BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-074J04
Chromosome4 (Build37)
Map Location 98,186,861 - 98,287,909
singlet/doubletdoublet
Overlap geneInadl
Upstream geneLOC620883, EG638698, Nfia, LOC100039459, LOC669426, LOC384106, 0610025J13Rik, Tm2d1
Downstream geneL1td1, Ankrd38, LOC100039541, Usp1, Dock7, Angptl3, LOC665193, Atg4c, LOC665212, LOC638890
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-074J04.bB6Ng01-074J04.g
ACCDH891383DH891384
length1,1951,175
definitionDH891383|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-074J04, 5' end.DH891384|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-074J04, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(98,286,712 - 98,287,909)(98,186,861 - 98,188,053)
sequence
gaattcttgatctcagctgaatgccctggctagtactgtgaaggctcact
ccctcaaccttccaccaacacctaagagaatgcacagatttggagcaagt
cctaaacgacttgaatgtgacatgtgctgggactgaacaatgaaagctta
ctgggcgaagccctcctgagctgctgcccctctgctgtaatagtaaagag
gcttttcttgggtcttttctatttttactgttgtggactgagctgctcac
cagaagagagaagcagaaggagctgacactggagtggtttgtgggaccag
gctgagctgtaaaagtggagaggcatctgactgctgaaggagagattgtt
caagagagtagccaggacaaaacaaagggaaaccgaggctggaaaggtga
agctagtggagttttgataaaaggctgtaaaaagccagggaagagaaact
gctagctctggccactgcaagagttccagagagctagcaagcctatgtag
caggaactgtctacaaacaaacaacaaaaagctcccaataaaacaagtac
tggggtattgtcacctactacaaagtaatgtttcagtaaatgataggcca
tatacaaagcaggttccttccatatgtcttagggtttcgactgctgtgat
aaaataccatccaaaagtaatgcttacacatctcagtcaaggtccatcac
caagagaagtcagggtttcttaaggcagaaatctggaggcagactctgat
gcagaggccatggaggaggactgcttcctgcctttctcatggcttgttca
atctggtttcttatacactccaggaccacctgtcctgcatagcactaccc
acagggagctgggccccctcacttcaatcattaagaaaatgctctgcagg
cttgcctacagcccaatctggtgacgacattttcccaattaaagttcttc
tgactctagcctgttccattgctgtaaaacaagcacatgtatcacacaca
ttgatggtgacactggtgtaaagaaactacagtaccaccaatcactcaaa
gtgcagcatatacagttacataatgcatatatttgaataacctgctgaac
gactacttactgattatgttaccaaatatctatactcaaatggcattata
gaaggctctcctccaagacaggtactattctgacggcactttgca
gaattccagttcaagatcctcctagctatatagtgagaacctagctcaaa
caatgacgaatccgtcagtaaacaaacagaaccgatgatatggaagtaga
aagcagataaaggtggctttctacaaagaacctcacacttacacctcact
gggaaagcagtacatgcagtggcgagcttattttactctgaaaggctgag
atgtcattaaaatgaatatgttctttcttgagtctttacttctttgttat
tttctcagcctctgtgaacgttatgcatataaatgaagtgtctgctcatt
tcacattaagtcttagcaagctcatcttcgaatctcaaaagttcttattt
gaaagatctcccttttcagaatttcaacttttgaatgtcatgaattttga
taatatcttatgattttagagctagcctcatttatccagcatctctaaag
tgcattaggaaattttcataagacatgagccacaggctgtgccacagacc
gagcacttacagtgacagtgcagcagatggaattaccttctgcgtgactg
tgctttctttctctctgttacagagttgaaatttttagagaacctaatgt
gtctcttggcatcagcatcgttggtggacaaacagttataaaacgcctca
agaatggagaggaactcaaggggatattcatcaaacaagtgttagaggac
agtcctgccgggaagaccaatgcgctgaaaaccggagataaaattcttga
ggtgagtgaggctgaaacaatgttttactcaaaacatttgagtcagcaaa
agaatcacttgggccaacttgatgtttattccaattgcatggcattggta
gtgtccatttgtgacccctcagtttgtataccataaccacacttcgagag
cttctctagcttctgaaggggagcaaatgaaaagataaggcaagagaccc
agctgattgacagatttaggacaggtggacacctacttccctagacttta
gcagttctgggttttatgcttgtaggttgtctacagaaagggacttgaaa
gggacaaacatggtcacatgtttcagtttatggagagaagctaacttatt
ttaggattatcattacttatgtttatactatgtgtggtgtggggatcgca
tgaattaatgttctaggcatacagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_98286712_98287909
seq2: B6Ng01-074J04.b_47_1241 (reverse)

