BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-075B11
Chromosome4 (Build37)
Map Location 120,395,231 - 120,484,918
singlet/doubletdoublet
Overlap geneKcnq4, Nfyc
Upstream geneHivep3, Edn2, Foxo6, Scmh1, Slfnl1, Ctps, EG667063, Cited4
Downstream geneRims3, LOC626489, 3110037I16Rik, Zfp69, Smap1l, Col9a2, Zmpste24, Tmco2, LOC100042174, Rlf, OTTMUSG00000008911, EG666914, LOC666921, LOC666927
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-075B11.bB6Ng01-075B11.g
ACCDH891747DH891748
length1,1851,074
definitionDH891747|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-075B11, 5' end.DH891748|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-075B11, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(120,395,231 - 120,396,412)(120,483,837 - 120,484,918)
sequence
gaattcatcacacaaagatgctctcggagaaacccaagctcagatgttta
cagcttaggagacagaggaagtctgggtgtgtctgccgcactggcttgtg
acttcattataggactgataggattgctcaagggttgtctctgaccctct
ggggcctcagtttctccagctaggtggtattctggggctggctggcctgg
tccttttgagatctccctagcagagcgccagactagaggcttcttccatt
acatctttatacaccccatcttggccaagtgggcctgtgtactcccttgg
ccaaccaggagttagaggtgtggcagataggggcagtatgtaggctagct
aggaggtctataacagtctttcctgtcccatataccctcccccattctgc
aactatccccctactcattcaggaagattagagaggaaagggtagatatt
tgcttagatccacagctatcaaattacagaagacatcagaacctctggaa
ggcttgtcaatgatggcacatgcctgtaactccagcagtcatgtgacaga
agcaaaactcagaaactcaaggtcacccttgagtacatggagaccttgtc
tttttaaaaaaaaaaatgctgatttctgggtacttccttgacaatgtctg
attcagtaagttcaaggtgggaatggagctcagttactaaccaatgcagg
gtttcgtttgtttttacttttgacagagtctcactgtgtatccaggctaa
cctaggactcaagatccccctccttcaacctcctcagtgctaggatgaca
ggctcgtgcttccacgcttgacaccaaatcagcacctttaacacatggca
atccttgctgtctccccacttcctcagatcactactagaaacggccaggg
ctggggggggctgtcagggagggaggtgctatgccaagcatcagcttcac
cactagtctgtgcaagcccaaattacaagcataagtgctccaagtggccc
agggcttcctactggtaccacacagcaccaaatccttccagcaacacatt
ctccacaaatccctaccacttgtttcccagcatacaagtgaagtgacaag
catgcagtctgtgagtccagaagtatcacattaacagggagttatgctta
cagaaataggacttaacttcctcaaccaagctgat
gaattcttgacctttctccacctcctgtgtgttgagattcttggtctaca
ccatttggcctcagagctgcggatagaaactagggcctggtgcctacaag
gcaaatgatctacctgagctacatccctgcaccattatttagcggtgagt
cttgagtgaggtcttgtatattgaaaattctctgcacgttatgaatactt
gcataaatattgtctgttgctgatgcaggctaattgagggccttaagtat
tttagggagataggtgtgacatcaaagaaaatgctggtgttgtgatatat
ttataaaataatgtttgattacctcacctgcatattctcatttgtgttta
caggatcctgtatttaagttaatttattattttgtgtatgtatgtaagtg
tgggcatgcataagaaatggcatatgtgtggaagacaggataacttttag
gagtcagatctttacttctaccatggatttaagagattaaactcaggtct
caacaagtacctgctgagctatctcaccagctcgattctgtctatttaat
atatattgggattattgaaccatcatcaagattcttatgaaggaatttta
acctctgtgtcaaaaattgagagttttcagaggattcaggagttcgacaa
cctctgttaaatagggagttgagggctagcctgggatacatgacgcctgc
ctcaaaaaaacaaacatcaaattaaggacctcagaataggatacagtgat
cgagtgtgcgtgcgtatgtgtgaatgcacatgtggagatcagaggatgac
cacttaaggagttcagggattaactcaggtcatcaggcttgcctgggaaa
tgttttttcccactgagtcatctcctggtcttttccccctcccctttttt
ttaatggaatgctgctttaaaaatgtcttcaaacttaggagctctcaaat
taagactgggaatgggaaacttgttcttattggatactgagtgtgcattt
attttcatgtgggtaagttctattgctgattgctaagcatgaaatgtttt
gttattattttttgttgctttgag
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_120395231_120396412
seq2: B6Ng01-075B11.b_44_1228

