BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-063I03
Chromosome4 (Build37)
Map Location 37,467,873 - 37,603,357
singlet/doubletdoublet
Overlap genenone
Upstream geneLOC100042132, LOC545600, LOC621458
Downstream geneLOC277771, LOC100039448
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-063I03.bB6Ng01-063I03.g
ACCDH883581DH883582
length1,121999
definitionDH883581|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-063I03, 5' end.DH883582|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-063I03, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(37,602,228 - 37,603,357)(37,467,873 - 37,468,889)
sequence
gaattccaggtcatccaggtctacataattaaacactgtttcaaaaaata
gtgatagtaaaataacacattaatctggcttgtaaatctgtgaatcagtt
ttaaaattagatattaatgaggtgattcttgattctggaatttgtaaaac
ctacacctgattgctctgatggacttaggttgatctcatgcaatcattca
agacatattggggtaggaaaggtacagtctaaatgttgtattttctagca
atgtcctcaaacttataatttattaagtgtttatatataacaagatagag
atacagagagagagaaaaatagagaaagagaaagagcaaggagagagaga
gagagagagagagagagagtcaaacttaaattcatcaggaagagcaatta
caaaagagagcaaaccaaacattgatagtaactaccgagtagaagcattg
gtagctgcagcatagtaaaagccattcttctgggtccagagagcaacaaa
tttaatgtccaagaagcagactttcctttctttcaaattcctagtgttcc
caaccaggagtttagacttcctattttaaaaatgtgttagtaaaaattct
gaaactgataaagtagctttttctaaaagagtaagagatgtaaatttctt
ctaaagttttttattagatcagataaaccaggatatttttaataccaaaa
actgtagtaaaatatgcataatcgggatgaggtggagaaagacattggtt
aagaactatttaatgagttactatattgaactgactcccttgttgaaggt
ctaagacttcttttagttctggatgttatttttttctttcttctacaggt
aagtctctatatctgctcaccctccattttattaacactatccttttcaa
taccaattagctgctaacacatgtagatgagttttatcaagtgggatgaa
actagaataaaagcaatcagttatcccttgtgcccagttctctctgctgg
tgcagattcttggctgtctgctctactgaagacccataatcctgatccat
cttcagaagccggttcacctcagagaagttggtaagaacctgacaccccc
acctgagtctcgagctgctgg
gaattccaacaacacagaaaacagtctcaataactgacaaatagagttac
atggaaatagtattatcatatgactggtaaatatcacttctgatcaaaag
ctcaaaggacattctgtcctgccacacagtcacttgagaatccatgttta
tctcgctccttttgcaacggcaagaacatggacacatcccagaagatgtg
tccatttaagaaatgaaagaaggaatgaaaggcagtaaattgatacaaag
gaatattatttagctttgaagaggagcttaattattaaatgttcaggtag
attgaattggaatatagcatataaaagacattaatactacttgaagaaaa
atagtctatataccagttcatatgcagattctgccctctgactgttacat
gtttatatgggagtaactatgggtaaaaaaccaggaaaataagaaagggt
caacagttggggaagaattaagtgtgaagagaataggggacaatagaata
aatggtaacaggaatatgggtaaagttgagtgcttaaaattttggagaag
aaataattaatcaaaatgaaatatatctgaatgctcacatggacacatca
ctttgtaagacaactaaaccaataaatggacaagcaaataacaagagaaa
atttcaaagtattgctagccttttccctcccccccccctcgagttatgta
gatatcctaatgtgactgtttccaattctgatgggaaattgtgcatatca
tttgatttgtaaaatgttattcccaaacataaagtcataaagcagtaact
attgccacacctttgagaagcagcccttcctgacatatggagatcaattg
ggaaactctgctatggctttaaaatcctgagttaaatgcatataagtctc
tgcactggatgtcaagtactctgcatgtgtgtgatgctgggctatttcta
gaatcatctggagctgtgacaaaataccaaccatagtactctgctgcat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_37602228_37603357
seq2: B6Ng01-063I03.b_45_1165 (reverse)

seq1  CCAGCAGCAGCTCTGAGACTTCAGGGTGTGGGTGGTCAGGTTCTTACCAA  50
          ||||||||| ||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||
seq2  ---CCAGCAGCTC-GAGAC-TCA-GGTGGGGGT-GTCAGGTTCTTACCAA  43

seq1  CTGCTCTGA-GTGCACCGGCTTCCTGAAGATGGATCAGGATATGGGGTCT  99
      || |||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||   ||||||
seq2  CTTCTCTGAGGTGAACCGGCTT-CTGAAGATGGATCAGGATTATGGGTCT  92

seq1  TCAGTAGAGCAGACCAGCCAAGAATCTGCACCAGCAGAGAGAACTGGGCA  149
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGTAGAGCAGA-CAGCCAAGAATCTGCACCAGCAGAGAGAACTGGGCA  141

