCAAGCTCAGTGCTTCACCCTTGGCTGTGGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAAAGTAGCAAGAGAAGCCAAGCTCAGTGCTTCACCCTTGGCTGTGGA  400

seq1  AGCTGTGGGCTCGCCACTAGAAATCCTTATTGTATTGAAGCATATCCCTT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGTGGGCTCGCCACTAGAAATCCTTATTGTATTGAAGCATATCCCTT  450

seq1  CTACATCAAATTTGTTGCAAGCTCTTAATCACTGCAGGATATTCCACACT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACATCAAATTTGTTGCAAGCTCTTAATCACTGCAGGATATTCCACACT  500

seq1  GTCATGTGCTTTTTGTTTCTCTTAAGATGATTATATGATTTTAAACATAT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATGTGCTTTTTGTTTCTCTTAAGATGATTATATGATTTTAAACATAT  550

seq1  TTCTATTATTGTTTCTCTTATTATTTGAAACCATAATATAATTACATCAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTATTATTGTTTCTCTTATTATTTGAAACCATAATATAATTACATCAT  600

seq1  TTCCCTTTCCCTTTCTAGCCCTGAAAACATGATTACTATCTTTTGTTCTT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCTTTCCCTTTCTAGCCCTGAAAACATGATTACTATCTTTTGTTCTT  650

seq1  CAAATGTGGTATATCGCATCTATTAATTGGCACATATAAAAACATCCTTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAATGTGGTATATCGCATCTATTAATTGGCACATATAAAAACATCCTTG  700

seq1  TATCCCTTGGATAAATATCACTTGTCATGGTTACGGTCCCTGTAATGCAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCCCTTGGATAAATATCACTTGTCATGGTTACGGTCCCTGTAATGCAC  750

seq1  TATTGAGTTTGGTTTTAAGTATTTTATGGGGCTCTTTGTGTCTGTGCTTA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTGAGTTTGGTTTTAAGTATTTTATGGGGCTCTTTGTGTCTGTGCTTA  800

seq1  TCAGGAATATTTAGATCTACAATTTTTCTTAGAGTATCTTCATCTGGCTT  850
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  TCAGGAATATTTAGATCTACAATTTTTCTTAGAGTATCTTTATCTGGCTT  850

seq1  TAGTATTAGAGGAATGCCATC-TCTGTGCAATGAGCTGTGGTGTTCTGCC  899
      ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTATTAGAGGAATGCCATCTTCTGTGCAATGAGCTGTGGTGTTCTGCC  900

seq1  CACTACAC-TTTGATAATTGTGGGAGTATGT-CCCCCACAATTTCATGTG  947
      |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  CACTACACTTTTGATAATTGTGGGAGTATGTCCCCCCACAATTTCATGTG  950

seq1  CTTCAAGTGTGGTCAGCAGTGTGGTAGA-GCAGGGTAGTAGAAGTAAGGC  996
      |||||   ||||||||||   ||||||| ||||| ||||| |||| | ||
seq2  CTTCAGTGGTGGTCAGCATGTTGGTAGATGCAGGTTAGTA-AAGTTACGC  999

seq1  ACACTGTAAGTAGATAGGTCTAGGAGGGACAATTCTTAGAAAGGTATGAA  1046
      |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||  |||
seq2  ACACTGTAAGTGAATAGGTCTAGGAGGGAC-ATTCTTA-AAAAGTTGGAA  1047

seq1  CTTCT-CCTAGGTTGGCGGTAAGT-CTCATACAAAGAATGG-GTCAGGGT  1093
      ||||| |||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||
seq2  CTTCTCCCTAGG-TGGCGGAAAGTCCTCATACAAAGAATGGTTTCAGGGT  1096

seq1  C--TCCCA  1099
      |  |||||
seq2  CCTTCCCA  1104