seq1  GAATTCATCACACAAAGATGCTCTCGGAGAAACCCAAGCTCAGATGTTTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCATCACACAAAGATGCTCTCGGAGAAACCCAAGCTCAGATGTTTA  50

seq1  CAGCTTAGGAGACAGAGGAAGTCTGGGTGTGTCTGCCGCACTGGCTTGTG  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGCTTAGGAGACAGAGGAAGTCTGGGTGTGTCTGCCGCACTGGCTTGTG  100

seq1  ACTTCATTATAGGACTGATAGGATTGCTCAAGGGTTGTCTCTGACCCTCT  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCATTATAGGACTGATAGGATTGCTCAAGGGTTGTCTCTGACCCTCT  150

seq1  GGGGCCTCAGTTTCTCCAGCTAGGTGGTATTCTGGGGCTGGCTGGCCTGG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGCCTCAGTTTCTCCAGCTAGGTGGTATTCTGGGGCTGGCTGGCCTGG  200

seq1  TCCTTTTGAGATCTCCCTAGCAGAGCGCCAGACTAGAGGCTTCTTCCATT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTTTGAGATCTCCCTAGCAGAGCGCCAGACTAGAGGCTTCTTCCATT  250

seq1  ACATCTTTATACACCCCATCTTGGCCAAGTGGGCCTGTGTACTCCCTTGG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATCTTTATACACCCCATCTTGGCCAAGTGGGCCTGTGTACTCCCTTGG  300

seq1  CCAACCAGGAGTTAGAGGTGTGGCAGATAGGGGCAGTATGTAGGCTAGCT  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAACCAGGAGTTAGAGGTGTGGCAGATAGGGGCAGTATGTAGGCTAGCT  350

seq1  AGGAGGTCTATAACAGTCTTTCCTGTCCCATATACCCTCCCCCATTCTGC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGAGGTCTATAACAGTCTTTCCTGTCCCATATACCCTCCCCCATTCTGC  400

seq1  AACTATCCCCCTACTCATTCAGGAAGATTAGAGAGGAAAGGGTAGATATT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTATCCCCCTACTCATTCAGGAAGATTAGAGAGGAAAGGGTAGATATT  450

seq1  TGCTTAGATCCACAGCTATCAAATTACAGAAGACATCAGAACCTCTGGAA  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTTAGATCCACAGCTATCAAATTACAGAAGACATCAGAACCTCTGGAA  500

seq1  GGCTTGTCAATGATGGCACATGCCTGTAACTCCAGCAGTCATGTGACAGA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCTTGTCAATGATGGCACATGCCTGTAACTCCAGCAGTCATGTGACAGA  550

seq1  AGCAAAACTCAGAAACTCAAGGTCACCCTTGAGTACATGGAGACCTTGTC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAAAACTCAGAAACTCAAGGTCACCCTTGAGTACATGGAGACCTTGTC  600

seq1  TTTTTAAAAAAAAAAATGCTGATTTCTGGGTACTTCCTTGACAATGTCTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTAAAAAAAAAAATGCTGATTTCTGGGTACTTCCTTGACAATGTCTG  650

seq1  ATTCAGTAAGTTCAAGGTGGGAATGGAGCTCAGTTACTAACCAATGCAGG  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTCAGTAAGTTCAAGGTGGGAATGGAGCTCAGTTACTAACCAATGCAGG  700

