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BAC Information

BAC name
Region	Chromosome -
Gene	search by nearby gene name.
Format	rows / page	Page	1

BAC

Clone Name	B6Ng01-053O02
Chromosome	4 (Build37)
Map Location	25,707,938 - 25,708,717
singlet/doublet	singlet
Overlap gene	Fut9
Upstream gene	Klhl32, 1110007M04Rik, C230012O17Rik, Gpr63, Fhl5, 1810074P20Rik, Prdx6-rs2, LOC665019, LOC625732
Downstream gene	LOC100040780, Hn1-ps1, Manea, Bhmt-ps1, LOC665079, Gng2-ps1
Link	Open Mouse BAC browser

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BAC End Information

BAC end	BAC-end 1	BAC-end 2
end name	B6Ng01-053O02.b	B6Ng01-053O02.g
ACC	DH876794	DH876795
length	759	781
definition	DH876794\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-053O02, 5' end.	DH876795\|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-053O02, 3' end.
singlet/doublet	---	singlet
BLAST hit	no hit data	unique
sequence	gaattcctgatttgatttaagtagttctaggaagtaagcttgatttaaat aattttggaagttaaggtagttgatagaaagtttagagttagcatcaaga atagaatgcaagcattgcctgagcatttgcgggagacatcttggttgcag gactccaccgagagtagtctgcacaggtgagagtgtggactacagaagct aacagcttctgggacaggcgggagccacagagcttctgaggcagccaaac gccagatatttgtgtaccttccctgtaagaggagagcttgactgcagaga gtgctctggccactgaaactcagaggagagatctagtctcccaggtctgc tgataggggttaacagaatcactagaggaacaagctctaaccagagacaa ctataacagctaactccagagattaccagatggtgaaaggtaaacacaag aatcttattaacagaaaccaagaccactcaccatcatcggaacccagcac tcccacctcacccagtccacggcaccaaacatacccgaaaagctagacct ggatttaaaagcatatctcatgatgatggtagaggacatcaagaaggact ttaataactcacttaaaaaaaagacaggagaaaactgataaagaggtaga agaccttaaagaggaagcacaaaaatcccttaaagaattgcaggaaaaca tgaccaaaaaggtgatggaattgaataaaaccatccaagacctaaaagag aagtagaca	gaattcatacaaaaatcgcgtgtctcatacaaggttaccgaatcagaatc tgtgttctaataatatcttgatgtgtttcgggtagaagtcaagtttggct aaaactataaggttttctttaaagacacttcctgttaaagacaagaatat ttggggacatttgaaaatgcttttctcttgtctccttgagatactataga acagacacaccacagcagttggtgaagctaagtttctggctttacagtga aataacaagcctagcaatgaaaaacataataactgtctaaaagaaaacaa atctttctttgtaatgtgctatgcttgatttaattataatcatgattaat tgtgaattattattaggtgaagacatctccattaatgatcatacagatga aatggaaaggaaaataaaagaaacctccaaattactttggccaggaaact ataatgacagccagttatgcgaagaacttatttaatcatgcagcacaata atgttatggctttcatgacaacttcaacatatcaaattagcacaactctg gatgtgatttaattagcgaaacaaatttcaggatatattcagtcttcaaa atctattattatagcagtatgagatccttcctagaacttttcataattaa agcaaattcttttttagagggatatctaatgattaaattaggtttccaca ttaagctacatagttcatgaagaagacacagaagagccagaggggatgga gaacatcaaagaaagaaagcctttctacata
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Alignment Information

