BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-069I14
Chromosome4 (Build37)
Map Location 95,841,700 - 95,938,208
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC546837
Upstream geneLOC100042411, 2310009E04Rik, Hook1, Cyp2j13, LOC242546
Downstream geneCyp2j11, LOC665095, Cyp2j6, Cyp2j9, Cyp2j5, LOC100039415, LOC620779
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-069I14.bB6Ng01-069I14.g
ACCDH887813DH887814
length1,179993
definitionDH887813|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-069I14, 5' end.DH887814|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-069I14, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(95,937,011 - 95,938,208)(95,841,700 - 95,842,516)
sequence
gaattcaagtgcttgtttatctcctctgagtcacttgtaaattttactag
aaaccaagtgcaattatgcatgtacttgtttcagtgtcatggagttcata
aattcataatttaataatttttcagttcacttctcctatcctggaatttg
acatgccttgtgttttggtattacagtttatgctttcttggacatctatt
ctggagtgtatggaagtaacagttacataatgttttagcttgaccatact
atgggcatacatagttccagaaagaatgaatttgaaccaccagtactggt
cctttaaaagttcattttctatttaagatcttctgtttatatgcatcaaa
ttctctttgattcaccaaaaggtggatttttttctaacttgtgctatccc
tatcatcacttttttctcaagttcaaggatgccttcactgaaaactaaga
aactggttaacatgaatcataggcatgaaaaggaacataaagaatgacct
cttagtttcacttattgcctacactatttcatgctccttgttttatctaa
tactcatggtagttccaactacaacaacttatggctttcttcccagtaag
cagagcctagaacatcagtggagatcagtgagtgcccagccaacttctaa
gtgtttatcgggggaaaaaaaccttaaaggggaaaaaagaggtggcagag
tgtaatgataaatattcctggaaagccgagttaagtcccccaatttcata
gacagctggaaaatccgtttattttcacaatgcccctctacatagaaaat
gtggcagcaggtaccctgcccagccagagaacctcactacttccagatgc
acctgttcccacagcagaacatctgctctggatcccacccactcagcaca
cactgagttgcaacttaaactcacccatccccaaggtgttctaacacatc
caggatcacaggtgagaccccaatccctgcccaatgtctggtatattcag
accatggaacacagggatgcagtaccccactaaacagagacccatgctca
ttccagttgcacctggcctgagataagactctgctttggatccctaccac
tcaacccccactaagatgcaagttgatgcgcagttctgaccactccgatc
ctgtatactcatgaacacggatcatagga
gaattcaatgattcttgaaggtgattgatggaagtttcaattttctctat
atctaaatcaatggctgccctcagactgtcacaatttttcccttgtaaga
ccaaagtggaggtctcagtgactgccctgtccactcacaatctcaacaga
aaggagacagtaagagctgtaacaggtttggtggacaggcttataggatg
gaggaaggaaacagaatctaaaggtgccaccaggctgtcatgataaagat
cagtgatcttgaacttaagcagattgtccgtcgtctgtcccatacagcag
gggacccccagagagcggggtgtctgccggtttcatatgggaagcatgca
cccaggctgcaataccatccatcttgagtactgtgggagtggttaacatc
accaggaagggtttcttccactggggttacagcaactgtgcccaatgcct
ccttatatagacccagtcaccagtctggaagcagtgaggggtccctggca
taccaggaatatttaaggcaaacagtttgggccaaatctaatgttgtctt
gacttaagaggctcctatcagtgatttgggatacctccagtggacaccaa
gagaggtagggtaccaaacaggatctcaaaaggggtcaggctaaaatggt
agggcatgttccaggctcagaacagggccagggaaaggagcatggcccag
tcactgatagtgtccaagtacaatttaattaaggtctcttttaggattat
gttcattctctctacctgccctgatctctggggacagtacagataatgga
tcttccaattagtccccaatgtctctgccaattcctgacttatcttacag
acaaaacaggaccctttgtccaattcaattactttaggcatgccgacctc
aggaaatttcctctgatatcctcttggctatatagtagctgtttctgctt
ggtggagaatccttacctatttcagagaagtatccacaaacac
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_95937011_95938208
seq2: B6Ng01-069I14.b_42_1220 (reverse)

seq1  TCCTATGATCCTGTGCTCCTTTGATGATCATGTGATCTGGGATGTGTCAG  50
      ||||||||||| ||| ||   |||  || |   ||||  |||   |||||
seq2  TCCTATGATCC-GTGTTC--ATGAGTAT-ACAGGATC--GGAGTGGTCAG  44

seq1  AACTGCTGGCAATCAACCTGCATCTTGGTGTGGGTTGAGTTGGTAGGGAT  100
      ||||||  || |||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||
seq2  AACTGC--GC-ATCAACTTGCATCTTAGTGGGGGTTGAG-TGGTAGGGAT  90

