BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-097P22
Chromosome4 (Build37)
Map Location 63,053,374 - 63,230,276
singlet/doubletdoublet
Overlap geneAkna, Whrn, Atp6v1g1, 6330416G13Rik
Upstream geneCdc26, Prpf4, Rnf183, Wdr31, Bspry, Hdhd3, Alad, Pole3, 4933430I17Rik, Rgs3, Zfp618, Ambp, Kif12, Col27a1, Orm1, Orm-ps, Orm3, Orm2
Downstream geneLOC670833, 1700018C11Rik, LOC667451, Tnfsf15, Tnfsf8, Rpl17-ps, Tnc
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-097P22.bB6Ng01-097P22.g
ACCDH908215DH908216
length946847
definitionDH908215|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-097P22, 5' end.DH908216|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-097P22, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(63,229,333 - 63,230,276)(63,053,374 - 63,054,218)
sequence
gaattctgtgtctaagccccacagtgatccttgcctgggagtatggcttg
ggataagctatggcacccctctaaacctcagtttccccacctgtaaactg
ggaataaccatgcccacccctcagggctgttccagggctaacagggtaaa
gcccggtactttttagggagttgttaaaaactaactccctcttccccttc
ttctgaaaggtggggtcagctaggccatgtgaccttgaagctagaagcca
gagatcagtgtgcttaagggttcagcagcagcagctggatagcctggttc
acacactgtttggccacaaaccgcacatgtctctgtatgtggagatgtag
gcatagctatatgtttctcagcatgtgcacacacaggtacatgcgtgcat
ttgtgtgtatgcacactataaatacaggaaacacctagccgtgaacaaag
aaaaaccaaatcccaaacgggaaagttttggccaaggacaaacactgagt
caggagtctggtgttctatagattcccaacctcaactcccatcctgtact
aaccccttccacaccaaatccatggtactaggcctgcctgggcagctggg
ttcctcatccccttatacgcctccggacacactgctgaatttggtgtggc
tgaggccaaggggaggccacttaccacagcaaacgccagcctcatgggcc
tggagttgtacatgatgtacctcctcacttgaggttccaaaagggcactc
tcagccaagttcctgtactgctcaacagggacctgggccatgcaagatga
agaggtcatcagtttcaggacaaccaactccctatatccttcccacggca
agcatgaacgtccccagatcgcacgacagaccacgggcaggaggcagaaa
gcataggtggggcaccttatacggcataaaagaggctcttagcaca
gaattctgggcagccagcctagcagaactggtgtgtaccaggtcagaggg
aaatcttgtgtccaaaaacacaagtaaggtggagaacttaggtagacact
caaagctgactgctgggcttcatagcatccacacgtgcatccacacatac
atgagcacatggattcacatatgcataaacacagagaaaggatggaaaac
taattaaaagttatagctcttctatactctggatcactggccttacacaa
agcccagagttttgttaaagcaactcacagtggggaaaaaacaaaacaga
tgccataggttgtctacgatgcaaggaactgacacctgaaaatgagccgc
tgttgtaaaaggtggggtggtgggcctgggggtaaagtgcccactgtgca
agcgtgagcaactgagcttggatctccagtacctgtactaaaaagtcaag
cacgaggctaggcatgacggtgcatgcctgtaatcccagcacttgggagg
caggggtgtgaggatctctgtgggttccaggagagcctggtctatatagt
gagttccaggagagccagagctatgcaaaaagaccagatcttgttccccc
caaaaccaaaaacagacaaagccaggcatgacgatgcatgcctgtaaccc
taggagaatccacaggctccatggtcagccaacctgagtgaggagttcca
ccctcagttaccctggcacaacagaatggggtggagagagatataagact
gcccctggcgtcataggaggggtagggcttgagaatatggctcagttggt
taagcaacttgatgttcttgcagaggggtccaggttaggttcccaat
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_63229333_63230276
seq2: B6Ng01-097P22.b_44_989 (reverse)

seq1  TGTGCTCTGAGCCTCTTCTTCTGCCCTCTAAGGTGCCCCACCTATGCCTT  50
      ||||||  ||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||| ||
seq2  TGTGCTAAGAGCCTCTT-TTATGCCGTATAAGGTGCCCCACCTATGCTTT  49