seq1  TGCAAGAGTGCTGTCAGAATAGTACATTGTCTTGGAGGAG---CTTCTTA  47
      ||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||   |||| ||
seq2  TGCAA-AGTGCCGTCAGAATAGTAC-CTGTCTTGGAGGAGAGCCTTC-TA  47

seq1  TAATGCAATATGAAGTATAGTATATTGGGT-ACATAAATCAGTAAGTAGT  96
      |||||| || || ||||||| ||||| ||| |||| ||||||||||||||
seq2  TAATGCCATTTG-AGTATAG-ATATTTGGTAACAT-AATCAGTAAGTAGT  94

seq1  CGTTCAGCAGGTTA-TCAAATATATGCATTATGTAACTGTATATGCTGCA  145
      |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGTTCAGCAGGTTATTCAAATATATGCATTATGTAACTGTATATGCTGCA  144

seq1  CTTTGAGGTGATTGGTGGTACTGTAGTTTCTTTACACCAGTGTCACCATC  195
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTTGA-GTGATTGGTGGTACTGTAGTTTCTTTACACCAGTGTCACCATC  193

seq1  AATGTGTGTGATACATGTGCTTGTTTTTACAGCAATGGAACAGGCTAGAG  245
      ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATGTGTGTGATACATGTGCTTG-TTTTACAGCAATGGAACAGGCTAGAG  242

seq1  TCAGAAGAACTTTAATTGGGAAAATGTCGTCACCAGATTGGGCTGTAGGC  295
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCAGAAGAACTTTAATTGGGAAAATGTCGTCACCAGATTGGGCTGTAGGC  292

seq1  AAGCCTGCAGAGCATTTTCTTAATGATTGAAGTGAGGGGGCCCAGCTCCC  345
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCCTGCAGAGCATTTTCTTAATGATTGAAGTGAGGGGGCCCAGCTCCC  342

seq1  TGTGGGTAGTGCTATGCAGGACAGGTGGTCCTGGAGTGTATAAGAAACCA  395
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTGGGTAGTGCTATGCAGGACAGGTGGTCCTGGAGTGTATAAGAAACCA  392

seq1  GATTGAACAAGCCATGAGAAAGGCAGGAAGCAGTCCTCCTCCATGGCCTC  445
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATTGAACAAGCCATGAGAAAGGCAGGAAGCAGTCCTCCTCCATGGCCTC  442

seq1  TGCATCAGAGTCTGCCTCCAGATTTCTGCCTTAAGAAACCCTGACTTCTC  495
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATCAGAGTCTGCCTCCAGATTTCTGCCTTAAGAAACCCTGACTTCTC  492

seq1  TTGGTGATGGACCTTGACTGAGATGTGTAAGCATTACTTTTGGATGGTAT  545
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTGATGGACCTTGACTGAGATGTGTAAGCATTACTTTTGGATGGTAT  542

seq1  TTTATCACAGCAGTCGAAACCCTAAGACATATGGAAGGAACCTGCTTTGT  595
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATCACAGCAGTCGAAACCCTAAGACATATGGAAGGAACCTGCTTTGT  592

seq1  ATATGGCCTATCATTTACTGAAACATTACTTTGTAGTAGGTGACAATACC  645
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATATGGCCTATCATTTACTGAAACATTACTTTGTAGTAGGTGACAATACC  642

seq1  CCAGTACTTGTTTTATTGGGAGCTTTTTGTTGTTTGTTTGTAGACAGTTC  695
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGTACTTGTTTTATTGGGAGCTTTTTGTTGTTTGTTTGTAGACAGTTC  692

seq1  CTGCTACATAGGCTTGCTAGCTCTCTGGAACTCTTGCAGTGGCCAGAGCT  745
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCTACATAGGCTTGCTAGCTCTCTGGAACTCTTGCAGTGGCCAGAGCT  742

