BAC Information

Click to search

BAC

Clone NameB6Ng01-100C15
Chromosome4 (Build37)
Map Location 17,925,848 - 18,056,219
singlet/doubletdoublet
Overlap geneMmp16
Upstream geneLOC667212, LOC100040173
Downstream geneLOC667251, LOC435772
LinkOpen Mouse BAC browser



BAC End Information

BAC end BAC-end 1BAC-end 2
end nameB6Ng01-100C15.bB6Ng01-100C15.g
ACCDH909742DH909743
length1,084901
definitionDH909742|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-100C15, 5' end.DH909743|Mus musculus domesticus DNA, BAC clone: B6Ng01-100C15, 3' end.
singlet/doubletdoubletdoublet
BLAST hituniqueunique
Map location.(17,925,848 - 17,926,942)(18,055,320 - 18,056,219)
sequence
gaattccactgctttccaaatccaaagtccccaaatccacattctttcaa
ataaaagcatggtcaggcctatcacagcaataccccagtccctggtacca
acttctgtcttagttagggttttactgctgtgaacagataccatgaccaa
ggcaagtcttataaaaaacaacatttaatttggtctggcttacagattca
gagattcagtcccttaccatcaaggtgagagcatggcagcatccaggcag
gcatggtgcaggaggagctgagaattctatgtcttcacccaaaggctgct
agtggaagactgacttccaggcaactagggtgagaatcttatgcccacac
ccacagtgacacacctactccaaccaggtcacacctattccaacaaggtc
acacctccaaatggtgccactccctggcccaagaatatacaaaccatcac
agttagtaactgtggtaagcactataaccactttatcttgtttattttat
tttattttttgttatttattgaagtcggtatccttctgtgctaccttcaa
tgatgcaaattgatgtcccacctaggatgatagttactttattgggatat
attatggctacttatttacccactgaagtactacgtcctatagagttgtg
gtatgaacaaaaagagttctcagctctgtgagataataacaaataaaatt
taggaccctggtcttaggaaatacataggagtgcacaggttaaaaaacta
tataaatgctatataaatgtgataactatgtaaataggatggtaatcaca
cacacacacacacacacacacacacacacacaagtaaatcaggatcgtct
atgacattctagaaaaccagagagtattgttaaagaaataattcttatag
ccgagacctataaggagattgaaagaaattattaaggcaatggatagaat
ggaaggtacttcaggaaaagtatgccagaaatacttcattcaagtgtgtg
attagagagattttataatacttgctattttcattaaaaccctttatgga
gatgtaaagatactttactggttgggtttttttt
gaattcaagaaaagaaaaaaaataaagtttattcatccagcaagtatgaa
aagtgggaatatggatttcataacacaatataaacatacagcccaggaga
cagtgcaaaataaaaactaagaacatttgaacagtcttgaacaagcttat
gatatttagtttcaaaagttatctgaaatgggaagactttaagctctaac
gtcaagaatccaacatctgattttggttaattatgaaccaggtactagag
agctctgtggatgggggacatgtatgaggaggcatacaccactacccagg
aggtgtgtagaaaaagtactagtgacaatatcattgtttgtttgggatac
tgtgaataagccaataggggctaagaaaaaagaaatagggctaagaaaaa
ataaataggtattgtagtaaaacagatttcacatactttagaagaaatag
gcacaaaggaaagcttaagaagacagaaagattataagaaagaaataatt
aaatccacaatttttaagggattaaataaggaacaagaacagaagagttt
ggaagtaaaaggatggaagaggaggaggggctcatggtgacacactattg
gtaactagagtaactaaggtgtgaatgtagcagagaacatcaaagtgagt
taaagcatgcaatccagagtctttaaaaacagatttaaaatatgaaaatt
ataaatcacctcaatcaatacattgtgcaatgtgctgggcatgttaccaa
gcattttatagcattatctggattttgcttctttaatattaattatcaaa
ttttaacatagattgaagtgaaaaacacacatgtatgtgtaaaaagacct
atacttgtcattgtgtgtgtgtgtgtgtgtgtttgtgtgtgtgtgtgtgt
a
quality valuesOpen.Open.




