BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-056A03
Chromosome4 (Build37)
Map Location 18,417,737 - 18,557,947
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneMmp16
Downstream geneLOC667251, LOC435772, Cngb3, LOC623122, Cpne3, LOC100040306, 2410005O16Rik, Wwp1
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-056A03.bB6Ng01-056A03.g
ACCDH878301DH878302
length470487
definitionDH878301|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-056A03, 5' end.DH878302|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-056A03, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(18,557,472 - 18,557,947)(18,417,737 - 18,418,229)
sequence
tatatggatctcttactgtatttattatgatacttgcaacctttgattta
cctgctatacttcccatgacacagattctcatactgaagtttgcactcag
actctttatagcagcacaacaacaaaatttaacttcactggttgttgaat
tgatgatccctaaatgattaaaggaagaaagtacatgaatcttcctcaaa
tactatatttgaaatttgataaatattcaatttgtgtaatattattggga
ttaattcactatatattttatgtctaaaatcttcaaaagtgtttttatta
tatagatatagttagttagatagatagatagatagataggtagatagata
gatagatagatagatagatagatagatattctcctcactccgaaggcgcc
tgcataaactgaggaaatacagaagaaatcacagcaatgaaggtagaaat
tgtatgctactgagttgatg
agggcatcttaaaaacaaaagatgtttgcaggaatggaagttcttcagtc
tgattctgtgagaggattcatgaccatacatatggttgtgcagcttcttt
ctgcttttgagaattatgattgcctagagttgatcacatgattttctgtc
atctatgtatcttatccttgtatctctatttctctattatctatttatct
gcctatcacctataatccatctctgtagctaactatcacctatcatctat
caatcattatcctttatttatctatataatagacatgctaaggaacaagc
agagcacatagaaggtgcagatatatctgcctgtctatcatctatgcatc
tgtctacctacctatcatctatgtatatatgtatgtatgtatgtatgtat
gtatgtatgtatctatctatctatctatccatccatctatcatcatcgat
ctacctaacatctatttgcctgtctatctatctatct
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_18557472_18557947
seq2: B6Ng01-056A03.b_45_520 (reverse)

seq1  CATCAACTCAGTAGCATCCAATTTCTACCTTCATTGCTGTGTTTTCCTGT  50
      ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| | |
seq2  CATCAACTCAGTAGCATACAATTTCTACCTTCATTGCTGTGATTTCTTCT  50

seq1  GTATTTCCTCAGTTTATGTAGGTGCCTTTGTATTGAGGAGAATATCTATC  100
      |||||||||||||||||| ||| ||||| | | |||||||||||||||||
seq2  GTATTTCCTCAGTTTATGCAGGCGCCTTCGGAGTGAGGAGAATATCTATC  100

seq1  TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTACCTATCTATCTATCTATCTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATCTATCTATCTATCTATCTATCTATCTACCTATCTATCTATCTATCTA  150

seq1  TCTAACTAACTATATCTATATAATAAAAACACTTTTGAAGATTTTAGACA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTAACTAACTATATCTATATAATAAAAACACTTTTGAAGATTTTAGACA  200

seq1  TAAAATATATAGTGAATTAATCCCAATAATATTACACAAATTGAATATTT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATATATAGTGAATTAATCCCAATAATATTACACAAATTGAATATTT  250

seq1  ATCAAATTTCAAATATAGTATTTGAGGAAGATTCATGTACTTTCTTCCTT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAAATTTCAAATATAGTATTTGAGGAAGATTCATGTACTTTCTTCCTT  300

seq1  TAATCATTTAGGGATCATCAATTCAACAACCAGTGAAGTTAAATTTTGTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATCATTTAGGGATCATCAATTCAACAACCAGTGAAGTTAAATTTTGTT  350

seq1  GTTGTGCTGCTATAAAGAGTCTGAGTGCAAACTTCAGTATGAGAATCTGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTGTGCTGCTATAAAGAGTCTGAGTGCAAACTTCAGTATGAGAATCTGT  400

seq1  GTCATGGGAAGTATAGCAGGTAAATCAAAGGTTGCAAGTATCATAATAAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATGGGAAGTATAGCAGGTAAATCAAAGGTTGCAAGTATCATAATAAA  450

seq1  TACAGTAAGAGATCCATATAGAATTC  476
      ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACAGTAAGAGATCCATATAGAATTC  476

seq1: chr4_18417737_18418229
seq2: B6Ng01-056A03.g_66_558

seq1  GAATTCAGGGCATCTTAAAAACAAAAGATGTTTGCAGGAATGGAAGTTCT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAGGGCATCTTAAAAACAAAAGATGTTTGCAGGAATGGAAGTTCT  50

seq1  TCAGTCTGATTCTGTGAGAGGATTCATGACCATACATATGGTTGTGCAGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTCTGATTCTGTGAGAGGATTCATGACCATACATATGGTTGTGCAGC  100

seq1  TTCTTTCTGCTTTTGAGAATTATGATTGCCTAGAGTTGATCACATGATTT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTCTGCTTTTGAGAATTATGATTGCCTAGAGTTGATCACATGATTT  150

seq1  TCTGTCATCTATGTATCTTATCCTTGTATCTCTATTTCTCTATTATCTAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTCATCTATGTATCTTATCCTTGTATCTCTATTTCTCTATTATCTAT  200

seq1  TTATCTGCCTATCACCTATAATCCATCTCTGTAGCTAACTATCACCTATC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTATCTGCCTATCACCTATAATCCATCTCTGTAGCTAACTATCACCTATC  250

seq1  ATCTATCAATCATTATCCTTTATTTATCTATATAATAGACATGCTAAGGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTATCAATCATTATCCTTTATTTATCTATATAATAGACATGCTAAGGA  300

seq1  ACAAGCAGAGCACATAGAAGGTGCAGATATATCTGCCTGTCTATCATCTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAAGCAGAGCACATAGAAGGTGCAGATATATCTGCCTGTCTATCATCTA  350

seq1  TGCATCTGTCTACCTACCTATCATCTATGTATATATGTATGTATGTATGT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATCTGTCTACCTACCTATCATCTATGTATATATGTATGTATGTATGT  400

seq1  ATGTATGTATGTATGTATCTATCTATCTATCTATCCATCCATCTATCATC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTATGTATGTATGTATCTATCTATCTATCTATCCATCCATCTATCATC  450

seq1  ATCGATCTACCTAACATCTATTTGCCTGTCTATCTATCTATCT  493
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCGATCTACCTAACATCTATTTGCCTGTCTATCTATCTATCT  493