seq1  CCAGAGCAGAGTCTCTGCTCCAGGCCCAGGTGCAAACTGGAATGAGCATG  150
      ||| ||||||||||   || |||| |||||||| ||||||||||||||||
seq2  CCAAAGCAGAGTCTTATCT-CAGG-CCAGGTGC-AACTGGAATGAGCATG  137

seq1  GGTCTCTGGTTTAGTGGGGTACCTGCATCCCTGTGTTTCCATGGTCCTGA  200
      ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||
seq2  GGTCTCT-GTTTAGTGGGGTA-CTGCATCCCTGTG-TTCCATGGT-CTGA  183

seq1  ATATACCAGACATTGGGGCAGGGATTGGGGTCTCACCTGTGATCCTGGAT  250
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATACCAGACATT-GGGCAGGGATTGGGGTCTCACCTGTGATCCTGGAT  232

seq1  GTGTTAGAACACCTTGGGGATGGGTGAGTTTAAGTTGCAACTCAGTGTGT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTTAGAACACCTTGGGGATGGGTGAGTTTAAGTTGCAACTCAGTGTGT  282

seq1  GCTGAGTGGGTGGGATCCAGAGCAGATGTTCTGCTGTGGGAACAGGTGCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
seq2  GCTGAGTGGGTGGGATCCAGAGCAGATGTTCTGCTGTGGGAACAGGTGC-  331

seq1  ATCTGGAAGTAGTGAGGTTCTCTGGCTGGGCAGGGTACCTGCTGCCACAT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTGGAAGTAGTGAGGTTCTCTGGCTGGGCAGGGTACCTGCTGCCACAT  381

seq1  TTTCTATGTAGAGGGGCATTGTGAAAATAAACGGATTTTCCAGCTGTCTA  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTATGTAGAGGGGCATTGTGAAAATAAACGGATTTTCCAGCTGTCTA  431

seq1  TGAAATTGGGGGACTTAACTCGGCTTTCCAGGAATATTTATCATTACACT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAAATTGGGGGACTTAACTCGGCTTTCCAGGAATATTTATCATTACACT  481

seq1  CTGCCACCTCTTTTTTCCCCTTTAAGGTTTTTTTCCCCCGATAAACACTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCACCTCTTTTTTCCCCTTTAAGGTTTTTTTCCCCCGATAAACACTT  531

seq1  AGAAGTTGGCTGGGCACTCACTGATCTCCACTGATGTTCTAGGCTCTGCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAAGTTGGCTGGGCACTCACTGATCTCCACTGATGTTCTAGGCTCTGCT  581

seq1  TACTGGGAAGAAAGCCATAAGTTGTTGTAGTTGGAACTACCATGAGTATT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACTGGGAAGAAAGCCATAAGTTGTTGTAGTTGGAACTACCATGAGTATT  631

seq1  AGATAAAACAAGGAGCATGAAATAGTGTAGGCAATAAGTGAAACTAAGAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGATAAAACAAGGAGCATGAAATAGTGTAGGCAATAAGTGAAACTAAGAG  681

seq1  GTCATTCTTTATGTTCCTTTTCATGCCTATGATTCATGTTAACCAGTTTC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCATTCTTTATGTTCCTTTTCATGCCTATGATTCATGTTAACCAGTTTC  731

seq1  TTAGTTTTCAGTGAAGGCATCCTTGAACTTGAGAAAAAAGTGATGATAGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTTTTCAGTGAAGGCATCCTTGAACTTGAGAAAAAAGTGATGATAGG  781

seq1  GATAGCACAAGTTAGAAAAAAATCCACCTTTTGGTGAATCAAAGAGAATT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATAGCACAAGTTAGAAAAAAATCCACCTTTTGGTGAATCAAAGAGAATT  831

seq1  TGATGCATATAAACAGAAGATCTTAAATAGAAAATGAACTTTTAAAGGAC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGCATATAAACAGAAGATCTTAAATAGAAAATGAACTTTTAAAGGAC  881

seq1  CAGTACTGGTGGTTCAAATTCATTCTTTCTGGAACTATGTATGCCCATAG  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTACTGGTGGTTCAAATTCATTCTTTCTGGAACTATGTATGCCCATAG  931

seq1  TATGGTCAAGCTAAAACATTATGTAACTGTTACTTCCATACACTCCAGAA  1000
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGGTCAAGCTAAAACATTATGTAACTGTTACTTCCATACACTCCAGAA  981

seq1  TAGATGTCCAAGAAAGCATAAACTGTAATACCAAAACACAAGGCATGTCA  1050
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGATGTCCAAGAAAGCATAAACTGTAATACCAAAACACAAGGCATGTCA  1031