seq1  CT-CCTCCT-CCCGTGGTCTGTCCTGCGATCTGGGGACG-CCATGCTTGC  97
      || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||
seq2  CTGCCTCCTGCCCGTGGTCTGTCGTGCGATCTGGGGACGTTCATGCTTGC  99

seq1  CGTGGGAAGGAGATAGGGAGTTGGTTGTCCTGTAACTGATGACCTCTTCA  147
      ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||
seq2  CGTGGGAAGGATATAGGGAGTTGGTTGTCCTGAAACTGATGACCTCTTCA  149

seq1  TCCTGCATGGCCCAGGTCCCTGCTGAGCAGTACAGGAACTTGGCTGAGAG  197
      || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTTGCATGGCCCAGGTCCCTGTTGAGCAGTACAGGAACTTGGCTGAGAG  199

seq1  TGCCCTTTTGGAACCTCAAGTGAGGAGGTACATCATCTACAACTCCAGGC  247
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||
seq2  TGCCCTTTTGGAACCTCAAGTGAGGAGGTACATCATGTACAACTCCAGGC  249

seq1  CCATGAGGCTGGCCTTTGCTGTGGTAAGTGGCCTCCCCTTGGCCTCAGCC  297
      ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCATGAGGCTGGCGTTTGCTGTGGTAAGTGGCCTCCCCTTGGCCTCAGCC  299

seq1  ACACCAAATTCAGCAGTGTGTCCGGAGGCGTATAAGGGGATGAGGAACCC  347
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCAAATTCAGCAGTGTGTCCGGAGGCGTATAAGGGGATGAGGAACCC  349

seq1  AGCTGCCCAGGCAGGCCTAGTACCATGGATTTGGTGTGGAAGGGGTTAGT  397
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCTGCCCAGGCAGGCCTAGTACCATGGATTTGGTGTGGAAGGGGTTAGT  399

seq1  ACAGGATGGGAGTTGAGGTTGGGAATCTATAGAACACCAGACTCCTGACT  447
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACAGGATGGGAGTTGAGGTTGGGAATCTATAGAACACCAGACTCCTGACT  449

seq1  CAGTGTTTGTCCTTGGCCAAAACTTTCCCGTCTGGGATTTGGTTTTTCTT  497
      ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
seq2  CAGTGTTTGTCCTTGGCCAAAACTTTCCCGTTTGGGATTTGGTTTTTCTT  499

seq1  TGTTCACGGCTAGGTGTTTCCTGTATTTATAGTGTGCATACACACAAATG  547
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTCACGGCTAGGTGTTTCCTGTATTTATAGTGTGCATACACACAAATG  549

seq1  CACGCATGTACCTGTGTGTGCACATGCTGAGAAACATATAGCTATGCCTA  597
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGCATGTACCTGTGTGTGCACATGCTGAGAAACATATAGCTATGCCTA  599

seq1  CATCTCCACATACAGAGACATGTGCGGTTTGTGGCCAAACAGTGTGTGAA  647
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CATCTCCACATACAGAGACATGTGCGGTTTGTGGCCAAACAGTGTGTGAA  649

seq1  CCAGGCTATCCAGCTGCTGCTGCTGAACCCTTAAGCACACTGATCTCTGG  697
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCAGGCTATCCAGCTGCTGCTGCTGAACCCTTAAGCACACTGATCTCTGG  699

seq1  CTTCTAGCTTCAAGGTCACATGGCCTAGCTGACCCCACCTTTCAGAAGAA  747
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTTCTAGCTTCAAGGTCACATGGCCTAGCTGACCCCACCTTTCAGAAGAA  749

seq1  GGGGAAGAGGGAGTTAGTTTTTAACAACTCCCTAAAAAGTACCGGGCTTT  797
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGGGAAGAGGGAGTTAGTTTTTAACAACTCCCTAAAAAGTACCGGGCTTT  799

seq1  ACCCTGTTAGCCCTGGAACAGCCCTGAGGGGTGGGCATGGTTATTCCCAG  847
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACCCTGTTAGCCCTGGAACAGCCCTGAGGGGTGGGCATGGTTATTCCCAG  849

seq1  TTTACAGGTGGGGAAACTGAGGTTTAGAGGGGTGCCATAGCTTATCCCAA  897
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTACAGGTGGGGAAACTGAGGTTTAGAGGGGTGCCATAGCTTATCCCAA  899

