BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-088F06
Chromosome4 (Build37)
Map Location 151,037,781 - 151,200,983
singlet/doubletdoublet
Overlap geneCamta1
Upstream geneLOC677027, Errfi1, Park7, Tnfrsf9, Uts2, Per3, Vamp3
Downstream geneLOC100041960, Dnajc11, Thap3, Phf13, Klhl21, Zbtb48, Tas1r1, Nol9, EG666980, Plekhg5, Tnfrsf25, Espn, LOC100043284, Hes2, Acot7, Gpr153, Hes3, Icmt, Rnf207, Rpl22, Chd5, Kcnab2, LOC100042028, Nphp4, LOC667039, Gm833
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-088F06.bB6Ng01-088F06.g
ACCDH901210DH901211
length4701,245
definitionDH901210|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-088F06, 5' end.DH901211|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-088F06, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(151,200,508 - 151,200,983)(151,037,781 - 151,039,036)
sequence
aggctgataggtgtgtagcaggctcctgggactgcagagccgtttaactg
ggtgtgttgcaagtactgactggtccatctctccagcccactgagctttc
tttctggagttggtcatttttgcaaagaactttgttctgtctttacaatg
ttggggagataaccccagaacttgtacatgccaggccctgtgcagtacca
ctgaaatgtagcctattgcttgtctttgctttcattgtaagacctcaaac
taaatggcagcctcatcaagcattttgtgggcagaaccatctccccagac
ctttctttttaaaatacacttagccgggcggtagtggcacacgcctttaa
tcccagcacttgggaggcagaagcaggtggatttctgagtttgaggccag
cctggtctacagagtgagttccataacagccaggactatgcagagagacc
ctgtctcagaaaaaaataaa
gaattctccaggcacatgtcacacatacatattgcacataaaattcctat
ggccttttcattgcctaaaaatgtgtgccaaattcacatgagagactaca
taggaaaaacaacaacgtaagcaaagtcacatggctagagccagcacagc
aggatcccaacccaaagggtcagagcgtccagtctggagcctgcttcatt
ccagctccatttctgaggcccacaggaatggaacaccacagaccaagcct
gctgagccctcacaggactgaggcctttccttcagctcttgagtgagtta
ctgatggctacctacagtcaggcataaaaaaggggaacctggggcgggga
gagctcagcacttagagcgagtgcttcttatccgggcctgagttcagttc
ccagcacccacccaggcagcttaaccacttgtaaattaagctctagggag
tccaacaccctcttctggcctccctgggccctgcatttacacacacacac
acacacacacacacacacacatacacataatgtgtaatttaaaatacatc
ttgaaaaagagatgggagcagcacatagagaagctgcaggtcagagagag
accgaccctgcgtcatagataagtaaatgtatgtatgtgtgcatgtatgt
gatgtatgtatgtgtgcatgtatgtggatgccacctaaagaatgaccctc
aaagttgttctgtggcctctacaaatacacactacatacacatcacacac
tctgcacagatgacatatacatgcaaacacacatatacacacctaaacac
acacatgtatgcagatatatatatgcacataaacacacatacatgctcat
acatgcatacagatatgagtagacaccatacaaacattgaaaagtgtcat
atatacatacatacatatatacatacacaatacatacatgcactcagaga
ttttgagaagtgtcatagtcccatgcactcagatgaaacgtgcagaaggt
ggcagtaccctctcccctgatgtcagctggtgatgcctgagggcagacca
atgaacctgggacatagcactagtttggtgatcccagggaaggaaggccc
ctcccctagctacaggtggtggtctaagggctaccaacgctgtgatgaaa
ccttgactaaagcacatcggaagaaagtcctttattctgctcatgttcta
cccacatccttccttctagaagtcatgccaggaacctcaagcagg
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_151200508_151200983
seq2: B6Ng01-088F06.b_46_521 (reverse)

seq1  TTTTTTTTTTTCTGAGACAGGGTCTCTCTGCATAGTCCTGGCTGTTCTGG  50
      ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||
seq2  TTTATTTTTTTCTGAGACAGGGTCTCTCTGCATAGTCCTGGCTGTTATGG  50