seq1  AGCAGTTTCTCTTCCCTGGCTTTTTACAGCCTTTTATCAAAACTCCACTA  795
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAGTTTCTCTTCCCTGGCTTTTTACAGCCTTTTATCAAAACTCCACTA  792

seq1  GCTTCACCTTTCCAGCCTCGGTTTCCCTTTGTTTTGTCCTGGCTACTCTC  845
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTTCACCTTTCCAGCCTCGGTTTCCCTTTGTTTTGTCCTGGCTACTCTC  842

seq1  TTGAACAATCTCTCCTTCAGCAGTCAGATGCCTCTCCACTTTTACAGCTC  895
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAACAATCTCTCCTTCAGCAGTCAGATGCCTCTCCACTTTTACAGCTC  892

seq1  AGCCTGGTCCCACAAACCACTCCAGTGTCAGCTCCTTCTGCTTCTCTCTT  945
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTGGTCCCACAAACCACTCCAGTGTCAGCTCCTTCTGCTTCTCTCTT  942

seq1  CTGGTGAGCAGCTCAGTCCACAACAGTAAAAATAGAAAAGACCCAAGAAA  995
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGGTGAGCAGCTCAGTCCACAACAGTAAAAATAGAAAAGACCCAAGAAA  992

seq1  AGCCTCTTTACTATTACAGCAGAGGGGCAGCAGCTCAGGAGGGCTTCGCC  1045
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCTCTTTACTATTACAGCAGAGGGGCAGCAGCTCAGGAGGGCTTCGCC  1042

seq1  CAGTAAGCTTTCATTGTTCAGTCCCAGCACATGTCACATTCAAGTCGTTT  1095
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGTAAGCTTTCATTGTTCAGTCCCAGCACATGTCACATTCAAGTCGTTT  1092

seq1  AGGACTTGCTCCAAATCTGTGCATTCTCTTAGGTGTTGGTGGAAGGTTGA  1145
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGACTTGCTCCAAATCTGTGCATTCTCTTAGGTGTTGGTGGAAGGTTGA  1142

seq1  GGGAGTGAGCCTTCACAGTACTAGCCAGGGCATTCAGCTGAGATCAAGAA  1195
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAGTGAGCCTTCACAGTACTAGCCAGGGCATTCAGCTGAGATCAAGAA  1192

seq1  TTC  1198
      |||
seq2  TTC  1195

seq1: chr4_98186861_98188053
seq2: B6Ng01-074J04.g_68_1242

seq1  GAATTCCAGTTCAAGATCCTCCTAGCTATATAGTGAGAACCTAGCTCAAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCAGTTCAAGATCCTCCTAGCTATATAGTGAGAACCTAGCTCAAA  50

seq1  CAATGACGAATCCGTCAGTAAACAAACAGAACCGATGATATGGAAGTAGA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATGACGAATCCGTCAGTAAACAAACAGAACCGATGATATGGAAGTAGA  100

seq1  AAGCAGATAAAGGTGGCTTTCTACAAAGAACCTCACACTTACACCTCACT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAGCAGATAAAGGTGGCTTTCTACAAAGAACCTCACACTTACACCTCACT  150

seq1  GGGAAAGCAGTACATGCAGTGGCGAGCTTATTTTACTCTGAAAGGCTGAG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGAAAGCAGTACATGCAGTGGCGAGCTTATTTTACTCTGAAAGGCTGAG  200

seq1  ATGTCATTAAAATGAATATGTTCTTTCTTGAGTCTTTACTTCTTTGTTAT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGTCATTAAAATGAATATGTTCTTTCTTGAGTCTTTACTTCTTTGTTAT  250

seq1  TTTCTCAGCCTCTGTGAACGTTATGCATATAAATGAAGTGTCTGCTCATT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTCTCAGCCTCTGTGAACGTTATGCATATAAATGAAGTGTCTGCTCATT  300

seq1  TCACATTAAGTCTTAGCAAGCTCATCTTCGAATCTCAAAAGTTCTTATTT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCACATTAAGTCTTAGCAAGCTCATCTTCGAATCTCAAAAGTTCTTATTT  350