seq1  GCCATACTCCCAGGCAAGGATCACTGTGGGGCTTAGACACAGAATTC  944
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCCATACTCCCAGGCAAGGATCACTGTGGGGCTTAGACACAGAATTC  946

seq1: chr4_63053374_63054218
seq2: B6Ng01-097P22.g_70_915

seq1  GAATTCTGGGCAGCCAGCCTAGCAGAACTGGTGTGTACCAGGTCAGAGGG  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCTGGGCAGCCAGCCTAGCAGAACTGGTGTGTACCAGGTCAGAGGG  50

seq1  AAATCTTGTGTCCAAAAACACAAGTAAGGTGGAGAACTTAGGTAGACACT  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAATCTTGTGTCCAAAAACACAAGTAAGGTGGAGAACTTAGGTAGACACT  100

seq1  CAAAGCTGACTGCTGGGCTTCATAGCATCCACACGTGCATCCACACATAC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAGCTGACTGCTGGGCTTCATAGCATCCACACGTGCATCCACACATAC  150

seq1  ATGAGCACATGGATTCACATATGCATAAACACAGAGAAAGGATGGAAAAC  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGAGCACATGGATTCACATATGCATAAACACAGAGAAAGGATGGAAAAC  200

seq1  TAATTAAAAGTTATAGCTCTTCTATACTCTGGATCACTGGCCTTACACAA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAATTAAAAGTTATAGCTCTTCTATACTCTGGATCACTGGCCTTACACAA  250

seq1  AGCCCAGAGTTTTGTTAAAGCAACTCACAGTGGGGAAAAAACAAAACAGA  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCCCAGAGTTTTGTTAAAGCAACTCACAGTGGGGAAAAAACAAAACAGA  300

seq1  TGCCATAGGTTGTCTACGATGCAAGGAACTGACACCTGAAAATGAGCCGC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGCCATAGGTTGTCTACGATGCAAGGAACTGACACCTGAAAATGAGCCGC  350

seq1  TGTTGTAAAAGGTGGGGTGGTGGGCCTGGGGGTAAAGTGCCCACTGTGCA  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGTTGTAAAAGGTGGGGTGGTGGGCCTGGGGGTAAAGTGCCCACTGTGCA  400

seq1  AGCGTGAGCAACTGAGCTTGGATCTCCAGTACCTGTACTAAAAAGTCAAG  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGCGTGAGCAACTGAGCTTGGATCTCCAGTACCTGTACTAAAAAGTCAAG  450

seq1  CACGAGGCTAGGCATGACGGTGCATGCCTGTAATCCCAGCACTTGGGAGG  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACGAGGCTAGGCATGACGGTGCATGCCTGTAATCCCAGCACTTGGGAGG  500

seq1  CAGGGGTGTGAGGATCTCTGTGGGTTCCAGGAGAGCCTGGTCTATATAGT  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAGGGGTGTGAGGATCTCTGTGGGTTCCAGGAGAGCCTGGTCTATATAGT  550

seq1  GAGTTCCAGGAGAGCCAGAGCTATGCAAAAAGACCAGATCTTGTTCCCCC  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGTTCCAGGAGAGCCAGAGCTATGCAAAAAGACCAGATCTTGTTCCCCC  600

seq1  CAAAACCAAAAACAGACAAAGCCAGGCATGACGATGCATGCCTGTAACCC  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAAAACCAAAAACAGACAAAGCCAGGCATGACGATGCATGCCTGTAACCC  650

seq1  TAGGAGAATCCACAGGCTCCATGGTCAGCCAACCTGAGTGAGGAGTTCCA  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGAGAATCCACAGGCTCCATGGTCAGCCAACCTGAGTGAGGAGTTCCA  700

seq1  CCCTCAGTTACCCTGGCACAACAGAATGGGGTGGAGAGAGATATAAGACT  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCCTCAGTTACCCTGGCACAACAGAATGGGGTGGAGAGAGATATAAGACT  750

seq1  GCCCCTGGCGTCATAGGAGGGGTAGGGCTGGAG-AGATGGCTCAG-TGGT  798
      ||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||
seq2  GCCCCTGGCGTCATAGGAGGGGTAGGGCTTGAGAATATGGCTCAGTTGGT  800

seq1  TAAGCACACTTGATGTTCTTGCAGAGGGGTCCAGGTTAGGTTCCCAA  845
      |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAAGCA-ACTTGATGTTCTTGCAGAGGGGTCCAGGTTAGGTTCCCAA  846