BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-063E08
Chromosome4 (Build37)
Map Location 86,029,264 - 86,202,724
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAdamtsl1, 4930500O09Rik
Upstream geneSh3gl2, A930009N24, LOC668052
Downstream geneRraga, 6230416J20Rik, LOC100040388, Adfp, EG624685, Dennd4c, Rps6, Asah3l, Slc24a2
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-063E08.bB6Ng01-063E08.g
ACCDH883415DH883416
length1,135956
definitionDH883415|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-063E08, 5' end.DH883416|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-063E08, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(86,029,264 - 86,030,405)(86,201,760 - 86,202,724)
sequence
gaattctgtgggcaaaccgggctgggtggtaagacatgaagcttctgctg
cttagaagcctgggagtggagtcaaccctccaaaccttcagtcctccagc
tcctgcagagcctgtcctctgtggagcctcttcaaaaggtcacctaggag
ctcttgtcacataaaactgcttacctgtcaacttcagggaaacttcccag
ggaacccaggttgttccaagagtacagaatctggctgccaaggatgagca
cccatcgcgtgactatacatagtctctctgatgctcacagacaaaatata
agaatagatggtggaagggcagaggcctatcctttgggtcattttctctc
ctgcttctgaggtcaccactttgtgttctcttgttttgagaagatagcct
ttgtctgggtcacccttctgacactgtaacaacacatccaagataccaac
tcgtaaagagaaaagttcctgttggctcacggttttggaagcatcagtca
gttatcaactggcttgttactttgactcagtagttacataacagatcacc
agataggtgtgtagaagaggaaaaccatacaccacagggccaggaggcaa
aagagtaagaggggtctgggatcccttgacctgtcctcaaaggtgttcct
cccacagaccatctacttagacccacttcttagaagttcttccaaccaga
agattgtgcctggggagacatgggacttgtgaggacacaaaatccaaatg
agagagactggaaagatggctccatggttaagagtgtctgctattctcac
agaggatatgagttaggttcctagagccctcatagccacctgttacccaa
gttccagcggagttgatgcctctggcctccctctgtagacacctgcatcc
acatgcttatccccacacacagatgagcatgcacgcacataatctttttt
tttcttttgaagccatggcagcttgaaaaatagaagcatgcttcctagca
gctgtcatttgtctagtcaaaatggattttgatgttttatgtcttttggc
tttatttttaaataaagcttaaataaaaaataaagatattgtaaaaaatg
aaggcccaactgaactttcaagtcaagaactggca
gaattctgagctctgctacctacaagtgtggctcttgttttcgaggtttg
tcaggtgggaccagccagtgtccagggctaatttttcatactaccgaaca
ttcagtttgttttttttttctaagactttgcttccttgtggggccttttg
catcactcctggctccatctctgctctcagaagagtggggttgaagtctt
tgagtcccatctttgcacagtatgtagtctaggaagacggggactcatca
ggggtgaggaacgtagagtcagatgacacctccattcctatctgatgtcc
tcagattctctttttcccccaccctgcaaagttgctccttccactggata
taaagtctttctggcatgccttccttgcctccccctcctgtgtctacttt
acggttctgtcacgtgccttgggtctgactctcatgttggtcagtcttcc
ctcctgcctgcttagtctattttagtttttttttttttcctgtgattttg
atggggcatctcagagttcaaagcaaactttttggtctccactcatggtt
cctttgtcttgcttttttcccctttttgaaaatgcgtctaccttcttctg
cctcctaaccttttaagatcttgctcatgttataagactcccgtctggct
cagtcctatagaccccacctagtacagaggtaggaccccacttcctatgg
tcttttagctatgtgtatgccagcttcatatctagtgatggtgtgctctg
gaacagccaagctctgttttgtatgctttgtgatactgacctgttgagta
gtcagacacacctttgtaggatggtggtgggatctgtggagtccgtaggg
acataaatcttggagtggtgctgtcccagggttgccacagaatgccattt
tacttcagtgaatacaattgagggcttccccacctcctccagcacctgag
ggtgga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_86029264_86030405
seq2: B6Ng01-063E08.b_45_1179

seq1  GAATTCTGTGGGCAAACCGGGCTGGGTGGTAAGACATGAAGCTTCTGCTG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGTGGGCAAACCGGGCTGGGTGGTAAGACATGAAGCTTCTGCTG  50

seq1  CTTAGAAGCCTGGGAGTGGAGTCAACCCTCCAAACCTTCAGTCCTCCAGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTAGAAGCCTGGGAGTGGAGTCAACCCTCCAAACCTTCAGTCCTCCAGC  100

seq1  TCCTGCAGAGCCTGTCCTCTGTGGAGCCTCTTCAAAAGGTCACCTAGGAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTGCAGAGCCTGTCCTCTGTGGAGCCTCTTCAAAAGGTCACCTAGGAG  150