seq1  CAAGGGATAACTGATTGCTTTTATTCTAGTTTCATCCCACTTGATAAAAC  199
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  CAAGGGATAACTGATTGCTTTTATTCTAGTTTCATCCCACTTGATAAAA-  190

seq1  CTCATCTACATGTGTTAGCAGCTAATTGGTATTGAAAAGGATAGTGTTAA  249
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATCTACATGTGTTAGCAGCTAATTGGTATTGAAAAGGATAGTGTTAA  240

seq1  TAAAATGGAGGGTGAGCAGATATAGAGACTTACCTGTAGAAGAAAGAAAA  299
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAAATGGAGGGTGAGCAGATATAGAGACTTACCTGTAGAAGAAAGAAAA  290

seq1  AAATAACATCCAGAACTAAAAGAAGTCTTAGACCTTCAACAAGGGAGTCA  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAACATCCAGAACTAAAAGAAGTCTTAGACCTTCAACAAGGGAGTCA  340

seq1  GTTCAATATAGTAACTCATTAAATAGTTCTTAACCAATGTCTTTCTCCAC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCAATATAGTAACTCATTAAATAGTTCTTAACCAATGTCTTTCTCCAC  390

seq1  CTCATCCCGATTATGCATATTTTACTACAGTTTTTGGTATTAAAAATATC  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCATCCCGATTATGCATATTTTACTACAGTTTTTGGTATTAAAAATATC  440

seq1  CTGGTTTATCTGATCTAATAAAAAACTTTAGAAGAAATTTACATCTCTTA  499
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTTTATCTGATCTAATAAAAAACTTTAGAAGAAATTTACATCTCTTA  490

seq1  CTCTTTTAGAAAAAGCTACTTTATCAGTTTCAGAATTTTTACTAACACAT  549
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTTTTAGAAAAAGCTACTTTATCAGTTTCAGAATTTTTACTAACACAT  540

seq1  TTTTAAAATAGGAAGTCTAAACTCCTGGTTGGGAACACTAGGAATTTGAA  599
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTAAAATAGGAAGTCTAAACTCCTGGTTGGGAACACTAGGAATTTGAA  590

seq1  AGAAAGGAAAGTCTGCTTCTTGGACATTAAATTTGTTGCTCTCTGGACCC  649
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAAGGAAAGTCTGCTTCTTGGACATTAAATTTGTTGCTCTCTGGACCC  640

seq1  AGAAGAATGGCTTTTACTATGCTGCAGCTACCAATGCTTCTACTCGGTAG  699
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGAATGGCTTTTACTATGCTGCAGCTACCAATGCTTCTACTCGGTAG  690

seq1  TTACTATCAATGTTTGGTTTGCTCTCTTTTGTAATTGCTCTTCCTGATGA  749
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACTATCAATGTTTGGTTTGCTCTCTTTTGTAATTGCTCTTCCTGATGA  740

seq1  ATTTAAGTTTGACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTTGCTCTT  799
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTTAAGTTTGACTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCCTTGCTCTT  790

seq1  TCTCTTTCTCTATTTTTCTCTCTCTCTGTATCTCTATCTTGTTATATATA  849
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCTTTCTCTATTTTTCTCTCTCTCTGTATCTCTATCTTGTTATATATA  840

seq1  AACACTTAATAAATTATAAGTTTGAGGACATTGCTAGAAAATACAACATT  899
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACACTTAATAAATTATAAGTTTGAGGACATTGCTAGAAAATACAACATT  890

seq1  TAGACTGTACCTTTCCTACCCCAATATGTCTTGAATGATTGCATGAGATC  949
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGACTGTACCTTTCCTACCCCAATATGTCTTGAATGATTGCATGAGATC  940

seq1  AACCTAAGTCCATCAGAGCAATCAGGTGTAGGTTTTACAAATTCCAGAAT  999
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACCTAAGTCCATCAGAGCAATCAGGTGTAGGTTTTACAAATTCCAGAAT  990

seq1  CAAGAATCACCTCATTAATATCTAATTTTAAAACTGATTCACAGATTTAC  1049
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAGAATCACCTCATTAATATCTAATTTTAAAACTGATTCACAGATTTAC  1040

seq1  AAGCCAGATTAATGTGTTATTTTACTATCACTATTTTTTGAAACAGTGTT  1099
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCAGATTAATGTGTTATTTTACTATCACTATTTTTTGAAACAGTGTT  1090

seq1  TAATTATGTAGACCTGGATGACCTGGAATTC  1130
      |||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTATGTAGACCTGGATGACCTGGAATTC  1121

seq1: chr4_37467873_37468889
seq2: B6Ng01-063I03.g_64_1062

seq1  GAATTCCAACAACACAGAAAACAGTCTCAATAACTGACAAATAGAGTTAC  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAACAACACAGAAAACAGTCTCAATAACTGACAAATAGAGTTAC  50