seq1  GAAAGATCTCCCTTTTCAGAATTTCAACTTTTGAATGTCATGAATTTTGA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAAAGATCTCCCTTTTCAGAATTTCAACTTTTGAATGTCATGAATTTTGA  400

seq1  TAATATCTTATGATTTTAGAGCTAGCCTCATTTATCCAGCATCTCTAAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATATCTTATGATTTTAGAGCTAGCCTCATTTATCCAGCATCTCTAAAG  450

seq1  TGCATTAGGAAATTTTCATAAGACATGAGCCACAGGCTGTGCCACAGACC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCATTAGGAAATTTTCATAAGACATGAGCCACAGGCTGTGCCACAGACC  500

seq1  GAGCACTTACAGTGACAGTGCAGCAGATGGAATTACCTTCTGCGTGACTG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCACTTACAGTGACAGTGCAGCAGATGGAATTACCTTCTGCGTGACTG  550

seq1  TGCTTTCTTTCTCTCTGTTACAGAGTTGAAATTTTTAGAGAACCTAATGT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTTCTTTCTCTCTGTTACAGAGTTGAAATTTTTAGAGAACCTAATGT  600

seq1  GTCTCTTGGCATCAGCATCGTTGGTGGACAAACAGTTATAAAACGCCTCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCTCTTGGCATCAGCATCGTTGGTGGACAAACAGTTATAAAACGCCTCA  650

seq1  AGAATGGAGAGGAACTCAAGGGGATATTCATCAAACAAGTGTTAGAGGAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATGGAGAGGAACTCAAGGGGATATTCATCAAACAAGTGTTAGAGGAC  700

seq1  AGTCCTGCCGGGAAGACCAATGCGCTGAAAACCGGAGATAAAATTCTTGA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTCCTGCCGGGAAGACCAATGCGCTGAAAACCGGAGATAAAATTCTTGA  750

seq1  GGTGAGTGAGGCTGAAACAATGTTTTACTCAAAACATTTGAGTCAGCAAA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGTGAGTGAGGCTGAAACAATGTTTTACTCAAAACATTTGAGTCAGCAAA  800

seq1  AGAATCACTTGGGCCAACTTGATGTTTATTCCAATTGCATGGCATTGGTA  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGAATCACTTGGGCCAACTTGATGTTTATTCCAATTGCATGGCATTGGTA  850

seq1  GTGTCCATTTGTGACCCCTCAGTTTGTATACCATAACCACACTTCGAGAG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTGTCCATTTGTGACCCCTCAGTTTGTATACCATAACCACACTTCGAGAG  900

seq1  CTTCTCTAGCTTCTGAAGGGGAGCAAATGAAAAGATAAGGCAAGAGACCC  950
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTCTAGCTTCTGAAGGGGAGCAAATGAAAAGATAAGGCAAGAGACCC  950

seq1  AGCTGATTGACAGATTTAGGACAGGTGGACACCTACTTCCCTAGAACCTT  1000
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||
seq2  AGCTGATTGACAGATTTAGGACAGGTGGACACCTACTTCCCTAGA--CTT  998

seq1  TAGCAAGTTCTGGGTTTTATGCTTGTAGTTTGTCTACAGAAAGGGGACTT  1050
      |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |
seq2  TAGC-AGTTCTGGGTTTTATGCTTGTAGGTTGTCTACAGAAA-GGGAC-T  1045

seq1  TGAAAGGGACAAACCATGGTTCACATGTTTTCAGTTTTATGAGAGACAGC  1100
      ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||| |||| |  
seq2  TGAAAGGGACAAA-CATGG-TCACATG-TTTCAG-TTTATG-GAGAGAAG  1090

seq1  CTTACTTATTTTTAAGATTTATTCATTACTTATTGTTTTATACATATGTG  1150
      || ||||| ||||| ||||   |||||||||||   ||||||| ||||||
seq2  CTAACTTA-TTTTAGGATT--ATCATTACTTAT--GTTTATAC-TATGTG  1134

seq1  T-GTGTGAGTACTGCATGAATTATGTGTCTCATGTGCATACAGG  1193
      | ||||| | |  ||||||||||  ||| || |  |||||||||
seq2  TGGTGTGGGGATCGCATGAATTA-ATGT-TC-TAGGCATACAGG  1175