seq1  CTCTTGTCACATAAAACTGCTTACCTGTCAACTTCAGGGAAACTTCCCAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTGTCACATAAAACTGCTTACCTGTCAACTTCAGGGAAACTTCCCAG  200

seq1  GGAACCCAGGTTGTTCCAAGAGTACAGAATCTGGCTGCCAAGGATGAGCA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAACCCAGGTTGTTCCAAGAGTACAGAATCTGGCTGCCAAGGATGAGCA  250

seq1  CCCATCGCGTGACTATACATAGTCTCTCTGATGCTCACAGACAAAATATA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCATCGCGTGACTATACATAGTCTCTCTGATGCTCACAGACAAAATATA  300

seq1  AGAATAGATGGTGGAAGGGCAGAGGCCTATCCTTTGGGTCATTTTCTCTC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATAGATGGTGGAAGGGCAGAGGCCTATCCTTTGGGTCATTTTCTCTC  350

seq1  CTGCTTCTGAGGTCACCACTTTGTGTTCTCTTGTTTTGAGAAGATAGCCT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTTCTGAGGTCACCACTTTGTGTTCTCTTGTTTTGAGAAGATAGCCT  400

seq1  TTGTCTGGGTCACCCTTCTGACACTGTAACAACACATCCAAGATACCAAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGTCTGGGTCACCCTTCTGACACTGTAACAACACATCCAAGATACCAAC  450

seq1  TCGTAAAGAGAAAAGTTCCTGTTGGCTCACGGTTTTGGAAGCATCAGTCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCGTAAAGAGAAAAGTTCCTGTTGGCTCACGGTTTTGGAAGCATCAGTCA  500

seq1  GTTATCAACTGGCTTGTTACTTTGACTCAGTAGTTACATAACAGATCACC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTATCAACTGGCTTGTTACTTTGACTCAGTAGTTACATAACAGATCACC  550

seq1  AGATAGGTGTGTAGAAGAGGAAAACCATACACCACAGGGCCAGGAGGCAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATAGGTGTGTAGAAGAGGAAAACCATACACCACAGGGCCAGGAGGCAA  600

seq1  AAGAGTAAGAGGGGTCTGGGATCCCTTGACCTGTCCTCAAAGGTGTTCCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGAGTAAGAGGGGTCTGGGATCCCTTGACCTGTCCTCAAAGGTGTTCCT  650

seq1  CCCACAGACCATCTACTTAGACCCACTTCTTAGAAGTTCTTCCAACCAGA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCACAGACCATCTACTTAGACCCACTTCTTAGAAGTTCTTCCAACCAGA  700

seq1  AGATTGTGCCTGGGGAGACATGGGACTTGTGAGGACACAAAATCCAAATG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATTGTGCCTGGGGAGACATGGGACTTGTGAGGACACAAAATCCAAATG  750

seq1  AGAGAGACTGGAAAGATGGCTCCATGGTTAAGAGTGTCTGCTATTCTCAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGAGACTGGAAAGATGGCTCCATGGTTAAGAGTGTCTGCTATTCTCAC  800

seq1  AGAGGATATGAGTTAGGTTCCTAGAGCCCTCATAGCCACCTGTTACCCAA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAGGATATGAGTTAGGTTCCTAGAGCCCTCATAGCCACCTGTTACCCAA  850

seq1  GTTCCAGCGGAGTTGATGCCTCTGGCCTCCCTCTGTAGACACCTGCATCC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCCAGCGGAGTTGATGCCTCTGGCCTCCCTCTGTAGACACCTGCATCC  900

seq1  ACATGCTTATCCCCACACACAGATGAGCATGCACGCACATAATCTTTTTT  950
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  ACATGCTTATCCCCACACACAGATGAGCATGCACGCACATAATC-TTTTT  949

seq1  TTTTCTTATTGAAGCCATGGCAGCTTGAAAAATAGAAGCATGCTTCCTAG  1000
      ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTCTT-TTGAAGCCATGGCAGCTTGAAAAATAGAAGCATGCTTCCTAG  998

seq1  CAGCTGTCATTTGTCTAGGTCAAAAATGGATTTTGATGTTTTATGTCTTT  1050
      ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTGTCATTTGTCTA-GTC-AAAATGGATTTTGATGTTTTATGTCTTT  1046

seq1  TGGCTTTATTCTTAACATAAAGCTTATATAAAAAATAAGTATA-TGTATA  1099
      |||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||  ||| |||| |
seq2  TGGCTTTATTTTTAA-ATAAAGCTTAAATAAAAAATAAAGATATTGTA-A  1094

seq1  AAAATGATGCCACAACTGACCTTTTCCAAGTCAAGAACTGGCA  1142
      ||||||| | | ||||||| ||||  |||||||||||||||||
seq2  AAAATGAAGGCCCAACTGAACTTT--CAAGTCAAGAACTGGCA  1135

seq1: chr4_86201760_86202724
seq2: B6Ng01-063E08.g_69_1024 (reverse)