seq1  ATGGAAATAGTATTATCATATGACTGGTAAATATCACTTCTGATCAAAAG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGGAAATAGTATTATCATATGACTGGTAAATATCACTTCTGATCAAAAG  100

seq1  CTCAAAGGACATTCTGTCCTGCCACACAGTCACTTGAGAATCCATGTTTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCAAAGGACATTCTGTCCTGCCACACAGTCACTTGAGAATCCATGTTTA  150

seq1  TCTCGCTCCTTTTGCAACGGCAAGAACATGGACACATCCCAGAAGATGTG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCGCTCCTTTTGCAACGGCAAGAACATGGACACATCCCAGAAGATGTG  200

seq1  TCCATTTAAGAAATGAAAGAAGGAATGAAAGGCAGTAAATTGATACAAAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCATTTAAGAAATGAAAGAAGGAATGAAAGGCAGTAAATTGATACAAAG  250

seq1  GAATATTATTTAGCTTTGAAGAGGAGCTTAATTATTAAATGTTCAGGTAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATATTATTTAGCTTTGAAGAGGAGCTTAATTATTAAATGTTCAGGTAG  300

seq1  ATTGAATTGGAATATAGCATATAAAAGACATTAATACTACTTGAAGAAAA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTGAATTGGAATATAGCATATAAAAGACATTAATACTACTTGAAGAAAA  350

seq1  ATAGTCTATATACCAGTTCATATGCAGATTCTGCCCTCTGACTGTTACAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAGTCTATATACCAGTTCATATGCAGATTCTGCCCTCTGACTGTTACAT  400

seq1  GTTTATATGGGAGTAACTATGGGTAAAAAACCAGGAAAATAAGAAAGGGT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTATATGGGAGTAACTATGGGTAAAAAACCAGGAAAATAAGAAAGGGT  450

seq1  CAACAGTTGGGGAAGAATTAAGTGTGAAGAGAATAGGGGACAATAGAATA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACAGTTGGGGAAGAATTAAGTGTGAAGAGAATAGGGGACAATAGAATA  500

seq1  AATGGTAACAGGAATATGGGTAAAGTTGAGTGCTTAAAATTTTGGAGAAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGTAACAGGAATATGGGTAAAGTTGAGTGCTTAAAATTTTGGAGAAG  550

seq1  AAATAATTAATCAAAATGAAATATATCTGAATGCTCACATGGACACATCA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATAATTAATCAAAATGAAATATATCTGAATGCTCACATGGACACATCA  600

seq1  CTTTGTAAGACAACTAAACCAATAAATGGACAAGCAAATAACAAGAGAAA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGTAAGACAACTAAACCAATAAATGGACAAGCAAATAACAAGAGAAA  650

seq1  ATTTCAAAGTATTGCTTAAATCATCCCTGGAACAGTCATATGGAGTTATG  700
      ||||||||||||||||    |  |||||    |   |   | ||||||||
seq2  ATTTCAAAGTATTGCTAGCCTTTTCCCT--CCCCCCCCCCTCGAGTTATG  698

seq1  TAGATATCCTAATGTGACTGTTTCCAATTCTGATGGGAAATTGTGCATAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATATCCTAATGTGACTGTTTCCAATTCTGATGGGAAATTGTGCATAT  748

seq1  CATTTGATTTGTAAAATGTTATTCCCAAACATAAAGTCATAAAGCAGTAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATTTGATTTGTAAAATGTTATTCCCAAACATAAAGTCATAAAGCAGTAA  798

seq1  CTATTGCCACACCTTTGAGAAGCAGCCCTTCCTGACATATGGAGATCAAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTGCCACACCTTTGAGAAGCAGCCCTTCCTGACATATGGAGATCAAT  848

seq1  TGGGAAACTCTGCTATGGCTTTAAAAATCCTGAGTTAAATGCATATAAAG  900
      |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TGGGAAACTCTGCTATGGCTTT-AAAATCCTGAGTTAAATGCATAT-AAG  896

seq1  TCTCTGCACTGGATGTTCAAGGTAACTCTTGCATGTGGTGTGAATGCTGG  950
      ||||||||||||||| |||||   |||| ||||||| ||||| |||||||
seq2  TCTCTGCACTGGATG-TCAAG--TACTC-TGCATGT-GTGTG-ATGCTGG  940

seq1  GCTATTTCCTAGAAATTCATCTGGAGCTGTTGACAAAATACCAACCCATA  1000
      ||||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||
seq2  GCTATTT-CTAGAA--TCATCTGGAGCTG-TGACAAAATACCAA-CCATA  985

seq1  GGTAACTCTGCTTGCAT  1017
      |   ||||||| |||||
seq2  G--TACTCTGC-TGCAT  999