seq1  AACTCACTCTGTAGACCAGGCTGGCCTCAAACTCAGAAATCCACCTGCCT  100
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  AACTCACTCTGTAGACCAGGCTGGCCTCAAACTCAGAAATCCACCTGCTT  100

seq1  CTGCCTCCCAAGTGCTGGGATTAAAGGCGTGTGCCACTACCGCCCGGCTA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGCCTCCCAAGTGCTGGGATTAAAGGCGTGTGCCACTACCGCCCGGCTA  150

seq1  AGTGTATTTTAAAAAGAAAGGTCTGGGGAGATGGTTCTGCCCACAAAATG  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGTATTTTAAAAAGAAAGGTCTGGGGAGATGGTTCTGCCCACAAAATG  200

seq1  CTTGATGAGGCTGCCATTTAGTTTGAGGTCTTACAATGAAAGCAAAGACA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTGATGAGGCTGCCATTTAGTTTGAGGTCTTACAATGAAAGCAAAGACA  250

seq1  AGCAATAGGCTACATTTCAGTGGTACTGCACAGGGCCTGGCATGTACAAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCAATAGGCTACATTTCAGTGGTACTGCACAGGGCCTGGCATGTACAAG  300

seq1  TTCTGGGGTTATCTCCCCAACATTGTAAAGACAGAACAAAGTTCTTTGCA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCTGGGGTTATCTCCCCAACATTGTAAAGACAGAACAAAGTTCTTTGCA  350

seq1  AAAATGACCAACTCCAGAAAGAAAGCTCAGTGGGCTGGAGAGATGGACCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAATGACCAACTCCAGAAAGAAAGCTCAGTGGGCTGGAGAGATGGACCA  400

seq1  GTCAGTACTTGCAACACACCCAGTTAAACGGCTCTGCAGTCCCAGGAGCC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCAGTACTTGCAACACACCCAGTTAAACGGCTCTGCAGTCCCAGGAGCC  450

seq1  TGCTACACACCTATCAGCCTGAATTC  476
      ||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCTACACACCTATCAGCCTGAATTC  476

seq1: chr4_151037781_151039036
seq2: B6Ng01-088F06.g_70_1314

seq1  GAATTCTCCAGGCACATGTCACACATACATATTGCACATAAAATTCCTAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTCCAGGCACATGTCACACATACATATTGCACATAAAATTCCTAT  50

seq1  GGCCTTTTCATTGCCTAAAAATGTGTGCCAAATTCACATGAGAGACTACA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCCTTTTCATTGCCTAAAAATGTGTGCCAAATTCACATGAGAGACTACA  100

seq1  TAGGAAAAACAACAACGTAAGCAAAGTCACATGGCTAGAGCCAGCACAGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGAAAAACAACAACGTAAGCAAAGTCACATGGCTAGAGCCAGCACAGC  150

seq1  AGGATCCCAACCCAAAGGGTCAGAGCGTCCAGTCTGGAGCCTGCTTCATT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGATCCCAACCCAAAGGGTCAGAGCGTCCAGTCTGGAGCCTGCTTCATT  200

seq1  CCAGCTCCATTTCTGAGGCCCACAGGAATGGAACACCACAGACCAAGCCT  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCTCCATTTCTGAGGCCCACAGGAATGGAACACCACAGACCAAGCCT  250

seq1  GCTGAGCCCTCACAGGACTGAGGCCTTTCCTTCAGCTCTTGAGTGAGTTA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGAGCCCTCACAGGACTGAGGCCTTTCCTTCAGCTCTTGAGTGAGTTA  300

seq1  CTGATGGCTACCTACAGTCAGGCATAAAAAAGGGGAACCTGGGGCGGGGA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTGATGGCTACCTACAGTCAGGCATAAAAAAGGGGAACCTGGGGCGGGGA  350

seq1  GAGCTCAGCACTTAGAGCGAGTGCTTCTTATCCGGGCCTGAGTTCAGTTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGCTCAGCACTTAGAGCGAGTGCTTCTTATCCGGGCCTGAGTTCAGTTC  400

seq1  CCAGCACCCACCCAGGCAGCTTAACCACTTGTAAATTAAGCTCTAGGGAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGCACCCACCCAGGCAGCTTAACCACTTGTAAATTAAGCTCTAGGGAG  450