seq1  AATTCCAGGATAGGAGAAGTGAACTGAAAAATTATTAAATTATGAATTTA  1100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCCAGGATAGGAGAAGTGAACTGAAAAATTATTAAATTATGAATTTA  1081

seq1  TGAACTCCATGACACTGAAACAAGTACATGCATAATTGCACTTGGTTTCT  1150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAACTCCATGACACTGAAACAAGTACATGCATAATTGCACTTGGTTTCT  1131

seq1  AGTAAAATTTACAAGTGACTCAGAGGAGATAAACAAGCACTTGAATTC  1198
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTAAAATTTACAAGTGACTCAGAGGAGATAAACAAGCACTTGAATTC  1179

seq1: chr4_95841700_95842516
seq2: B6Ng01-069I14.g_70_886

seq1  GAATTCAATGATTCTTGAAGGTGATTGATGGAAGTTTCAATTTTCTCTAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCAATGATTCTTGAAGGTGATTGATGGAAGTTTCAATTTTCTCTAT  50

seq1  ATCTAAATCAATGGCTGCCCTCAGACTGTCACAATTTTTCCCTTGTAAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATCTAAATCAATGGCTGCCCTCAGACTGTCACAATTTTTCCCTTGTAAGA  100

seq1  CCAAAGTGGAGGTCTCAGTGACTGCCCTGTCCACTCACAATCTCAACAGA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAAAGTGGAGGTCTCAGTGACTGCCCTGTCCACTCACAATCTCAACAGA  150

seq1  AAGGAGACAGTAAGAGCTGTAACAGGTTTGGTGGACAGGCTTATAGGATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGGAGACAGTAAGAGCTGTAACAGGTTTGGTGGACAGGCTTATAGGATG  200

seq1  GAGGAAGGAAACAGAATCTAAAGGTGCCACCAGGCTGTCATGATAAAGAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGGAAGGAAACAGAATCTAAAGGTGCCACCAGGCTGTCATGATAAAGAT  250

seq1  CAGTGATCTTGAACTTAAGCAGATTGTCCGTCGTCTGTCCCATACAGCAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTGATCTTGAACTTAAGCAGATTGTCCGTCGTCTGTCCCATACAGCAG  300

seq1  GGGACCCCCAGAGAGCGGGGTGTCTGCCGGTTTCATATGGGAAGCATGCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGACCCCCAGAGAGCGGGGTGTCTGCCGGTTTCATATGGGAAGCATGCA  350

seq1  CCCAGGCTGCAATACCATCCATCTTGAGTACTGTGGGAGTGGTTAACATC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCAGGCTGCAATACCATCCATCTTGAGTACTGTGGGAGTGGTTAACATC  400

seq1  ACCAGGAAGGGTTTCTTCCACTGGGGTTACAGCAACTGTGCCCAATGCCT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCAGGAAGGGTTTCTTCCACTGGGGTTACAGCAACTGTGCCCAATGCCT  450

seq1  CCTTATATAGACCCAGTCACCAGTCTGGAAGCAGTGAGGGGTCCCTGGCA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTTATATAGACCCAGTCACCAGTCTGGAAGCAGTGAGGGGTCCCTGGCA  500

seq1  TACCAGGAATATTTAAGGCAAACAGTTTGGGCCAAATCTAATGTTGTCTT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACCAGGAATATTTAAGGCAAACAGTTTGGGCCAAATCTAATGTTGTCTT  550

seq1  GACTTAAGAGGCTCCTATCAGTGATTTGGGATACCTCCAGTGGACACCAA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GACTTAAGAGGCTCCTATCAGTGATTTGGGATACCTCCAGTGGACACCAA  600

seq1  GAGAGGTAGGGTACCAAACAGGATCTCAAAAGGGGTCAGGCTAAAATGGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGAGGTAGGGTACCAAACAGGATCTCAAAAGGGGTCAGGCTAAAATGGT  650

seq1  AGGGCATGTTCCAGGCTCAGAACAGGGCCAGGGAAAGGAGCATGGCCCAG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGCATGTTCCAGGCTCAGAACAGGGCCAGGGAAAGGAGCATGGCCCAG  700

seq1  TCACTGATAGTGTCCAAGTACAATTTAATTAAGGTCTCTTTTAGGATTAT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACTGATAGTGTCCAAGTACAATTTAATTAAGGTCTCTTTTAGGATTAT  750

seq1  GTTCATTCTCTCTACCTGCCCTGATCTCTGGGGACAGTACAGATAATGGA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTCATTCTCTCTACCTGCCCTGATCTCTGGGGACAGTACAGATAATGGA  800

seq1  TCTTCCAATTAGTCCCC  817
      |||||||||||||||||
seq2  TCTTCCAATTAGTCCCC  817