Alignment Information

BAC End 1BAC End 2
seq1: chr4_17925848_17926942
seq2: B6Ng01-100C15.b_44_1127

seq1  GAATTCCACTGCTTTCCAAATCCAAAGTCCCCAAATCCACATTCTTTCAA  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAATTCCACTGCTTTCCAAATCCAAAGTCCCCAAATCCACATTCTTTCAA  50

seq1  ATAAAAGCATGGTCAGGCCTATCACAGCAATACCCCAGTCCCTGGTACCA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAAAGCATGGTCAGGCCTATCACAGCAATACCCCAGTCCCTGGTACCA  100

seq1  ACTTCTGTCTTAGTTAGGGTTTTACTGCTGTGAACAGATACCATGACCAA  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTTCTGTCTTAGTTAGGGTTTTACTGCTGTGAACAGATACCATGACCAA  150

seq1  GGCAAGTCTTATAAAAAACAACATTTAATTTGGTCTGGCTTACAGATTCA  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GGCAAGTCTTATAAAAAACAACATTTAATTTGGTCTGGCTTACAGATTCA  200

seq1  GAGATTCAGTCCCTTACCATCAAGGTGAGAGCATGGCAGCATCCAGGCAG  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GAGATTCAGTCCCTTACCATCAAGGTGAGAGCATGGCAGCATCCAGGCAG  250

seq1  GCATGGTGCAGGAGGAGCTGAGAATTCTATGTCTTCACCCAAAGGCTGCT  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GCATGGTGCAGGAGGAGCTGAGAATTCTATGTCTTCACCCAAAGGCTGCT  300

seq1  AGTGGAAGACTGACTTCCAGGCAACTAGGGTGAGAATCTTATGCCCACAC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTGGAAGACTGACTTCCAGGCAACTAGGGTGAGAATCTTATGCCCACAC  350

seq1  CCACAGTGACACACCTACTCCAACCAGGTCACACCTATTCCAACAAGGTC  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCACAGTGACACACCTACTCCAACCAGGTCACACCTATTCCAACAAGGTC  400

seq1  ACACCTCCAAATGGTGCCACTCCCTGGCCCAAGAATATACAAACCATCAC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACCTCCAAATGGTGCCACTCCCTGGCCCAAGAATATACAAACCATCAC  450

seq1  AGTTAGTAACTGTGGTAAGCACTATAACCACTTTATCTTGTTTATTTTAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGTTAGTAACTGTGGTAAGCACTATAACCACTTTATCTTGTTTATTTTAT  500

seq1  TTTATTTTTTGTTATTTATTGAAGTCGGTATCCTTCTGTGCTACCTTCAA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTATTTTTTGTTATTTATTGAAGTCGGTATCCTTCTGTGCTACCTTCAA  550

seq1  TGATGCAAATTGATGTCCCACCTAGGATGATAGTTACTTTATTGGGATAT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TGATGCAAATTGATGTCCCACCTAGGATGATAGTTACTTTATTGGGATAT  600

seq1  ATTATGGCTACTTATTTACCCACTGAAGTACTACGTCCTATAGAGTTGTG  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATTATGGCTACTTATTTACCCACTGAAGTACTACGTCCTATAGAGTTGTG  650

seq1  GTATGAACAAAAAGAGTTCTCAGCTCTGTGAGATAATAACAAATAAAATT  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATGAACAAAAAGAGTTCTCAGCTCTGTGAGATAATAACAAATAAAATT  700

seq1  TAGGACCCTGGTCTTAGGAAATACATAGGAGTGCACAGGTTAAAAAACTA  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TAGGACCCTGGTCTTAGGAAATACATAGGAGTGCACAGGTTAAAAAACTA  750

seq1  TATAAATGCTATATAAATGTGATAACTATGTAAATAGGATGGTAAT--CA  798
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||
seq2  TATAAATGCTATATAAATGTGATAACTATGTAAATAGGATGGTAATCACA  800

seq1  CACACACACACACACACACACACACACACACAAGTAAATCAGGATCGTCT  848
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CACACACACACACACACACACACACACACACAAGTAAATCAGGATCGTCT  850

seq1  ATGACATTCTAGAAAACCAGAGAGTATTGTTAAAGAAATAATTCTTATAG  898
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATGACATTCTAGAAAACCAGAGAGTATTGTTAAAGAAATAATTCTTATAG  900

seq1  CCGAGACCTATAAGGAGATTTGAAAGAAATTATTAAGGCAATGGATAGAA  948
      |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |
seq2  CCGAGACCTATAAGGAGA-TTGAAAGAAATTATTAAGGCAATGGATAG-A  948

seq1  ATGGAAGGTACTTCAGGAAAAAGGTATGCCAGAAATACCTCAATCAAAGT  998
      |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||| || ||||
seq2  ATGGAAGGTACTTCAGGAAAA--GTATGCCAGAAATACTTCATTC-AAGT  995

seq1  GTGTGATTAGAAGAGGAATTTTATAATACTTGCTATTTTCATAAAAACCC  1048
      |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||
seq2  GTGTGATTAG-AGAG--ATTTTATAATACTTGCTATTTTCATTAAAACCC  1042