seq1  TCCAACACCCTCTTCTGGCCTCCCTGGGCCCTGCATTTACACACACACAC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCAACACCCTCTTCTGGCCTCCCTGGGCCCTGCATTTACACACACACAC  500

seq1  ACACACACACACACACACACATACACATAATGTGTAATTTAAAATACATC  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACACACACATACACATAATGTGTAATTTAAAATACATC  550

seq1  TTGAAAAAGAGATGGGAGCAGCACATAGAGAAGCTGCAGGTCAGAGAGAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGAAAAAGAGATGGGAGCAGCACATAGAGAAGCTGCAGGTCAGAGAGAG  600

seq1  ACCGACCCTGCGTCATAGATAAGTAAATGTATGTATGTGTGCATGTATGT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCGACCCTGCGTCATAGATAAGTAAATGTATGTATGTGTGCATGTATGT  650

seq1  GATGTATGTATGTGTGCATGTATGTGGATGCCACCTAAAGAATGACCCTC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTATGTATGTGTGCATGTATGTGGATGCCACCTAAAGAATGACCCTC  700

seq1  AAAGTTGTTCTGTGGCCTCTACAAATACACACTACATACACATCACACAC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAAGTTGTTCTGTGGCCTCTACAAATACACACTACATACACATCACACAC  750

seq1  TCTGCACAGATGACATATACATGCAAACACACATATACACACCTAAACAC  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTGCACAGATGACATATACATGCAAACACACATATACACACCTAAACAC  800

seq1  ACACATGTATGCAGATATATATATGCACATAAACACACATACATGCTCAT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACATGTATGCAGATATATATATGCACATAAACACACATACATGCTCAT  850

seq1  ACATGCATACAGATATGAGTAGACACACATACAAACATTGAAAAGTGTCA  900
      |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||
seq2  ACATGCATACAGATATGAGTAGACAC-CATACAAACATTGAAAAGTGTCA  899

seq1  TATATACATACATACATATATACATACACACATACATACATGCACACAGA  950
      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||
seq2  TATATACATACATACATATATACATACACA-ATACATACATGCACTCAGA  948

seq1  GAATTTTGAGAAGTGTCAATAGT-CCATGCACTCAGATGAAACGTGCAGA  999
      | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||
seq2  G-ATTTTGAGAAGTGTC-ATAGTCCCATGCACTCAGATGAAACGTGCAGA  996

seq1  AGGTGGCAGTAACCCCCACCCCTGATGGCAGCTGGTGATGCCCTGAGGGC  1049
      |||||||||| |||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||
seq2  AGGTGGCAGT-ACCCTCTCCCCTGATGTCAGCTGGTGATG-CCTGAGGGC  1044

seq1  AGA-CAATGGACCTGGGACATAGCAACAGCTGGGTGATCCAGGGGAAGGA  1098
      ||| ||||| |||||||||||||||  || | ||||||||  ||||||||
seq2  AGACCAATGAACCTGGGACATAGCACTAGTTTGGTGATCCCAGGGAAGGA  1094

seq1  AAGGCACTCCCCCAGGCACAGGGTGGT-GTCTTAGGGTTACCAAGGCTGT  1147
      | | | |||||| ||  ||| |||||| |||| |||| |||||| |||||
seq2  AGGCCCCTCCCCTAGCTACA-GGTGGTGGTCTAAGGGCTACCAACGCTGT  1143

seq1  GATGAAACACCATGACTAAAAGCAACTTGGGAAGGAAAGGGC-TTATTCA  1196
      ||||||  ||| ||||| ||||| || | |||| |||||  | |||||| 
seq2  GATGAA--ACCTTGACT-AAAGC-ACATCGGAA-GAAAGTCCTTTATTCT  1188

seq1  GCTTACATGTCCACACCACCATTCATCATCGAAGAAGGTCAGGGCAGGAA  1246
      |||  ||||| |  |||  ||| | || |   |||| |||| | ||||||
seq2  GCT--CATGTTC-TACCCACATCCTTCCTTCTAGAA-GTCATGCCAGGAA  1234

seq1  -CTCAAGCAGG  1256
       ||||||||||
seq2  CCTCAAGCAGG  1245