BAC Information

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BAC

Clone NameB6Ng01-051O14
Chromosome1 (Build37)4 (Build37)
Map Location 22,900,963 - 22,901,2824,774,929 - 4,776,035
singlet/doubletsingletsinglet
Overlap genenone
Upstream geneKcnq5, LOC435612, LOC100040338, Rims1, Rims1
Downstream geneEG665725, LOC665731, 4933415F23Rik, Rn4.5s-ps4, EG623356, Ogfrl1, LOC665782, B3gat2, Smap1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-051O14.bB6Ng01-051O14.g
ACCDH875420DH875421
length4231,105
definitionDH875420|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-051O14, 5' end.DH875421|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-051O14, 3' end.
singlet/doubletsingletsinglet
BLAST hituniqueunique
Map location.(22,900,963 - 22,901,282)(4,774,929 - 4,776,035)
sequence
caggacagccagggctatacagagaaaccctgtctcgaaaaacctatata
tatacatatatatatacatatatatatgtatatatatatgtatatatata
tatacatatatatatatatacatatatatatatatatatatatatgtata
tatatatgtatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata
tatatatgtatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata
tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata
tatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatatata
tatatatatatgtgtatatggaggtatgtatacatatatatatatatata
tacacgtatatatagatatatat
gaattcaagacctacctgtgttacatagggagtactaggagagccagagc
acttgggaggcataggaagctgtatgctacaagtttcaggccagcctggt
atgaataacaaggaaacagtgagattctatctcaagaaagcagaaagaac
ttaggaacttagcaagaccttgtctcaaataaaagtcaataaaaatgtgg
ggggggggaagccttggagtattgacatgtaggagagctctcttggccaa
ccactccaaaggtgctaggttcaagccctatttctatcacataataacaa
taataataataatcccaggatttgagattctcccatgtgaggcaaagcaa
cagaacagtaactgagacagtggtccacagagaagagatctaagtgacag
gagtcatcgtacctgcctgcagtcattcctctgccatgatggtgaaggac
tcttaaccttctgggactatgcacccaagcaaacctttccttctataagt
tgcaaaagaaaatttacaaataaacctcctgtgcttgtatagtcaaaaaa
aataataatagtaacaataatgacaacaataatattcataaaaatctata
attttatattgccggtgtatatatttttctttttaaaaacttttgttggt
aaagctggaaattcaccaactttattgattcttgacataagcagcattac
tttactgatatactctatcacatctatattttctcttcctttcatttcag
tattcagtgctttttttccaatttttgtaaggactgtatttcgcaataca
ttatttttaatcaattccagcccttcttgtctttactccacctcgtccaa
agtatttccccaatctctcttgaatccatgacctcttcttctagttatta
ttgctgaatatattataaaacctgctagggttgctgtgtgtcaatgtgtt
agggctaaccaaaatattgactaggaatgagaaacctgctccttcttcat
aaggctctaatggctaggatgatatctcttcaattttttaaggatgtact
taggggctaaaatttccctatatgcaccattttcattgtttcccaaaagt
ttggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr1_22900963_22901282
seq2: B6Ng01-051O14.b_174_475 (reverse)

seq1  ATATATATACTCT-TGTACCT-TATATATGTGTATATATATATATAC---  45
      |||||||| || | | ||| | ||||||| | ||||||||| |||||   
seq2  ATATATAT-CTATATATACGTGTATATATATATATATATATGTATACATA  49

seq1  ---TCTTGTAC-CTTATATATGTGCGTATATATATATATATATACTCTTG  91
          | | ||| | ||||||| |   ||||||||||||||||||      
seq2  CCTCCATATACACATATATATATATATATATATATATATATATA------  93

seq1  TACCTTATATGTGTGTACATATATACACTCTTGTACCTTATATATGTGTG  141
      ||   ||||| | | || ||||||| |    | ||   ||||||| | | 
seq2  TA---TATATATATATATATATATATA----TATA---TATATATATATA  133

seq1  TGTGTATATATATATGTATATATATATATACTCTTGTACCTTATATGTGT  191
      | | ||||||||||| ||||||||||||||    | ||   ||||| | |
seq2  TATATATATATATATATATATATATATATA----TATA---TATATATAT  176

seq1  GTGTATATATATATATATATATTCTTGTACCTTATATATATATATGTATA  241
       | |||||||||||||||||||   | ||   |||||||||| || ||||
seq2  ATATATATATATATATATATATATATATA---TATATATATACATATATA  223

seq1  TATATATATGTATATGTATATACATATATACATATATATATATATATATA  291
      ||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||
seq2  TATATATATATATATATATATATATATATATATATATATATACATATATA  273

seq1  TATACATATATATATATATATATATATAT  320
      |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATACATATATATATATATATATATATAT  302

seq1: chr4_4774929_4776035
seq2: B6Ng01-051O14.g_64_1168 (reverse)

seq1  CCCAAACTTATGAGAAACAATGAAAATGGTGCTAATAGGAAAATTTATAG  50
      ||||||||| || |||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||
seq2  CCCAAACTTTTGGGAAACAATGAAAATGGTGCATATAGGGAAATTT-TAG  49