BAC End 1	BAC End 2
	seq1: chr4_25707938_25708717 seq2: B6Ng01-053O02.g_70_850 seq1 GAATTCATACAAAAATCGCGTGTCTCATACAAGGTTACCGAATCAGAATC 50 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GAATTCATACAAAAATCGCGTGTCTCATACAAGGTTACCGAATCAGAATC 50 seq1 TGTGTTCTAATAATATCTTGATGTGTTTCGGGTAGAAGTCAAGTTTGGCT 100 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGTGTTCTAATAATATCTTGATGTGTTTCGGGTAGAAGTCAAGTTTGGCT 100 seq1 AAAACTATAAGGTTTTCTTTAAAGACACTTCCTGTTAAAGACAAGAATAT 150 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AAAACTATAAGGTTTTCTTTAAAGACACTTCCTGTTAAAGACAAGAATAT 150 seq1 TTGGGGACATTTGAAAATGCTTTTCTCTTGTCTCCTTGAGATACTATAGA 200 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TTGGGGACATTTGAAAATGCTTTTCTCTTGTCTCCTTGAGATACTATAGA 200 seq1 ACAGACACACCACAGCAGTTGGTGAAGCTAAGTTTCTGGCTTTACAGTGA 250 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ACAGACACACCACAGCAGTTGGTGAAGCTAAGTTTCTGGCTTTACAGTGA 250 seq1 AATAACAAGCCTAGCAATGAAAAACATAATAACTGTCTAAAAGAAAACAA 300 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AATAACAAGCCTAGCAATGAAAAACATAATAACTGTCTAAAAGAAAACAA 300 seq1 ATCTTTCTTTGTAATGTGCTATGCTTGATTTAATTATAATCATGATTAAT 350 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATCTTTCTTTGTAATGTGCTATGCTTGATTTAATTATAATCATGATTAAT 350 seq1 TGTGAATTATTATTAGGTGAAGACATCTCCATTAATGATCATACAGATGA 400 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TGTGAATTATTATTAGGTGAAGACATCTCCATTAATGATCATACAGATGA 400 seq1 AATGGAAAGGAAAATAAAAGAAACCTCCAAATTACTTTGGCCAGGAAACT 450 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AATGGAAAGGAAAATAAAAGAAACCTCCAAATTACTTTGGCCAGGAAACT 450 seq1 ATAATGACAGCCAGTTATGCGAAGAACTTATTTAATCATGCAGCACAATA 500 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATAATGACAGCCAGTTATGCGAAGAACTTATTTAATCATGCAGCACAATA 500 seq1 ATGTTATGGCTTTCATGACAACTTCAACATATCAAATTAGCACAACTCTG 550 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATGTTATGGCTTTCATGACAACTTCAACATATCAAATTAGCACAACTCTG 550 seq1 GATGTGATTTAATTAGCGAAACAAATTTCAGGATATATTCAGTCTTCAAA 600 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GATGTGATTTAATTAGCGAAACAAATTTCAGGATATATTCAGTCTTCAAA 600 seq1 ATCTATTATTATAGCAGTATGAGATCCTTCCTAGAACTTTTCATAATTAA 650 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 ATCTATTATTATAGCAGTATGAGATCCTTCCTAGAACTTTTCATAATTAA 650 seq1 AGCAAATTCTTTTTTAGAGGGATATCTAATGATTAAATTAGGTTTCCACA 700 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 AGCAAATTCTTTTTTAGAGGGATATCTAATGATTAAATTAGGTTTCCACA 700 seq1 TTAAGCTACATAGTTCAGGAAGAAGACACAGAAGAGCCAGAGGGGATGGA 750 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 TTAAGCTACATAGTTCATGAAGAAGACACAGAAGAGCCAGAGGGGATGGA 750 seq1 GAACATCAAAGAAAGAAAGCC-TTCTACATA 780 \|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\|\| \|\|\|\|\|\|\|\|\| seq2 GAACATCAAAGAAAGAAAGCCTTTCTACATA 781

BAC End 1

BAC End 2

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      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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seq1  ATAATGACAGCCAGTTATGCGAAGAACTTATTTAATCATGCAGCACAATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAATGACAGCCAGTTATGCGAAGAACTTATTTAATCATGCAGCACAATA  500

seq1  ATGTTATGGCTTTCATGACAACTTCAACATATCAAATTAGCACAACTCTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTTATGGCTTTCATGACAACTTCAACATATCAAATTAGCACAACTCTG  550

seq1  GATGTGATTTAATTAGCGAAACAAATTTCAGGATATATTCAGTCTTCAAA  600
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seq2  GATGTGATTTAATTAGCGAAACAAATTTCAGGATATATTCAGTCTTCAAA  600

seq1  ATCTATTATTATAGCAGTATGAGATCCTTCCTAGAACTTTTCATAATTAA  650
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seq2  ATCTATTATTATAGCAGTATGAGATCCTTCCTAGAACTTTTCATAATTAA  650

seq1  AGCAAATTCTTTTTTAGAGGGATATCTAATGATTAAATTAGGTTTCCACA  700
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seq2  AGCAAATTCTTTTTTAGAGGGATATCTAATGATTAAATTAGGTTTCCACA  700

seq1  TTAAGCTACATAGTTCAGGAAGAAGACACAGAAGAGCCAGAGGGGATGGA  750
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAGCTACATAGTTCATGAAGAAGACACAGAAGAGCCAGAGGGGATGGA  750

seq1  GAACATCAAAGAAAGAAAGCC-TTCTACATA  780
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seq2  GAACATCAAAGAAAGAAAGCCTTTCTACATA  781

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