BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-070L13
Chromosome4 (Build37)
Map Location 5,702,910 - 5,704,057
singlet/doubletsinglet
Overlap gene1700012H17Rik
Upstream geneImpad1, LOC100039338
Downstream geneLOC669309, 3110003A22Rik, Cyp7a1, Sdcbp, Nsmaf, LOC100039397, LOC100039414, Tox
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-070L13.bB6Ng01-070L13.g
ACCDH888636DH888637
length1,2391,155
definitionDH888636|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-070L13, 5' end.DH888637|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-070L13, 3' end.
singlet/doublet---singlet
BLAST hitno hit dataunique
sequence
gaattctttgtttagctctgagccacatttttaatggggttatttgattt
tctgaagtccaccttcttgagttctttatatatgttggatattagtcccc
tatctgatttaggataggtaaagagcctttcccaatctgttggtggtctt
tttgtcttattgacggtgtcttttgccttgcagaaactttggagtttcat
taggtcccatttgtcaattctcgatcttacagcacaagccattgctgttc
tgttcaggaatttttcccctgtgcccatatcttcaaggcttttccccact
ttctcctctataagtttcagtgtctctggttttaagtgaagttccttgat
ccacttagatttgaccttagtacaaggagataagtatggatcgattcgca
ttcttctacatgataacaaccagttgtgccagcaccaattgttgaaaatg
ctgtctttcttccttgataagagtttttgctatcctaggttttttgttat
tccagatgaatttgcaaattgctccttctaattcgttgaagaattgagtt
ggaattttgatggggattgcattgaatctgtagattgcttttggcaagat
agccatttttacaatgttgatcctgccaatccatgagcatgggagatcct
tccatcttctgagggtgttgtttccctaatttctttctcagcctgtttat
tctttgtatagagaaaggccattgacttgtttgagtttattttatatcca
gctacttcaccgaagctgtttctcaggtttaggagttctctggtggaatt
tttggggtcacttatatatactatcatatcatctgcaaaaagtgatattt
tgacttcctcttttccaatttctatccccttgatctccttttgttgtcga
attgctctggctaatacttcaagtactatgttgaaaaggtagggagaaag
tgggcagccttgtctagtccctgattttagtgggatgcttcagcttctct
ccatctacttcgatgtggctgctggtttgctgcagaatgctgttatcatg
attaggaggggcgtgaattctgaacattccccacactttttctgaatggg
ggttggatcttgtcaaagcctttccacctacagaaggaccagtggcttgg
ctgagttgttatatgatacctttaggattcgattaaacacgtctggatct
ggataaaacactgtcaagaagcgaaatgctcaggggctg
gaattcttttgttagttttaaaagaaaaaatgtctgtcgtagttattagg
acagaccttcacatctacacgcagcatgaactttcagggttttggggggt
tttttatacctatttctaataaaataataatttaataaaactgcagaggc
tggtaagtattgtcccatcaggtacagaggcatgcgaattgcgtgtttga
aactagtatgggctgcagagctagttgtatggcaagcctaggatatacag
tgaggccttatcccaaaaagccaaaggaataaatgtataaacaagcaaac
aagcacatacataaataaggtgacataaagaaagttaagaaacgttaggt
atgctgtcaatgactcttactctacatggattagaaaaacacagggaagc
ttcatcaggagagtggtctgttcttctatgtttcagagacaaatatccat
tttaggaatattctccttttttgatttgtttaacctcttaatcaacatat
tcttaaagcattgctgtctgcaacaagacctagctgcaactgggaacagc
tgtggtaacacaggaccctgtacatgaaagtaagatttctaacaatcaga
aatggttaggaacattgaaagaacaccacgaattccatactacactgtac
atgtatgtatgtatgtatgtatgtatgtaagaacaccacgaattccatac
tacactgtacatgtatgtatgtatgtatgtatgtatgaaagaacaccacg
aattcctacactgtacatgtatgtatgtatgtatgtatgaaagaacacca
cgaattccatactacactgtacatgtatgtatgtatgtatgaaagaacat
catgaattccatactacactgtacatgtatgtatgtatgaaagaacacca
tgaatttccatactacactgtacatgtatgcatgtatgtatgtatgaaag
acatcacgaattccatactacactgtacatgttatgtattttatgaaaaa
caccatgaattccatactacactgtacatgtattgtatgtattgtttgta
ttgaaagaacaaccacgatttcaaactacccggtattgtgtacaaaatgg
aacagtaagctcggattcttccgtttccacagcccaggtcatattccgcc
ctggg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_5702910_5704057
seq2: B6Ng01-070L13.g_69_1223

seq1  GAATTCTTTTGTTAGTTTTAAAAGAAAAAATGTCTGTCGTAGTTATTAGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTTTTGTTAGTTTTAAAAGAAAAAATGTCTGTCGTAGTTATTAGG  50

seq1  ACAGACCTTCACATCTACACGCAGCATGAACTTTCAGGGTTTTGGGGGGT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGACCTTCACATCTACACGCAGCATGAACTTTCAGGGTTTTGGGGGGT  100