seq1  -CACTAAGTACATCCATAAAAAATTGGAGAGATATCATACTAGCAATTTA  99
       | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||| |||  
seq2  CCCCTAAGTACATCCTTAAAAAATTGAAGAGATATCATCCTAGCCATT--  97

seq1  AGAGCACTATGAAG-AGGAACAGGTTTCTCATTCCTAGTCCATATTTTGG  148
      |||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||
seq2  AGAGCCTTATGAAGAAGGAGCAGGTTTCTCATTCCTAGTCAATATTTTGG  147

seq1  TTAGCCCTAAACACATTGACACACAGCAACCCTAGCAGGTTTTAT-ATAT  197
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  TTAGCCCT-AACACATTGACACACAGCAACCCTAGCAGGTTTTATAATAT  196

seq1  ATTCAGCAATAATAACTAGAAGAAGAGGTCATGGATTCAAGAGAGATTGG  247
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAGCAATAATAACTAGAAGAAGAGGTCATGGATTCAAGAGAGATTGG  246

seq1  GGAAATACCTTGGACGAGGTGGAGTAGAGACAAGAAGGGCTGGAATTGAT  297
      |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  GGAAATACTTTGGACGAGGTGGAGTAAAGACAAGAAGGGCTGGAATTGAT  296

seq1  TAAAAATAATGTATTTGCGAGATACAGTCCTTACAAAAATTGGAAAAAAA  347
      ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAAATAATGTA-TTGCGAAATACAGTCCTTACAAAAATTGGAAAAAAA  345

seq1  GCACTGAATACTGAAATGAAAGGAAGAGAAAATATAGATGTGATAGAGTA  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTGAATACTGAAATGAAAGGAAGAGAAAATATAGATGTGATAGAGTA  395

seq1  TATCAGTAAAGTAATGCTGCTTATGTCAAGAATCAATAAAGTTGGTGAAT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCAGTAAAGTAATGCTGCTTATGTCAAGAATCAATAAAGTTGGTGAAT  445

seq1  TTCCAGCTTTACCAACAAAAGTTTTTAAAAAGAAAAATATATACACCGGC  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCAGCTTTACCAACAAAAGTTTTTAAAAAGAAAAATATATACACCGGC  495

seq1  AATATAAAATTATAGATTTTTATGAATATTATTGTTGTCATTATTGTTAC  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATATAAAATTATAGATTTTTATGAATATTATTGTTGTCATTATTGTTAC  545

seq1  TATTATTATTTTTTTTGACTATACAAGCACAGGAGGTTTATTTGTAAATT  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATTATTATTTTTTTTGACTATACAAGCACAGGAGGTTTATTTGTAAATT  595

seq1  TTCTTTTGCAACTTATAGAAGGAAAGGTTTGCTTGGGTGCATAGTCCCAG  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTTGCAACTTATAGAAGGAAAGGTTTGCTTGGGTGCATAGTCCCAG  645

seq1  AAGGTTAAGAGTCCTTCACCATCATGGCAGAGGAATGACTGCAGGCAGGT  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGTTAAGAGTCCTTCACCATCATGGCAGAGGAATGACTGCAGGCAGGT  695

seq1  ACGATGACTCCTGTCACTTAGATCTCTTCTCTGTGGACCACTGTCTCAGT  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACGATGACTCCTGTCACTTAGATCTCTTCTCTGTGGACCACTGTCTCAGT  745

seq1  TACTGTTCTGTTGCTTTGCCTCACATGGGAGAATCTCAAATCCTGGGATT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGTTCTGTTGCTTTGCCTCACATGGGAGAATCTCAAATCCTGGGATT  795

seq1  ATTATTATTATTGTTATTATGTGATAGAAATAGGGCTTGAACCTAGCACC  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATTATTATTGTTATTATGTGATAGAAATAGGGCTTGAACCTAGCACC  845

seq1  TTTGGAGTGGTTGGCCAAGAGAGCTCTCCTACATGTCAATACTCCAAGGC  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGGAGTGGTTGGCCAAGAGAGCTCTCCTACATGTCAATACTCCAAGGC  895

seq1  TTCCCCCCCCCCACATTTTTATTGACTTTTATTTGAGACAAGGTCTTGCT  947
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCCCCCCCCCACATTTTTATTGACTTTTATTTGAGACAAGGTCTTGCT  945

seq1  AAGTTCCTAAGTTCTTTCTGCTTTCTTGAGATAGAATCTCACTGTTTCCT  997
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGTTCCTAAGTTCTTTCTGCTTTCTTGAGATAGAATCTCACTGTTTCCT  995

seq1  TGTTATTCATACCAGGCTGGCCTGAAACTTGTAGCATACAGCTTCCTATG  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTATTCATACCAGGCTGGCCTGAAACTTGTAGCATACAGCTTCCTATG  1045

seq1  CCTCCCAAGTGCTCTGGCTCTCCTAGTACTCCCTATGTAACACAGGTAGG  1097
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTCCCAAGTGCTCTGGCTCTCCTAGTACTCCCTATGTAACACAGGTAGG  1095

seq1  TCTTGAATTC  1107
      ||||||||||
seq2  TCTTGAATTC  1105