BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-097O10
Chromosome4 (Build37)
Map Location 99,089,342 - 99,249,196
singlet/doubletdoublet
Overlap geneLOC665212, LOC638890
Upstream geneInadl, L1td1, Ankrd38, LOC100039541, Usp1, Dock7, Angptl3, LOC665193, Atg4c
Downstream geneLOC100042589, Foxd3, Alg6, Itgb3bp, BC020077, Pgm2, Ror1, Ube2u, LOC277707
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-097O10.bB6Ng01-097O10.g
ACCDH908148DH908149
length1,102874
definitionDH908148|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-097O10, 5' end.DH908149|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-097O10, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(99,089,342 - 99,090,446)(99,248,319 - 99,249,196)
sequence
gaattccacaaaccctcagttttctaaatgtaaaacatggataatagtta
gatgtgacaactacaccttagaaattagaacagctcagcattactttagc
caaacatctgaactattctagcaccagggctttctggcaatcatttatca
tacacatgaatttataaagcactcactatgtgtcaggggctttttgtcaa
gcactcactatgtgtcagaggcttttcaaggtgcaaagataactgtgttc
cactgattattaaaggctcagtgttgagaacaatgacaggcagttctcag
aactcaacacatttaataaaaatgaataaaaatctacagataagtaaatg
tttaatccacatagatacgaaagggaatgttggaccctgcctatcaaaac
ttacctgttctacaaacactgagtcctgctctcagcatgattctgaatgc
tggagaagacattagaatgaactaaagtgttttctgctttgaagaacagc
agggtgtagaagcctggggtgaagtcagatgacatgcatctactcactag
ttagtcattttgaacagatacctgggtcttagtgtccccaacctatgaag
tgagggtagtagtggcttaaatgagtgttggaaggaattgtgtttgcaga
agtgctctgaaagttagcatgcgtggctgtcatttatgtaagtgtgcctt
gaatgtccactgctagagatagcatacaggatctttcaaagatgactgag
aattgccctgacacccaggtttgtgctgctgctgaagatgaggctgatgg
taggaagtaatgaaatgaatccacttctctggaccccactcaagacaatc
acaagtgtttgctttaaagagctagttaggtaaaagaaatgttcgctgat
caaacactaggagccagtagagtctgagtctctctgttagcagtcactag
taagttgttgcttgctgggcacattttctgtgccttttgcttgcctagct
caggtcaagttaaaacatttaccaggcactgtatgagtttatttttctgt
tgtcagggataaaatatccagaaacagcagtattaagagaaagggtttct
tt
gaattccatgagatgtagggtagaaggaaatgtgctcggtctttgtgcac
aatactgacatgcaagatccccaccactctataaagccgcaaatatgaag
gtaattgcttaatatccccaaactctggttccttaccacaagctaattct
ggctctcccccagcaaaaacagtcactatgtctttctggttttctggggg
aagcttggtaattgccacttggttctgctgatcttttagatatgtacctg
agtggtgtgactcaacatcataataatttcaaaatacacattatattact
tatatgagtccttttgcaggcgagaagaaataacttctgggcataaattt
aatctagcaatatcctgttcaaaaggaacaaagacataggtttgggaact
tgttttaggaaccccaatgacatgtgacaatccacttttaatatagggtg
aaatttctatctcctttacttccatatgcaaatattagtcttctcagcct
atttagaaatgcatatgatgttgtcagctacattatactcatgcagccgt
acgtgtatgtcacaagacatatttatgtagatgccctaaagttatggcgt
cttggaggacactggagcgtaaatcagtccagcgcttgaagatatgctgc
tgccgtggatgaggcagtctctcccggagagttcacttgagcattgtgtc
ccagaggcagcttgtgtttcttaggtacctgattgattttagggctgcct
ctttcactacagtcatttggagtgctacctgcttgaaatggtcaaagtgc
cttttgccttttttctggtgtaaaaactgctggttgtgtccttcactaca
gatgtctactgaagtctcactgga
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_99089342_99090446
seq2: B6Ng01-097O10.b_45_1146

seq1  GAATTCCACAAACCCTCAGTTTTCTAAATGTAAAACATGGATAATAGTTA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCACAAACCCTCAGTTTTCTAAATGTAAAACATGGATAATAGTTA  50

seq1  GATGTGACAACTACACCTTAGAAATTAGAACAGCTCAGCATTACTTTAGC  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GATGTGACAACTACACCTTAGAAATTAGAACAGCTCAGCATTACTTTAGC  100

seq1  CAAACATCTGAACTATTCTAGCACCAGGGCTTTCTGGCAATCATTTATCA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAACATCTGAACTATTCTAGCACCAGGGCTTTCTGGCAATCATTTATCA  150