seq1  TTTTTATACCTATTTCTAATAAAATAATAATTTAATAAAACTGCAGAGGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTATACCTATTTCTAATAAAATAATAATTTAATAAAACTGCAGAGGC  150

seq1  TGGTAAGTATTGTCCCATCAGGTACAGAGGCATGCGAATTGCGTGTTTGA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTAAGTATTGTCCCATCAGGTACAGAGGCATGCGAATTGCGTGTTTGA  200

seq1  AACTAGTATGGGCTGCAGAGCTAGTTGTATGGCAAGCCTAGGATATACAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTAGTATGGGCTGCAGAGCTAGTTGTATGGCAAGCCTAGGATATACAG  250

seq1  TGAGGCCTTATCCCAAAAAGCCAAAGGAATAAATGTATAAACAAGCAAAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGCCTTATCCCAAAAAGCCAAAGGAATAAATGTATAAACAAGCAAAC  300

seq1  AAGCACATACATAAATAAGGTGACATAAAGAAAGTTAAGAAACGTTAGGT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCACATACATAAATAAGGTGACATAAAGAAAGTTAAGAAACGTTAGGT  350

seq1  ATGCTGTCAATGACTCTTACTCTACATGGATTAGAAAAACACAGGGAAGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGCTGTCAATGACTCTTACTCTACATGGATTAGAAAAACACAGGGAAGC  400

seq1  TTCATCAGGAGAGTGGTCTGTTCTTCTATGTTTCAGAGACAAATATCCAT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATCAGGAGAGTGGTCTGTTCTTCTATGTTTCAGAGACAAATATCCAT  450

seq1  TTTAGGAATATTCTCCTTTTTTGATTTGTTTAACCTCTTAATCAACATAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAGGAATATTCTCCTTTTTTGATTTGTTTAACCTCTTAATCAACATAT  500

seq1  TCTTAAAGCATTGCTGTCTGCAACAAGACCTAGCTGCAACTGGGAACAGC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAAAGCATTGCTGTCTGCAACAAGACCTAGCTGCAACTGGGAACAGC  550

seq1  TGTGGTAACACAGGACCCTGTACATGAAAGTAAGATTTCTAACAATCAGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGTAACACAGGACCCTGTACATGAAAGTAAGATTTCTAACAATCAGA  600

seq1  AATGGTTAGGAACATTGAAAGAACACCACGAATTCCATACTACACTGTAC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGGTTAGGAACATTGAAAGAACACCACGAATTCCATACTACACTGTAC  650

seq1  ATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTAAGAACACCACGAATTCCATAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGTAAGAACACCACGAATTCCATAC  700

seq1  TACACTGTACATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGAAAGAACACCACG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACTGTACATGTATGTATGTATGTATGTATGTATGAAAGAACACCACG  750

seq1  AATTCCTACACTGTACATGTATGTATGTATGTATGTATGAAAGAACACCA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTCCTACACTGTACATGTATGTATGTATGTATGTATGAAAGAACACCA  800

seq1  CGAATTCCATACTACACTGTACATGTATGTATGTATGTATGAAAGAACAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAATTCCATACTACACTGTACATGTATGTATGTATGTATGAAAGAACAT  850

seq1  CATGAATTCCATACTACACTGTACATGTATGTATGTATGAAAGAACACCA  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATGAATTCCATACTACACTGTACATGTATGTATGTATGAAAGAACACCA  900

seq1  TGAA-TTCCATACTACACTGTACATGTATGCATGTATGTATGTATGAAAG  949
      |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAATTTCCATACTACACTGTACATGTATGCATGTATGTATGTATGAAAG  950

seq1  AACATCACGAATTCCATACTACACTGTACATG-TATGTA-TGTATGAAAG  997
       ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| 
seq2  -ACATCACGAATTCCATACTACACTGTACATGTTATGTATTTTATGAAA-  998

seq1  AACACCATGAATTCCATACTACACTGTACATGTA-TGTATGTA-TGTATG  1045
      |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||
seq2  AACACCATGAATTCCATACTACACTGTACATGTATTGTATGTATTGTTTG  1048

seq1  TA-TGAAAGAAC-ACCACGAATTCCATACTACACTGTA-TGTGTACAAA-  1091
      || ||||||||| |||||| ||| || ||||| | ||| |||||||||| 
seq2  TATTGAAAGAACAACCACG-ATTTCAAACTACCCGGTATTGTGTACAAAA  1097

seq1  -TGAACAGTAAAGCTTCAGATCCTTC--GTTCCACAGCCCA-GTCATA-T  1136
        ||||||| |||| || ||| ||||   |||||||||||| |||||| |
seq2  TGGAACAGT-AAGC-TCGGATTCTTCCGTTTCCACAGCCCAGGTCATATT  1145

seq1  CCGTCCCCTGGG  1148
      |||  |||||||
seq2  CCG--CCCTGGG  1155