seq1  CTTAATGAGATGTTAAAAGATAACTTTAATTTGTTTTGGTTTTTTTT  1095
       |||  |||||||  |||||| ||||||   || || ||||||||||
seq2  TTTATGGAGATGT--AAAGAT-ACTTTA--CTGGTTGGGTTTTTTTT  1084

seq1: chr4_18055320_18056219
seq2: B6Ng01-100C15.g_66_965 (reverse)

seq1  ACACACACACACACACAAACACACACACACACACACACAATGACAAGTAT  50
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACACACACACACACACAAACACACACACACACACACACAATGACAAGTAT  50

seq1  AGGTCTTTTTACACATACATGTGTGTTTTTCACTTCAATCTATGTTAAAA  100
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AGGTCTTTTTACACATACATGTGTGTTTTTCACTTCAATCTATGTTAAAA  100

seq1  TTTGATAATTAATATTAAAGAAGCAAAATCCAGATAATGCTATAAAATGC  150
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTGATAATTAATATTAAAGAAGCAAAATCCAGATAATGCTATAAAATGC  150

seq1  TTGGTAACATGCCCAGCACATTGCACAATGTATTGATTGAGGTGATTTAT  200
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTGGTAACATGCCCAGCACATTGCACAATGTATTGATTGAGGTGATTTAT  200

seq1  AATTTTCATATTTTAAATCTGTTTTTAAAGACTCTGGATTGCATGCTTTA  250
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTTTCATATTTTAAATCTGTTTTTAAAGACTCTGGATTGCATGCTTTA  250

seq1  ACTCACTTTGATGTTCTCTGCTACATTCACACCTTAGTTACTCTAGTTAC  300
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ACTCACTTTGATGTTCTCTGCTACATTCACACCTTAGTTACTCTAGTTAC  300

seq1  CAATAGTGTGTCACCATGAGCCCCTCCTCCTCTTCCATCCTTTTACTTCC  350
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CAATAGTGTGTCACCATGAGCCCCTCCTCCTCTTCCATCCTTTTACTTCC  350

seq1  AAACTCTTCTGTTCTTGTTCCTTATTTAATCCCTTAAAAATTGTGGATTT  400
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AAACTCTTCTGTTCTTGTTCCTTATTTAATCCCTTAAAAATTGTGGATTT  400

seq1  AATTATTTCTTTCTTATAATCTTTCTGTCTTCTTAAGCTTTCCTTTGTGC  450
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  AATTATTTCTTTCTTATAATCTTTCTGTCTTCTTAAGCTTTCCTTTGTGC  450

seq1  CTATTTCTTCTAAAGTATGTGAAATCTGTTTTACTACAATACCTATTTAT  500
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTATTTCTTCTAAAGTATGTGAAATCTGTTTTACTACAATACCTATTTAT  500

seq1  TTTTTCTTAGCCCTATTTCTTTTTTCTTAGCCCCTATTGGCTTATTCACA  550
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTTTTCTTAGCCCTATTTCTTTTTTCTTAGCCCCTATTGGCTTATTCACA  550

seq1  GTATCCCAAACAAACAATGATATTGTCACTAGTACTTTTTCTACACACCT  600
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTATCCCAAACAAACAATGATATTGTCACTAGTACTTTTTCTACACACCT  600

seq1  CCTGGGTAGTGGTGTATGCCTCCTCATACATGTCCCCCATCCACAGAGCT  650
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CCTGGGTAGTGGTGTATGCCTCCTCATACATGTCCCCCATCCACAGAGCT  650

seq1  CTCTAGTACCTGGTTCATAATTAACCAAAATCAGATGTTGGATTCTTGAC  700
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  CTCTAGTACCTGGTTCATAATTAACCAAAATCAGATGTTGGATTCTTGAC  700

seq1  GTTAGAGCTTAAAGTCTTCCCATTTCAGATAACTTTTGAAACTAAATATC  750
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  GTTAGAGCTTAAAGTCTTCCCATTTCAGATAACTTTTGAAACTAAATATC  750

seq1  ATAAGCTTGTTCAAGACTGTTCAAATGTTCTTAGTTTTTATTTTGCACTG  800
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  ATAAGCTTGTTCAAGACTGTTCAAATGTTCTTAGTTTTTATTTTGCACTG  800

seq1  TCTCCTGGGCTGTATGTTTATATTGTGTTATGAAATCCATATTCCCACTT  850
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TCTCCTGGGCTGTATGTTTATATTGTGTTATGAAATCCATATTCCCACTT  850

seq1  TTCATACTTGCTGGATGAATAAACTTTATTTTTTTTCTTTTCTTGAATTC  900
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
seq2  TTCATACTTGCTGGATGAATAAACTTTATTTTTTTTCTTTTCTTGAATTC  900