seq1  GTTTCGTTTGTTTTTACTTTTGACAGAGTCTCACTGTGTATCCAGGCTAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTTCGTTTGTTTTTACTTTTGACAGAGTCTCACTGTGTATCCAGGCTAA  750

seq1  CCTAGGACTCAAGATCCCCCTCCTTCAACCTCCTCAGTGCTAGGATGACA  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGGACTCAAGATCCCCCTCCTTCAACCTCCTCAGTGCTAGGATGACA  800

seq1  GGCTCGTGCTTCCACGCTTGACACCAAATCAGCACCTTTAACACAATGGC  850
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||
seq2  GGCTCGTGCTTCCACGCTTGACACCAAATCAGCACCTTTAACAC-ATGGC  849

seq1  AATCCTTGCTGTCTCCCCACTTCCTCAGATCACTACTAGAAACGGCCAGG  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATCCTTGCTGTCTCCCCACTTCCTCAGATCACTACTAGAAACGGCCAGG  899

seq1  GCT-GGGGGGGCTGTCAGGGAGGGAGGTGCTATGCC-AGCATCAGCTTCA  948
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  GCTGGGGGGGGCTGTCAGGGAGGGAGGTGCTATGCCAAGCATCAGCTTCA  949

seq1  CCACTAGTCTGTGCAAGCCCAAATTACAAGCATAAGTGCTCCAAGTGGCC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACTAGTCTGTGCAAGCCCAAATTACAAGCATAAGTGCTCCAAGTGGCC  999

seq1  CAGGGCTTCCTACTGGTACCACACAGCACCAAATCCTTCCAGC-ACACAT  1047
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||
seq2  CAGGGCTTCCTACTGGTACCACACAGCACCAAATCCTTCCAGCAACACAT  1049

seq1  TCTCCACAAAATCCCTACCAC-TGTTTCCCAAGCATACAAGTGAAGTGAC  1096
      ||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||
seq2  TCTCCAC-AAATCCCTACCACTTGTTTCCC-AGCATACAAGTGAAGTGAC  1097

seq1  AAGCCATGCCAGTCTGTGAGTCCAGAAGTATACACATTAACA-GGAGTTA  1145
      ||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||
seq2  AAG-CATG-CAGTCTGTGAGTCCAGAAGTAT-CACATTAACAGGGAGTTA  1144

seq1  TGC-TACAG-AATAGGACTT-ACTT-CTCAACAAAGCTGAT  1182
      ||| ||||| |||||||||| |||| |||||| ||||||||
seq2  TGCTTACAGAAATAGGACTTAACTTCCTCAACCAAGCTGAT  1185

seq1: chr4_120483837_120484918
seq2: B6Ng01-075B11.g_70_1143 (reverse)

seq1  CTCAAAGCAAACAAAAAATAAATAAACAACACATCTC-TGCTAAGCAATC  49
      |||||||| ||||||||||||   ||||| |||| || |||| |||||||
seq2  CTCAAAGC-AACAAAAAATAA--TAACAAAACATTTCATGCTTAGCAATC  47

seq1  AGCAATAAGAACTTACCCACATGAAAATAAAATGCACACCTCAGTATCCA  99
      |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||
seq2  AGCAAT-AGAACTTACCCACATGAAAAT-AAATGCACA-CTCAGTATCCA  94

seq1  ATAAGAACAGGTTTCCCATTCCCAGTCTTTATTTGGAGAAGCTCCTAAGT  149
      ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||
seq2  ATAAGAACAAGTTTCCCATTCCCAGTCTTAATTT-GAG-AGCTCCTAAGT  142

seq1  TTGATGACATTTTTTAAAGCAGCATTCCATTAAAAAAAAGGGGAGGGGGA  199
      |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAGACA-TTTTTAAAGCAGCATTCCATTAAAAAAAAGGGGAGGGGGA  191

seq1  AAAGACCAGGAGATGACTCAGTGGGAAAAAACATTTGCCAGGCAAGCCTG  249
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  AAAGACCAGGAGATGACTCAGTGGGAAAAAACATTTCCCAGGCAAGCCTG  241

