BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-056D20
Chromosome4 (Build37)
Map Location 71,572,875 - 71,681,144
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100039565, LOC100039979, LOC667638, EG667649
Downstream geneTle1, Aldoa-ps2, EG384113
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-056D20.bB6Ng01-056D20.g
ACCDH878464DH878465
length1,177784
definitionDH878464|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-056D20, 5' end.DH878465|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-056D20, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(71,679,948 - 71,681,144)(71,572,875 - 71,573,658)
sequence
gaattcagtctagaaggccaaatgacttttaacataaattcgacctggaa
ttaaatttaagattagctatcacactttatttacagtgtaggaaattctc
aaatatttttctttcagagtaatctcatttggtgaagttaagcagtataa
ttatatttatgttcaagttaaaggctttcaaaagaattaaatttcttagt
actctgtcatggtgtgctacctaggagacttttggtttgagagtccattt
ttaggaaatacatttacacaacacttttaaaattggagctgtgagaaatg
ttttaaaatgtctacataacatattgtataggtgagcacttgaccacagg
gagctttgcttgtacattcagtgagtactaagccacagtgtgttctagac
tttgcatactcctagattctgcactatctgtatcagtttcatgatttttt
aaatatctatgttattttactggatcaattgttccattatgataaattaa
tttaaagaaatgtacagttcctctggtggaaaatggcaagagtatgatgc
tcttagaagtgtttagaaatgcagtgttatggctccactcttatgtggac
ctgatgaaccagactctgaaaaagaggtctagggatctgagttttaatga
ctcttcatataatttttacacacattcaagttgagagccatagtattgct
gtcaactgaaagcataacttgctattgatgaaaacatatcacaaagaatg
aaaaggaatcacacatgattttaaattttatctagaaacagttgtctacc
gaggttttcaatttggactctgtattctcatcattaagaaattacaaagg
tggctggagagatggctcagtggttaagagcactgactgctcttccagaa
gtcctgagtttaattcccagcaaccatatggtagctcacaacatctgtaa
tgagatatgatgccctcttctggtgtgcatgaagacagtgacagtatatt
cacacatataaataaataagaagtcttttttaaaaaagaaactacaatat
gtataaagactgagactgctcttttgacttttcgaacattagagaaataa
ttcttttcatgtgctatcatgtactagttgtttgagtaactttggtacaa
actcagacatatggaactttgaacttc
gaattcttgagtaagaagtactgaaaactgggcagattactgtgagacac
ctgagtatggatggggtaattttccttaagtagtgaagaatactgaatat
aggatctgaaagcatcctagagtccggaatggggttttagcctgttttgt
ttcagaagctattttgctttcatgggtggaaatagagaatggataagtgg
cttgcttattatttaagttctcaaaaacctagtaatttttctaagtggca
agtagaagaacagctggagtcctgggtcactataaggtgtggagaagggg
gctggtgagcattcacatttgtaagccaaatgctaagaataaggagatct
gggaagacataaatttttgaaattttgaactgataatttcagtttctgag
atcagaaatgtaataatcccaaattggtaactctcaaggctccatgccaa
attaaacatatatccctctggtggatcatgtaatcacatccttcaaatta
tttctacaaacaattgtacaaataagtaaaatgcttggaaaataaaacaa
aatagtcagaagtataatgagaaaacatctaaacaaaaacaaaaacataa
gaggaccaaagtattgttgtcaggtagataggtcttggtatacatctatc
tgtgtctgtgtctgtgtctgtgtctgtgtctgtctgtgtctgtgtctgtg
tctgtgtctgtgtctgtgtctgtgtctgtgtctgtgtctgtgtctatctg
tctgtctctctctctctctctctctctctctcgc
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_71679948_71681144
seq2: B6Ng01-056D20.b_41_1217 (reverse)

seq1  GAAG-TCAAAGTTCACTATGTTCTTGGAGTTTGTACCAAAGTTTACTCAA  49
      |||| |||||||||  |||| |||  ||||||||||||||| ||||||||
seq2  GAAGTTCAAAGTTCCATATG-TCT--GAGTTTGTACCAAAG-TTACTCAA  46

seq1  AACAAACTATGTTACATGATTTAGCACATGAAAAGAAATTATTTTCTCTA  99
      |   |||||   |||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||
seq2  A--CAACTA--GTACATGA--TAGCACATGAAAAG-AATTA-TTTCTCTA  88