seq1  TCCAGCCCTCAAGTGGCTGGAGGAAGTTGGGGAAGCCCTCAATTGTAATT  50
      |||| |||||| || |||||||| || ||||||||||||||||||| |||
seq2  TCCA-CCCTCAGGT-GCTGGAGG-AGGTGGGGAAGCCCTCAATTGT-ATT  46

seq1  CACTGAAGTAAAATGGCATCATGTGGCAAGCACTGGAGACAGCACCACTC  100
      |||||||||||||||||||  |||||||| | |||| |||||||||||||
seq2  CACTGAAGTAAAATGGCATTCTGTGGCAA-CCCTGG-GACAGCACCACTC  94

seq1  C-AGATTGTATGTCCCTAACGGACTCCACAGATCCCACCACCATCCTACA  149
      | ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGATT-TATGTCCCT-ACGGACTCCACAGATCCCACCACCATCCTACA  142

seq1  AAGGTGTGTTCTGACTACTCAACAGGTCAGTATCACAAAGCATACAAAAA  199
      |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||
seq2  AAGGTGTG-TCTGACTACTCAACAGGTCAGTATCACAAAGCATAC-AAAA  190

seq1  CAGAGCTTGGCTGTTCCAGAGCACACCATCACTAGATATGAAGCTGGCAT  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGCTTGGCTGTTCCAGAGCACACCATCACTAGATATGAAGCTGGCAT  240

seq1  ACACATAGCTAAAAGACCATAGGAAGTGGGGTCCTACCTCTGTACTAGGT  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACATAGCTAAAAGACCATAGGAAGTGGGGTCCTACCTCTGTACTAGGT  290

seq1  GGGGTCTATAGGACTGAGCCAGACGGGAGTCTTATAACATGAGCAAGATC  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGTCTATAGGACTGAGCCAGACGGGAGTCTTATAACATGAGCAAGATC  340

seq1  TTAAAAGGTTAGGAGGCAGAAGAAGGTAGACGCATTTTCAAAAAGGGGAA  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAAAAGGTTAGGAGGCAGAAGAAGGTAGACGCATTTTCAAAAAGGGGAA  390

seq1  AAAAGCAAGACAAAGGAACCATGAGTGGAGACCAAAAAGTTTGCTTTGAA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAGCAAGACAAAGGAACCATGAGTGGAGACCAAAAAGTTTGCTTTGAA  440

seq1  CTCTGAGATGCCCCATCAAAATCACAGGAAAAAAAAAAAAACTAAAATAG  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTGAGATGCCCCATCAAAATCACAGGAAAAAAAAAAAAACTAAAATAG  490

seq1  ACTAAGCAGGCAGGAGGGAAGACTGACCAACATGAGAGTCAGACCCAAGG  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTAAGCAGGCAGGAGGGAAGACTGACCAACATGAGAGTCAGACCCAAGG  540

seq1  CACGTGACAGAACCGTAAAGTAGACACAGGAGGGGGAGGCAAGGAAGGCA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGTGACAGAACCGTAAAGTAGACACAGGAGGGGGAGGCAAGGAAGGCA  590

seq1  TGCCAGAAAGACTTTATATCCAGTGGAAGGAGCAACTTTGCAGGGTGGGG  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCAGAAAGACTTTATATCCAGTGGAAGGAGCAACTTTGCAGGGTGGGG  640

seq1  GAAAAAGAGAATCTGAGGACATCAGATAGGAATGGAGGTGTCATCTGACT  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAAAGAGAATCTGAGGACATCAGATAGGAATGGAGGTGTCATCTGACT  690

seq1  CTACGTTCCTCACCCCTGATGAGTCCCCGTCTTCCTAGACTACATACTGT  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTACGTTCCTCACCCCTGATGAGTCCCCGTCTTCCTAGACTACATACTGT  740

seq1  GCAAAGATGGGACTCAAAGACTTCAACCCCACTCTTCTGAGAGCAGAGAT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAAAGATGGGACTCAAAGACTTCAACCCCACTCTTCTGAGAGCAGAGAT  790

seq1  GGAGCCAGGAGTGATGCAAAAGGCCCCACAAGGAAGCAAAGTCTTAGAAA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGAGCCAGGAGTGATGCAAAAGGCCCCACAAGGAAGCAAAGTCTTAGAAA  840

seq1  AAAAAAACAAACTGAATGTTCGGTAGTATGAAAAATTAGCCCTGGACACT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAAAAACAAACTGAATGTTCGGTAGTATGAAAAATTAGCCCTGGACACT  890

seq1  GGCTGGTCCCACCTGACAAACCTCGAAAACAAGAGCCACACTTGTAGGTA  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTGGTCCCACCTGACAAACCTCGAAAACAAGAGCCACACTTGTAGGTA  940

seq1  GCAGAGCTCAGAATTC  965
      ||||||||||||||||
seq2  GCAGAGCTCAGAATTC  956