seq1  TACACATGAATTTATAAAGCACTCACTATGTGTCAGGGGCTTTTTGTCAA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TACACATGAATTTATAAAGCACTCACTATGTGTCAGGGGCTTTTTGTCAA  200

seq1  GCACTCACTATGTGTCAGAGGCTTTTCAAGGTGCAAAGATAACTGTGTTC  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCACTCACTATGTGTCAGAGGCTTTTCAAGGTGCAAAGATAACTGTGTTC  250

seq1  CACTGATTATTAAAGGCTCAGTGTTGAGAACAATGACAGGCAGTTCTCAG  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACTGATTATTAAAGGCTCAGTGTTGAGAACAATGACAGGCAGTTCTCAG  300

seq1  AACTCAACACATTTAATAAAAATGAATAAAAATCTACAGATAAGTAAATG  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AACTCAACACATTTAATAAAAATGAATAAAAATCTACAGATAAGTAAATG  350

seq1  TTTAATCCACATAGATACGAAAGGGAATGTTGGACCCTGCCTATCAAAAC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTAATCCACATAGATACGAAAGGGAATGTTGGACCCTGCCTATCAAAAC  400

seq1  TTACCTGTTCTACAAACACTGAGTCCTGCTCTCAGCATGATTCTGAATGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTACCTGTTCTACAAACACTGAGTCCTGCTCTCAGCATGATTCTGAATGC  450

seq1  TGGAGAAGACATTAGAATGAACTAAAGTGTTTTCTGCTTTGAAGAACAGC  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGGAGAAGACATTAGAATGAACTAAAGTGTTTTCTGCTTTGAAGAACAGC  500

seq1  AGGGTGTAGAAGCCTGGGGTGAAGTCAGATGACATGCATCTACTCACTAG  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGGTGTAGAAGCCTGGGGTGAAGTCAGATGACATGCATCTACTCACTAG  550

seq1  TTAGTCATTTTGAACAGATACCTGGGTCTTAGTGTCCCCAACCTATGAAG  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTAGTCATTTTGAACAGATACCTGGGTCTTAGTGTCCCCAACCTATGAAG  600

seq1  TGAGGGTAGTAGTGGCTTAAATGAGTGTTGGAAGGAATTGTGTTTGCAGA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGAGGGTAGTAGTGGCTTAAATGAGTGTTGGAAGGAATTGTGTTTGCAGA  650

seq1  AGTGCTCTGAAAGTTAGCATGCGTGGCTGTCATTTATGTAAGTGTGCCTT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGCTCTGAAAGTTAGCATGCGTGGCTGTCATTTATGTAAGTGTGCCTT  700

seq1  GAATGTCCACTGCTAGAGATAGCATACAGGATCTTTCAAAGATGACTGAG  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATGTCCACTGCTAGAGATAGCATACAGGATCTTTCAAAGATGACTGAG  750

seq1  AATTGCCCTGACACCCAGGTTTGTGCTGCTGCTGAAGATGAGGCTGATGG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTGCCCTGACACCCAGGTTTGTGCTGCTGCTGAAGATGAGGCTGATGG  800

seq1  TAGGAAGTAATGAAATGAATCCACTTCTCTGGACCCCACTCAAGACAATC  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGAAGTAATGAAATGAATCCACTTCTCTGGACCCCACTCAAGACAATC  850

seq1  AGAAGTGTTTGCTTTAAAGAGCTAGTTAGGTAAAAAGAAATGTTCGCTGA  900
      | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  ACAAGTGTTTGCTTTAAAGAGCTAGTTAGGT-AAAAGAAATGTTCGCTGA  899

seq1  TCAAACACTAGGAGCCAGTAAGAAGTCTGAGTCTCTCTGTTAAGCAGTCA  950
      ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||
seq2  TCAAACACTAGGAGCCAGTA--GAGTCTGAGTCTCTCTGTT-AGCAGTCA  946

seq1  CTAGTAAGTTGTTGCTTGCTGGGCCACA-TTTCTGTGCCCTTTTGCTTGC  999
      ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||
seq2  CTAGTAAGTTGTTGCTTGCTGGG-CACATTTTCTGTG-CCTTTTGCTTGC  994

seq1  CTAGCTCAGGGTCAAGTT-AAACATTTACCAGGCACTG-ATGAGTTAATT  1047
      |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||
seq2  CTAGCTCA-GGTCAAGTTAAAACATTTACCAGGCACTGTATGAGTTTATT  1043