seq1  ATGGTCTGAATATGTCAGAAGAAGCAGTCTCTAGTCTTTATACATATTTG  149
      ||| || ||| | |||| ||| ||||||||| |||||||||||||| |||
seq2  ATGTTC-GAA-AAGTCAAAAG-AGCAGTCTC-AGTCTTTATACATA-TTG  133

seq1  TAGTTTCTTTTTTTAAAAAAGACTTCTTTATTTATTTTATATGTGTGAAT  199
      ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||
seq2  TAGTTTC-TTTTTTAAAAAAGACTTC-TTATTTA-TTTATATGTGTGAAT  180

seq1  ATACTGTCACTGTCTTCATGCACACCAGAAGAGGGCATCATATCTCATTA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTGTCACTGTCTTCATGCACACCAGAAGAGGGCATCATATCTCATTA  230

seq1  CAGATGTTTGTGAGCTACCATATGGTTGCTGGGAATTAAACTCAGGACTT  299
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGATG-TTGTGAGCTACCATATGGTTGCTGGGAATTAAACTCAGGACTT  279

seq1  CTGGAAGAGCAGTCAGTGCTCTTAACCACTGAGCCATCTCTCCAGCCACC  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGAAGAGCAGTCAGTGCTCTTAACCACTGAGCCATCTCTCCAGCCACC  329

seq1  TTTGTAATTTCTTAATGATGAGAATACAGAGTCCAAATTGAAAACCTCGG  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGTAATTTCTTAATGATGAGAATACAGAGTCCAAATTGAAAACCTCGG  379

seq1  TAGACAACTGTTTCTAGATAAAATTTAAAATCATGTGTGATTCCTTTTCA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGACAACTGTTTCTAGATAAAATTTAAAATCATGTGTGATTCCTTTTCA  429

seq1  TTCTTTGTGATATGTTTTCATCAATAGCAAGTTATGCTTTCAGTTGACAG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTTTGTGATATGTTTTCATCAATAGCAAGTTATGCTTTCAGTTGACAG  479

seq1  CAATACTATGGCTCTCAACTTGAATGTGTGTAAAAATTATATGAAGAGTC  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATACTATGGCTCTCAACTTGAATGTGTGTAAAAATTATATGAAGAGTC  529

seq1  ATTAAAACTCAGATCCCTAGACCTCTTTTTCAGAGTCTGGTTCATCAGGT  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAAACTCAGATCCCTAGACCTCTTTTTCAGAGTCTGGTTCATCAGGT  579

seq1  CCACATAAGAGTGGAGCCATAACACTGCATTTCTAAACACTTCTAAGAGC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACATAAGAGTGGAGCCATAACACTGCATTTCTAAACACTTCTAAGAGC  629

seq1  ATCATACTCTTGCCATTTTCCACCAGAGGAACTGTACATTTCTTTAAATT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCATACTCTTGCCATTTTCCACCAGAGGAACTGTACATTTCTTTAAATT  679

seq1  AATTTATCATAATGGAACAATTGATCCAGTAAAATAACATAGATATTTAA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTATCATAATGGAACAATTGATCCAGTAAAATAACATAGATATTTAA  729

seq1  AAAATCATGAAACTGATACAGATAGTGCAGAATCTAGGAGTATGCAAAGT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATCATGAAACTGATACAGATAGTGCAGAATCTAGGAGTATGCAAAGT  779

seq1  CTAGAACACACTGTGGCTTAGTACTCACTGAATGTACAAGCAAAGCTCCC  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTAGAACACACTGTGGCTTAGTACTCACTGAATGTACAAGCAAAGCTCCC  829

seq1  TGTGGTCAAGTGCTCACCTATACAATATGTTATGTAGACATTTTAAAACA  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGTCAAGTGCTCACCTATACAATATGTTATGTAGACATTTTAAAACA  879

seq1  TTTCTCACAGCTCCAATTTTAAAAGTGTTGTGTAAATGTATTTCCTAAAA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTCACAGCTCCAATTTTAAAAGTGTTGTGTAAATGTATTTCCTAAAA  929

seq1  ATGGACTCTCAAACCAAAAGTCTCCTAGGTAGCACACCATGACAGAGTAC  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGACTCTCAAACCAAAAGTCTCCTAGGTAGCACACCATGACAGAGTAC  979

seq1  TAAGAAATTTAATTCTTTTGAAAGCCTTTAACTTGAACATAAATATAATT  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGAAATTTAATTCTTTTGAAAGCCTTTAACTTGAACATAAATATAATT  1029