seq1  ATGACCTGAGTTTAATCCCTGAACTCCTTAAGTGGTCATCCTCTGATCTC  299
      |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACCTGAG-TTAATCCCTGAACTCCTTAAGTGGTCATCCTCTGATCTC  290

seq1  CACATGTGCATTCACACATACGCACGCACACTCGATCACTGTATCCTATT  349
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACATGTGCATTCACACATACGCACGCACACTCGATCACTGTATCCTATT  340

seq1  CTGAGGTCCTTAATTTGATGTTTGTTTTTTTGAGGCAGGCGTCATGTATC  399
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGAGGTCCTTAATTTGATGTTTGTTTTTTTGAGGCAGGCGTCATGTATC  390

seq1  CCAGGCTAGCCCTCAACTCCCTATTTAACAGAGGTTGTCGAACTCCTGAA  449
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGCTAGCCCTCAACTCCCTATTTAACAGAGGTTGTCGAACTCCTGAA  440

seq1  TCCTCTG-AGACTCTCAATTTTTGACACAGAGGTTAAAATTCCTTCATAA  498
      ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTCTGAAAACTCTCAATTTTTGACACAGAGGTTAAAATTCCTTCATAA  490

seq1  GAATCTTGATGATGGTTCAATAATCCCAATATATATTAAATAGACAGAAT  548
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATCTTGATGATGGTTCAATAATCCCAATATATATTAAATAGACAGAAT  540

seq1  CGAGCTGGTGAGATAGCTCAGCAGGTACTTGTTGAGACCTGAGTTTAATC  598
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CGAGCTGGTGAGATAGCTCAGCAGGTACTTGTTGAGACCTGAGTTTAATC  590

seq1  TCTTAAATCCATGGTAGAAGTAAAGATCTGACTCCTAAAAGTTATCCTGT  648
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTAAATCCATGGTAGAAGTAAAGATCTGACTCCTAAAAGTTATCCTGT  640

seq1  CTTCCACACATATGCCATTTCTTATGCATGCCCACACTTACATACATACA  698
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCCACACATATGCCATTTCTTATGCATGCCCACACTTACATACATACA  690

seq1  CAAAATAATAAATTAACTTAAATACAGGATCCTGTAAACACAAATGAGAA  748
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAATAATAAATTAACTTAAATACAGGATCCTGTAAACACAAATGAGAA  740

seq1  TATGCAGGTGAGGTAATCAAACATTATTTTATAAATATATCACAACACCA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TATGCAGGTGAGGTAATCAAACATTATTTTATAAATATATCACAACACCA  790

seq1  GCATTTTCTTTGATGTCACACCTATCTCCCTAAAATACTTAAGGCCCTCA  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATTTTCTTTGATGTCACACCTATCTCCCTAAAATACTTAAGGCCCTCA  840

seq1  ATTAGCCTGCATCAGCAACAGACAATATTTATGCAAGTATTCATAACGTG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTAGCCTGCATCAGCAACAGACAATATTTATGCAAGTATTCATAACGTG  890

seq1  CAGAGAATTTTCAATATACAAGACCTCACTCAAGACTCACCGCTAAATAA  948
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGAGAATTTTCAATATACAAGACCTCACTCAAGACTCACCGCTAAATAA  940

seq1  TGGTGCAGGGATGTAGCTCAGGTAGATCATTTGCCTTGTAGGCACCAGGC  998
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGTGCAGGGATGTAGCTCAGGTAGATCATTTGCCTTGTAGGCACCAGGC  990

seq1  CCTAGTTTCTATCCGCAGCTCTGAGGCCAAATGGTGTAGACCAAGAATCT  1048
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTAGTTTCTATCCGCAGCTCTGAGGCCAAATGGTGTAGACCAAGAATCT  1040

seq1  CAACACACAGGAGGTGGAGAAAGGTCAAGAATTC  1082
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAACACACAGGAGGTGGAGAAAGGTCAAGAATTC  1074