seq1  TTCTTGTTGCCA-GGATAAAATATCCAAGAAACAGCAGTATAAAGAG-AA  1095
      ||  ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||
seq2  TTTCTGTTGTCAGGGATAAAATATCC-AGAAACAGCAGTATTAAGAGAAA  1092

seq1  GGGTTTCTTT  1105
      ||||||||||
seq2  GGGTTTCTTT  1102

seq1: chr4_99248319_99249196
seq2: B6Ng01-097O10.g_68_941 (reverse)

seq1  TCCAGTGAGACTTTCAGTAGACATCTGTAGTGAAGGACACACACAAGCAG  50
      ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||
seq2  TCCAGTGAGAC-TTCAGTAGACATCTGTAGTGAAGGACACA-ACCAGCAG  48

seq1  TTTTATACACCCAGAAAAAGGCAAAAGGCACTTTGACCATTTTCAAGCAG  100
      |||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||
seq2  TTTT-TACACCAGAAAAAAGGCAAAAGGCACTTTGACCA-TTTCAAGCAG  96

seq1  GTAGCACTCCAAATGACTGTAGTGAAAGAGGCAGCCCTAAAATCAATCAG  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTAGCACTCCAAATGACTGTAGTGAAAGAGGCAGCCCTAAAATCAATCAG  146

seq1  GTACCTAAGAAACACAAGCTGCCTCTGGGACACAATGCTCAAGTGAACTC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTACCTAAGAAACACAAGCTGCCTCTGGGACACAATGCTCAAGTGAACTC  196

seq1  TCCGGGAGAGACTGCCTCATCCACGGCAGCAGCATATCTTCAAGCGCTGG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCGGGAGAGACTGCCTCATCCACGGCAGCAGCATATCTTCAAGCGCTGG  246

seq1  ACTGATTTACGCTCCAGTGTCCTCCAAGACGCCATAACTTTAGGGCATCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTGATTTACGCTCCAGTGTCCTCCAAGACGCCATAACTTTAGGGCATCT  296

seq1  ACATAAATATGTCTTGTGACATACACGTACGGCTGCATGAGTATAATGTA  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACATAAATATGTCTTGTGACATACACGTACGGCTGCATGAGTATAATGTA  346

seq1  GCTGACAACATCATATGCATTTCTAAATAGGCTGAGAAGACTAATATTTG  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCTGACAACATCATATGCATTTCTAAATAGGCTGAGAAGACTAATATTTG  396

seq1  CATATGGAAGTAAAGGAGATAGAAATTTCACCCTATATTAAAAGTGGATT  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATATGGAAGTAAAGGAGATAGAAATTTCACCCTATATTAAAAGTGGATT  446

seq1  GTCACATGTCATTGGGGTTCCTAAAACAAGTTCCCAAACCTATGTCTTTG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTCACATGTCATTGGGGTTCCTAAAACAAGTTCCCAAACCTATGTCTTTG  496

seq1  TTCCTTTTGAACAGGATATTGCTAGATTAAATTTATGCCCAGAAGTTATT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCCTTTTGAACAGGATATTGCTAGATTAAATTTATGCCCAGAAGTTATT  546

seq1  TCTTCTCGCCTGCAAAAGGACTCATATAAGTAATATAATGTGTATTTTGA  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTCTCGCCTGCAAAAGGACTCATATAAGTAATATAATGTGTATTTTGA  596

seq1  AATTATTATGATGTTGAGTCACACCACTCAGGTACATATCTAAAAGATCA  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTATTATGATGTTGAGTCACACCACTCAGGTACATATCTAAAAGATCA  646

seq1  GCAGAACCAAGTGGCAATTACCAAGCTTCCCCCAGAAAACCAGAAAGACA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCAGAACCAAGTGGCAATTACCAAGCTTCCCCCAGAAAACCAGAAAGACA  696

seq1  TAGTGACTGTTTTTGCTGGGGGAGAGCCAGAATTAGCTTGTGGTAAGGAA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGTGACTGTTTTTGCTGGGGGAGAGCCAGAATTAGCTTGTGGTAAGGAA  746

seq1  CCAGAGTTTGGGGATATTAAGCAATTACCTTCATATTTGCGGCTTTATAG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGAGTTTGGGGATATTAAGCAATTACCTTCATATTTGCGGCTTTATAG  796

seq1  AGTGGTGGGGATCTTGCATGTCAGTATTGTGCACAAAGACCGAGCACATT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGTGGGGATCTTGCATGTCAGTATTGTGCACAAAGACCGAGCACATT  846

seq1  TCCTTCTACCCTACATCTCATGGAATTC  878
      ||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCCTTCTACCCTACATCTCATGGAATTC  874