seq1  ATACTGCTTAACTTCACCAAATGAGATTACTCTGAAAGAAAAATATTTGA  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATACTGCTTAACTTCACCAAATGAGATTACTCTGAAAGAAAAATATTTGA  1079

seq1  GAATTTCCTACACTGTAAATAAAGTGTGATAGCTAATCTTAAATTTAATT  1149
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTTCCTACACTGTAAATAAAGTGTGATAGCTAATCTTAAATTTAATT  1129

seq1  CCAGGTCGAATTTATGTTAAAAGTCATTTGGCCTTCTAGACTGAATTC  1197
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGTCGAATTTATGTTAAAAGTCATTTGGCCTTCTAGACTGAATTC  1177

seq1: chr4_71572875_71573658
seq2: B6Ng01-056D20.g_67_850

seq1  GAATTCTTGAGTAAGAAGTACTGAAAACTGGGCAGATTACTGTGAGACAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTGAGTAAGAAGTACTGAAAACTGGGCAGATTACTGTGAGACAC  50

seq1  CTGAGTATGGATGGGGTAATTTTCCTTAAGTAGTGAAGAATACTGAATAT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGTATGGATGGGGTAATTTTCCTTAAGTAGTGAAGAATACTGAATAT  100

seq1  AGGATCTGAAAGCATCCTAGAGTCCGGAATGGGGTTTTAGCCTGTTTTGT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATCTGAAAGCATCCTAGAGTCCGGAATGGGGTTTTAGCCTGTTTTGT  150

seq1  TTCAGAAGCTATTTTGCTTTCATGGGTGGAAATAGAGAATGGATAAGTGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCAGAAGCTATTTTGCTTTCATGGGTGGAAATAGAGAATGGATAAGTGG  200

seq1  CTTGCTTATTATTTAAGTTCTCAAAAACCTAGTAATTTTTCTAAGTGGCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGCTTATTATTTAAGTTCTCAAAAACCTAGTAATTTTTCTAAGTGGCA  250

seq1  AGTAGAAGAACAGCTGGAGTCCTGGGTCACTATAAGGTGTGGAGAAGGGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAGAAGAACAGCTGGAGTCCTGGGTCACTATAAGGTGTGGAGAAGGGG  300

seq1  GCTGGTGAGCATTCACATTTGTAAGCCAAATGCTAAGAATAAGGAGATCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGGTGAGCATTCACATTTGTAAGCCAAATGCTAAGAATAAGGAGATCT  350

seq1  GGGAAGACATAAATTTTTGAAATTTTGAACTGATAATTTCAGTTTCTGAG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAAGACATAAATTTTTGAAATTTTGAACTGATAATTTCAGTTTCTGAG  400

seq1  ATCAGAAATGTAATAATCCCAAATTGGTAACTCTCAAGGCTCCATGCCAA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCAGAAATGTAATAATCCCAAATTGGTAACTCTCAAGGCTCCATGCCAA  450

seq1  ATTAAACATATATCCCTCTGGTGGATCATGTAATCACATCCTTCAAATTA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAAACATATATCCCTCTGGTGGATCATGTAATCACATCCTTCAAATTA  500

seq1  TTTCTACAAACAATTGTACAAATAAGTAAAATGCTTGGAAAATAAAACAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTACAAACAATTGTACAAATAAGTAAAATGCTTGGAAAATAAAACAA  550

seq1  AATAGTCAGAAGTATAATGAGAAAACATCTAAACAAAAACAAAAACATAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATAGTCAGAAGTATAATGAGAAAACATCTAAACAAAAACAAAAACATAA  600

seq1  GAGGACCAAAGTATTGTTGTCAGGTAGATAGGTCTTGGTATACATCTATC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGACCAAAGTATTGTTGTCAGGTAGATAGGTCTTGGTATACATCTATC  650

seq1  TGTGTCTGTGTCTGTGTCTGTGTCTGTGTCTGTCTGTGTCTGTGTCTGTG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGTCTGTGTCTGTGTCTGTGTCTGTGTCTGTCTGTGTCTGTGTCTGTG  700

seq1  TCTGTGTCTGTGTCTGTGTCTGTGTCTGTGTCTGTGTCTGTGTCTATCTG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGTGTCTGTGTCTGTGTCTGTGTCTGTGTCTGTGTCTGTGTCTATCTG  750

seq1  TCTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTC  784
      |||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  TCTGTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCGC  784